Doublet Group distance statistics: 50993

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.009, 0.022, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.021, 0.035, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.024 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.009, 0.029, 0.049, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.029 std_dev=0.020
N4	A	0, 0.020, 0.050, 0.081, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.050 std_dev=0.031
O2	A	0, 0.010, 0.043, 0.077, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.043 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.168, 0.303, 0.437, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.303 std_dev=0.135
C2'	A	0, 0.128, 0.278, 0.428, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.278 std_dev=0.150
O2'	A	0, 0.127, 0.302, 0.477, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.302 std_dev=0.175
C4'	A	0, 0.209, 0.414, 0.620, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.414 std_dev=0.205
C2'	B	0, 0.277, 0.507, 0.738, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.507 std_dev=0.231
C3'	A	0, 0.232, 0.463, 0.695, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.463 std_dev=0.231
C1'	B	0, 0.215, 0.490, 0.764, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.490 std_dev=0.275
O2'	B	0, 0.390, 0.680, 0.969, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.680 std_dev=0.289
O3'	A	0, 0.323, 0.657, 0.991, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.657 std_dev=0.334
N1	B	0, 0.370, 0.714, 1.058, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.714 std_dev=0.344
C5'	A	0, 0.394, 0.748, 1.102, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.748 std_dev=0.354
O2	B	0, 0.479, 0.845, 1.211, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.845 std_dev=0.366
C3'	B	0, 0.563, 0.933, 1.303, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.933 std_dev=0.370
O5'	A	0, 0.523, 0.898, 1.274, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.898 std_dev=0.376
O4'	B	0, 0.355, 0.749, 1.144, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.749 std_dev=0.394
C6	B	0, 0.433, 0.841, 1.250, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.841 std_dev=0.409
C2	B	0, 0.549, 0.966, 1.383, 1.463 max_d=1.463 avg_d=0.966 std_dev=0.417
C4'	B	0, 0.692, 1.125, 1.558, 1.518 max_d=1.518 avg_d=1.125 std_dev=0.433
P	A	0, 0.653, 1.103, 1.552, 1.587 max_d=1.587 avg_d=1.103 std_dev=0.450
O3'	B	0, 0.871, 1.406, 1.941, 1.883 max_d=1.883 avg_d=1.406 std_dev=0.535
C5	B	0, 0.699, 1.257, 1.815, 1.871 max_d=1.871 avg_d=1.257 std_dev=0.558
N3	B	0, 0.832, 1.397, 1.963, 1.940 max_d=1.940 avg_d=1.397 std_dev=0.565
O5'	B	0, 0.575, 1.143, 1.712, 1.917 max_d=1.917 avg_d=1.143 std_dev=0.569
C5'	B	0, 0.992, 1.569, 2.146, 2.046 max_d=2.046 avg_d=1.569 std_dev=0.577
OP1	A	0, 0.975, 1.569, 2.164, 2.121 max_d=2.121 avg_d=1.569 std_dev=0.594
OP2	B	0, 1.016, 1.623, 2.229, 2.098 max_d=2.098 avg_d=1.623 std_dev=0.607
P	B	0, 0.980, 1.613, 2.246, 2.257 max_d=2.257 avg_d=1.613 std_dev=0.633
C4	B	0, 0.918, 1.554, 2.190, 2.201 max_d=2.201 avg_d=1.554 std_dev=0.636
N4	B	0, 1.220, 2.014, 2.808, 2.790 max_d=2.790 avg_d=2.014 std_dev=0.794
