Doublet Group distance statistics: 51013

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 5, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.002, 0.013, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.003, 0.019, 0.034, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.010, 0.027, 0.044, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.017, 0.036, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.036 std_dev=0.019
O6	A	0, 0.003, 0.034, 0.065, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.034 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.007, 0.041, 0.076, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.041 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.006, 0.044, 0.081, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.044 std_dev=0.038
C2'	A	0, 0.035, 0.081, 0.126, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.081 std_dev=0.045
O4'	A	0, 0.015, 0.066, 0.117, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.066 std_dev=0.051
C4'	A	0, 0.038, 0.099, 0.160, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.099 std_dev=0.061
C3'	A	0, 0.038, 0.105, 0.172, 0.216 max_d=0.216 avg_d=0.105 std_dev=0.067
O3'	A	0, 0.055, 0.131, 0.207, 0.282 max_d=0.282 avg_d=0.131 std_dev=0.076
OP1	A	0, 0.104, 0.182, 0.260, 0.245 max_d=0.245 avg_d=0.182 std_dev=0.078
O2'	A	0, 0.037, 0.118, 0.198, 0.282 max_d=0.282 avg_d=0.118 std_dev=0.081
C5'	A	0, 0.043, 0.124, 0.205, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.124 std_dev=0.081
O5'	A	0, 0.082, 0.166, 0.250, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.166 std_dev=0.084
P	A	0, 0.064, 0.150, 0.235, 0.272 max_d=0.272 avg_d=0.150 std_dev=0.085
OP2	A	0, 0.077, 0.166, 0.255, 0.263 max_d=0.263 avg_d=0.166 std_dev=0.089
C2	B	0, 0.227, 0.397, 0.567, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.397 std_dev=0.170
N3	B	0, 0.199, 0.371, 0.542, 0.651 max_d=0.651 avg_d=0.371 std_dev=0.172
N1	B	0, 0.173, 0.362, 0.552, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.362 std_dev=0.190
C6	B	0, 0.249, 0.461, 0.672, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.461 std_dev=0.211
C4	B	0, 0.160, 0.376, 0.592, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.376 std_dev=0.216
C1'	B	0, 0.222, 0.440, 0.659, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.440 std_dev=0.218
O2	B	0, 0.310, 0.540, 0.770, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.540 std_dev=0.230
C5	B	0, 0.265, 0.502, 0.739, 0.929 max_d=0.929 avg_d=0.502 std_dev=0.237
O4'	B	0, 0.355, 0.614, 0.874, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.614 std_dev=0.259
O4	B	0, 0.163, 0.436, 0.709, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.436 std_dev=0.273
C2'	B	0, 0.430, 0.736, 1.043, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.736 std_dev=0.307
C4'	B	0, 0.504, 0.838, 1.172, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.838 std_dev=0.334
P	B	0, 0.496, 0.843, 1.191, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.843 std_dev=0.348
O5'	B	0, 0.526, 0.879, 1.233, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.879 std_dev=0.353
C3'	B	0, 0.528, 0.887, 1.245, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.887 std_dev=0.358
O2'	B	0, 0.481, 0.875, 1.270, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.875 std_dev=0.395
C5'	B	0, 0.562, 0.963, 1.365, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.963 std_dev=0.402
O3'	B	0, 0.454, 0.857, 1.260, 1.564 max_d=1.564 avg_d=0.857 std_dev=0.403
OP1	B	0, 0.666, 1.241, 1.817, 2.234 max_d=2.234 avg_d=1.241 std_dev=0.576
OP2	B	0, 1.189, 1.943, 2.697, 2.435 max_d=2.435 avg_d=1.943 std_dev=0.754

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.03	0.03	0.02	0.09	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.04	0.06	0.08	0.02	0.03	0.05	0.03
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.06	0.04	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.10	0.06
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.08	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.03	0.06	0.02	0.02	0.07	0.03
