Doublet Group distance statistics: 51007

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 7, 6, 2, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.011, 0.027, 0.044, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.027 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.014, 0.031, 0.048, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.031 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.013, 0.034, 0.056, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.017, 0.039, 0.062, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.039 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.008, 0.031, 0.054, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.031 std_dev=0.023
C2	A	0, 0.012, 0.037, 0.062, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.037 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.014, 0.040, 0.065, 0.141 max_d=0.141 avg_d=0.040 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.020, 0.046, 0.071, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.046 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.023, 0.053, 0.084, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.053 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.023, 0.054, 0.084, 0.166 max_d=0.166 avg_d=0.054 std_dev=0.031
N2	A	0, 0.011, 0.067, 0.123, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.067 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.095, 0.226, 0.356, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.226 std_dev=0.130
C2'	A	0, 0.179, 0.330, 0.481, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.330 std_dev=0.151
C4'	A	0, 0.267, 0.458, 0.649, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.458 std_dev=0.191
O2'	A	0, 0.359, 0.564, 0.769, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.564 std_dev=0.205
N1	B	0, 0.363, 0.576, 0.788, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.576 std_dev=0.212
C6	B	0, 0.377, 0.591, 0.805, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.591 std_dev=0.214
N3	B	0, 0.411, 0.629, 0.846, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.629 std_dev=0.218
C2	B	0, 0.368, 0.593, 0.818, 1.180 max_d=1.180 avg_d=0.593 std_dev=0.225
C4	B	0, 0.446, 0.672, 0.899, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.672 std_dev=0.226
C5	B	0, 0.418, 0.647, 0.876, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.647 std_dev=0.229
C3'	A	0, 0.244, 0.477, 0.709, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.477 std_dev=0.233
C1'	B	0, 0.365, 0.629, 0.894, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.629 std_dev=0.264
O4'	B	0, 0.397, 0.666, 0.935, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.666 std_dev=0.269
C3'	B	0, 0.418, 0.696, 0.975, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.696 std_dev=0.279
C2'	B	0, 0.364, 0.653, 0.941, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.653 std_dev=0.289
O4	B	0, 0.505, 0.795, 1.085, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.795 std_dev=0.290
O2	B	0, 0.369, 0.659, 0.949, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.659 std_dev=0.290
C4'	B	0, 0.465, 0.762, 1.058, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.762 std_dev=0.297
O5'	A	0, 0.398, 0.699, 1.001, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.699 std_dev=0.301
P	A	0, 0.423, 0.749, 1.075, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.749 std_dev=0.326
C5'	B	0, 0.537, 0.868, 1.198, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.868 std_dev=0.330
O3'	A	0, 0.428, 0.761, 1.094, 1.382 max_d=1.382 avg_d=0.761 std_dev=0.333
C5'	A	0, 0.425, 0.758, 1.091, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.758 std_dev=0.333
OP2	A	0, 0.449, 0.800, 1.151, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.800 std_dev=0.351
