Doublet Group distance statistics: 51004

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 5, 5, 10, 4, 4, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.011, 0.020, 0.030, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.012, 0.026, 0.039, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.026 std_dev=0.013
N2	A	0, 0.016, 0.030, 0.045, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.030 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.025, 0.042, 0.059, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.042 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.030 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.017, 0.037, 0.058, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.037 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.021, 0.048, 0.075, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.048 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.082, 0.261, 0.440, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.261 std_dev=0.179
C2	B	0, 0.199, 0.388, 0.578, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.388 std_dev=0.189
O4'	B	0, 0.240, 0.430, 0.619, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.430 std_dev=0.190
C1'	B	0, 0.163, 0.358, 0.553, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.358 std_dev=0.195
C3'	B	0, 0.246, 0.442, 0.637, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.442 std_dev=0.195
N1	B	0, 0.123, 0.320, 0.516, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.320 std_dev=0.196
OP1	A	0, 0.285, 0.487, 0.688, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.487 std_dev=0.202
N3	B	0, 0.213, 0.416, 0.619, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.416 std_dev=0.203
C2'	A	0, 0.138, 0.343, 0.548, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.343 std_dev=0.205
O2	B	0, 0.269, 0.479, 0.689, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.479 std_dev=0.210
C6	B	0, 0.133, 0.343, 0.553, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.343 std_dev=0.210
P	A	0, 0.289, 0.500, 0.710, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.500 std_dev=0.210
C4'	B	0, 0.278, 0.491, 0.704, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.491 std_dev=0.213
O3'	B	0, 0.239, 0.467, 0.695, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.467 std_dev=0.228
C2'	B	0, 0.164, 0.392, 0.621, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.392 std_dev=0.229
C4	B	0, 0.135, 0.366, 0.597, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.366 std_dev=0.231
C5	B	0, 0.116, 0.348, 0.580, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.348 std_dev=0.232
O5'	A	0, 0.255, 0.494, 0.733, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.494 std_dev=0.239
O4	B	0, 0.178, 0.423, 0.667, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.423 std_dev=0.245
O5'	B	0, 0.347, 0.609, 0.872, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.609 std_dev=0.262
P	B	0, 0.391, 0.662, 0.932, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.662 std_dev=0.270
C5'	A	0, 0.225, 0.497, 0.768, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.497 std_dev=0.272
O2'	B	0, 0.155, 0.450, 0.745, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.450 std_dev=0.295
OP2	A	0, 0.361, 0.687, 1.013, 1.343 max_d=1.343 avg_d=0.687 std_dev=0.326
C4'	A	0, 0.211, 0.548, 0.885, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.548 std_dev=0.337
C5'	B	0, 0.311, 0.649, 0.987, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.649 std_dev=0.338
OP2	B	0, 0.386, 0.790, 1.195, 2.308 max_d=2.308 avg_d=0.790 std_dev=0.405
OP1	B	0, 0.432, 0.934, 1.435, 3.076 max_d=3.076 avg_d=0.934 std_dev=0.502
C3'	A	0, 0.330, 0.879, 1.429, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.879 std_dev=0.550
