Doublet Group distance statistics: 50973

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 12, 14, 10, 8, 6, 6, 9, 14, 15, 9, 5, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.022, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.002, 0.013, 0.024, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.013 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.005, 0.020, 0.034, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.012, 0.037, 0.061, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.037 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.010, 0.035, 0.060, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.035 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.014, 0.043, 0.072, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.043 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.028, 0.110, 0.193, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.110 std_dev=0.083
O4'	A	0, 0.007, 0.096, 0.186, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.096 std_dev=0.090
O2'	A	0, 0.063, 0.173, 0.283, 0.678 max_d=0.678 avg_d=0.173 std_dev=0.110
C4'	A	0, 0.047, 0.163, 0.279, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.163 std_dev=0.116
C3'	A	0, 0.061, 0.189, 0.317, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.189 std_dev=0.128
C4	B	0, 0.177, 0.351, 0.525, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.351 std_dev=0.174
N4	B	0, 0.129, 0.313, 0.496, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.313 std_dev=0.184
O3'	A	0, 0.125, 0.312, 0.498, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.312 std_dev=0.186
C5'	A	0, 0.070, 0.263, 0.456, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.263 std_dev=0.193
N3	B	0, 0.209, 0.433, 0.657, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.433 std_dev=0.224
C5	B	0, 0.151, 0.398, 0.646, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.398 std_dev=0.248
C6	B	0, 0.268, 0.530, 0.792, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.530 std_dev=0.262
O5'	A	0, -0.002, 0.309, 0.619, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.309 std_dev=0.311
P	A	0, 0.076, 0.390, 0.703, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.390 std_dev=0.314
OP1	A	0, 0.140, 0.470, 0.800, 2.249 max_d=2.249 avg_d=0.470 std_dev=0.330
C2	B	0, 0.248, 0.584, 0.920, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.584 std_dev=0.336
OP2	A	0, 0.081, 0.424, 0.767, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.424 std_dev=0.343
N1	B	0, 0.292, 0.638, 0.984, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.638 std_dev=0.346
O2	B	0, 0.243, 0.701, 1.159, 1.984 max_d=1.984 avg_d=0.701 std_dev=0.458
C1'	B	0, 0.330, 0.870, 1.410, 1.994 max_d=1.994 avg_d=0.870 std_dev=0.540
C3'	B	0, 0.357, 0.956, 1.556, 3.335 max_d=3.335 avg_d=0.956 std_dev=0.599
O3'	B	0, 0.197, 0.818, 1.438, 4.661 max_d=4.661 avg_d=0.818 std_dev=0.620
O4'	B	0, 0.410, 1.051, 1.693, 2.221 max_d=2.221 avg_d=1.051 std_dev=0.641
C2'	B	0, 0.316, 1.027, 1.738, 2.819 max_d=2.819 avg_d=1.027 std_dev=0.711
C4'	B	0, 0.485, 1.238, 1.990, 2.460 max_d=2.460 avg_d=1.238 std_dev=0.753
O2'	B	0, 0.417, 1.478, 2.539, 3.302 max_d=3.302 avg_d=1.478 std_dev=1.061
C5'	B	0, 0.584, 1.756, 2.929, 4.609 max_d=4.609 avg_d=1.756 std_dev=1.172
O5'	B	0, 0.545, 1.839, 3.134, 5.206 max_d=5.206 avg_d=1.839 std_dev=1.294
P	B	0, 0.610, 2.832, 5.054, 7.180 max_d=7.180 avg_d=2.832 std_dev=2.222
OP1	B	0, 0.697, 2.965, 5.233, 9.320 max_d=9.320 avg_d=2.965 std_dev=2.268
