Doublet Group distance statistics: 50997

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.009
O2	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.031 std_dev=0.022
N4	A	0, 0.005, 0.031, 0.057, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.031 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.017, 0.056, 0.096, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.056 std_dev=0.039
C4'	A	0, 0.029, 0.100, 0.172, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.100 std_dev=0.072
C2'	A	0, -0.007, 0.074, 0.154, 0.209 max_d=0.209 avg_d=0.074 std_dev=0.080
O2'	A	0, -0.002, 0.113, 0.228, 0.301 max_d=0.301 avg_d=0.113 std_dev=0.115
C3'	A	0, -0.018, 0.102, 0.221, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.102 std_dev=0.119
O3'	A	0, 0.013, 0.155, 0.297, 0.386 max_d=0.386 avg_d=0.155 std_dev=0.142
C5'	A	0, 0.037, 0.211, 0.385, 0.418 max_d=0.418 avg_d=0.211 std_dev=0.174
N2	B	0, 0.106, 0.331, 0.556, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.331 std_dev=0.225
C2	B	0, 0.168, 0.433, 0.699, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.433 std_dev=0.265
N3	B	0, 0.186, 0.462, 0.738, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.462 std_dev=0.276
O4'	B	0, 0.210, 0.520, 0.831, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.520 std_dev=0.311
N1	B	0, 0.208, 0.520, 0.832, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.520 std_dev=0.312
C4'	B	0, 0.221, 0.567, 0.913, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.567 std_dev=0.346
C4	B	0, 0.255, 0.613, 0.970, 0.899 max_d=0.899 avg_d=0.613 std_dev=0.357
C6	B	0, 0.273, 0.662, 1.050, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.662 std_dev=0.388
C1'	B	0, 0.290, 0.694, 1.099, 1.013 max_d=1.013 avg_d=0.694 std_dev=0.404
C5	B	0, 0.299, 0.714, 1.128, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.714 std_dev=0.415
N9	B	0, 0.303, 0.718, 1.134, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.718 std_dev=0.415
O6	B	0, 0.302, 0.733, 1.163, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.733 std_dev=0.431
C5'	B	0, 0.268, 0.727, 1.186, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.727 std_dev=0.459
O3'	B	0, 0.315, 0.776, 1.236, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.776 std_dev=0.461
C3'	B	0, 0.307, 0.772, 1.236, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.772 std_dev=0.465
C8	B	0, 0.363, 0.859, 1.355, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.859 std_dev=0.496
N7	B	0, 0.366, 0.870, 1.373, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.870 std_dev=0.503
C2'	B	0, 0.363, 0.902, 1.441, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.902 std_dev=0.539
O2'	B	0, 0.442, 1.106, 1.770, 1.748 max_d=1.748 avg_d=1.106 std_dev=0.664
OP2	B	0, 0.529, 1.345, 2.161, 2.039 max_d=2.039 avg_d=1.345 std_dev=0.816
P	B	0, 0.482, 1.307, 2.132, 2.089 max_d=2.089 avg_d=1.307 std_dev=0.825
O5'	B	0, 0.405, 1.306, 2.207, 2.152 max_d=2.152 avg_d=1.306 std_dev=0.901
OP1	B	0, 0.506, 1.427, 2.348, 2.415 max_d=2.415 avg_d=1.427 std_dev=0.921
O5'	A	0, 0.600, 1.559, 2.519, 2.398 max_d=2.398 avg_d=1.559 std_dev=0.959
P	A	0, 0.896, 2.295, 3.695, 3.445 max_d=3.445 avg_d=2.295 std_dev=1.399
