Doublet Group distance statistics: 50999

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 5, 7, 17, 15, 13, 7, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.016, 0.027, 0.037, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.027 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.012, 0.024, 0.037, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.024 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.030 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.028, 0.047, 0.065, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.047 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.017, 0.037, 0.057, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.037 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.008, 0.032, 0.056, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.032 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.023, 0.051, 0.079, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.051 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.028, 0.062, 0.096, 0.178 max_d=0.178 avg_d=0.062 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.043, 0.149, 0.256, 0.557 max_d=0.557 avg_d=0.149 std_dev=0.107
C2'	A	0, 0.059, 0.182, 0.304, 0.639 max_d=0.639 avg_d=0.182 std_dev=0.122
N1	B	0, 0.233, 0.384, 0.535, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.384 std_dev=0.151
C2	B	0, 0.178, 0.339, 0.500, 0.785 max_d=0.785 avg_d=0.339 std_dev=0.161
C2'	B	0, 0.290, 0.481, 0.673, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.481 std_dev=0.191
C4'	A	0, 0.052, 0.251, 0.449, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.251 std_dev=0.198
C1'	B	0, 0.333, 0.532, 0.731, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.532 std_dev=0.199
N3	B	0, 0.255, 0.456, 0.657, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.456 std_dev=0.201
P	A	0, 0.328, 0.541, 0.754, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.541 std_dev=0.213
C6	B	0, 0.343, 0.564, 0.786, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.564 std_dev=0.221
C5'	A	0, 0.158, 0.380, 0.602, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.380 std_dev=0.222
O2	B	0, 0.300, 0.532, 0.763, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.532 std_dev=0.231
O5'	A	0, 0.131, 0.371, 0.610, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.371 std_dev=0.239
C3'	B	0, 0.348, 0.592, 0.837, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.592 std_dev=0.244
O2'	B	0, 0.298, 0.556, 0.814, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.556 std_dev=0.258
C3'	A	0, 0.032, 0.295, 0.558, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.295 std_dev=0.263
C4	B	0, 0.266, 0.530, 0.793, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.530 std_dev=0.263
O2'	A	0, 0.050, 0.321, 0.592, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.321 std_dev=0.271
C5	B	0, 0.326, 0.597, 0.869, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.597 std_dev=0.272
O3'	B	0, 0.327, 0.606, 0.885, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.606 std_dev=0.279
OP1	A	0, 0.270, 0.549, 0.828, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.549 std_dev=0.279
OP2	A	0, 0.476, 0.769, 1.061, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.769 std_dev=0.292
O4'	B	0, 0.451, 0.753, 1.055, 1.454 max_d=1.454 avg_d=0.753 std_dev=0.302
C4'	B	0, 0.460, 0.787, 1.114, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.787 std_dev=0.327
O4	B	0, 0.360, 0.739, 1.118, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.739 std_dev=0.379
C5'	B	0, 0.576, 0.998, 1.420, 1.959 max_d=1.959 avg_d=0.998 std_dev=0.422
O3'	A	0, 0.043, 0.522, 1.001, 2.758 max_d=2.758 avg_d=0.522 std_dev=0.479
O5'	B	0, 0.639, 1.185, 1.731, 2.900 max_d=2.900 avg_d=1.185 std_dev=0.546