OP2	B	0, 0.635, 3.226, 5.817, 7.646 max_d=7.646 avg_d=3.226 std_dev=2.591

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.11	0.15	0.06
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.11	0.03	0.22	0.19	0.16	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.04	0.07	0.08	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.13	0.21	0.11	0.10
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.09	0.06	0.07	0.06	0.08	0.04	0.02	0.00	0.01	0.17	0.26	0.11	0.15
C4	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.02	0.23	0.18	0.14	0.16
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.07	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.12	0.15	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.29	0.23	0.19	0.22
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.12	0.08	0.05	0.11	0.12	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.10	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.30	0.24	0.22	0.24
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.03	0.30	0.21	0.15	0.20
N1	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.02	0.27	0.22	0.19	0.21
N3	0.02	0.00	0.08	0.07	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.03	0.20	0.17	0.13	0.13
N6	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.32	0.27	0.26	0.28
N7	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.33	0.25	0.20	0.25
N9	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.22	0.17	0.13	0.13
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.03	0.09	0.09	0.06	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.06	0.18	0.12	0.05
O3'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.10	0.09	0.10	0.07	0.09	0.03	0.04	0.00	0.01	0.13	0.34	0.18	0.19
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.24	0.11
O5'	0.10	0.22	0.13	0.17	0.23	0.01	0.29	0.01	0.30	0.30	0.27	0.20	0.32	0.33	0.22	0.06	0.13	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.11	0.19	0.21	0.26	0.18	0.12	0.23	0.10	0.24	0.21	0.22	0.17	0.27	0.25	0.17	0.18	0.34	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.16	0.11	0.11	0.14	0.15	0.19	0.16	0.22	0.15	0.19	0.13	0.26	0.20	0.13	0.12	0.18	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.16	0.10	0.15	0.16	0.03	0.22	0.01	0.24	0.20	0.21	0.13	0.28	0.25	0.13	0.05	0.19	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.11	0.22	0.16	0.11	0.15	0.10	0.43	0.09	0.10	0.10	0.14	0.14	0.60	0.23	0.16	0.65	0.97	0.69	0.92
C2	0.12	0.14	0.17	0.23	0.13	0.16	0.13	0.41	0.13	0.12	0.14	0.14	0.15	0.48	0.14	0.14	0.47	0.77	0.30	0.49
C2'	0.09	0.08	0.14	0.16	0.08	0.18	0.08	0.37	0.06	0.07	0.08	0.12	0.12	0.47	0.22	0.20	0.55	0.82	0.59	0.75
C3'	0.12	0.10	0.15	0.18	0.09	0.27	0.09	0.45	0.08	0.09	0.09	0.12	0.14	0.45	0.31	0.29	0.60	0.90	0.73	0.83
C4	0.08	0.09	0.15	0.19	0.08	0.15	0.09	0.41	0.08	0.08	0.09	0.10	0.12	0.51	0.15	0.14	0.55	0.88	0.27	0.69
C4'	0.08	0.08	0.22	0.15	0.09	0.20	0.08	0.46	0.08	0.08	0.08	0.13	0.11	0.61	0.34	0.22	0.70	1.02	0.99	1.02
C5	0.09	0.09	0.13	0.21	0.08	0.15	0.10	0.38	0.09	0.08	0.08	0.10	0.11	0.48	0.14	0.15	0.52	0.86	0.23	0.64
C5'	0.09	0.08	0.22	0.16	0.09	0.24	0.08	0.50	0.07	0.07	0.08	0.12	0.11	0.62	0.39	0.26	0.73	1.09	1.06	1.07
C6	0.10	0.10	0.13	0.24	0.10	0.15	0.12	0.37	0.11	0.09	0.10	0.11	0.12	0.45	0.14	0.15	0.46	0.79	0.29	0.52
C8	0.09	0.09	0.16	0.17	0.08	0.16	0.09	0.40	0.08	0.08	0.08	0.11	0.11	0.52	0.19	0.18	0.59	0.94	0.48	0.80
N1	0.12	0.12	0.15	0.25	0.12	0.15	0.14	0.38	0.12	0.11	0.13	0.13	0.14	0.45	0.15	0.14	0.44	0.74	0.38	0.44