OP2	A	0, 1.131, 2.726, 4.321, 3.850 max_d=3.850 avg_d=2.726 std_dev=1.595
OP1	A	0, 1.086, 2.721, 4.357, 4.012 max_d=4.012 avg_d=2.721 std_dev=1.635

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.25	0.24	0.11	0.24
C2	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.36	0.45	0.20	0.35
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.23	0.27	0.18	0.30
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.08	0.10
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.48	0.66	0.37	0.53
C4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.52	0.70	0.43	0.58
C5'	0.04	0.07	0.06	0.01	0.14	0.00	0.16	0.00	0.15	0.09	0.10	0.15	0.02	0.05	0.04	0.01	0.00	0.16	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.48	0.58	0.37	0.51
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.38	0.43	0.23	0.37
N3	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.42	0.56	0.27	0.43
N4	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.51	0.73	0.41	0.56
O2	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.28	0.35	0.12	0.26
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.08	0.00	0.04	0.02	0.21	0.32	0.19	0.33
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.00	0.08	0.04	0.00	0.04	0.08	0.06	0.16	0.06
O4'	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.04	0.00	0.17	0.07	0.16	0.11
O5'	0.25	0.36	0.23	0.04	0.48	0.01	0.52	0.00	0.48	0.38	0.42	0.51	0.28	0.21	0.08	0.17	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.24	0.45	0.27	0.07	0.66	0.08	0.70	0.16	0.58	0.43	0.56	0.73	0.35	0.32	0.06	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.11	0.20	0.18	0.08	0.37	0.06	0.43	0.07	0.37	0.23	0.27	0.41	0.12	0.19	0.16	0.16	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.24	0.35	0.30	0.10	0.53	0.02	0.58	0.01	0.51	0.37	0.43	0.56	0.26	0.33	0.06	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.09	0.10	0.09	0.09	0.13	0.09	0.27	0.09	0.09	0.09	0.08	0.09	0.09	0.09	0.08	0.08	0.07	0.18	0.09	0.32	0.17	0.11
C2	0.06	0.08	0.06	0.05	0.08	0.09	0.08	0.18	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07	0.05	0.04	0.05	0.13	0.08	0.41	0.09	0.15
C2'	0.10	0.07	0.12	0.12	0.08	0.16	0.08	0.33	0.08	0.09	0.07	0.06	0.07	0.09	0.09	0.09	0.08	0.09	0.20	0.08	0.34	0.12	0.09
C3'	0.12	0.08	0.13	0.14	0.10	0.18	0.10	0.36	0.09	0.11	0.09	0.07	0.09	0.11	0.11	0.11	0.10	0.10	0.29	0.10	0.28	0.14	0.10
C4	0.03	0.06	0.05	0.04	0.06	0.08	0.06	0.16	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.06	0.05	0.03	0.04	0.04	0.20	0.07	0.45	0.06	0.20
C4'	0.15	0.12	0.15	0.15	0.14	0.20	0.14	0.34	0.13	0.15	0.12	0.11	0.13	0.14	0.15	0.13	0.13	0.12	0.26	0.13	0.29	0.18	0.13
C5	0.05	0.06	0.06	0.06	0.06	0.11	0.06	0.21	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.06	0.05	0.04	0.05	0.05	0.14	0.07	0.43	0.10	0.17
C5'	0.14	0.09	0.15	0.16	0.12	0.19	0.11	0.32	0.10	0.13	0.09	0.09	0.11	0.12	0.13	0.15	0.15	0.10	0.26	0.09	0.29	0.18	0.12
C6	0.07	0.07	0.08	0.08	0.07	0.12	0.07	0.25	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.06	0.12	0.07	0.40	0.13	0.15
N1	0.07	0.08	0.08	0.07	0.08	0.12	0.08	0.24	0.08	0.08	0.08	0.07	0.08	0.08	0.07	0.06	0.06	0.06	0.10	0.08	0.38	0.13	0.13
N3	0.03	0.07	0.04	0.03	0.06	0.07	0.07	0.14	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.07	0.05	0.02	0.03	0.04	0.21	0.07	0.44	0.05	0.19
