Doublet Group distance statistics: 50969

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.001, 0.012, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.003, 0.021, 0.038, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.001, 0.021, 0.042, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.009, 0.036, 0.063, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.036 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.033, 0.065, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.003, 0.042, 0.080, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.042 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.015, 0.151, 0.287, 0.391 max_d=0.391 avg_d=0.151 std_dev=0.136
O4'	A	0, 0.010, 0.150, 0.289, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.150 std_dev=0.140
O2'	A	0, 0.067, 0.211, 0.356, 0.404 max_d=0.404 avg_d=0.211 std_dev=0.145
N3	B	0, 0.053, 0.230, 0.406, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.230 std_dev=0.176
C4	B	0, 0.093, 0.274, 0.454, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.274 std_dev=0.181
C5	B	0, 0.073, 0.268, 0.463, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.268 std_dev=0.195
C2	B	0, 0.047, 0.260, 0.473, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.260 std_dev=0.213
C4'	A	0, 0.016, 0.231, 0.447, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.231 std_dev=0.215
C6	B	0, -0.030, 0.194, 0.419, 0.633 max_d=0.633 avg_d=0.194 std_dev=0.224
C3'	A	0, 0.014, 0.239, 0.465, 0.650 max_d=0.650 avg_d=0.239 std_dev=0.226
N1	B	0, 0.040, 0.269, 0.498, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.269 std_dev=0.229
P	A	0, 0.059, 0.303, 0.547, 0.729 max_d=0.729 avg_d=0.303 std_dev=0.244
N9	B	0, 0.114, 0.363, 0.612, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.363 std_dev=0.249
O5'	A	0, 0.049, 0.298, 0.547, 0.714 max_d=0.714 avg_d=0.298 std_dev=0.249
N6	B	0, -0.050, 0.200, 0.451, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.200 std_dev=0.250
N7	B	0, 0.114, 0.387, 0.660, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.387 std_dev=0.273
O4'	B	0, 0.167, 0.457, 0.747, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.457 std_dev=0.290
C1'	B	0, 0.110, 0.418, 0.726, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.418 std_dev=0.308
O3'	A	0, 0.040, 0.363, 0.687, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.363 std_dev=0.323
C8	B	0, 0.108, 0.441, 0.775, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.441 std_dev=0.333
C5'	A	0, 0.033, 0.370, 0.707, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.370 std_dev=0.337
C4'	B	0, 0.097, 0.439, 0.781, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.439 std_dev=0.342
C2'	B	0, 0.165, 0.524, 0.883, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.524 std_dev=0.359
OP2	A	0, 0.089, 0.453, 0.818, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.453 std_dev=0.365
C3'	B	0, 0.072, 0.437, 0.803, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.437 std_dev=0.365
O3'	B	0, 0.104, 0.536, 0.969, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.536 std_dev=0.432
OP1	A	0, 0.085, 0.566, 1.047, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.566 std_dev=0.481
O2'	B	0, 0.158, 0.686, 1.213, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.686 std_dev=0.527
C5'	B	0, 0.223, 0.842, 1.462, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.842 std_dev=0.620
O5'	B	0, -0.009, 0.644, 1.297, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.644 std_dev=0.653
OP2	B	0, 0.077, 0.985, 1.892, 2.553 max_d=2.553 avg_d=0.985 std_dev=0.908
P	B	0, -0.153, 0.784, 1.722, 2.607 max_d=2.607 avg_d=0.784 std_dev=0.938
OP1	B	0, 0.072, 1.303, 2.535, 3.464 max_d=3.464 avg_d=1.303 std_dev=1.232

