Doublet Group distance statistics: 51009

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 5, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.018 std_dev=0.012
O6	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C2	A	0, -0.003, 0.013, 0.029, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.013 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.020 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.007, 0.028, 0.049, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N2	A	0, -0.007, 0.025, 0.057, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.025 std_dev=0.032
C4	B	0, 0.051, 0.100, 0.150, 0.184 max_d=0.184 avg_d=0.100 std_dev=0.050
O4'	A	0, 0.088, 0.140, 0.191, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.140 std_dev=0.051
C5	B	0, 0.060, 0.120, 0.179, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.120 std_dev=0.060
N3	B	0, 0.056, 0.117, 0.178, 0.231 max_d=0.231 avg_d=0.117 std_dev=0.061
C2'	A	0, 0.128, 0.189, 0.251, 0.248 max_d=0.248 avg_d=0.189 std_dev=0.062
C6	B	0, 0.074, 0.139, 0.204, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.139 std_dev=0.065
O4	B	0, 0.051, 0.119, 0.187, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.119 std_dev=0.068
N1	B	0, 0.073, 0.147, 0.222, 0.247 max_d=0.247 avg_d=0.147 std_dev=0.074
C2	B	0, 0.063, 0.140, 0.217, 0.280 max_d=0.280 avg_d=0.140 std_dev=0.077
O2'	A	0, 0.171, 0.252, 0.334, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.252 std_dev=0.081
O4'	B	0, 0.110, 0.196, 0.282, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.196 std_dev=0.086
C3'	A	0, 0.157, 0.243, 0.330, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.243 std_dev=0.087
O2	B	0, 0.076, 0.175, 0.274, 0.380 max_d=0.380 avg_d=0.175 std_dev=0.099
C1'	B	0, 0.083, 0.183, 0.283, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.183 std_dev=0.100
C4'	B	0, 0.156, 0.264, 0.371, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.264 std_dev=0.108
C5'	B	0, 0.213, 0.323, 0.432, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.323 std_dev=0.110
O5'	B	0, 0.193, 0.306, 0.418, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.306 std_dev=0.112
C4'	A	0, 0.113, 0.226, 0.340, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.226 std_dev=0.114
O3'	A	0, 0.127, 0.243, 0.358, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.243 std_dev=0.116
OP1	B	0, 0.150, 0.270, 0.391, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.270 std_dev=0.121
P	B	0, 0.149, 0.271, 0.393, 0.420 max_d=0.420 avg_d=0.271 std_dev=0.122
C3'	B	0, 0.155, 0.283, 0.412, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.283 std_dev=0.129
OP2	B	0, 0.106, 0.238, 0.370, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.238 std_dev=0.132
C2'	B	0, 0.103, 0.245, 0.386, 0.492 max_d=0.492 avg_d=0.245 std_dev=0.142
O3'	B	0, 0.225, 0.400, 0.575, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.400 std_dev=0.175
C5'	A	0, 0.267, 0.447, 0.627, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.447 std_dev=0.180
O2'	B	0, 0.100, 0.287, 0.473, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.287 std_dev=0.187
O5'	A	0, 0.425, 0.648, 0.871, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.648 std_dev=0.223
P	A	0, 0.665, 1.073, 1.481, 1.512 max_d=1.512 avg_d=1.073 std_dev=0.408
OP2	A	0, 0.883, 1.466, 2.048, 2.008 max_d=2.008 avg_d=1.466 std_dev=0.583
OP1	A	0, 1.059, 1.697, 2.335, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.697 std_dev=0.638

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.09	0.02	0.13	0.18	0.12
C2	0.03	0.00	0.06	0.09	0.01	0.13	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.07	0.18	0.00	0.27	0.25	0.18
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.02	0.06	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.08	0.10	0.06
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.08	0.11	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.08	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.04	0.03	0.12	0.01	0.26	0.25	0.19
C4'	0.00	0.13	0.01	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.12	0.16	0.11	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.08	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.04	0.03	0.13	0.01	0.30	0.29	0.21
C5'	0.03	0.24	0.05	0.01	0.14	0.01	0.14	0.00	0.18	0.06	0.22	0.27	0.21	0.10	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.18	0.03	0.06	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.04	0.15	0.00	0.32	0.29	0.22
C8	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.13	0.01	0.25	0.31	0.21
N1	0.03	0.00	0.06	0.08	0.01	0.12	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.06	0.17	0.00	0.30	0.28	0.20
N2	0.05	0.00	0.07	0.11	0.01	0.16	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.10	0.08	0.21	0.01	0.24	0.28	0.17
N3	0.03	0.01	0.05	0.07	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.06	0.15	0.01	0.24	0.21	0.16
N7	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.01	0.13	0.01	0.29	0.32	0.23
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.11	0.02	0.23	0.25	0.18
