Doublet Group distance statistics: 51000

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 13, 10, 8, 12, 13, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.013, 0.028, 0.044, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.029 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.015, 0.031, 0.048, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.031 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.008, 0.027, 0.045, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.016, 0.038, 0.059, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.038 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.020, 0.045, 0.069, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.045 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.022, 0.049, 0.077, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.049 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.008, 0.039, 0.069, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.039 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.022, 0.054, 0.085, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.054 std_dev=0.032
C8	A	0, 0.027, 0.068, 0.108, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.068 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.052, 0.141, 0.230, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.141 std_dev=0.089
C2'	A	0, 0.129, 0.223, 0.316, 0.448 max_d=0.448 avg_d=0.223 std_dev=0.093
C4'	A	0, 0.176, 0.310, 0.444, 0.612 max_d=0.612 avg_d=0.310 std_dev=0.134
C3'	A	0, 0.296, 0.456, 0.615, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.456 std_dev=0.159
O2'	A	0, 0.230, 0.391, 0.552, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.391 std_dev=0.161
C4	B	0, 0.224, 0.407, 0.590, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.407 std_dev=0.183
O5'	A	0, 0.204, 0.395, 0.586, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.395 std_dev=0.191
O4	B	0, 0.302, 0.496, 0.691, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.496 std_dev=0.194
C5'	A	0, 0.177, 0.382, 0.586, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.382 std_dev=0.204
N3	B	0, 0.328, 0.537, 0.746, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.537 std_dev=0.209
C5	B	0, 0.333, 0.547, 0.761, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.547 std_dev=0.214
C6	B	0, 0.389, 0.623, 0.857, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.623 std_dev=0.234
C2	B	0, 0.287, 0.521, 0.756, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.521 std_dev=0.234
N1	B	0, 0.238, 0.476, 0.714, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.476 std_dev=0.238
O3'	A	0, 0.550, 0.820, 1.090, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.820 std_dev=0.270
C1'	B	0, 0.309, 0.590, 0.871, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.590 std_dev=0.281
C2'	B	0, 0.353, 0.649, 0.946, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.649 std_dev=0.296
C3'	B	0, 0.342, 0.656, 0.969, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.656 std_dev=0.313
P	A	0, 0.297, 0.616, 0.935, 1.507 max_d=1.507 avg_d=0.616 std_dev=0.319
O2	B	0, 0.403, 0.725, 1.048, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.725 std_dev=0.323
O4'	B	0, 0.266, 0.600, 0.933, 1.406 max_d=1.406 avg_d=0.600 std_dev=0.333
C4'	B	0, 0.329, 0.686, 1.044, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.686 std_dev=0.358
OP2	A	0, 0.478, 0.837, 1.196, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.837 std_dev=0.359
O3'	B	0, 0.401, 0.765, 1.130, 1.646 max_d=1.646 avg_d=0.765 std_dev=0.365
O2'	B	0, 0.464, 0.831, 1.199, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.831 std_dev=0.368
C5'	B	0, 0.353, 0.730, 1.108, 1.764 max_d=1.764 avg_d=0.730 std_dev=0.377
