Doublet Group distance statistics: 51005

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 4, 11, 7, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.007, 0.015, 0.023, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.017 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N2	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.015
O6	A	0, 0.013, 0.032, 0.050, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.032 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.009, 0.033, 0.056, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.010, 0.038, 0.066, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.038 std_dev=0.028
C6	B	0, 0.394, 0.552, 0.709, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.552 std_dev=0.158
C4	B	0, 0.424, 0.603, 0.783, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.603 std_dev=0.180
C5	B	0, 0.547, 0.738, 0.929, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.738 std_dev=0.191
N3	B	0, 0.435, 0.632, 0.829, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.632 std_dev=0.197
C2	B	0, 0.472, 0.694, 0.916, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.694 std_dev=0.222
N1	B	0, 0.161, 0.396, 0.630, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.396 std_dev=0.234
O4'	B	0, 0.505, 0.752, 1.000, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.752 std_dev=0.247
C5'	B	0, 0.353, 0.619, 0.885, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.619 std_dev=0.266
O4	B	0, 0.522, 0.796, 1.069, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.796 std_dev=0.273
C1'	B	0, 0.407, 0.683, 0.958, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.683 std_dev=0.276
O5'	B	0, 0.396, 0.693, 0.990, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.693 std_dev=0.297
C4'	B	0, 0.386, 0.684, 0.982, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.684 std_dev=0.298
O2	B	0, 0.823, 1.145, 1.466, 1.561 max_d=1.561 avg_d=1.145 std_dev=0.322
C2'	B	0, 0.475, 0.852, 1.229, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.852 std_dev=0.377
P	B	0, 0.834, 1.243, 1.652, 1.992 max_d=1.992 avg_d=1.243 std_dev=0.409
C3'	B	0, 0.247, 0.677, 1.106, 1.594 max_d=1.594 avg_d=0.677 std_dev=0.429
O4'	A	0, 0.507, 0.959, 1.411, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.959 std_dev=0.452
C2'	A	0, 0.522, 0.998, 1.474, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.998 std_dev=0.476
OP2	B	0, 1.210, 1.747, 2.284, 2.809 max_d=2.809 avg_d=1.747 std_dev=0.537
O2'	B	0, 0.801, 1.361, 1.921, 2.353 max_d=2.353 avg_d=1.361 std_dev=0.560
OP1	B	0, 0.962, 1.617, 2.272, 3.131 max_d=3.131 avg_d=1.617 std_dev=0.655
O3'	B	0, 0.452, 1.121, 1.791, 2.317 max_d=2.317 avg_d=1.121 std_dev=0.669
C3'	A	0, 0.996, 1.685, 2.374, 2.365 max_d=2.365 avg_d=1.685 std_dev=0.689
C4'	A	0, 0.932, 1.647, 2.361, 2.511 max_d=2.511 avg_d=1.647 std_dev=0.715
O5'	A	0, 0.875, 1.616, 2.356, 2.763 max_d=2.763 avg_d=1.616 std_dev=0.740
OP2	A	0, 0.802, 1.563, 2.325, 2.902 max_d=2.902 avg_d=1.563 std_dev=0.762
O2'	A	0, 0.689, 1.475, 2.261, 2.442 max_d=2.442 avg_d=1.475 std_dev=0.786
P	A	0, 0.698, 1.519, 2.340, 2.913 max_d=2.913 avg_d=1.519 std_dev=0.821
C5'	A	0, 1.210, 2.136, 3.063, 3.454 max_d=3.454 avg_d=2.136 std_dev=0.926
O3'	A	0, 1.448, 2.392, 3.335, 3.143 max_d=3.143 avg_d=2.392 std_dev=0.944
OP1	A	0, 0.897, 2.035, 3.174, 3.945 max_d=3.945 avg_d=2.035 std_dev=1.138

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.28	0.00	0.16	0.02	0.14	0.24	0.15
C2	0.02	0.00	0.25	0.15	0.01	0.14	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.28	0.23	0.09	0.01	0.09	0.28	0.12
