Doublet Group distance statistics: 51002

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 6, 10, 13, 11, 8, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.015, 0.021, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.025 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.011, 0.024, 0.037, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.015, 0.030, 0.046, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.030 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.038, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.018, 0.036, 0.055, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.036 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.023, 0.043, 0.062, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.043 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.014, 0.038, 0.062, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.038 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.028, 0.056, 0.084, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.056 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.032, 0.066, 0.100, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.066 std_dev=0.034
O4'	A	0, 0.006, 0.179, 0.352, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.179 std_dev=0.173
C6	B	0, 0.379, 0.553, 0.726, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.553 std_dev=0.173
N3	B	0, 0.394, 0.568, 0.742, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.568 std_dev=0.174
C3'	B	0, 0.291, 0.473, 0.655, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.473 std_dev=0.182
C5	B	0, 0.409, 0.592, 0.776, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.592 std_dev=0.183
C2'	A	0, 0.030, 0.220, 0.410, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.220 std_dev=0.190
C2	B	0, 0.385, 0.577, 0.769, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.577 std_dev=0.192
C4	B	0, 0.336, 0.529, 0.721, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.529 std_dev=0.193
N1	B	0, 0.294, 0.489, 0.684, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.489 std_dev=0.195
O4'	B	0, 0.334, 0.531, 0.728, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.531 std_dev=0.197
C4'	B	0, 0.282, 0.480, 0.677, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.480 std_dev=0.198
O4	B	0, 0.360, 0.572, 0.785, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.572 std_dev=0.212
C5'	B	0, 0.295, 0.513, 0.730, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.513 std_dev=0.218
C1'	B	0, 0.286, 0.506, 0.725, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.506 std_dev=0.219
C2'	B	0, 0.298, 0.517, 0.736, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.517 std_dev=0.219
O5'	B	0, 0.330, 0.562, 0.794, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.562 std_dev=0.232
O2	B	0, 0.476, 0.732, 0.989, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.732 std_dev=0.256
O3'	B	0, 0.369, 0.653, 0.936, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.653 std_dev=0.284
O2'	B	0, 0.394, 0.705, 1.016, 1.511 max_d=1.511 avg_d=0.705 std_dev=0.311
P	A	0, 0.261, 0.620, 0.978, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.620 std_dev=0.359
C5'	A	0, 0.103, 0.464, 0.825, 1.608 max_d=1.608 avg_d=0.464 std_dev=0.361
C4'	A	0, -0.004, 0.373, 0.749, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.373 std_dev=0.376
O5'	A	0, 0.094, 0.473, 0.853, 1.945 max_d=1.945 avg_d=0.473 std_dev=0.379
P	B	0, 0.277, 0.686, 1.095, 2.379 max_d=2.379 avg_d=0.686 std_dev=0.409
OP2	A	0, 0.257, 0.686, 1.115, 2.386 max_d=2.386 avg_d=0.686 std_dev=0.429
OP1	A	0, 0.358, 0.825, 1.291, 2.853 max_d=2.853 avg_d=0.825 std_dev=0.466
C3'	A	0, -0.066, 0.470, 1.007, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.470 std_dev=0.537
O2'	A	0, -0.058, 0.525, 1.109, 1.835 max_d=1.835 avg_d=0.525 std_dev=0.584