O2'	A	0, 0.338, 1.022, 1.706, 1.867 max_d=1.867 avg_d=1.022 std_dev=0.684
O3'	A	0, 0.598, 1.775, 2.953, 2.889 max_d=2.889 avg_d=1.775 std_dev=1.178

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.00	0.02	0.34	0.00	0.19	0.02	0.19	0.35	0.24
C2	0.03	0.00	0.14	0.07	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.21	0.49	0.12	0.12	0.01	0.15	0.29	0.18
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.23	0.05	0.11	0.10	0.18	0.14	0.08	0.02	0.00	0.03	0.01	0.46	0.04	0.46	0.60	0.50
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.17	0.00	0.30	0.02	0.27	0.41	0.17	0.06	0.05	0.41	0.22	0.01	0.01	0.01	0.15	0.33	0.17	0.14	0.12
C4	0.01	0.01	0.07	0.17	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.24	0.06	0.12	0.01	0.16	0.31	0.19
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.07	0.20	0.03	0.12	0.07	0.18	0.08	0.31	0.03	0.00	0.01	0.11	0.08	0.10	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.30	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.35	0.07	0.03	0.15	0.01	0.17	0.29	0.17
C5'	0.08	0.09	0.23	0.02	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.13	0.07	0.12	0.09	0.14	0.05	0.07	0.23	0.02	0.01	0.11	0.09	0.09	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.27	0.01	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.36	0.12	0.05	0.16	0.00	0.17	0.28	0.17
C8	0.01	0.01	0.11	0.41	0.00	0.20	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.36	0.25	0.08	0.16	0.02	0.17	0.32	0.19
N1	0.02	0.00	0.10	0.17	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.29	0.31	0.09	0.13	0.01	0.16	0.28	0.17
N2	0.03	0.00	0.18	0.06	0.01	0.12	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.64	0.15	0.13	0.01	0.15	0.29	0.19
N3	0.03	0.00	0.14	0.05	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.50	0.12	0.13	0.01	0.16	0.31	0.19
N7	0.00	0.01	0.08	0.41	0.00	0.18	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.41	0.24	0.05	0.19	0.02	0.18	0.29	0.18
N9	0.00	0.02	0.02	0.22	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.11	0.01	0.13	0.01	0.16	0.33	0.20
O2'	0.02	0.21	0.00	0.01	0.24	0.31	0.35	0.07	0.36	0.36	0.29	0.20	0.18	0.41	0.22	0.00	0.05	0.23	0.36	0.41	0.35	0.68	0.42
O3'	0.34	0.49	0.03	0.01	0.24	0.03	0.07	0.23	0.12	0.25	0.31	0.64	0.50	0.24	0.11	0.05	0.00	0.26	0.32	0.08	0.56	0.36	0.38
O4'	0.00	0.12	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.09	0.15	0.12	0.05	0.01	0.23	0.26	0.00	0.10	0.04	0.10	0.22	0.14
O5'	0.19	0.12	0.46	0.15	0.12	0.01	0.15	0.01	0.16	0.16	0.13	0.13	0.13	0.19	0.13	0.36	0.32	0.10	0.00	0.19	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.33	0.01	0.11	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.41	0.08	0.04	0.19	0.00	0.20	0.27	0.18
OP1	0.19	0.15	0.46	0.17	0.16	0.08	0.17	0.09	0.17	0.17	0.16	0.15	0.16	0.18	0.16	0.35	0.56	0.10	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.29	0.60	0.14	0.31	0.10	0.29	0.09	0.28	0.32	0.28	0.29	0.31	0.29	0.33	0.68	0.36	0.22	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.18	0.50	0.12	0.19	0.03	0.17	0.01	0.17	0.19	0.17	0.19	0.19	0.18	0.20	0.42	0.38	0.14	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.14	0.20	0.23	0.14	0.22	0.16	0.31	0.14	0.08	0.13	0.25	0.31	0.25	0.19	0.16	0.36	0.33	0.43	0.29
C2	0.20	0.22	0.23	0.21	0.11	0.21	0.16	0.29	0.16	0.17	0.19	0.30	0.27	0.20	0.16	0.20	0.41	0.40	0.56	0.32
C2'	0.20	0.12	0.25	0.38	0.12	0.37	0.18	0.49	0.20	0.12	0.13	0.23	0.29	0.42	0.19	0.26	0.47	0.46	0.54	0.42
C3'	0.12	0.10	0.13	0.16	0.21	0.15	0.26	0.26	0.23	0.12	0.12	0.17	0.23	0.17	0.24	0.10	0.34	0.39	0.40	0.31
C4	0.18	0.17	0.22	0.22	0.11	0.23	0.16	0.33	0.14	0.13	0.14	0.27	0.27	0.21	0.18	0.20	0.41	0.37	0.52	0.32
C4'	0.18	0.17	0.18	0.16	0.20	0.15	0.23	0.20	0.21	0.18	0.17	0.21	0.26	0.17	0.22	0.15	0.28	0.28	0.30	0.21