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.21	0.12	0.13	0.20	0.30	0.24	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.44	0.09	0.48	0.57	0.47
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.20	0.00	0.30	0.02	0.31	0.34	0.23	0.10	0.11	0.37	0.21	0.01	0.01	0.01	0.09	0.35	0.19	0.14	0.11
C4	0.01	0.01	0.13	0.20	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.19	0.14	0.12	0.09	0.01	0.11	0.28	0.14
C4'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.07	0.21	0.09	0.20	0.14	0.18	0.08	0.27	0.02	0.00	0.01	0.10	0.08	0.04	0.04
C5	0.01	0.01	0.07	0.30	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.08	0.05	0.14	0.01	0.20	0.36	0.22
C5'	0.07	0.18	0.21	0.02	0.08	0.01	0.07	0.00	0.07	0.18	0.12	0.24	0.18	0.16	0.04	0.08	0.19	0.01	0.01	0.09	0.07	0.02	0.02
C6	0.02	0.00	0.12	0.31	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.08	0.09	0.14	0.01	0.21	0.40	0.23
C8	0.01	0.01	0.13	0.34	0.01	0.21	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.37	0.19	0.14	0.21	0.01	0.24	0.33	0.26
N1	0.02	0.00	0.20	0.23	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.24	0.15	0.18	0.09	0.01	0.13	0.35	0.17
N2	0.02	0.00	0.30	0.10	0.01	0.20	0.01	0.24	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.35	0.38	0.28	0.11	0.01	0.11	0.26	0.11
N3	0.02	0.00	0.24	0.11	0.00	0.14	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.31	0.23	0.11	0.01	0.10	0.25	0.12
N7	0.01	0.01	0.06	0.37	0.01	0.18	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.38	0.21	0.08	0.23	0.01	0.30	0.42	0.31
N9	0.00	0.01	0.02	0.21	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.08	0.01	0.10	0.01	0.11	0.25	0.15
O2'	0.02	0.27	0.00	0.01	0.19	0.27	0.27	0.08	0.26	0.37	0.24	0.35	0.27	0.38	0.19	0.00	0.04	0.19	0.34	0.30	0.40	0.67	0.43
O3'	0.28	0.28	0.02	0.01	0.14	0.02	0.08	0.19	0.08	0.19	0.15	0.38	0.31	0.21	0.08	0.04	0.00	0.21	0.22	0.13	0.31	0.27	0.24
O4'	0.00	0.23	0.01	0.01	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.14	0.18	0.28	0.23	0.08	0.01	0.19	0.21	0.00	0.06	0.06	0.08	0.17	0.13
O5'	0.16	0.09	0.44	0.09	0.09	0.01	0.14	0.01	0.14	0.21	0.09	0.11	0.11	0.23	0.10	0.34	0.22	0.06	0.00	0.20	0.02	0.01	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.35	0.01	0.10	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.30	0.13	0.06	0.20	0.00	0.29	0.46	0.29
OP1	0.14	0.09	0.48	0.19	0.11	0.08	0.20	0.07	0.21	0.24	0.13	0.11	0.10	0.30	0.11	0.40	0.31	0.08	0.02	0.29	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.28	0.57	0.14	0.28	0.04	0.36	0.02	0.40	0.33	0.35	0.26	0.25	0.42	0.25	0.67	0.27	0.17	0.01	0.46	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.12	0.47	0.11	0.14	0.04	0.22	0.02	0.23	0.26	0.17	0.11	0.12	0.31	0.15	0.43	0.24	0.13	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.21	0.15	0.12	0.26	0.11	0.25	0.12	0.22	0.17	0.25	0.27	0.24	0.16	0.31	0.11	0.13	0.29	0.52	0.17
C2	0.17	0.20	0.15	0.10	0.15	0.11	0.20	0.11	0.16	0.15	0.15	0.31	0.22	0.11	0.24	0.15	0.13	0.32	0.82	0.16
C2'	0.18	0.13	0.20	0.30	0.22	0.30	0.23	0.38	0.23	0.14	0.21	0.21	0.19	0.32	0.31	0.24	0.40	0.68	0.72	0.46
C3'	0.11	0.15	0.11	0.07	0.26	0.06	0.24	0.14	0.18	0.13	0.21	0.18	0.21	0.10	0.33	0.06	0.21	0.38	0.20	0.21
C4	0.10	0.14	0.10	0.10	0.18	0.09	0.22	0.10	0.17	0.09	0.15	0.25	0.16	0.13	0.27	0.09	0.11	0.22	0.72	0.15
C4'	0.22	0.21	0.20	0.10	0.21	0.12	0.23	0.09	0.23	0.21	0.20	0.25	0.26	0.13	0.23	0.16	0.08	0.31	0.15	0.06
C5	0.11	0.17	0.13	0.13	0.13	0.11	0.20	0.13	0.16	0.10	0.15	0.26	0.16	0.18	0.22	0.10	0.14	0.26	0.80	0.17
C5'	0.28	0.26	0.28	0.15	0.20	0.15	0.22	0.10	0.24	0.25	0.22	0.33	0.32	0.09	0.19	0.22	0.09	0.41	0.08	0.08
C6	0.15	0.21	0.13	0.13	0.09	0.12	0.17	0.15	0.15	0.14	0.20	0.29	0.17	0.17	0.16	0.13	0.17	0.37	0.89	0.20