OP2	B	0, 0.945, 1.869, 2.792, 3.310 max_d=3.310 avg_d=1.869 std_dev=0.923
OP1	B	0, 1.018, 1.996, 2.975, 3.548 max_d=3.548 avg_d=1.996 std_dev=0.979
O3'	A	0, -0.174, 0.841, 1.857, 3.080 max_d=3.080 avg_d=0.841 std_dev=1.016

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.03	0.28	0.01	0.15	0.02	0.13	0.28	0.15
C2	0.04	0.00	0.15	0.12	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.35	0.10	0.11	0.01	0.10	0.23	0.11
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.19	0.08	0.11	0.12	0.19	0.14	0.09	0.03	0.01	0.03	0.01	0.36	0.08	0.37	0.52	0.40
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.17	0.01	0.27	0.02	0.26	0.33	0.19	0.09	0.09	0.34	0.19	0.02	0.01	0.02	0.12	0.30	0.13	0.14	0.09
C4	0.02	0.01	0.07	0.17	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.18	0.06	0.11	0.02	0.10	0.23	0.11
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.07	0.16	0.04	0.08	0.06	0.15	0.07	0.28	0.02	0.01	0.02	0.10	0.08	0.13	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.27	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.31	0.10	0.04	0.15	0.02	0.13	0.24	0.14
C5'	0.07	0.08	0.19	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.08	0.12	0.07	0.10	0.08	0.13	0.04	0.09	0.20	0.02	0.01	0.11	0.08	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.26	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.32	0.12	0.05	0.16	0.01	0.15	0.26	0.16
C8	0.02	0.01	0.11	0.33	0.01	0.16	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.20	0.08	0.17	0.02	0.13	0.23	0.13
N1	0.03	0.00	0.12	0.19	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.23	0.08	0.13	0.01	0.12	0.25	0.13
N2	0.05	0.01	0.19	0.09	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.46	0.12	0.11	0.02	0.10	0.23	0.11
N3	0.04	0.01	0.14	0.09	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.37	0.10	0.11	0.01	0.10	0.23	0.11
N7	0.02	0.01	0.09	0.34	0.01	0.15	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.34	0.20	0.06	0.20	0.02	0.17	0.26	0.17
N9	0.00	0.02	0.03	0.19	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.19	0.10	0.01	0.11	0.02	0.10	0.24	0.12
O2'	0.03	0.19	0.01	0.02	0.22	0.28	0.31	0.09	0.32	0.30	0.26	0.17	0.15	0.34	0.19	0.00	0.05	0.21	0.25	0.36	0.25	0.57	0.31
O3'	0.28	0.35	0.03	0.01	0.18	0.02	0.10	0.20	0.12	0.20	0.23	0.46	0.37	0.20	0.10	0.05	0.00	0.20	0.26	0.13	0.42	0.29	0.30
O4'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.05	0.08	0.08	0.12	0.10	0.06	0.01	0.21	0.20	0.00	0.06	0.05	0.07	0.18	0.08
O5'	0.15	0.11	0.36	0.12	0.11	0.02	0.15	0.01	0.16	0.17	0.13	0.11	0.11	0.20	0.11	0.25	0.26	0.06	0.00	0.19	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.30	0.02	0.10	0.02	0.11	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.36	0.13	0.05	0.19	0.00	0.19	0.30	0.19
OP1	0.13	0.10	0.37	0.13	0.10	0.08	0.13	0.08	0.15	0.13	0.12	0.10	0.10	0.17	0.10	0.25	0.42	0.07	0.02	0.19	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.23	0.52	0.14	0.23	0.13	0.24	0.13	0.26	0.23	0.25	0.23	0.23	0.26	0.24	0.57	0.29	0.18	0.02	0.30	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.11	0.40	0.09	0.11	0.03	0.14	0.02	0.16	0.13	0.13	0.11	0.11	0.17	0.12	0.31	0.30	0.08	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.17	0.14	0.10	0.17	0.09	0.20	0.12	0.18	0.13	0.15	0.27	0.21	0.13	0.21	0.10	0.15	0.34	0.72	0.21
C2	0.18	0.24	0.17	0.12	0.14	0.12	0.19	0.15	0.17	0.17	0.21	0.33	0.22	0.12	0.17	0.14	0.20	0.48	1.14	0.21
C2'	0.14	0.14	0.15	0.24	0.14	0.23	0.19	0.30	0.19	0.12	0.14	0.25	0.17	0.29	0.19	0.16	0.31	0.62	0.85	0.42
C3'	0.14	0.12	0.13	0.11	0.16	0.11	0.21	0.14	0.20	0.14	0.13	0.19	0.17	0.12	0.19	0.11	0.18	0.35	0.43	0.20
C4	0.16	0.21	0.16	0.11	0.10	0.11	0.17	0.13	0.15	0.14	0.16	0.31	0.20	0.12	0.16	0.12	0.18	0.32	1.00	0.21
C4'	0.18	0.20	0.15	0.09	0.22	0.10	0.22	0.09	0.21	0.19	0.21	0.24	0.19	0.12	0.23	0.13	0.11	0.34	0.36	0.13
C5	0.17	0.23	0.17	0.12	0.11	0.12	0.15	0.16	0.16	0.16	0.20	0.30	0.19	0.12	0.16	0.13	0.20	0.31	1.11	0.23
