Doublet Group distance statistics: 51011

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 1, 0, 4, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.015, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.014, 0.028, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.028 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.012, 0.028, 0.044, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.015, 0.031, 0.046, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.031 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.010, 0.028, 0.045, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.016, 0.042, 0.067, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.042 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.016, 0.046, 0.076, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.046 std_dev=0.030
O6	A	0, 0.044, 0.077, 0.110, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.077 std_dev=0.033
N2	A	0, 0.023, 0.063, 0.104, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.063 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.019, 0.251, 0.482, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.251 std_dev=0.231
C4	B	0, 0.202, 0.434, 0.667, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.434 std_dev=0.232
N3	B	0, 0.292, 0.573, 0.854, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.573 std_dev=0.281
O4	B	0, 0.363, 0.658, 0.953, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.658 std_dev=0.295
C5	B	0, 0.209, 0.514, 0.819, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.514 std_dev=0.305
C2'	A	0, 0.046, 0.354, 0.663, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.354 std_dev=0.308
C4'	A	0, 0.170, 0.514, 0.858, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.514 std_dev=0.344
C6	B	0, 0.265, 0.626, 0.986, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.626 std_dev=0.360
C2	B	0, 0.334, 0.720, 1.106, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.720 std_dev=0.386
N1	B	0, 0.297, 0.697, 1.098, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.697 std_dev=0.400
O2'	A	0, 0.130, 0.575, 1.020, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.575 std_dev=0.445
C3'	A	0, 0.134, 0.596, 1.057, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.596 std_dev=0.461
O2	B	0, 0.512, 1.081, 1.649, 1.716 max_d=1.716 avg_d=1.081 std_dev=0.569
C1'	B	0, 0.471, 1.050, 1.629, 1.931 max_d=1.931 avg_d=1.050 std_dev=0.579
C5'	A	0, 0.254, 0.878, 1.503, 1.898 max_d=1.898 avg_d=0.878 std_dev=0.624
C2'	B	0, 0.462, 1.088, 1.713, 2.054 max_d=2.054 avg_d=1.088 std_dev=0.625
O5'	A	0, 0.268, 0.896, 1.524, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.896 std_dev=0.628
P	A	0, 0.445, 1.083, 1.721, 2.130 max_d=2.130 avg_d=1.083 std_dev=0.638
OP2	A	0, 0.485, 1.147, 1.808, 2.104 max_d=2.104 avg_d=1.147 std_dev=0.661
C3'	B	0, 0.498, 1.179, 1.861, 2.221 max_d=2.221 avg_d=1.179 std_dev=0.681
OP1	A	0, 0.420, 1.114, 1.809, 2.360 max_d=2.360 avg_d=1.114 std_dev=0.694
O4'	B	0, 0.607, 1.306, 2.005, 2.316 max_d=2.316 avg_d=1.306 std_dev=0.699
O3'	A	0, 0.267, 0.981, 1.694, 2.269 max_d=2.269 avg_d=0.981 std_dev=0.714
O2'	B	0, 0.675, 1.453, 2.230, 2.577 max_d=2.577 avg_d=1.453 std_dev=0.778
O3'	B	0, 0.564, 1.346, 2.128, 2.513 max_d=2.513 avg_d=1.346 std_dev=0.782
C4'	B	0, 0.674, 1.457, 2.239, 2.545 max_d=2.545 avg_d=1.457 std_dev=0.783
C5'	B	0, 0.766, 1.628, 2.489, 2.727 max_d=2.727 avg_d=1.628 std_dev=0.861
O5'	B	0, 0.598, 1.808, 3.018, 3.812 max_d=3.812 avg_d=1.808 std_dev=1.210
OP1	B	0, 0.918, 2.189, 3.459, 3.910 max_d=3.910 avg_d=2.189 std_dev=1.271
P	B	0, 0.629, 2.272, 3.914, 5.220 max_d=5.220 avg_d=2.272 std_dev=1.642
