Doublet Group distance statistics: 51001

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 1, 3, 6, 14, 21, 8, 1, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.031, 0.045, 0.059, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.045 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.041, 0.057, 0.072, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.057 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.030, 0.050, 0.071, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.050 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.039, 0.060, 0.082, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.060 std_dev=0.021
C5	A	0, 0.019, 0.042, 0.065, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.042 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.088, 0.117, 0.145, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.117 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.036, 0.070, 0.105, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.070 std_dev=0.034
N9	A	0, 0.050, 0.086, 0.122, 0.160 max_d=0.160 avg_d=0.086 std_dev=0.036
O6	A	0, 0.035, 0.078, 0.120, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.078 std_dev=0.043
N7	A	0, 0.045, 0.094, 0.144, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.094 std_dev=0.049
C8	A	0, 0.067, 0.132, 0.197, 0.268 max_d=0.268 avg_d=0.132 std_dev=0.065
N1	B	0, 0.249, 0.443, 0.637, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.443 std_dev=0.194
C6	B	0, 0.323, 0.517, 0.712, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.517 std_dev=0.194
C5	B	0, 0.380, 0.611, 0.842, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.611 std_dev=0.231
O4'	A	0, -0.008, 0.237, 0.482, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.237 std_dev=0.245
C2'	A	0, 0.165, 0.428, 0.691, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.428 std_dev=0.263
C4	B	0, 0.310, 0.581, 0.852, 1.487 max_d=1.487 avg_d=0.581 std_dev=0.271
C1'	B	0, 0.197, 0.468, 0.739, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.468 std_dev=0.271
C2	B	0, 0.326, 0.600, 0.874, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.600 std_dev=0.274
N3	B	0, 0.333, 0.622, 0.911, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.622 std_dev=0.289
O4'	B	0, 0.160, 0.480, 0.800, 1.997 max_d=1.997 avg_d=0.480 std_dev=0.320
C2'	B	0, 0.128, 0.455, 0.782, 2.214 max_d=2.214 avg_d=0.455 std_dev=0.327
O4	B	0, 0.313, 0.684, 1.056, 2.283 max_d=2.283 avg_d=0.684 std_dev=0.371
C4'	A	0, 0.017, 0.398, 0.778, 1.876 max_d=1.876 avg_d=0.398 std_dev=0.381
C3'	B	0, 0.084, 0.465, 0.846, 2.623 max_d=2.623 avg_d=0.465 std_dev=0.381
C3'	A	0, 0.187, 0.572, 0.956, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.572 std_dev=0.385
O2	B	0, 0.429, 0.823, 1.217, 2.193 max_d=2.193 avg_d=0.823 std_dev=0.394
C4'	B	0, 0.096, 0.515, 0.934, 2.754 max_d=2.754 avg_d=0.515 std_dev=0.419
O5'	A	0, 0.069, 0.491, 0.913, 2.769 max_d=2.769 avg_d=0.491 std_dev=0.422
O5'	B	0, 0.205, 0.634, 1.063, 2.771 max_d=2.771 avg_d=0.634 std_dev=0.429
O2'	B	0, 0.173, 0.611, 1.050, 3.137 max_d=3.137 avg_d=0.611 std_dev=0.438
C5'	A	0, 0.042, 0.490, 0.938, 2.810 max_d=2.810 avg_d=0.490 std_dev=0.448
C5'	B	0, 0.131, 0.604, 1.078, 3.038 max_d=3.038 avg_d=0.604 std_dev=0.473
O3'	B	0, 0.052, 0.555, 1.058, 3.517 max_d=3.517 avg_d=0.555 std_dev=0.503
P	A	0, 0.043, 0.579, 1.115, 3.685 max_d=3.685 avg_d=0.579 std_dev=0.536
P	B	0, 0.214, 0.812, 1.411, 3.407 max_d=3.407 avg_d=0.812 std_dev=0.599
OP2	A	0, 0.117, 0.730, 1.342, 3.791 max_d=3.791 avg_d=0.730 std_dev=0.612
O2'	A	0, 0.212, 0.836, 1.459, 2.752 max_d=2.752 avg_d=0.836 std_dev=0.623
OP1	A	0, 0.042, 0.792, 1.543, 4.786 max_d=4.786 avg_d=0.792 std_dev=0.751
O3'	A	0, 0.177, 0.964, 1.751, 2.587 max_d=2.587 avg_d=0.964 std_dev=0.787