OP1	A	0, 0.353, 0.740, 1.127, 1.823 max_d=1.823 avg_d=0.740 std_dev=0.387
O5'	B	0, 0.275, 0.752, 1.229, 2.308 max_d=2.308 avg_d=0.752 std_dev=0.477
P	B	0, 0.441, 0.940, 1.439, 2.412 max_d=2.412 avg_d=0.940 std_dev=0.499
OP2	B	0, 0.445, 1.047, 1.649, 2.369 max_d=2.369 avg_d=1.047 std_dev=0.602
OP1	B	0, 0.310, 1.291, 2.272, 4.008 max_d=4.008 avg_d=1.291 std_dev=0.981

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.03	0.09	0.13	0.10
C2	0.04	0.00	0.12	0.12	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.15	0.06	0.13	0.02	0.13	0.20	0.14
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.08	0.02	0.08	0.02	0.10	0.06	0.12	0.14	0.11	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.11	0.10	0.11	0.08
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.10	0.01	0.12	0.02	0.14	0.12	0.14	0.13	0.11	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.12	0.16	0.15	0.13	0.11
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.04	0.13	0.02	0.13	0.18	0.14
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.04	0.06	0.04	0.07	0.04	0.06	0.03	0.01	0.02	0.07	0.08	0.07	0.04
C5	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.04	0.17	0.02	0.17	0.22	0.17
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.13	0.09	0.07	0.06	0.14	0.07	0.06	0.04	0.02	0.01	0.13	0.10	0.10	0.02
C6	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.18	0.05	0.18	0.01	0.19	0.24	0.19
C8	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.17	0.03	0.16	0.18	0.16
N1	0.04	0.01	0.12	0.14	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.12	0.17	0.06	0.15	0.01	0.16	0.23	0.17
N2	0.05	0.01	0.14	0.13	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.17	0.08	0.12	0.03	0.12	0.19	0.13
N3	0.04	0.01	0.11	0.11	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.06	0.11	0.02	0.11	0.18	0.12
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.17	0.04	0.19	0.03	0.19	0.23	0.20
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.12	0.03	0.12	0.16	0.13
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.09	0.04	0.12	0.17	0.12	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.09	0.11	0.08	0.06
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.11	0.03	0.16	0.04	0.18	0.14	0.17	0.17	0.12	0.17	0.08	0.05	0.00	0.02	0.14	0.21	0.21	0.21	0.15
O4'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.08	0.06	0.04	0.02	0.04	0.02	0.00	0.09	0.05	0.13	0.16	0.15
O5'	0.07	0.13	0.08	0.12	0.13	0.02	0.17	0.01	0.18	0.17	0.15	0.12	0.11	0.19	0.12	0.06	0.14	0.09	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.11	0.16	0.02	0.07	0.02	0.13	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.09	0.21	0.05	0.20	0.00	0.22	0.27	0.22
OP1	0.09	0.13	0.10	0.15	0.13	0.08	0.17	0.10	0.19	0.16	0.16	0.12	0.11	0.19	0.12	0.11	0.21	0.13	0.02	0.22	0.00	0.02	0.01
OP2	0.13	0.20	0.11	0.13	0.18	0.07	0.22	0.10	0.24	0.18	0.23	0.19	0.18	0.23	0.16	0.08	0.21	0.16	0.02	0.27	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.14	0.08	0.11	0.14	0.04	0.17	0.02	0.19	0.16	0.17	0.13	0.12	0.20	0.13	0.06	0.15	0.15	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.25	0.22	0.19	0.22	0.18	0.21	0.20	0.18	0.15	0.27	0.39	0.34	0.23	0.28	0.17	0.32	0.37	0.44	0.28
C2	0.25	0.25	0.26	0.19	0.18	0.20	0.25	0.23	0.24	0.23	0.21	0.32	0.33	0.18	0.23	0.22	0.45	0.66	0.60	0.42
C2'	0.18	0.25	0.19	0.15	0.21	0.14	0.21	0.17	0.17	0.14	0.26	0.40	0.32	0.18	0.28	0.14	0.33	0.40	0.46	0.31
C3'	0.16	0.26	0.18	0.12	0.21	0.12	0.21	0.17	0.17	0.13	0.26	0.40	0.31	0.15	0.28	0.11	0.31	0.43	0.42	0.32
C4	0.22	0.23	0.25	0.18	0.16	0.17	0.21	0.20	0.20	0.18	0.22	0.33	0.32	0.18	0.25	0.18	0.42	0.51	0.55	0.36
C4'	0.17	0.30	0.17	0.13	0.24	0.13	0.20	0.16	0.16	0.17	0.30	0.43	0.30	0.17	0.29	0.13	0.24	0.32	0.32	0.23
