Doublet Group distance statistics: 50978

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.003, 0.017, 0.032, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.007, 0.027, 0.047, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.023, 0.055, 0.086, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.055 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.014, 0.046, 0.078, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.046 std_dev=0.032
N6	A	0, 0.012, 0.048, 0.083, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.048 std_dev=0.036
O4'	A	0, 0.028, 0.082, 0.135, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.082 std_dev=0.054
C2'	A	0, 0.038, 0.096, 0.154, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.096 std_dev=0.058
C4'	A	0, 0.057, 0.143, 0.228, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.143 std_dev=0.086
O2'	A	0, 0.066, 0.157, 0.248, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.157 std_dev=0.091
C3'	A	0, 0.063, 0.155, 0.247, 0.233 max_d=0.233 avg_d=0.155 std_dev=0.092
O3'	A	0, 0.079, 0.189, 0.298, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.189 std_dev=0.110
C5'	A	0, 0.090, 0.222, 0.353, 0.328 max_d=0.328 avg_d=0.222 std_dev=0.132
C6	B	0, 0.088, 0.302, 0.515, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.302 std_dev=0.213
N1	B	0, 0.100, 0.315, 0.530, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.315 std_dev=0.215
O5'	B	0, 0.116, 0.351, 0.586, 0.614 max_d=0.614 avg_d=0.351 std_dev=0.235
C5	B	0, 0.134, 0.388, 0.641, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.388 std_dev=0.254
O6	B	0, 0.077, 0.331, 0.585, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.331 std_dev=0.254
C2	B	0, 0.120, 0.424, 0.727, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.424 std_dev=0.304
O5'	A	0, 0.202, 0.515, 0.828, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.515 std_dev=0.313
C4	B	0, 0.148, 0.464, 0.781, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.464 std_dev=0.317
N7	B	0, 0.152, 0.472, 0.792, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.472 std_dev=0.320
P	B	0, 0.159, 0.512, 0.865, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.512 std_dev=0.353
N3	B	0, 0.122, 0.491, 0.860, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.491 std_dev=0.369
C8	B	0, 0.176, 0.557, 0.937, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.557 std_dev=0.380
P	A	0, 0.259, 0.645, 1.031, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.645 std_dev=0.386
N2	B	0, 0.125, 0.525, 0.926, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.525 std_dev=0.401
C5'	B	0, 0.216, 0.616, 1.017, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.616 std_dev=0.401
N9	B	0, 0.169, 0.575, 0.982, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.575 std_dev=0.407
OP1	A	0, 0.302, 0.723, 1.144, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.723 std_dev=0.421
C3'	B	0, 0.180, 0.609, 1.038, 1.205 max_d=1.205 avg_d=0.609 std_dev=0.429
OP2	B	0, 0.121, 0.565, 1.008, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.565 std_dev=0.443
O3'	B	0, 0.188, 0.636, 1.085, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.636 std_dev=0.449
OP1	B	0, 0.198, 0.649, 1.101, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.649 std_dev=0.451
C4'	B	0, 0.208, 0.670, 1.132, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.670 std_dev=0.462
OP2	A	0, 0.306, 0.788, 1.270, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.788 std_dev=0.482
O4'	B	0, 0.178, 0.686, 1.194, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.686 std_dev=0.508
C2'	B	0, 0.149, 0.661, 1.172, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.661 std_dev=0.511
C1'	B	0, 0.161, 0.673, 1.186, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.673 std_dev=0.513
O2'	B	0, 0.126, 0.793, 1.460, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.793 std_dev=0.667