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.08	0.18	0.11
C2	0.02	0.00	0.09	0.07	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.06	0.10	0.16	0.30	0.16
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.09	0.04	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.11	0.06	0.04
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.05	0.04	0.07	0.06	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.06	0.15	0.10	0.08
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.04	0.03	0.10	0.16	0.28	0.17
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.09	0.04	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.02	0.12	0.22	0.31	0.19
C5'	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.07	0.03	0.03	0.05	0.07	0.04	0.03	0.04	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.06	0.02	0.12	0.24	0.32	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.05	0.14	0.21	0.27	0.20
N1	0.01	0.00	0.08	0.07	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.04	0.11	0.20	0.32	0.18
N3	0.02	0.00	0.09	0.06	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.06	0.09	0.13	0.27	0.15
N6	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.13	0.29	0.33	0.21
N7	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.03	0.13	0.26	0.31	0.21
N9	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.10	0.14	0.24	0.16
O2'	0.02	0.10	0.01	0.01	0.05	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.08	0.09	0.04	0.03	0.01	0.00	0.05	0.04	0.02	0.13	0.05	0.02
O3'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.09	0.07	0.06	0.05	0.02	0.05	0.00	0.02	0.11	0.25	0.20	0.17
O4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.05	0.04	0.06	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.09	0.08	0.19	0.13
O5'	0.08	0.10	0.03	0.06	0.10	0.01	0.12	0.01	0.12	0.14	0.11	0.09	0.13	0.13	0.10	0.02	0.11	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.08	0.16	0.11	0.15	0.16	0.09	0.22	0.07	0.24	0.21	0.20	0.13	0.29	0.26	0.14	0.13	0.25	0.08	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.18	0.30	0.06	0.10	0.28	0.04	0.31	0.01	0.32	0.27	0.32	0.27	0.33	0.31	0.24	0.05	0.20	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.16	0.04	0.08	0.17	0.01	0.19	0.00	0.20	0.20	0.18	0.15	0.21	0.21	0.16	0.02	0.17	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.21	0.06	0.07	0.12	0.08	0.10	0.19	0.16	0.05	0.22	0.17	0.16	0.05	0.08	0.06	0.08	0.06	0.31	0.28	0.43	0.21
C2	0.17	0.27	0.15	0.14	0.22	0.17	0.24	0.26	0.27	0.16	0.28	0.24	0.29	0.20	0.18	0.15	0.14	0.17	0.21	0.30	0.39	0.20
C2'	0.09	0.08	0.14	0.16	0.09	0.13	0.11	0.20	0.07	0.16	0.08	0.07	0.08	0.17	0.11	0.12	0.17	0.08	0.32	0.30	0.49	0.26
C3'	0.10	0.04	0.13	0.15	0.09	0.13	0.11	0.21	0.07	0.17	0.03	0.06	0.08	0.17	0.12	0.12	0.16	0.10	0.30	0.30	0.47	0.25
C4	0.15	0.26	0.13	0.12	0.20	0.15	0.20	0.23	0.25	0.15	0.27	0.23	0.27	0.16	0.16	0.13	0.12	0.15	0.21	0.29	0.38	0.18
C4'	0.03	0.11	0.01	0.05	0.05	0.06	0.03	0.17	0.06	0.03	0.11	0.09	0.04	0.04	0.02	0.03	0.06	0.02	0.33	0.28	0.41	0.21
C5	0.19	0.26	0.16	0.15	0.22	0.18	0.22	0.23	0.25	0.20	0.27	0.23	0.27	0.21	0.20	0.17	0.15	0.19	0.13	0.32	0.34	0.17
C5'	0.03	0.12	0.03	0.04	0.06	0.06	0.04	0.18	0.07	0.03	0.11	0.09	0.05	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.31	0.29	0.39	0.21
C6	0.22	0.26	0.18	0.18	0.24	0.21	0.24	0.25	0.26	0.23	0.27	0.24	0.27	0.24	0.22	0.19	0.18	0.22	0.10	0.36	0.32	0.20
C8	0.16	0.24	0.13	0.12	0.19	0.15	0.18	0.21	0.22	0.16	0.25	0.21	0.22	0.16	0.17	0.13	0.12	0.16	0.17	0.29	0.36	0.17
N1	0.21	0.26	0.18	0.17	0.24	0.20	0.25	0.26	0.27	0.21	0.27	0.24	0.28	0.24	0.21	0.18	0.18	0.21	0.12	0.34	0.34	0.18
N3	0.13	0.27	0.11	0.11	0.20	0.14	0.21	0.24	0.27	0.12	0.29	0.23	0.30	0.14	0.15	0.11	0.11	0.13	0.27	0.30	0.42	0.22