C5	0.18	0.18	0.21	0.19	0.14	0.23	0.17	0.34	0.16	0.14	0.17	0.24	0.24	0.18	0.19	0.21	0.42	0.38	0.54	0.33
C5'	0.23	0.21	0.23	0.18	0.25	0.17	0.28	0.19	0.28	0.24	0.22	0.21	0.25	0.17	0.26	0.19	0.26	0.31	0.26	0.20
C6	0.18	0.20	0.20	0.18	0.14	0.21	0.15	0.31	0.15	0.16	0.20	0.25	0.23	0.17	0.19	0.20	0.42	0.40	0.58	0.34
C8	0.18	0.15	0.21	0.22	0.16	0.27	0.20	0.39	0.19	0.13	0.15	0.22	0.26	0.20	0.20	0.23	0.40	0.35	0.47	0.33
N1	0.20	0.22	0.21	0.19	0.11	0.21	0.15	0.29	0.16	0.17	0.21	0.27	0.25	0.18	0.16	0.20	0.42	0.41	0.58	0.33
N2	0.22	0.24	0.23	0.22	0.17	0.22	0.19	0.28	0.19	0.20	0.22	0.30	0.28	0.21	0.20	0.20	0.42	0.41	0.56	0.32
N3	0.20	0.20	0.23	0.22	0.10	0.22	0.15	0.30	0.15	0.15	0.15	0.30	0.29	0.22	0.17	0.19	0.40	0.38	0.53	0.31
N7	0.18	0.17	0.21	0.19	0.17	0.25	0.21	0.39	0.19	0.15	0.17	0.22	0.23	0.17	0.21	0.23	0.42	0.37	0.51	0.34
N9	0.17	0.14	0.22	0.23	0.13	0.24	0.17	0.34	0.15	0.10	0.13	0.24	0.28	0.22	0.18	0.19	0.39	0.35	0.47	0.31
O2'	0.16	0.25	0.17	0.26	0.12	0.25	0.22	0.46	0.20	0.11	0.21	0.45	0.37	0.27	0.17	0.15	0.51	0.59	0.71	0.54
O3'	0.28	0.46	0.22	0.17	0.39	0.15	0.33	0.27	0.29	0.33	0.47	0.57	0.28	0.25	0.41	0.18	0.35	0.46	0.39	0.31
O4'	0.15	0.13	0.17	0.20	0.20	0.18	0.22	0.24	0.19	0.14	0.15	0.16	0.28	0.22	0.22	0.15	0.31	0.29	0.36	0.23
O5'	0.20	0.20	0.22	0.08	0.25	0.08	0.28	0.15	0.27	0.22	0.21	0.21	0.28	0.02	0.27	0.13	0.30	0.34	0.28	0.26
O6	0.17	0.19	0.19	0.16	0.18	0.20	0.15	0.30	0.15	0.16	0.21	0.23	0.21	0.16	0.23	0.20	0.40	0.41	0.59	0.34
OP1	0.05	0.08	0.10	0.02	0.13	0.10	0.15	0.20	0.13	0.07	0.10	0.11	0.15	0.02	0.15	0.06	0.25	0.49	0.35	0.32
OP2	0.07	0.14	0.08	0.06	0.18	0.18	0.20	0.32	0.17	0.11	0.16	0.16	0.09	0.02	0.20	0.13	0.31	0.47	0.39	0.35
P	0.05	0.08	0.10	0.01	0.14	0.08	0.17	0.18	0.15	0.08	0.10	0.11	0.13	0.01	0.16	0.04	0.26	0.39	0.30	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.36	0.29	0.13
C2	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.23	0.43	0.36	0.17
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.02	0.04	0.09	0.00	0.02	0.04	0.00	0.17	0.28	0.23	0.14
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.03	0.10	0.05	0.07	0.09	0.01	0.01	0.09	0.01	0.25	0.25	0.21	0.18
C4	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.02	0.33	0.48	0.45	0.23
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.07	0.00	0.02	0.17	0.26	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.03	0.35	0.49	0.45	0.24
C5'	0.02	0.08	0.02	0.03	0.14	0.01	0.15	0.00	0.13	0.08	0.11	0.06	0.04	0.05	0.15	0.01	0.01	0.11	0.27	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.03	0.31	0.46	0.39	0.20
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.01	0.22	0.42	0.34	0.16
N3	0.01	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.02	0.28	0.46	0.40	0.20
O2	0.03	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.18	0.40	0.34	0.15
O2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.05	0.09	0.00	0.04	0.05	0.04	0.07	0.23	0.24	0.09
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.09	0.02	0.12	0.05	0.11	0.05	0.07	0.10	0.04	0.00	0.10	0.02	0.24	0.29	0.23	0.21
O4	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.03	0.34	0.49	0.48	0.26
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.04	0.02	0.03	0.00	0.10	0.37	0.33	0.17
O5'	0.11	0.23	0.17	0.25	0.33	0.02	0.35	0.01	0.31	0.22	0.28	0.18	0.07	0.24	0.34	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.36	0.43	0.28	0.25	0.48	0.17	0.49	0.11	0.46	0.42	0.46	0.40	0.23	0.29	0.49	0.37	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.29	0.36	0.23	0.21	0.45	0.26	0.45	0.27	0.39	0.34	0.40	0.34	0.24	0.23	0.48	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.17	0.14	0.18	0.23	0.07	0.24	0.02	0.20	0.16	0.20	0.15	0.09	0.21	0.26	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00