P	B	0, 0.996, 1.782, 2.567, 4.518 max_d=4.518 avg_d=1.782 std_dev=0.786
OP1	B	0, 1.148, 2.083, 3.017, 5.260 max_d=5.260 avg_d=2.083 std_dev=0.934
OP2	B	0, 0.950, 1.933, 2.915, 5.788 max_d=5.788 avg_d=1.933 std_dev=0.982

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.02	0.13	0.01	0.10	0.02	0.10	0.17	0.12
C2	0.03	0.00	0.13	0.12	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.20	0.05	0.12	0.02	0.14	0.25	0.17
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.09	0.09	0.07	0.11	0.16	0.13	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.17	0.10	0.23	0.27	0.20
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.11	0.00	0.16	0.02	0.16	0.18	0.14	0.13	0.10	0.19	0.11	0.02	0.01	0.01	0.09	0.18	0.15	0.16	0.10
C4	0.01	0.01	0.08	0.11	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.11	0.03	0.12	0.01	0.14	0.23	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.10	0.03	0.05	0.04	0.10	0.04	0.14	0.02	0.00	0.02	0.07	0.07	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.16	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.12	0.04	0.16	0.01	0.20	0.28	0.21
C5'	0.04	0.06	0.09	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.13	0.08	0.05	0.05	0.14	0.07	0.07	0.10	0.01	0.01	0.13	0.06	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.20	0.14	0.04	0.17	0.01	0.22	0.30	0.23
C8	0.02	0.01	0.07	0.18	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.15	0.05	0.16	0.02	0.18	0.23	0.18
N1	0.03	0.01	0.11	0.14	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.16	0.05	0.14	0.01	0.18	0.28	0.20
N2	0.04	0.01	0.16	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.25	0.06	0.11	0.02	0.13	0.24	0.16
N3	0.03	0.01	0.13	0.10	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.19	0.05	0.11	0.02	0.12	0.22	0.14
N7	0.02	0.01	0.07	0.19	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.17	0.04	0.18	0.02	0.23	0.29	0.23
N9	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.07	0.01	0.11	0.02	0.12	0.20	0.14
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.14	0.14	0.17	0.07	0.20	0.13	0.20	0.20	0.16	0.17	0.10	0.00	0.05	0.10	0.11	0.21	0.19	0.29	0.16
O3'	0.13	0.20	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.10	0.14	0.15	0.16	0.25	0.19	0.17	0.07	0.05	0.00	0.09	0.17	0.17	0.30	0.28	0.22
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.06	0.05	0.04	0.01	0.10	0.09	0.00	0.08	0.05	0.09	0.14	0.13
O5'	0.10	0.12	0.17	0.09	0.12	0.02	0.16	0.01	0.17	0.16	0.14	0.11	0.11	0.18	0.11	0.11	0.17	0.08	0.00	0.19	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.10	0.18	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.21	0.17	0.05	0.19	0.00	0.25	0.33	0.26
OP1	0.10	0.14	0.23	0.15	0.14	0.07	0.20	0.06	0.22	0.18	0.18	0.13	0.12	0.23	0.12	0.19	0.30	0.09	0.01	0.25	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.25	0.27	0.16	0.23	0.06	0.28	0.04	0.30	0.23	0.28	0.24	0.22	0.29	0.20	0.29	0.28	0.14	0.02	0.33	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.17	0.20	0.10	0.16	0.03	0.21	0.01	0.23	0.18	0.20	0.16	0.14	0.23	0.14	0.16	0.22	0.13	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.15	0.17	0.19	0.18	0.18	0.21	0.21	0.18	0.12	0.16	0.26	0.22	0.21	0.22	0.15	0.38	0.38	0.48	0.39
C2	0.19	0.19	0.18	0.20	0.33	0.23	0.38	0.30	0.31	0.22	0.22	0.25	0.20	0.18	0.38	0.22	0.61	0.74	0.94	0.74
C2'	0.11	0.14	0.14	0.17	0.17	0.15	0.21	0.20	0.18	0.11	0.15	0.26	0.19	0.18	0.22	0.13	0.41	0.42	0.51	0.41
C3'	0.10	0.15	0.09	0.10	0.19	0.09	0.23	0.14	0.20	0.12	0.16	0.26	0.15	0.10	0.22	0.08	0.35	0.37	0.38	0.32
C4	0.16	0.16	0.16	0.19	0.21	0.20	0.28	0.26	0.25	0.16	0.15	0.26	0.18	0.18	0.24	0.18	0.56	0.64	0.79	0.64
C4'	0.12	0.19	0.10	0.11	0.18	0.09	0.20	0.13	0.18	0.14	0.19	0.29	0.17	0.15	0.20	0.09	0.27	0.26	0.28	0.22
C5	0.18	0.17	0.17	0.22	0.17	0.25	0.29	0.33	0.27	0.17	0.16	0.25	0.17	0.20	0.20	0.23	0.65	0.78	0.92	0.77