OP1	B	0, 0.535, 1.334, 2.132, 4.345 max_d=4.345 avg_d=1.334 std_dev=0.799
OP2	B	0, 0.519, 1.320, 2.120, 3.554 max_d=3.554 avg_d=1.320 std_dev=0.800

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.32	0.00	0.28	0.02	0.27	0.38	0.26
C2	0.03	0.00	0.20	0.15	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.35	0.12	0.32	0.01	0.37	0.50	0.33
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.02	0.07	0.20	0.11	0.10	0.16	0.23	0.19	0.07	0.03	0.00	0.04	0.02	0.45	0.10	0.51	0.59	0.48
C3'	0.02	0.15	0.00	0.00	0.20	0.00	0.30	0.02	0.31	0.34	0.23	0.12	0.12	0.37	0.21	0.02	0.01	0.02	0.16	0.35	0.22	0.13	0.13
C4	0.01	0.01	0.11	0.20	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.20	0.06	0.33	0.01	0.38	0.49	0.34
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.09	0.18	0.05	0.11	0.07	0.17	0.08	0.27	0.02	0.00	0.01	0.11	0.11	0.14	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.30	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.30	0.11	0.04	0.36	0.01	0.47	0.56	0.40
C5'	0.09	0.11	0.20	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.16	0.21	0.12	0.14	0.11	0.22	0.11	0.09	0.21	0.02	0.01	0.19	0.19	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.31	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.30	0.13	0.05	0.37	0.00	0.49	0.59	0.41
C8	0.01	0.01	0.10	0.34	0.00	0.18	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.31	0.18	0.10	0.38	0.01	0.46	0.53	0.40
N1	0.02	0.00	0.16	0.23	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.22	0.09	0.34	0.01	0.43	0.55	0.37
N2	0.04	0.01	0.23	0.12	0.01	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.47	0.15	0.31	0.02	0.34	0.48	0.31
N3	0.03	0.00	0.19	0.12	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.39	0.12	0.31	0.01	0.34	0.46	0.30
N7	0.01	0.01	0.07	0.37	0.00	0.17	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.35	0.21	0.07	0.40	0.01	0.52	0.60	0.45
N9	0.00	0.01	0.03	0.21	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.20	0.12	0.02	0.32	0.01	0.35	0.45	0.32
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.20	0.27	0.30	0.09	0.30	0.31	0.23	0.13	0.12	0.35	0.20	0.00	0.07	0.18	0.30	0.34	0.37	0.62	0.37
O3'	0.32	0.35	0.04	0.01	0.20	0.02	0.11	0.21	0.13	0.18	0.22	0.47	0.39	0.21	0.12	0.07	0.00	0.22	0.29	0.15	0.44	0.35	0.34
O4'	0.00	0.12	0.02	0.02	0.06	0.00	0.04	0.02	0.05	0.10	0.09	0.15	0.12	0.07	0.02	0.18	0.22	0.00	0.15	0.05	0.14	0.20	0.12
O5'	0.28	0.32	0.45	0.16	0.33	0.01	0.36	0.01	0.37	0.38	0.34	0.31	0.31	0.40	0.32	0.30	0.29	0.15	0.00	0.39	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.10	0.35	0.01	0.11	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.34	0.15	0.05	0.39	0.00	0.54	0.63	0.45
OP1	0.27	0.37	0.51	0.22	0.38	0.11	0.47	0.19	0.49	0.46	0.43	0.34	0.34	0.52	0.35	0.37	0.44	0.14	0.02	0.54	0.00	0.01	0.01
OP2	0.38	0.50	0.59	0.13	0.49	0.14	0.56	0.21	0.59	0.53	0.55	0.48	0.46	0.60	0.45	0.62	0.35	0.20	0.02	0.63	0.01	0.00	0.01
P	0.26	0.33	0.48	0.13	0.34	0.03	0.40	0.02	0.41	0.40	0.37	0.31	0.30	0.45	0.32	0.37	0.34	0.12	0.00	0.45	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.20	0.14	0.11	0.19	0.10	0.18	0.12	0.16	0.13	0.23	0.28	0.24	0.14	0.23	0.12	0.15	0.50	0.41	0.18
C2	0.16	0.14	0.18	0.20	0.21	0.18	0.22	0.23	0.18	0.14	0.14	0.20	0.22	0.21	0.29	0.15	0.29	0.80	0.69	0.35
C2'	0.13	0.19	0.17	0.25	0.16	0.22	0.16	0.28	0.14	0.11	0.21	0.30	0.23	0.31	0.20	0.16	0.29	0.58	0.52	0.32
C3'	0.12	0.20	0.12	0.14	0.22	0.13	0.30	0.21	0.28	0.15	0.21	0.35	0.22	0.11	0.24	0.13	0.33	0.60	0.41	0.37
C4	0.14	0.12	0.18	0.20	0.15	0.17	0.17	0.21	0.15	0.12	0.13	0.18	0.22	0.22	0.20	0.14	0.25	0.73	0.59	0.29
C4'	0.18	0.30	0.16	0.11	0.22	0.11	0.22	0.13	0.21	0.19	0.28	0.45	0.25	0.09	0.23	0.15	0.20	0.37	0.35	0.23
C5	0.18	0.14	0.22	0.27	0.11	0.25	0.19	0.30	0.19	0.15	0.11	0.18	0.23	0.30	0.15	0.19	0.33	0.84	0.70	0.38