OP2	B	0, 0.330, 2.577, 4.824, 6.969 max_d=6.969 avg_d=2.577 std_dev=2.247

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.15	0.02	0.04	0.35	0.13
C2	0.03	0.00	0.19	0.18	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.23	0.04	0.28	0.01	0.15	0.33	0.16
C2'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.02	0.07	0.12	0.13	0.23	0.19	0.10	0.04	0.00	0.03	0.00	0.18	0.07	0.19	0.26	0.07
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.03	0.14	0.23	0.15	0.23	0.17	0.22	0.10	0.02	0.01	0.02	0.21	0.17	0.31	0.23	0.14
C4	0.01	0.01	0.09	0.11	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.11	0.12	0.02	0.30	0.01	0.16	0.32	0.15
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.10	0.16	0.07	0.10	0.06	0.16	0.07	0.05	0.03	0.00	0.02	0.13	0.11	0.32	0.11
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.11	0.00	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.18	0.03	0.39	0.01	0.27	0.37	0.26
C5'	0.03	0.14	0.02	0.03	0.15	0.00	0.24	0.00	0.24	0.26	0.19	0.12	0.11	0.30	0.15	0.04	0.05	0.02	0.01	0.29	0.21	0.29	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.18	0.03	0.40	0.00	0.30	0.40	0.30
C8	0.02	0.01	0.12	0.23	0.01	0.16	0.01	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.27	0.05	0.40	0.02	0.24	0.33	0.22
N1	0.03	0.00	0.13	0.15	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.18	0.19	0.03	0.35	0.01	0.24	0.37	0.24
N2	0.05	0.00	0.23	0.23	0.01	0.10	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.30	0.32	0.05	0.24	0.02	0.11	0.33	0.13
N3	0.03	0.00	0.19	0.17	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.22	0.04	0.24	0.01	0.10	0.32	0.12
N7	0.01	0.01	0.10	0.22	0.01	0.16	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.28	0.05	0.45	0.02	0.33	0.38	0.32
N9	0.00	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.11	0.01	0.28	0.02	0.12	0.32	0.12
O2'	0.02	0.24	0.00	0.02	0.11	0.05	0.07	0.04	0.11	0.07	0.18	0.30	0.22	0.05	0.03	0.00	0.07	0.04	0.09	0.09	0.14	0.29	0.10
O3'	0.02	0.23	0.03	0.01	0.12	0.03	0.18	0.05	0.18	0.27	0.19	0.32	0.22	0.28	0.11	0.07	0.00	0.02	0.16	0.23	0.40	0.27	0.19
O4'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.04	0.11	0.43	0.23
O5'	0.15	0.28	0.18	0.21	0.30	0.02	0.39	0.01	0.40	0.40	0.35	0.24	0.24	0.45	0.28	0.09	0.16	0.11	0.00	0.46	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.17	0.01	0.13	0.01	0.29	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.23	0.04	0.46	0.00	0.38	0.46	0.38
OP1	0.04	0.15	0.19	0.31	0.16	0.11	0.27	0.21	0.30	0.24	0.24	0.11	0.10	0.33	0.12	0.14	0.40	0.11	0.02	0.38	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.33	0.26	0.23	0.32	0.32	0.37	0.29	0.40	0.33	0.37	0.33	0.32	0.38	0.32	0.29	0.27	0.43	0.02	0.46	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.16	0.07	0.14	0.15	0.11	0.26	0.02	0.30	0.22	0.24	0.13	0.12	0.32	0.12	0.10	0.19	0.23	0.01	0.38	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.35	0.27	0.33	0.22	0.35	0.25	0.43	0.27	0.29	0.29	0.42	0.22	0.28	0.17	0.33	0.36	0.16	0.88	0.41
C2	0.16	0.26	0.14	0.19	0.17	0.23	0.26	0.33	0.22	0.17	0.28	0.37	0.15	0.17	0.15	0.20	0.77	0.53	1.55	0.97
C2'	0.27	0.39	0.23	0.25	0.26	0.26	0.25	0.34	0.24	0.28	0.36	0.51	0.21	0.19	0.24	0.27	0.46	0.26	1.00	0.52
C3'	0.14	0.27	0.13	0.10	0.14	0.11	0.14	0.20	0.12	0.15	0.24	0.39	0.18	0.07	0.13	0.11	0.57	0.36	1.04	0.57
C4	0.17	0.24	0.14	0.20	0.16	0.26	0.23	0.36	0.23	0.17	0.26	0.32	0.13	0.17	0.13	0.23	0.70	0.42	1.38	0.83
C4'	0.20	0.28	0.19	0.19	0.14	0.18	0.11	0.28	0.11	0.19	0.23	0.39	0.23	0.18	0.12	0.17	0.36	0.14	0.74	0.33
C5	0.18	0.18	0.17	0.24	0.17	0.31	0.24	0.41	0.26	0.16	0.23	0.23	0.16	0.24	0.21	0.28	0.84	0.56	1.59	1.00
C5'	0.29	0.28	0.34	0.12	0.15	0.10	0.15	0.14	0.16	0.23	0.22	0.36	0.45	0.12	0.13	0.17	0.43	0.20	0.73	0.34