C5	0.22	0.22	0.26	0.19	0.13	0.18	0.20	0.22	0.21	0.18	0.22	0.30	0.30	0.18	0.22	0.18	0.47	0.55	0.59	0.41
C5'	0.25	0.33	0.26	0.16	0.26	0.16	0.22	0.16	0.19	0.23	0.32	0.45	0.37	0.16	0.29	0.20	0.22	0.34	0.25	0.21
C6	0.23	0.23	0.26	0.21	0.13	0.21	0.22	0.26	0.24	0.21	0.21	0.28	0.29	0.19	0.16	0.21	0.50	0.67	0.64	0.47
C8	0.20	0.26	0.26	0.18	0.22	0.16	0.22	0.19	0.20	0.17	0.27	0.35	0.31	0.18	0.27	0.15	0.41	0.41	0.51	0.35
N1	0.25	0.24	0.26	0.20	0.16	0.21	0.25	0.25	0.25	0.23	0.21	0.30	0.31	0.18	0.16	0.22	0.49	0.71	0.64	0.47
N2	0.27	0.26	0.26	0.20	0.23	0.22	0.27	0.24	0.26	0.25	0.23	0.33	0.34	0.19	0.27	0.24	0.44	0.71	0.61	0.43
N3	0.24	0.24	0.26	0.19	0.18	0.19	0.23	0.21	0.22	0.21	0.20	0.33	0.34	0.19	0.26	0.21	0.41	0.56	0.56	0.37
N7	0.21	0.24	0.27	0.20	0.20	0.18	0.21	0.22	0.21	0.18	0.25	0.31	0.30	0.19	0.26	0.17	0.46	0.47	0.56	0.40
N9	0.21	0.25	0.25	0.17	0.20	0.16	0.21	0.18	0.19	0.16	0.26	0.36	0.33	0.19	0.27	0.16	0.38	0.42	0.50	0.32
O2'	0.21	0.27	0.21	0.17	0.22	0.17	0.21	0.18	0.18	0.17	0.27	0.41	0.34	0.20	0.28	0.18	0.31	0.38	0.44	0.29
O3'	0.17	0.26	0.18	0.12	0.21	0.13	0.21	0.17	0.17	0.14	0.26	0.42	0.31	0.15	0.27	0.13	0.30	0.48	0.43	0.33
O4'	0.15	0.28	0.17	0.20	0.25	0.17	0.21	0.20	0.17	0.14	0.30	0.42	0.31	0.26	0.29	0.14	0.27	0.33	0.37	0.24
O5'	0.20	0.27	0.23	0.08	0.24	0.06	0.23	0.11	0.22	0.20	0.27	0.36	0.31	0.03	0.27	0.12	0.30	0.44	0.29	0.28
O6	0.24	0.23	0.27	0.23	0.17	0.24	0.23	0.30	0.26	0.23	0.23	0.26	0.29	0.22	0.19	0.24	0.54	0.73	0.67	0.53
OP1	0.06	0.16	0.11	0.02	0.17	0.10	0.17	0.22	0.14	0.07	0.18	0.24	0.19	0.03	0.20	0.06	0.23	0.58	0.34	0.29
OP2	0.10	0.23	0.08	0.08	0.27	0.19	0.26	0.30	0.22	0.16	0.27	0.27	0.10	0.02	0.30	0.17	0.35	0.61	0.39	0.37
P	0.05	0.17	0.10	0.02	0.18	0.08	0.18	0.18	0.15	0.08	0.19	0.24	0.16	0.01	0.21	0.04	0.25	0.50	0.27	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.01	0.12	0.41	0.25	0.11
C2	0.02	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.01	0.03	0.24	0.57	0.42	0.20
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.08	0.15	0.00	0.02	0.06	0.01	0.16	0.26	0.20	0.12
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.10	0.15	0.02	0.01	0.10	0.01	0.20	0.24	0.13	0.14
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.03	0.34	0.69	0.61	0.28
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.06	0.02	0.06	0.00	0.02	0.15	0.22	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.04	0.36	0.68	0.60	0.29
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.11	0.07	0.09	0.07	0.06	0.04	0.12	0.02	0.01	0.15	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.11	0.01	0.04	0.32	0.61	0.47	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.02	0.02	0.23	0.54	0.37	0.18
N3	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.12	0.01	0.03	0.29	0.64	0.53	0.24
O2	0.04	0.01	0.15	0.15	0.01	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.13	0.18	0.02	0.05	0.20	0.53	0.37	0.17
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.08	0.13	0.00	0.04	0.06	0.05	0.07	0.21	0.16	0.07
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.04	0.11	0.05	0.12	0.18	0.04	0.00	0.13	0.02	0.17	0.35	0.15	0.16
O4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.13	0.00	0.04	0.36	0.71	0.67	0.31
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.04	0.00	0.08	0.40	0.26	0.13
O5'	0.12	0.24	0.16	0.20	0.34	0.02	0.36	0.01	0.32	0.23	0.29	0.20	0.07	0.17	0.36	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.41	0.57	0.26	0.24	0.69	0.15	0.68	0.15	0.61	0.54	0.64	0.53	0.21	0.35	0.71	0.40	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.42	0.20	0.13	0.61	0.22	0.60	0.30	0.47	0.37	0.53	0.37	0.16	0.15	0.67	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.20	0.12	0.14	0.28	0.04	0.29	0.02	0.23	0.18	0.24	0.17	0.07	0.16	0.31	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00