C5'	0.26	0.33	0.26	0.17	0.27	0.18	0.29	0.17	0.28	0.25	0.31	0.46	0.35	0.11	0.28	0.23	0.25	0.31	0.40	0.27
C6	0.19	0.16	0.22	0.29	0.15	0.27	0.23	0.34	0.22	0.18	0.14	0.20	0.22	0.31	0.15	0.22	0.40	0.93	0.82	0.46
C8	0.19	0.17	0.24	0.26	0.15	0.23	0.19	0.25	0.18	0.15	0.16	0.23	0.27	0.31	0.18	0.19	0.25	0.68	0.51	0.26
N1	0.18	0.16	0.20	0.25	0.19	0.23	0.25	0.30	0.21	0.17	0.14	0.22	0.22	0.26	0.24	0.19	0.36	0.89	0.79	0.44
N2	0.17	0.14	0.18	0.19	0.24	0.17	0.24	0.22	0.18	0.15	0.16	0.20	0.24	0.20	0.34	0.16	0.28	0.79	0.69	0.35
N3	0.14	0.12	0.17	0.17	0.19	0.15	0.19	0.18	0.15	0.12	0.15	0.17	0.22	0.19	0.27	0.13	0.23	0.72	0.59	0.28
N7	0.20	0.15	0.26	0.32	0.14	0.29	0.19	0.34	0.20	0.16	0.14	0.19	0.26	0.36	0.18	0.23	0.34	0.83	0.66	0.37
N9	0.14	0.15	0.17	0.17	0.15	0.15	0.16	0.17	0.15	0.12	0.17	0.22	0.23	0.21	0.19	0.13	0.19	0.63	0.48	0.22
O2'	0.20	0.25	0.18	0.14	0.22	0.13	0.18	0.20	0.15	0.16	0.26	0.38	0.37	0.18	0.28	0.15	0.29	0.55	0.64	0.37
O3'	0.20	0.43	0.15	0.19	0.26	0.16	0.19	0.27	0.19	0.21	0.43	0.64	0.26	0.26	0.29	0.14	0.36	0.67	0.41	0.42
O4'	0.12	0.27	0.12	0.11	0.23	0.10	0.20	0.11	0.18	0.15	0.29	0.38	0.22	0.14	0.25	0.11	0.14	0.39	0.32	0.17
O5'	0.15	0.30	0.16	0.07	0.23	0.06	0.20	0.11	0.18	0.18	0.30	0.39	0.20	0.02	0.26	0.09	0.19	0.31	0.39	0.24
O6	0.22	0.19	0.25	0.33	0.17	0.32	0.25	0.41	0.25	0.20	0.18	0.22	0.23	0.36	0.17	0.26	0.47	1.02	0.93	0.55
OP1	0.12	0.23	0.10	0.11	0.29	0.14	0.32	0.23	0.29	0.19	0.27	0.28	0.13	0.03	0.33	0.14	0.34	0.52	0.55	0.41
OP2	0.14	0.29	0.13	0.12	0.34	0.16	0.33	0.27	0.29	0.22	0.34	0.32	0.10	0.02	0.38	0.16	0.36	0.47	0.51	0.39
P	0.05	0.20	0.08	0.01	0.19	0.06	0.18	0.13	0.16	0.10	0.22	0.27	0.11	0.01	0.22	0.03	0.20	0.32	0.38	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.07	0.18	0.21	0.09
C2	0.02	0.00	0.08	0.10	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.01	0.03	0.14	0.48	0.26	0.16
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.08	0.02	0.06	0.14	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.12	0.08	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.02	0.11	0.05	0.10	0.14	0.02	0.01	0.10	0.01	0.05	0.14	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.02	0.19	0.75	0.43	0.24
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.06	0.00	0.01	0.19	0.24	0.02
C5	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.03	0.20	0.74	0.42	0.25
C5'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.09	0.05	0.05	0.04	0.13	0.01	0.01	0.33	0.31	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.11	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.04	0.17	0.55	0.29	0.19
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.12	0.41	0.23	0.15
N3	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.01	0.03	0.17	0.63	0.36	0.20
O2	0.03	0.00	0.14	0.14	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.17	0.01	0.05	0.12	0.40	0.23	0.14
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.03	0.06	0.12	0.00	0.05	0.06	0.05	0.05	0.14	0.13	0.05
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.04	0.12	0.05	0.12	0.17	0.05	0.00	0.13	0.02	0.09	0.31	0.20	0.14
O4	0.02	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.03	0.21	0.83	0.50	0.26
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.05	0.02	0.03	0.00	0.07	0.09	0.34	0.10
O5'	0.07	0.14	0.04	0.05	0.19	0.01	0.20	0.01	0.17	0.12	0.17	0.12	0.05	0.09	0.21	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.48	0.12	0.14	0.75	0.19	0.74	0.33	0.55	0.41	0.63	0.40	0.14	0.31	0.83	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.21	0.26	0.08	0.10	0.43	0.24	0.42	0.31	0.29	0.23	0.36	0.23	0.13	0.20	0.50	0.34	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.05	0.07	0.24	0.02	0.25	0.01	0.19	0.15	0.20	0.14	0.05	0.14	0.26	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00