C5'	0.21	0.25	0.20	0.11	0.22	0.10	0.24	0.10	0.23	0.21	0.23	0.32	0.25	0.11	0.23	0.15	0.23	0.26	0.23	0.17
C6	0.21	0.18	0.19	0.25	0.21	0.29	0.35	0.39	0.32	0.22	0.17	0.24	0.18	0.23	0.21	0.28	0.73	0.91	1.08	0.89
C8	0.13	0.17	0.15	0.18	0.16	0.19	0.21	0.25	0.19	0.11	0.17	0.26	0.15	0.18	0.20	0.16	0.53	0.57	0.65	0.57
N1	0.21	0.19	0.19	0.23	0.30	0.27	0.39	0.36	0.34	0.23	0.19	0.24	0.19	0.21	0.33	0.27	0.69	0.87	1.06	0.86
N2	0.19	0.20	0.18	0.20	0.37	0.22	0.40	0.30	0.32	0.22	0.24	0.24	0.22	0.18	0.45	0.22	0.60	0.74	0.95	0.74
N3	0.17	0.18	0.17	0.19	0.29	0.19	0.32	0.26	0.27	0.18	0.20	0.25	0.21	0.18	0.34	0.19	0.54	0.62	0.81	0.63
N7	0.16	0.17	0.17	0.22	0.17	0.25	0.23	0.32	0.22	0.14	0.19	0.24	0.16	0.22	0.23	0.22	0.64	0.75	0.85	0.74
N9	0.13	0.15	0.16	0.18	0.17	0.18	0.22	0.23	0.20	0.12	0.14	0.26	0.18	0.18	0.20	0.15	0.48	0.51	0.63	0.52
O2'	0.16	0.19	0.16	0.16	0.22	0.15	0.23	0.18	0.19	0.15	0.20	0.29	0.24	0.17	0.26	0.15	0.36	0.38	0.49	0.37
O3'	0.12	0.21	0.10	0.11	0.20	0.10	0.22	0.16	0.19	0.14	0.21	0.33	0.17	0.16	0.24	0.09	0.33	0.41	0.35	0.31
O4'	0.11	0.17	0.14	0.19	0.18	0.17	0.18	0.19	0.16	0.11	0.19	0.27	0.19	0.24	0.21	0.12	0.31	0.29	0.34	0.28
O5'	0.20	0.24	0.22	0.09	0.22	0.08	0.25	0.07	0.24	0.21	0.23	0.31	0.26	0.02	0.23	0.14	0.30	0.29	0.28	0.24
O6	0.24	0.18	0.21	0.28	0.18	0.35	0.34	0.45	0.34	0.23	0.19	0.23	0.20	0.27	0.20	0.33	0.80	1.05	1.21	1.01
OP1	0.08	0.14	0.13	0.02	0.17	0.07	0.21	0.17	0.18	0.09	0.14	0.22	0.21	0.02	0.19	0.05	0.23	0.39	0.45	0.27
OP2	0.09	0.16	0.06	0.08	0.27	0.15	0.32	0.25	0.28	0.16	0.20	0.18	0.09	0.02	0.30	0.14	0.39	0.47	0.40	0.37
P	0.06	0.12	0.10	0.01	0.18	0.05	0.22	0.13	0.20	0.10	0.14	0.19	0.15	0.01	0.20	0.02	0.26	0.30	0.31	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.13	0.21	0.23	0.15
C2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02	0.03	0.26	0.37	0.51	0.33
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.05	0.13	0.00	0.02	0.05	0.01	0.15	0.13	0.16	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.13	0.02	0.13	0.05	0.07	0.12	0.02	0.01	0.10	0.01	0.19	0.13	0.13	0.13
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.01	0.03	0.38	0.59	0.78	0.53
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.03	0.04	0.06	0.05	0.02	0.07	0.00	0.02	0.13	0.13	0.05
C5	0.02	0.02	0.06	0.13	0.00	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.01	0.05	0.41	0.61	0.77	0.55
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.12	0.01	0.14	0.00	0.11	0.06	0.08	0.06	0.05	0.03	0.13	0.01	0.01	0.13	0.22	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.14	0.01	0.04	0.36	0.48	0.59	0.44
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.26	0.35	0.45	0.31
N3	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.08	0.01	0.02	0.32	0.48	0.66	0.43
O2	0.04	0.01	0.13	0.12	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.02	0.00	0.13	0.14	0.03	0.05	0.20	0.31	0.42	0.25
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.07	0.13	0.00	0.05	0.05	0.04	0.04	0.24	0.09	0.08
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.11	0.02	0.15	0.03	0.14	0.05	0.08	0.14	0.05	0.00	0.13	0.02	0.15	0.23	0.22	0.12
O4	0.02	0.02	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.13	0.00	0.04	0.40	0.66	0.86	0.59
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.04	0.02	0.04	0.00	0.09	0.21	0.17	0.12
O5'	0.13	0.26	0.15	0.19	0.38	0.02	0.41	0.01	0.36	0.26	0.32	0.20	0.04	0.15	0.40	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.21	0.37	0.13	0.13	0.59	0.13	0.61	0.13	0.48	0.35	0.48	0.31	0.24	0.23	0.66	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.51	0.16	0.13	0.78	0.13	0.77	0.22	0.59	0.45	0.66	0.42	0.09	0.22	0.86	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.33	0.11	0.13	0.53	0.05	0.55	0.02	0.44	0.31	0.43	0.25	0.08	0.12	0.59	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00