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.05	0.04
C2	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.04	0.09	0.13	0.14	0.13
C2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.07	0.03	0.02	0.07	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.13	0.11
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.08	0.03	0.02	0.07	0.07	0.03	0.00	0.00	0.01	0.09	0.05	0.12	0.10
C4	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.09	0.12	0.12	0.11
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.07	0.05	0.01	0.10	0.07	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01
C5	0.02	0.02	0.04	0.04	0.01	0.05	0.00	0.11	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.13	0.18	0.15	0.15
C5'	0.02	0.07	0.03	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.12	0.12	0.10	0.05	0.16	0.13	0.06	0.03	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.07	0.02	0.12	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.06	0.14	0.21	0.17	0.18
C8	0.03	0.02	0.07	0.08	0.01	0.07	0.01	0.12	0.03	0.00	0.03	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.15	0.17	0.13	0.14
N1	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.03	0.06	0.12	0.18	0.17	0.17
N3	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.04	0.03	0.07	0.10	0.12	0.11
N6	0.06	0.01	0.07	0.07	0.04	0.10	0.04	0.16	0.01	0.06	0.01	0.03	0.00	0.06	0.06	0.04	0.05	0.08	0.19	0.26	0.22	0.23
N7	0.02	0.02	0.06	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.03	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.04	0.04	0.15	0.20	0.15	0.17
N9	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.06	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.10	0.10	0.09
O2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.19	0.15
O3'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.03	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.05	0.13	0.08
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.05	0.06	0.03	0.08	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.08	0.07	0.07	0.05
O5'	0.05	0.09	0.07	0.09	0.09	0.01	0.13	0.00	0.14	0.15	0.12	0.07	0.19	0.15	0.09	0.10	0.09	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.13	0.06	0.05	0.12	0.05	0.18	0.05	0.21	0.17	0.18	0.10	0.26	0.20	0.10	0.08	0.05	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.14	0.13	0.12	0.12	0.01	0.15	0.01	0.17	0.13	0.17	0.12	0.22	0.15	0.10	0.19	0.13	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.13	0.11	0.10	0.11	0.01	0.15	0.01	0.18	0.14	0.17	0.11	0.23	0.17	0.09	0.15	0.08	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.18	0.11	0.08	0.15	0.10	0.13	0.06	0.14	0.11	0.13	0.27	0.19	0.13	0.14	0.18	0.11	0.16	0.07	0.19	0.09	0.06	0.06
C2	0.10	0.04	0.12	0.15	0.08	0.12	0.13	0.12	0.12	0.14	0.04	0.11	0.04	0.17	0.11	0.11	0.17	0.10	0.14	0.19	0.20	0.21	0.17
C2'	0.14	0.14	0.12	0.13	0.14	0.11	0.15	0.09	0.17	0.12	0.15	0.17	0.14	0.15	0.13	0.15	0.17	0.14	0.10	0.21	0.11	0.08	0.09
C3'	0.15	0.13	0.09	0.11	0.12	0.09	0.12	0.07	0.15	0.10	0.13	0.18	0.15	0.12	0.13	0.15	0.15	0.14	0.09	0.19	0.10	0.06	0.08
C4	0.09	0.11	0.08	0.09	0.08	0.07	0.11	0.06	0.12	0.10	0.07	0.19	0.10	0.13	0.09	0.11	0.12	0.09	0.09	0.19	0.14	0.13	0.11
C4'	0.18	0.17	0.11	0.07	0.14	0.10	0.11	0.06	0.13	0.10	0.12	0.25	0.20	0.10	0.15	0.21	0.10	0.17	0.07	0.18	0.08	0.03	0.05
C5	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.07	0.11	0.08	0.11	0.10	0.05	0.17	0.08	0.15	0.08	0.11	0.12	0.08	0.11	0.18	0.17	0.17	0.14
C5'	0.18	0.17	0.11	0.07	0.15	0.10	0.12	0.06	0.14	0.10	0.13	0.24	0.19	0.11	0.15	0.20	0.10	0.17	0.06	0.18	0.08	0.03	0.04
C6	0.09	0.05	0.10	0.13	0.08	0.10	0.13	0.12	0.12	0.14	0.04	0.12	0.03	0.18	0.10	0.10	0.15	0.10	0.15	0.19	0.22	0.23	0.19
C8	0.14	0.16	0.11	0.06	0.11	0.08	0.10	0.04	0.11	0.08	0.09	0.25	0.16	0.11	0.11	0.18	0.08	0.13	0.07	0.17	0.12	0.11	0.09