N4	0.03	0.06	0.04	0.03	0.06	0.07	0.07	0.13	0.07	0.06	0.07	0.06	0.05	0.07	0.05	0.02	0.03	0.04	0.27	0.08	0.47	0.06	0.23
O2	0.07	0.09	0.06	0.05	0.09	0.09	0.09	0.16	0.09	0.08	0.09	0.07	0.09	0.09	0.08	0.05	0.03	0.05	0.13	0.09	0.39	0.09	0.13
O2'	0.13	0.07	0.17	0.17	0.10	0.19	0.11	0.37	0.10	0.12	0.08	0.06	0.09	0.12	0.12	0.14	0.12	0.13	0.17	0.10	0.39	0.09	0.11
O3'	0.13	0.09	0.15	0.15	0.11	0.19	0.11	0.37	0.10	0.12	0.09	0.07	0.09	0.12	0.12	0.12	0.11	0.12	0.34	0.11	0.26	0.15	0.13
O4'	0.11	0.11	0.10	0.09	0.11	0.11	0.11	0.24	0.10	0.11	0.10	0.10	0.11	0.11	0.11	0.13	0.12	0.07	0.23	0.10	0.25	0.22	0.13
O5'	0.17	0.36	0.12	0.10	0.27	0.12	0.28	0.24	0.33	0.21	0.36	0.40	0.30	0.24	0.21	0.13	0.09	0.16	0.36	0.34	0.27	0.22	0.18
OP1	0.24	0.50	0.16	0.11	0.39	0.15	0.42	0.23	0.48	0.31	0.52	0.55	0.42	0.37	0.31	0.17	0.09	0.24	0.42	0.51	0.32	0.30	0.27
OP2	0.21	0.28	0.22	0.24	0.22	0.23	0.23	0.32	0.26	0.21	0.29	0.33	0.24	0.22	0.21	0.23	0.26	0.15	0.25	0.27	0.21	0.11	0.08
P	0.14	0.36	0.09	0.07	0.26	0.09	0.27	0.19	0.33	0.18	0.37	0.41	0.29	0.23	0.19	0.09	0.08	0.15	0.42	0.34	0.20	0.25	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.39	0.01	0.37	0.05	0.21
C2	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.46	0.01	0.45	0.10	0.28
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.37	0.02	0.34	0.06	0.22
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.25	0.13	0.04
C4	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.52	0.01	0.43	0.12	0.29
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.29	0.18	0.01
C5	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.03	0.60	0.01	0.44	0.17	0.34
C5'	0.08	0.07	0.07	0.01	0.12	0.00	0.15	0.00	0.13	0.19	0.10	0.05	0.07	0.18	0.14	0.06	0.03	0.03	0.00	0.13	0.41	0.23	0.01
C6	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.61	0.00	0.47	0.18	0.36
C8	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01	0.58	0.01	0.39	0.18	0.32
N1	0.00	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.55	0.01	0.47	0.15	0.33
N2	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.39	0.01	0.44	0.09	0.25
N3	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.44	0.01	0.43	0.08	0.25
N7	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.02	0.62	0.01	0.42	0.20	0.36
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.52	0.01	0.40	0.12	0.28
O2'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.00	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.33	0.02	0.31	0.10	0.22
O3'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.18	0.14	0.02
O4'	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.30	0.04	0.38	0.05	0.17
O5'	0.39	0.46	0.37	0.05	0.52	0.01	0.60	0.00	0.61	0.58	0.55	0.39	0.44	0.62	0.52	0.33	0.06	0.30	0.00	0.65	0.03	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.65	0.00	0.48	0.22	0.40
OP1	0.37	0.45	0.34	0.25	0.43	0.29	0.44	0.41	0.47	0.39	0.47	0.44	0.43	0.42	0.40	0.31	0.18	0.38	0.03	0.48	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.10	0.06	0.13	0.12	0.18	0.17	0.23	0.18	0.18	0.15	0.09	0.08	0.20	0.12	0.10	0.14	0.05	0.01	0.22	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.28	0.22	0.04	0.29	0.01	0.34	0.01	0.36	0.32	0.33	0.25	0.25	0.36	0.28	0.22	0.02	0.17	0.01	0.40	0.00	0.00	0.00