C6	0.20	0.17	0.19	0.26	0.18	0.33	0.26	0.43	0.27	0.17	0.23	0.22	0.18	0.27	0.24	0.30	0.94	0.70	1.79	1.17
C8	0.20	0.18	0.17	0.25	0.20	0.33	0.23	0.45	0.26	0.19	0.22	0.20	0.16	0.22	0.20	0.31	0.65	0.34	1.22	0.71
N1	0.17	0.22	0.15	0.22	0.18	0.28	0.27	0.38	0.26	0.17	0.26	0.29	0.14	0.21	0.20	0.25	0.89	0.66	1.72	1.12
N2	0.18	0.29	0.16	0.18	0.18	0.21	0.26	0.30	0.21	0.18	0.28	0.41	0.19	0.16	0.18	0.18	0.75	0.53	1.54	0.97
N3	0.18	0.28	0.16	0.20	0.15	0.23	0.24	0.33	0.21	0.18	0.28	0.39	0.17	0.17	0.12	0.20	0.67	0.42	1.37	0.82
N7	0.22	0.14	0.22	0.28	0.19	0.36	0.22	0.47	0.26	0.17	0.20	0.16	0.22	0.29	0.24	0.33	0.85	0.53	1.53	0.96
N9	0.20	0.26	0.15	0.24	0.19	0.29	0.24	0.40	0.25	0.21	0.26	0.31	0.13	0.19	0.15	0.27	0.56	0.29	1.15	0.64
O2'	0.41	0.53	0.37	0.35	0.37	0.37	0.33	0.41	0.34	0.41	0.49	0.66	0.35	0.29	0.34	0.39	0.30	0.16	0.81	0.36
O3'	0.19	0.33	0.17	0.08	0.17	0.09	0.15	0.17	0.11	0.18	0.30	0.49	0.25	0.07	0.17	0.12	0.57	0.42	1.05	0.59
O4'	0.18	0.23	0.17	0.33	0.14	0.31	0.14	0.42	0.16	0.18	0.20	0.31	0.13	0.32	0.13	0.24	0.28	0.13	0.69	0.27
O5'	0.24	0.32	0.24	0.13	0.36	0.07	0.35	0.09	0.33	0.30	0.34	0.30	0.20	0.02	0.37	0.16	0.57	0.33	0.83	0.48
O6	0.25	0.15	0.25	0.33	0.19	0.40	0.25	0.50	0.30	0.20	0.21	0.18	0.24	0.35	0.29	0.37	1.04	0.83	1.96	1.32
OP1	0.03	0.10	0.10	0.03	0.12	0.18	0.13	0.30	0.11	0.06	0.11	0.12	0.14	0.02	0.14	0.12	0.32	0.32	0.59	0.30
OP2	0.14	0.22	0.09	0.11	0.25	0.18	0.23	0.27	0.20	0.19	0.25	0.23	0.07	0.02	0.27	0.17	0.47	0.34	0.77	0.39
P	0.04	0.10	0.07	0.01	0.14	0.10	0.14	0.18	0.11	0.08	0.12	0.12	0.09	0.01	0.15	0.05	0.37	0.22	0.62	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.18	0.13	0.25	0.20
C2	0.03	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.04	0.38	0.23	0.64	0.45
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.05	0.02	0.04	0.10	0.00	0.02	0.05	0.01	0.26	0.18	0.34	0.23
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.02	0.08	0.04	0.07	0.10	0.02	0.01	0.08	0.01	0.35	0.24	0.41	0.27
C4	0.03	0.01	0.04	0.07	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.00	0.05	0.58	0.37	1.06	0.72
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.05	0.05	0.07	0.02	0.06	0.00	0.01	0.07	0.15	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.05	0.61	0.38	1.09	0.75
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.11	0.00	0.11	0.00	0.09	0.06	0.09	0.06	0.07	0.03	0.11	0.01	0.01	0.12	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.05	0.53	0.31	0.83	0.61
N1	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.38	0.22	0.58	0.42
N3	0.03	0.00	0.04	0.07	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01	0.04	0.48	0.30	0.87	0.59
O2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.10	0.02	0.05	0.28	0.18	0.49	0.34
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.06	0.07	0.05	0.07	0.04	0.03	0.07	0.12	0.00	0.04	0.07	0.05	0.08	0.11	0.11	0.05
O3'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.08	0.02	0.10	0.03	0.09	0.04	0.07	0.10	0.04	0.00	0.09	0.02	0.27	0.24	0.36	0.19
O4	0.03	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.09	0.00	0.05	0.61	0.41	1.18	0.79
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.04	0.04	0.05	0.05	0.02	0.05	0.00	0.04	0.08	0.12	0.08
O5'	0.18	0.38	0.26	0.35	0.58	0.01	0.61	0.01	0.53	0.38	0.48	0.28	0.08	0.27	0.61	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.13	0.23	0.18	0.24	0.37	0.07	0.38	0.12	0.31	0.22	0.30	0.18	0.11	0.24	0.41	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.64	0.34	0.41	1.06	0.15	1.09	0.25	0.83	0.58	0.87	0.49	0.11	0.36	1.18	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.20	0.45	0.23	0.27	0.72	0.02	0.75	0.02	0.61	0.42	0.59	0.34	0.05	0.19	0.79	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00