OP2	A	0, 1.462, 2.292, 3.123, 2.858 max_d=2.858 avg_d=2.292 std_dev=0.830
OP1	B	0, 1.433, 2.610, 3.788, 3.871 max_d=3.871 avg_d=2.610 std_dev=1.178

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.04	0.07	0.05	0.04
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.07	0.02	0.08	0.16	0.12	0.10
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.04	0.10	0.01	0.03	0.01	0.03	0.07	0.05	0.03
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.04	0.05	0.04	0.11	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.07	0.05
C4	0.04	0.02	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.03	0.04	0.07	0.20	0.19	0.11
C4'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.03	0.04	0.07	0.05	0.03	0.00	0.02	0.06	0.05	0.02
C5	0.04	0.03	0.06	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.06	0.06	0.05	0.08	0.21	0.20	0.11
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.08	0.01	0.10	0.00	0.09	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.09	0.02
C6	0.04	0.01	0.06	0.07	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.07	0.05	0.06	0.16	0.15	0.08
N1	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.06	0.13	0.10	0.07
N3	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.07	0.06	0.03	0.08	0.18	0.15	0.10
N4	0.04	0.02	0.04	0.04	0.00	0.04	0.02	0.08	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.07	0.03	0.05	0.08	0.23	0.21	0.12
O2	0.05	0.01	0.10	0.11	0.03	0.07	0.04	0.07	0.03	0.03	0.02	0.03	0.00	0.10	0.13	0.05	0.10	0.15	0.12	0.11
O2'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04	0.04	0.07	0.07	0.10	0.00	0.06	0.04	0.04	0.09	0.05	0.03
O3'	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.03	0.06	0.01	0.07	0.04	0.06	0.03	0.13	0.06	0.00	0.02	0.07	0.17	0.12	0.08
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.05	0.05	0.04	0.02	0.00	0.09	0.08	0.07	0.08
O5'	0.04	0.08	0.03	0.06	0.07	0.02	0.08	0.01	0.06	0.06	0.08	0.08	0.10	0.04	0.07	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.07	0.16	0.07	0.11	0.20	0.06	0.21	0.07	0.16	0.13	0.18	0.23	0.15	0.09	0.17	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.05	0.12	0.05	0.07	0.19	0.05	0.20	0.09	0.15	0.10	0.15	0.21	0.12	0.05	0.12	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.10	0.03	0.05	0.11	0.02	0.11	0.02	0.08	0.07	0.10	0.12	0.11	0.03	0.08	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.14	0.10	0.09	0.11	0.11	0.05	0.14	0.04	0.05	0.16	0.14	0.22	0.11	0.13	0.09	0.12	0.20	0.13	0.10
C2	0.05	0.16	0.08	0.09	0.13	0.13	0.07	0.14	0.06	0.07	0.18	0.15	0.24	0.11	0.13	0.13	0.13	0.19	0.14	0.10
C2'	0.06	0.17	0.13	0.09	0.13	0.08	0.07	0.13	0.05	0.08	0.18	0.15	0.25	0.16	0.12	0.06	0.16	0.20	0.17	0.07
C3'	0.06	0.16	0.09	0.07	0.14	0.11	0.10	0.15	0.09	0.09	0.18	0.16	0.22	0.12	0.09	0.11	0.17	0.21	0.19	0.07
C4	0.14	0.08	0.13	0.15	0.10	0.18	0.05	0.17	0.08	0.07	0.14	0.15	0.14	0.19	0.15	0.20	0.18	0.25	0.22	0.12
C4'	0.04	0.13	0.08	0.07	0.12	0.10	0.08	0.14	0.07	0.06	0.16	0.14	0.19	0.10	0.11	0.10	0.14	0.20	0.16	0.08
C5	0.13	0.05	0.13	0.14	0.08	0.17	0.04	0.17	0.08	0.07	0.11	0.13	0.09	0.17	0.14	0.19	0.20	0.23	0.25	0.13
C5'	0.05	0.13	0.06	0.06	0.13	0.11	0.10	0.14	0.08	0.07	0.17	0.16	0.18	0.09	0.11	0.12	0.15	0.19	0.18	0.07