N1	0.11	0.04	0.12	0.15	0.09	0.12	0.14	0.13	0.12	0.16	0.04	0.10	0.04	0.19	0.12	0.11	0.17	0.12	0.16	0.18	0.23	0.25	0.20
N3	0.07	0.07	0.09	0.11	0.07	0.08	0.11	0.08	0.12	0.10	0.05	0.15	0.05	0.14	0.08	0.09	0.14	0.08	0.10	0.19	0.15	0.15	0.12
N6	0.09	0.04	0.10	0.12	0.07	0.10	0.13	0.13	0.11	0.15	0.03	0.12	0.03	0.18	0.10	0.10	0.14	0.10	0.16	0.17	0.24	0.26	0.21
N7	0.10	0.12	0.08	0.07	0.08	0.06	0.10	0.06	0.11	0.09	0.07	0.21	0.12	0.13	0.08	0.14	0.09	0.09	0.10	0.18	0.16	0.15	0.13
N9	0.13	0.16	0.10	0.07	0.12	0.08	0.11	0.05	0.12	0.10	0.11	0.24	0.16	0.12	0.12	0.16	0.09	0.13	0.06	0.18	0.10	0.09	0.07
O2'	0.14	0.15	0.17	0.19	0.15	0.14	0.18	0.13	0.20	0.14	0.19	0.14	0.13	0.17	0.14	0.17	0.23	0.15	0.13	0.23	0.14	0.13	0.13
O3'	0.15	0.12	0.09	0.11	0.11	0.08	0.10	0.07	0.13	0.08	0.11	0.18	0.15	0.09	0.12	0.15	0.17	0.14	0.09	0.17	0.10	0.06	0.08
O4'	0.20	0.21	0.15	0.08	0.17	0.12	0.13	0.06	0.13	0.12	0.14	0.30	0.23	0.12	0.17	0.24	0.08	0.18	0.06	0.18	0.07	0.02	0.04
O5'	0.19	0.19	0.12	0.07	0.17	0.12	0.16	0.07	0.18	0.14	0.17	0.24	0.20	0.15	0.17	0.21	0.09	0.19	0.06	0.22	0.08	0.03	0.05
OP1	0.19	0.19	0.12	0.09	0.17	0.12	0.16	0.08	0.17	0.13	0.17	0.24	0.20	0.15	0.17	0.20	0.12	0.18	0.07	0.22	0.11	0.04	0.06
OP2	0.22	0.22	0.15	0.12	0.21	0.16	0.23	0.12	0.25	0.20	0.23	0.24	0.22	0.23	0.21	0.23	0.12	0.23	0.11	0.30	0.10	0.11	0.10
P	0.19	0.20	0.12	0.06	0.18	0.11	0.18	0.06	0.20	0.15	0.19	0.25	0.21	0.17	0.18	0.21	0.08	0.19	0.06	0.24	0.08	0.04	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.06	0.05	0.05
C2	0.04	0.00	0.09	0.09	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.03	0.07	0.03	0.07	0.12	0.09
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.10	0.09	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.11	0.12	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.09	0.10	0.09	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.08	0.13	0.16	0.08
C4	0.03	0.01	0.06	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.02	0.09	0.04	0.10	0.13	0.11
C4'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.05	0.02
C5	0.03	0.01	0.05	0.05	0.01	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.07	0.02	0.12	0.03	0.14	0.18	0.15
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.00
C6	0.04	0.02	0.08	0.08	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.09	0.11	0.03	0.11	0.01	0.15	0.19	0.15
C8	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.13	0.02	0.14	0.19	0.14
N1	0.04	0.01	0.09	0.09	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.12	0.03	0.09	0.02	0.11	0.15	0.12
N2	0.03	0.01	0.10	0.10	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.02	0.07	0.03	0.06	0.11	0.09
N3	0.04	0.00	0.09	0.09	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.03	0.07	0.03	0.06	0.10	0.08
N7	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.14	0.02	0.17	0.22	0.17
N9	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.09	0.04	0.09	0.12	0.10
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.06	0.02	0.09	0.03	0.11	0.13	0.11	0.04	0.02	0.00	0.04	0.02	0.02	0.10	0.13	0.11	0.04
O3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.11	0.02	0.12	0.13	0.10	0.04	0.03	0.04	0.00	0.01	0.09	0.11	0.17	0.21	0.12
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.04	0.08	0.06
O5'	0.04	0.07	0.02	0.05	0.09	0.01	0.12	0.00	0.11	0.13	0.09	0.07	0.07	0.14	0.09	0.02	0.09	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00
O6	0.05	0.03	0.08	0.08	0.04	0.03	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.10	0.11	0.04	0.12	0.00	0.17	0.21	0.16
OP1	0.06	0.07	0.11	0.13	0.10	0.10	0.14	0.08	0.15	0.14	0.11	0.06	0.06	0.17	0.09	0.13	0.17	0.04	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.12	0.12	0.16	0.13	0.05	0.18	0.02	0.19	0.19	0.15	0.11	0.10	0.22	0.12	0.11	0.21	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.09	0.05	0.08	0.11	0.02	0.15	0.00	0.15	0.14	0.12	0.09	0.08	0.17	0.10	0.04	0.12	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00