O5'	B	0, 0.523, 0.878, 1.232, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.878 std_dev=0.354
O3'	B	0, 0.478, 0.840, 1.202, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.840 std_dev=0.362
O2'	B	0, 0.504, 0.877, 1.249, 1.677 max_d=1.677 avg_d=0.877 std_dev=0.373
OP1	A	0, 0.387, 0.830, 1.273, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.830 std_dev=0.443
P	B	0, 0.603, 1.055, 1.508, 1.933 max_d=1.933 avg_d=1.055 std_dev=0.452
OP2	B	0, 0.690, 1.144, 1.598, 2.029 max_d=2.029 avg_d=1.144 std_dev=0.454
OP1	B	0, 0.664, 1.208, 1.752, 2.268 max_d=2.268 avg_d=1.208 std_dev=0.544

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.02	0.08	0.22	0.12
C2	0.05	0.00	0.11	0.12	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.14	0.04	0.16	0.01	0.15	0.29	0.18
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.08	0.14	0.11	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.12	0.06	0.13	0.15	0.09
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.09	0.09	0.10	0.16	0.11	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.17	0.09	0.19	0.12	0.12
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.16	0.01	0.15	0.28	0.18
C4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.06	0.06	0.10	0.07	0.07	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.06	0.08	0.17	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.09	0.02	0.20	0.01	0.20	0.30	0.21
C5'	0.02	0.11	0.02	0.03	0.10	0.01	0.12	0.00	0.14	0.11	0.12	0.12	0.10	0.14	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.15	0.09	0.20	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.11	0.02	0.21	0.00	0.22	0.33	0.23
C8	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.05	0.19	0.02	0.17	0.26	0.19
N1	0.04	0.00	0.08	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.19	0.01	0.19	0.31	0.21
N2	0.07	0.00	0.14	0.16	0.01	0.10	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.19	0.07	0.16	0.02	0.14	0.29	0.18
N3	0.05	0.00	0.11	0.11	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.05	0.14	0.01	0.13	0.27	0.17
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.07	0.00	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.22	0.02	0.22	0.30	0.23
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.14	0.01	0.13	0.25	0.16
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.03	0.07	0.04	0.10	0.16	0.11	0.04	0.02	0.00	0.03	0.03	0.05	0.07	0.13	0.14	0.05
O3'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.04	0.11	0.10	0.13	0.19	0.12	0.10	0.05	0.03	0.00	0.02	0.15	0.12	0.25	0.15	0.14
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.07	0.05	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.03	0.09	0.24	0.14
O5'	0.07	0.16	0.12	0.17	0.16	0.02	0.20	0.01	0.21	0.19	0.19	0.16	0.14	0.22	0.14	0.05	0.15	0.07	0.00	0.23	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.12	0.03	0.23	0.00	0.26	0.35	0.25
OP1	0.08	0.15	0.13	0.19	0.15	0.08	0.20	0.09	0.22	0.17	0.19	0.14	0.13	0.22	0.13	0.13	0.25	0.09	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.29	0.15	0.12	0.28	0.17	0.30	0.20	0.33	0.26	0.31	0.29	0.27	0.30	0.25	0.14	0.15	0.24	0.02	0.35	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.18	0.09	0.12	0.18	0.04	0.21	0.02	0.23	0.19	0.21	0.18	0.17	0.23	0.16	0.05	0.14	0.14	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.23	0.23	0.22	0.17	0.22	0.15	0.21	0.16	0.19	0.21	0.28	0.31	0.25	0.19	0.22	0.23	0.29	0.28	0.24
C2	0.21	0.21	0.22	0.22	0.24	0.21	0.22	0.22	0.20	0.20	0.22	0.23	0.25	0.24	0.29	0.20	0.25	0.30	0.36	0.30
C2'	0.22	0.22	0.21	0.17	0.15	0.18	0.14	0.17	0.14	0.18	0.19	0.29	0.31	0.21	0.18	0.19	0.20	0.30	0.28	0.23
C3'	0.21	0.21	0.21	0.16	0.14	0.16	0.13	0.15	0.13	0.17	0.18	0.28	0.32	0.19	0.16	0.17	0.17	0.32	0.26	0.21
C4	0.20	0.18	0.21	0.21	0.17	0.20	0.17	0.21	0.16	0.17	0.16	0.20	0.26	0.24	0.20	0.19	0.24	0.29	0.33	0.27