C6	0.09	0.08	0.09	0.11	0.08	0.15	0.03	0.16	0.06	0.04	0.12	0.12	0.13	0.13	0.12	0.16	0.18	0.21	0.22	0.12
N1	0.05	0.12	0.08	0.09	0.10	0.13	0.04	0.15	0.05	0.03	0.15	0.13	0.19	0.10	0.12	0.13	0.15	0.19	0.17	0.11
N3	0.10	0.15	0.09	0.12	0.13	0.16	0.07	0.15	0.07	0.07	0.18	0.16	0.23	0.15	0.14	0.17	0.14	0.21	0.16	0.11
N4	0.20	0.07	0.19	0.19	0.10	0.21	0.08	0.20	0.12	0.12	0.12	0.15	0.08	0.26	0.19	0.24	0.22	0.32	0.26	0.16
O2	0.09	0.20	0.11	0.09	0.15	0.12	0.10	0.14	0.09	0.11	0.20	0.16	0.28	0.13	0.14	0.11	0.10	0.19	0.10	0.11
O2'	0.11	0.20	0.19	0.15	0.15	0.09	0.08	0.12	0.07	0.12	0.20	0.16	0.28	0.23	0.17	0.05	0.19	0.23	0.19	0.13
O3'	0.09	0.17	0.12	0.09	0.15	0.12	0.12	0.17	0.11	0.11	0.18	0.17	0.23	0.16	0.11	0.12	0.20	0.24	0.23	0.07
O4'	0.03	0.11	0.09	0.09	0.09	0.11	0.04	0.14	0.05	0.03	0.14	0.12	0.17	0.10	0.14	0.11	0.13	0.19	0.15	0.10
O5'	0.06	0.14	0.06	0.05	0.15	0.11	0.11	0.14	0.09	0.08	0.18	0.19	0.17	0.08	0.09	0.13	0.16	0.19	0.20	0.08
OP1	0.14	0.24	0.08	0.06	0.26	0.14	0.21	0.16	0.18	0.18	0.29	0.31	0.25	0.05	0.08	0.17	0.11	0.19	0.17	0.12
OP2	0.13	0.15	0.18	0.17	0.13	0.18	0.08	0.20	0.09	0.11	0.18	0.16	0.20	0.20	0.19	0.16	0.26	0.24	0.29	0.14
P	0.05	0.15	0.06	0.04	0.17	0.10	0.13	0.13	0.10	0.09	0.20	0.22	0.17	0.08	0.08	0.12	0.17	0.18	0.23	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.00	0.13	0.12	0.17	0.05
C2	0.03	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.08	0.02	0.17	0.25	0.28	0.10
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.22	0.08	0.07
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.12	0.01	0.01	0.01	0.18	0.26	0.13	0.10
C4	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.05	0.03	0.21	0.31	0.38	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.08	0.03	0.02	0.01	0.03	0.10	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.23	0.24	0.37	0.15
C5'	0.03	0.08	0.01	0.01	0.10	0.01	0.10	0.00	0.07	0.05	0.09	0.12	0.10	0.03	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.22	0.17	0.29	0.09
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.17	0.18	0.24	0.07
N3	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.08	0.03	0.18	0.31	0.34	0.14
N4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.02	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.06	0.03	0.22	0.35	0.42	0.20
O2	0.06	0.00	0.12	0.12	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.10	0.13	0.05	0.15	0.25	0.25	0.08
O2'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.10	0.00	0.06	0.03	0.05	0.17	0.06	0.04
O3'	0.03	0.08	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.01	0.05	0.03	0.08	0.06	0.13	0.06	0.00	0.02	0.25	0.33	0.19	0.12
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.19	0.12	0.16	0.08
O5'	0.13	0.17	0.07	0.18	0.21	0.03	0.23	0.01	0.22	0.17	0.18	0.22	0.15	0.05	0.25	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.12	0.25	0.22	0.26	0.31	0.10	0.24	0.10	0.17	0.18	0.31	0.35	0.25	0.17	0.33	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.17	0.28	0.08	0.13	0.38	0.04	0.37	0.01	0.29	0.24	0.34	0.42	0.25	0.06	0.19	0.16	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.07	0.10	0.16	0.03	0.15	0.02	0.09	0.07	0.14	0.20	0.08	0.04	0.12	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00