C8	0.16	0.20	0.22	0.21	0.21	0.17	0.24	0.14	0.22	0.16	0.21	0.26	0.27	0.26	0.26	0.14	0.13	0.30	0.60	0.17
N1	0.18	0.24	0.15	0.10	0.12	0.11	0.19	0.13	0.17	0.17	0.20	0.32	0.20	0.12	0.17	0.15	0.16	0.39	0.88	0.19
N2	0.19	0.22	0.18	0.11	0.17	0.13	0.20	0.12	0.17	0.17	0.17	0.33	0.26	0.12	0.25	0.17	0.13	0.35	0.83	0.16
N3	0.13	0.14	0.12	0.10	0.19	0.10	0.21	0.10	0.17	0.11	0.13	0.26	0.19	0.11	0.28	0.12	0.12	0.23	0.74	0.15
N7	0.13	0.18	0.19	0.21	0.17	0.17	0.21	0.16	0.18	0.12	0.18	0.24	0.22	0.27	0.23	0.12	0.15	0.26	0.74	0.18
N9	0.12	0.18	0.14	0.12	0.23	0.11	0.24	0.11	0.20	0.13	0.21	0.25	0.21	0.17	0.29	0.09	0.12	0.24	0.61	0.16
O2'	0.11	0.21	0.11	0.22	0.27	0.22	0.31	0.39	0.27	0.13	0.26	0.37	0.28	0.21	0.36	0.16	0.49	0.85	0.96	0.64
O3'	0.25	0.35	0.20	0.07	0.32	0.08	0.27	0.15	0.25	0.27	0.36	0.43	0.30	0.17	0.36	0.14	0.22	0.41	0.18	0.24
O4'	0.19	0.18	0.18	0.17	0.24	0.17	0.27	0.15	0.25	0.21	0.21	0.19	0.25	0.25	0.26	0.17	0.10	0.22	0.30	0.09
O5'	0.15	0.15	0.17	0.08	0.17	0.05	0.18	0.09	0.15	0.13	0.14	0.22	0.19	0.02	0.21	0.09	0.12	0.43	0.10	0.09
O6	0.16	0.23	0.15	0.17	0.14	0.15	0.15	0.19	0.15	0.16	0.23	0.28	0.17	0.21	0.16	0.15	0.22	0.46	0.95	0.25
OP1	0.04	0.08	0.08	0.03	0.19	0.10	0.24	0.19	0.19	0.07	0.11	0.16	0.12	0.02	0.24	0.06	0.20	0.57	0.51	0.19
OP2	0.12	0.21	0.08	0.10	0.38	0.16	0.40	0.22	0.33	0.21	0.29	0.15	0.07	0.03	0.44	0.16	0.26	0.52	0.36	0.17
P	0.03	0.09	0.06	0.01	0.22	0.06	0.25	0.13	0.20	0.09	0.15	0.13	0.09	0.01	0.27	0.04	0.15	0.49	0.30	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.06	0.31	0.26	0.07
C2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.09	0.01	0.02	0.06	0.48	0.52	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.08	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.07	0.11	0.00	0.02	0.09	0.01	0.04	0.09	0.16	0.04
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.14	0.00	0.15	0.02	0.13	0.07	0.11	0.10	0.02	0.01	0.16	0.01	0.04	0.17	0.07	0.04
C4	0.02	0.01	0.08	0.14	0.00	0.07	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.02	0.11	0.65	0.76	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.08	0.04	0.05	0.06	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.11	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.17	0.01	0.02	0.13	0.66	0.75	0.13
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.09	0.01	0.11	0.00	0.09	0.04	0.06	0.05	0.05	0.03	0.11	0.02	0.01	0.16	0.32	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.01	0.02	0.10	0.56	0.59	0.09
N1	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.07	0.02	0.01	0.05	0.45	0.46	0.06
N3	0.02	0.00	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.01	0.02	0.08	0.57	0.65	0.11
O2	0.04	0.00	0.11	0.10	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.12	0.01	0.04	0.07	0.42	0.45	0.08
O2'	0.02	0.08	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.07	0.14	0.00	0.04	0.06	0.04	0.04	0.10	0.09	0.04
O3'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.16	0.01	0.17	0.03	0.14	0.07	0.12	0.12	0.04	0.00	0.19	0.01	0.06	0.38	0.22	0.06
O4	0.02	0.01	0.09	0.16	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.19	0.00	0.02	0.13	0.70	0.82	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.08	0.35	0.18	0.10
O5'	0.06	0.06	0.04	0.04	0.11	0.02	0.13	0.01	0.10	0.05	0.08	0.07	0.04	0.06	0.13	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.31	0.48	0.09	0.17	0.65	0.11	0.66	0.16	0.56	0.45	0.57	0.42	0.10	0.38	0.70	0.35	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.26	0.52	0.16	0.07	0.76	0.17	0.75	0.32	0.59	0.46	0.65	0.45	0.09	0.22	0.82	0.18	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.08	0.04	0.04	0.13	0.03	0.13	0.02	0.09	0.06	0.11	0.08	0.04	0.06	0.16	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00