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.05	0.06	0.03	0.06	0.05	0.05	0.04	0.03	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.07	0.11	0.05
O3'	0.04	0.08	0.01	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.04	0.07	0.10	0.07	0.04	0.04	0.03	0.00	0.04	0.02	0.05	0.14	0.04	0.06
O4'	0.00	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.08	0.06	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.09	0.04	0.11	0.17	0.11
O5'	0.09	0.18	0.05	0.02	0.12	0.02	0.13	0.01	0.15	0.13	0.17	0.21	0.15	0.13	0.11	0.05	0.02	0.09	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.05	0.04	0.15	0.00	0.34	0.31	0.23
OP1	0.13	0.27	0.08	0.08	0.26	0.07	0.30	0.03	0.32	0.25	0.30	0.24	0.24	0.29	0.23	0.07	0.14	0.11	0.01	0.34	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.25	0.10	0.04	0.25	0.03	0.29	0.06	0.29	0.31	0.28	0.28	0.21	0.32	0.25	0.11	0.04	0.17	0.01	0.31	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.18	0.06	0.03	0.19	0.02	0.21	0.01	0.22	0.21	0.20	0.17	0.16	0.23	0.18	0.05	0.06	0.11	0.01	0.23	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.06	0.10	0.10	0.04	0.07	0.05	0.07	0.05	0.05	0.05	0.06	0.11	0.12	0.04	0.05	0.06	0.05	0.04	0.04
C2	0.08	0.07	0.10	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.09	0.12	0.04	0.07	0.07	0.07	0.09	0.11	0.08
C2'	0.05	0.06	0.09	0.10	0.05	0.07	0.05	0.06	0.05	0.05	0.05	0.06	0.10	0.12	0.06	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04
C3'	0.04	0.06	0.07	0.08	0.06	0.05	0.06	0.04	0.05	0.05	0.06	0.07	0.08	0.10	0.06	0.04	0.04	0.07	0.06	0.05
C4	0.06	0.05	0.09	0.07	0.03	0.06	0.02	0.06	0.03	0.04	0.05	0.07	0.10	0.08	0.04	0.05	0.05	0.07	0.07	0.05
C4'	0.06	0.09	0.07	0.07	0.08	0.05	0.08	0.05	0.08	0.08	0.08	0.10	0.07	0.10	0.06	0.06	0.05	0.07	0.06	0.05
C5	0.04	0.04	0.06	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.07	0.04	0.06	0.04	0.05	0.06	0.08	0.06
C5'	0.16	0.19	0.13	0.14	0.17	0.13	0.18	0.12	0.18	0.18	0.18	0.20	0.11	0.14	0.14	0.15	0.13	0.09	0.11	0.10
C6	0.05	0.05	0.05	0.04	0.06	0.05	0.07	0.07	0.06	0.05	0.05	0.06	0.06	0.03	0.10	0.06	0.07	0.08	0.10	0.08
C8	0.04	0.05	0.08	0.07	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.04	0.05	0.05	0.08	0.08	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04
N1	0.07	0.07	0.07	0.04	0.07	0.06	0.08	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.08	0.04	0.10	0.08	0.08	0.10	0.12	0.09
N2	0.11	0.09	0.13	0.05	0.05	0.06	0.06	0.06	0.07	0.08	0.07	0.12	0.16	0.04	0.07	0.08	0.08	0.10	0.12	0.10
N3	0.08	0.07	0.12	0.08	0.03	0.07	0.03	0.06	0.04	0.06	0.05	0.09	0.13	0.08	0.05	0.07	0.05	0.08	0.09	0.07
N7	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.05	0.06	0.05	0.04	0.03	0.05	0.05	0.06	0.04
N9	0.06	0.05	0.10	0.09	0.04	0.07	0.03	0.06	0.04	0.05	0.05	0.06	0.10	0.10	0.04	0.05	0.06	0.05	0.05	0.04
O2'	0.07	0.05	0.11	0.12	0.04	0.09	0.03	0.08	0.05	0.05	0.04	0.05	0.11	0.13	0.07	0.06	0.08	0.05	0.04	0.05
O3'	0.05	0.05	0.08	0.09	0.05	0.07	0.05	0.07	0.04	0.05	0.05	0.06	0.09	0.11	0.06	0.05	0.06	0.11	0.09	0.09
O4'	0.06	0.06	0.10	0.09	0.04	0.06	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.07	0.11	0.12	0.04	0.04	0.04	0.06	0.05	0.05
O5'	0.11	0.12	0.10	0.11	0.11	0.09	0.12	0.08	0.12	0.12	0.12	0.13	0.10	0.12	0.10	0.10	0.08	0.09	0.08	0.07
O6	0.07	0.07	0.06	0.06	0.08	0.07	0.08	0.08	0.08	0.07	0.07	0.07	0.06	0.06	0.12	0.08	0.08	0.09	0.11	0.09
OP1	0.18	0.22	0.22	0.12	0.23	0.08	0.19	0.06	0.17	0.19	0.24	0.23	0.24	0.10	0.26	0.12	0.09	0.19	0.13	0.13
OP2	0.20	0.21	0.19	0.21	0.22	0.20	0.22	0.20	0.21	0.21	0.22	0.21	0.19	0.24	0.24	0.19	0.19	0.20	0.15	0.17
P	0.10	0.13	0.10	0.07	0.15	0.07	0.14	0.08	0.13	0.12	0.15	0.13	0.12	0.08	0.18	0.08	0.09	0.14	0.10	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.06	0.04
C2	0.02	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.04	0.04	0.07	0.04
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.07	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.02
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02
C4	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.07	0.04
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01
C5	0.02	0.01	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01	0.04	0.07	0.04	0.07	0.04
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.04	0.08	0.04
N3	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.03
O2	0.04	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.01	0.03	0.05	0.05	0.08	0.06
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.03
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.08	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.04	0.04
O4	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.08	0.06	0.08	0.06
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.04	0.07	0.05
O5'	0.03	0.04	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.00	0.05	0.04	0.04	0.05	0.02	0.03	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.07	0.06	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.07	0.04	0.04	0.07	0.03	0.07	0.01	0.07	0.08	0.07	0.08	0.04	0.04	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.04	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00