C5'	0.24	0.24	0.23	0.13	0.23	0.14	0.24	0.12	0.24	0.24	0.24	0.27	0.27	0.14	0.24	0.19	0.11	0.46	0.28	0.15
C6	0.18	0.25	0.17	0.13	0.15	0.14	0.16	0.18	0.17	0.18	0.25	0.30	0.19	0.13	0.17	0.15	0.23	0.43	1.25	0.25
C8	0.15	0.18	0.16	0.12	0.11	0.13	0.16	0.16	0.15	0.12	0.14	0.26	0.19	0.12	0.17	0.13	0.20	0.36	0.84	0.26
N1	0.18	0.25	0.17	0.13	0.14	0.13	0.18	0.17	0.17	0.18	0.25	0.32	0.20	0.12	0.14	0.15	0.23	0.51	1.23	0.24
N2	0.19	0.24	0.18	0.12	0.17	0.13	0.20	0.15	0.17	0.18	0.21	0.33	0.23	0.12	0.20	0.16	0.21	0.55	1.16	0.22
N3	0.17	0.22	0.17	0.11	0.14	0.11	0.19	0.13	0.16	0.15	0.17	0.33	0.22	0.12	0.19	0.13	0.17	0.39	1.03	0.19
N7	0.16	0.21	0.17	0.13	0.13	0.13	0.16	0.17	0.16	0.15	0.19	0.27	0.18	0.13	0.18	0.14	0.21	0.29	1.02	0.26
N9	0.14	0.17	0.15	0.11	0.12	0.10	0.17	0.13	0.16	0.12	0.13	0.28	0.20	0.12	0.17	0.11	0.17	0.31	0.85	0.22
O2'	0.20	0.26	0.18	0.14	0.20	0.12	0.25	0.25	0.20	0.17	0.22	0.44	0.34	0.17	0.25	0.12	0.34	0.70	0.99	0.52
O3'	0.19	0.33	0.14	0.11	0.30	0.10	0.22	0.17	0.20	0.22	0.36	0.42	0.21	0.22	0.35	0.11	0.20	0.38	0.42	0.22
O4'	0.14	0.17	0.12	0.10	0.24	0.10	0.24	0.10	0.21	0.16	0.20	0.21	0.19	0.15	0.26	0.10	0.13	0.29	0.48	0.15
O5'	0.16	0.16	0.18	0.07	0.17	0.06	0.19	0.09	0.19	0.16	0.17	0.20	0.21	0.03	0.19	0.11	0.12	0.51	0.31	0.17
O6	0.18	0.24	0.17	0.16	0.20	0.16	0.17	0.22	0.18	0.19	0.26	0.28	0.18	0.16	0.25	0.16	0.26	0.47	1.34	0.28
OP1	0.14	0.14	0.17	0.04	0.13	0.08	0.13	0.16	0.13	0.13	0.14	0.19	0.26	0.02	0.15	0.11	0.19	0.82	0.52	0.25
OP2	0.11	0.17	0.07	0.12	0.20	0.19	0.20	0.31	0.18	0.14	0.19	0.19	0.08	0.02	0.23	0.18	0.28	0.77	0.43	0.31
P	0.05	0.09	0.09	0.02	0.10	0.06	0.11	0.15	0.11	0.06	0.10	0.14	0.14	0.01	0.13	0.04	0.15	0.67	0.36	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.03	0.01	0.11	0.54	0.23	0.12
C2	0.02	0.00	0.08	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.08	0.01	0.03	0.15	0.77	0.59	0.15
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.05	0.03	0.07	0.13	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.23	0.20	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.07	0.12	0.02	0.01	0.09	0.01	0.05	0.20	0.18	0.07
C4	0.03	0.01	0.06	0.07	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.16	0.95	0.91	0.20
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.05	0.06	0.05	0.02	0.08	0.00	0.02	0.15	0.22	0.04
C5	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.04	0.16	0.95	0.90	0.21
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.13	0.08	0.11	0.08	0.06	0.05	0.15	0.02	0.01	0.17	0.41	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.04	0.16	0.84	0.68	0.18
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.14	0.73	0.51	0.15
N3	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.16	0.88	0.77	0.18
O2	0.04	0.01	0.13	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.00	0.14	0.14	0.02	0.04	0.15	0.70	0.49	0.14
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.06	0.05	0.04	0.06	0.04	0.03	0.08	0.14	0.00	0.04	0.07	0.04	0.06	0.19	0.15	0.07
O3'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.08	0.02	0.10	0.05	0.10	0.04	0.09	0.14	0.04	0.00	0.10	0.02	0.13	0.49	0.31	0.16
O4	0.03	0.01	0.07	0.09	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.10	0.00	0.05	0.17	1.00	1.00	0.22
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.00	0.13	0.57	0.11	0.15
O5'	0.11	0.15	0.05	0.05	0.16	0.02	0.16	0.01	0.16	0.14	0.16	0.15	0.06	0.13	0.17	0.13	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.54	0.77	0.23	0.20	0.95	0.15	0.95	0.17	0.84	0.73	0.88	0.70	0.19	0.49	1.00	0.57	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.23	0.59	0.20	0.18	0.91	0.22	0.90	0.41	0.68	0.51	0.77	0.49	0.15	0.31	1.00	0.11	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.15	0.05	0.07	0.20	0.04	0.21	0.02	0.18	0.15	0.18	0.14	0.07	0.16	0.22	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00