N3	0.11	0.12	0.17	0.20	0.11	0.16	0.11	0.43	0.10	0.11	0.12	0.11	0.14	0.52	0.14	0.14	0.54	0.85	0.20	0.64
N6	0.11	0.10	0.12	0.26	0.10	0.16	0.13	0.36	0.12	0.10	0.10	0.12	0.13	0.43	0.15	0.16	0.44	0.77	0.36	0.49
N7	0.10	0.08	0.13	0.20	0.08	0.16	0.09	0.38	0.08	0.08	0.07	0.10	0.11	0.48	0.16	0.18	0.54	0.90	0.33	0.71
N9	0.08	0.09	0.17	0.17	0.08	0.15	0.09	0.41	0.08	0.08	0.08	0.11	0.11	0.54	0.19	0.16	0.60	0.94	0.47	0.81
O2'	0.08	0.08	0.18	0.15	0.11	0.13	0.11	0.36	0.09	0.08	0.09	0.15	0.12	0.54	0.26	0.16	0.59	0.81	0.76	0.83
O3'	0.17	0.15	0.20	0.22	0.13	0.35	0.13	0.50	0.13	0.14	0.14	0.14	0.21	0.40	0.41	0.35	0.61	0.90	0.81	0.82
O4'	0.11	0.12	0.26	0.17	0.11	0.17	0.10	0.47	0.10	0.11	0.11	0.14	0.15	0.67	0.29	0.18	0.72	1.07	0.93	1.06
O5'	0.09	0.10	0.22	0.19	0.15	0.20	0.13	0.40	0.10	0.09	0.12	0.20	0.11	0.55	0.37	0.23	0.60	0.94	0.81	0.88
OP1	0.28	0.25	0.34	0.27	0.23	0.29	0.22	0.31	0.23	0.25	0.24	0.24	0.28	0.49	0.37	0.33	0.46	0.84	0.82	0.79
OP2	0.21	0.15	0.17	0.24	0.14	0.32	0.15	0.43	0.15	0.16	0.13	0.15	0.18	0.41	0.29	0.36	0.57	0.96	0.68	0.83
P	0.13	0.10	0.21	0.19	0.12	0.22	0.12	0.39	0.10	0.10	0.11	0.16	0.12	0.52	0.36	0.26	0.60	0.98	0.85	0.91

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.33	0.00	0.28	0.24	0.55	0.34
C2	0.02	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.37	0.17	0.09	0.52	0.61	0.64	0.67
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.27	0.09	0.02	0.10	0.06	0.17	0.00	0.02	0.01	0.55	0.57	1.22	0.83
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.27	0.00	0.34	0.02	0.32	0.18	0.18	0.28	0.10	0.02	0.01	0.01	0.06	0.10	0.70	0.26
C4	0.01	0.01	0.05	0.27	0.00	0.06	0.00	0.31	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.31	0.08	0.03	0.39	0.55	0.26	0.39
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.06	0.07	0.08	0.30	0.02	0.00	0.01	0.05	0.41	0.08
C5	0.01	0.01	0.06	0.34	0.00	0.06	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.13	0.06	0.19	0.31	0.63	0.14
C5'	0.13	0.30	0.27	0.02	0.31	0.01	0.23	0.00	0.18	0.21	0.34	0.34	0.31	0.05	0.25	0.02	0.01	0.06	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.09	0.32	0.01	0.06	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.08	0.14	0.21	0.46	0.14
N1	0.00	0.01	0.02	0.18	0.01	0.03	0.01	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.12	0.01	0.34	0.36	0.32	0.35
N3	0.01	0.00	0.10	0.18	0.00	0.06	0.00	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.39	0.10	0.07	0.53	0.69	0.45	0.66
N4	0.01	0.01	0.06	0.28	0.00	0.07	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.34	0.11	0.03	0.40	0.62	0.34	0.41
O2	0.03	0.01	0.17	0.10	0.01	0.08	0.01	0.31	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.48	0.30	0.15	0.60	0.71	1.02	0.86
O2'	0.02	0.37	0.00	0.02	0.31	0.30	0.18	0.05	0.11	0.17	0.39	0.34	0.48	0.00	0.03	0.20	0.42	0.43	1.42	0.80
O3'	0.33	0.17	0.02	0.01	0.08	0.02	0.13	0.25	0.10	0.12	0.10	0.11	0.30	0.03	0.00	0.31	0.26	0.43	0.46	0.10
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.02	0.08	0.01	0.07	0.03	0.15	0.20	0.31	0.00	0.06	0.11	0.15	0.11
O5'	0.28	0.52	0.55	0.06	0.39	0.01	0.19	0.01	0.14	0.34	0.53	0.40	0.60	0.42	0.26	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.24	0.61	0.57	0.10	0.55	0.05	0.31	0.06	0.21	0.36	0.69	0.62	0.71	0.43	0.43	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.55	0.64	1.22	0.70	0.26	0.41	0.63	0.26	0.46	0.32	0.45	0.34	1.02	1.42	0.46	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.34	0.67	0.83	0.26	0.39	0.08	0.14	0.01	0.14	0.35	0.66	0.41	0.86	0.80	0.10	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00