C4'	0.24	0.26	0.22	0.15	0.18	0.17	0.15	0.15	0.15	0.20	0.22	0.33	0.33	0.18	0.19	0.20	0.18	0.30	0.23	0.20
C5	0.19	0.18	0.20	0.21	0.18	0.20	0.19	0.22	0.18	0.18	0.16	0.18	0.23	0.23	0.21	0.19	0.25	0.31	0.35	0.30
C5'	0.29	0.28	0.29	0.17	0.19	0.20	0.16	0.15	0.17	0.24	0.24	0.35	0.40	0.18	0.19	0.24	0.14	0.31	0.22	0.19
C6	0.20	0.21	0.20	0.22	0.24	0.21	0.25	0.24	0.22	0.21	0.22	0.21	0.22	0.23	0.28	0.21	0.28	0.33	0.39	0.33
C8	0.21	0.19	0.22	0.21	0.14	0.19	0.14	0.20	0.15	0.18	0.16	0.21	0.27	0.23	0.16	0.18	0.23	0.30	0.31	0.26
N1	0.21	0.23	0.21	0.22	0.26	0.21	0.25	0.24	0.22	0.21	0.24	0.24	0.23	0.23	0.31	0.21	0.27	0.32	0.38	0.32
N2	0.22	0.22	0.23	0.23	0.25	0.21	0.23	0.22	0.20	0.20	0.23	0.25	0.27	0.24	0.31	0.21	0.25	0.30	0.36	0.30
N3	0.21	0.19	0.22	0.22	0.20	0.21	0.18	0.21	0.17	0.18	0.18	0.21	0.27	0.25	0.24	0.20	0.24	0.29	0.33	0.27
N7	0.19	0.16	0.20	0.21	0.13	0.20	0.16	0.22	0.16	0.17	0.13	0.16	0.23	0.23	0.16	0.18	0.24	0.31	0.34	0.29
N9	0.21	0.18	0.22	0.21	0.15	0.20	0.14	0.20	0.14	0.17	0.17	0.22	0.28	0.24	0.17	0.19	0.23	0.29	0.31	0.26
O2'	0.25	0.26	0.23	0.19	0.18	0.21	0.15	0.19	0.16	0.21	0.23	0.34	0.33	0.21	0.20	0.23	0.21	0.29	0.27	0.23
O3'	0.22	0.22	0.22	0.15	0.13	0.16	0.13	0.14	0.13	0.17	0.18	0.30	0.35	0.18	0.16	0.18	0.16	0.33	0.27	0.21
O4'	0.23	0.25	0.21	0.21	0.19	0.21	0.17	0.20	0.17	0.20	0.23	0.32	0.30	0.26	0.20	0.21	0.23	0.29	0.26	0.24
O5'	0.19	0.20	0.21	0.08	0.17	0.07	0.17	0.07	0.16	0.17	0.19	0.24	0.33	0.01	0.17	0.13	0.15	0.28	0.24	0.18
O6	0.21	0.22	0.20	0.23	0.27	0.23	0.28	0.27	0.25	0.22	0.24	0.22	0.21	0.23	0.32	0.23	0.31	0.35	0.42	0.37
OP1	0.04	0.08	0.09	0.02	0.11	0.09	0.14	0.19	0.11	0.05	0.09	0.13	0.16	0.02	0.12	0.05	0.30	0.44	0.35	0.34
OP2	0.10	0.15	0.15	0.06	0.20	0.13	0.20	0.24	0.17	0.14	0.18	0.15	0.19	0.01	0.22	0.10	0.30	0.36	0.32	0.30
P	0.05	0.08	0.11	0.01	0.10	0.05	0.12	0.13	0.09	0.05	0.09	0.11	0.18	0.00	0.11	0.01	0.21	0.32	0.26	0.23

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.09	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.02	0.14	0.13	0.17	0.15
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.07	0.00	0.02	0.06	0.01	0.04	0.14	0.12	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.05	0.04	0.06	0.07	0.02	0.00	0.05	0.01	0.07	0.17	0.13	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.00	0.04	0.19	0.19	0.23	0.21
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.05	0.00	0.02	0.11	0.07	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.20	0.19	0.22	0.22
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.11	0.00	0.12	0.00	0.10	0.06	0.08	0.04	0.05	0.03	0.12	0.01	0.01	0.11	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.05	0.17	0.15	0.17	0.17
N1	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.13	0.12	0.14	0.13
N3	0.02	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.07	0.01	0.03	0.17	0.16	0.20	0.18
O2	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.12	0.11	0.15	0.13
O2'	0.02	0.05	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.04	0.03	0.06	0.06	0.00	0.05	0.08	0.05	0.05	0.16	0.11	0.05
O3'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.06	0.04	0.07	0.08	0.05	0.00	0.07	0.01	0.13	0.27	0.19	0.15
O4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.04	0.20	0.21	0.26	0.23
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.04	0.00	0.08	0.10	0.11	0.10
O5'	0.07	0.14	0.04	0.07	0.19	0.02	0.20	0.01	0.17	0.13	0.17	0.12	0.05	0.13	0.20	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.09	0.13	0.14	0.17	0.19	0.11	0.19	0.11	0.15	0.12	0.16	0.11	0.16	0.27	0.21	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.17	0.12	0.13	0.23	0.07	0.22	0.04	0.17	0.14	0.20	0.15	0.11	0.19	0.26	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.15	0.06	0.08	0.21	0.03	0.22	0.01	0.17	0.13	0.18	0.13	0.05	0.15	0.23	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00