N6	0.24	0.26	0.21	0.21	0.25	0.23	0.25	0.26	0.26	0.25	0.26	0.25	0.27	0.26	0.24	0.22	0.22	0.25	0.11	0.42	0.31	0.25
N7	0.20	0.25	0.16	0.14	0.21	0.18	0.21	0.23	0.24	0.20	0.25	0.23	0.24	0.20	0.20	0.17	0.14	0.19	0.12	0.32	0.33	0.18
N9	0.13	0.23	0.10	0.10	0.17	0.12	0.16	0.21	0.21	0.12	0.24	0.20	0.22	0.12	0.13	0.10	0.10	0.12	0.24	0.28	0.39	0.18
O2'	0.09	0.03	0.15	0.19	0.08	0.13	0.13	0.19	0.10	0.17	0.02	0.03	0.17	0.19	0.11	0.13	0.20	0.09	0.40	0.33	0.51	0.29
O3'	0.16	0.09	0.20	0.21	0.16	0.17	0.18	0.22	0.16	0.22	0.11	0.12	0.18	0.23	0.18	0.20	0.21	0.14	0.33	0.30	0.50	0.27
O4'	0.10	0.21	0.09	0.07	0.14	0.08	0.12	0.18	0.16	0.06	0.21	0.18	0.16	0.06	0.10	0.11	0.07	0.08	0.32	0.27	0.39	0.19
O5'	0.04	0.09	0.03	0.06	0.04	0.09	0.04	0.20	0.05	0.09	0.09	0.06	0.04	0.08	0.05	0.03	0.06	0.07	0.32	0.33	0.42	0.25
OP1	0.02	0.14	0.03	0.05	0.03	0.08	0.01	0.21	0.07	0.09	0.14	0.09	0.05	0.08	0.02	0.05	0.05	0.06	0.34	0.39	0.46	0.30
OP2	0.18	0.05	0.18	0.22	0.12	0.25	0.14	0.36	0.08	0.24	0.05	0.07	0.08	0.23	0.18	0.17	0.22	0.23	0.40	0.54	0.59	0.44
P	0.09	0.08	0.08	0.11	0.06	0.15	0.07	0.27	0.06	0.14	0.09	0.06	0.06	0.13	0.09	0.06	0.11	0.13	0.34	0.43	0.49	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.05	0.41	0.12
C2	0.04	0.00	0.17	0.22	0.01	0.06	0.02	0.13	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.10	0.25	0.09	0.17	0.08	0.45	0.10
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.02	0.02	0.06	0.11	0.13	0.18	0.04	0.08	0.01	0.01	0.03	0.00	0.20	0.26	0.19	0.09
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.11	0.00	0.06	0.02	0.11	0.13	0.18	0.20	0.09	0.07	0.03	0.01	0.01	0.00	0.31	0.37	0.07	0.20
C4	0.03	0.01	0.08	0.11	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.05	0.18	0.06	0.43	0.10
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.06	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.13	0.31	0.05
C5	0.02	0.02	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.02	0.23	0.09	0.43	0.10
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.11	0.01	0.13	0.00	0.15	0.08	0.15	0.11	0.16	0.11	0.07	0.03	0.03	0.02	0.01	0.15	0.33	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.12	0.04	0.24	0.11	0.44	0.11
C8	0.01	0.03	0.11	0.13	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.07	0.14	0.06	0.23	0.06	0.41	0.10
N1	0.03	0.00	0.13	0.18	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.21	0.07	0.22	0.10	0.45	0.10
N3	0.04	0.00	0.18	0.20	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.09	0.15	0.06	0.44	0.09
N6	0.02	0.00	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.16	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.03	0.26	0.15	0.42	0.11
N7	0.01	0.02	0.08	0.07	0.00	0.02	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.08	0.03	0.26	0.10	0.41	0.10
N9	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.16	0.05	0.42	0.10
O2'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.07	0.08	0.10	0.05	0.06	0.02	0.00	0.05	0.03	0.04	0.20	0.24	0.02
O3'	0.02	0.25	0.03	0.01	0.10	0.01	0.06	0.03	0.12	0.14	0.21	0.21	0.10	0.08	0.03	0.05	0.00	0.01	0.26	0.44	0.02	0.24
O4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.07	0.09	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.13	0.04	0.49	0.21
O5'	0.05	0.17	0.20	0.31	0.18	0.03	0.23	0.01	0.24	0.23	0.22	0.15	0.26	0.26	0.16	0.04	0.26	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.08	0.26	0.37	0.06	0.13	0.09	0.15	0.11	0.06	0.10	0.06	0.15	0.10	0.05	0.20	0.44	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.41	0.45	0.19	0.07	0.43	0.31	0.43	0.33	0.44	0.41	0.45	0.44	0.42	0.41	0.42	0.24	0.02	0.49	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.10	0.09	0.20	0.10	0.05	0.10	0.01	0.11	0.10	0.10	0.09	0.11	0.10	0.10	0.02	0.24	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00