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.05	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.04	0.03	0.07	0.02	0.02	0.06	0.02
C5'	0.01	0.06	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.03	0.05	0.07	0.05	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.04	0.03	0.06	0.01	0.02	0.05	0.02
C8	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.02	0.05	0.03	0.03	0.07	0.03
N1	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.04	0.05	0.08	0.01	0.02	0.04	0.03
N2	0.03	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.11	0.05	0.06	0.08	0.02	0.04	0.05	0.05
N3	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.04	0.06	0.07	0.03	0.03	0.07	0.03
N7	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.07	0.02	0.04	0.06	0.03
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.08	0.03
O2'	0.02	0.09	0.00	0.02	0.06	0.02	0.06	0.02	0.08	0.05	0.08	0.11	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.02	0.05	0.09	0.05	0.13	0.08
O3'	0.05	0.04	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.06	0.00	0.06	0.05	0.05	0.04	0.08	0.05
O4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.05	0.06	0.06	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.04	0.06	0.11	0.07
O5'	0.03	0.08	0.04	0.05	0.06	0.01	0.07	0.01	0.06	0.05	0.08	0.08	0.07	0.07	0.04	0.05	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.02	0.05	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.09	0.05	0.04	0.06	0.00	0.02	0.05	0.02
OP1	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.05	0.04	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.05	0.10	0.08	0.07	0.05	0.06	0.02	0.05	0.07	0.04	0.05	0.07	0.06	0.08	0.13	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.03	0.06	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.08	0.05	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.07	0.16	0.14	0.07	0.09	0.15	0.07	0.17	0.12	0.09	0.08	0.23	0.20	0.11	0.10	0.13	0.27	0.34	0.23
C2	0.14	0.09	0.17	0.17	0.12	0.12	0.09	0.10	0.15	0.09	0.16	0.12	0.25	0.23	0.17	0.11	0.16	0.21	0.27	0.18
C2'	0.13	0.07	0.17	0.14	0.08	0.09	0.14	0.07	0.16	0.12	0.08	0.07	0.24	0.19	0.16	0.09	0.12	0.28	0.33	0.23
C3'	0.12	0.05	0.17	0.13	0.08	0.08	0.12	0.06	0.15	0.10	0.08	0.05	0.25	0.18	0.15	0.09	0.12	0.32	0.33	0.24
C4	0.16	0.07	0.17	0.17	0.04	0.12	0.15	0.09	0.18	0.13	0.10	0.09	0.23	0.22	0.09	0.12	0.14	0.22	0.31	0.19
C4'	0.12	0.05	0.16	0.13	0.08	0.08	0.12	0.09	0.15	0.10	0.09	0.06	0.24	0.19	0.15	0.09	0.14	0.32	0.33	0.25
C5	0.18	0.10	0.18	0.18	0.06	0.15	0.17	0.11	0.20	0.16	0.09	0.11	0.21	0.25	0.05	0.16	0.14	0.20	0.29	0.17
C5'	0.12	0.07	0.16	0.13	0.11	0.09	0.12	0.12	0.14	0.09	0.12	0.08	0.26	0.18	0.18	0.09	0.17	0.33	0.32	0.26
C6	0.18	0.09	0.18	0.19	0.04	0.17	0.13	0.12	0.18	0.15	0.11	0.12	0.21	0.26	0.07	0.16	0.14	0.20	0.26	0.15
C8	0.17	0.11	0.18	0.17	0.10	0.14	0.19	0.10	0.20	0.16	0.09	0.11	0.21	0.23	0.07	0.15	0.14	0.22	0.32	0.19
N1	0.16	0.09	0.18	0.19	0.08	0.15	0.08	0.11	0.15	0.11	0.15	0.13	0.23	0.25	0.12	0.13	0.14	0.20	0.24	0.15
N2	0.11	0.11	0.15	0.15	0.16	0.11	0.11	0.13	0.13	0.08	0.18	0.14	0.26	0.20	0.20	0.09	0.19	0.22	0.25	0.18
N3	0.14	0.08	0.17	0.16	0.11	0.11	0.11	0.09	0.16	0.11	0.14	0.10	0.25	0.21	0.18	0.10	0.16	0.23	0.31	0.20
N7	0.18	0.12	0.18	0.18	0.12	0.16	0.19	0.12	0.20	0.17	0.10	0.12	0.21	0.25	0.11	0.17	0.14	0.21	0.31	0.18
N9	0.14	0.08	0.16	0.15	0.04	0.11	0.15	0.08	0.17	0.13	0.08	0.09	0.22	0.21	0.07	0.11	0.14	0.24	0.33	0.21
O2'	0.19	0.15	0.22	0.20	0.14	0.16	0.21	0.14	0.22	0.19	0.13	0.14	0.27	0.23	0.14	0.17	0.15	0.26	0.31	0.20
O3'	0.12	0.07	0.16	0.13	0.07	0.07	0.13	0.05	0.15	0.11	0.08	0.08	0.23	0.17	0.12	0.08	0.11	0.32	0.32	0.24
O4'	0.13	0.06	0.17	0.16	0.05	0.11	0.11	0.10	0.15	0.10	0.09	0.08	0.24	0.21	0.12	0.10	0.17	0.30	0.35	0.25
O5'	0.10	0.10	0.13	0.12	0.15	0.10	0.11	0.13	0.13	0.07	0.16	0.12	0.22	0.15	0.22	0.09	0.18	0.32	0.30	0.24
O6	0.18	0.11	0.18	0.20	0.08	0.18	0.14	0.14	0.17	0.15	0.11	0.15	0.20	0.27	0.08	0.18	0.13	0.21	0.25	0.14
OP1	0.11	0.08	0.16	0.14	0.15	0.11	0.11	0.15	0.12	0.07	0.15	0.09	0.29	0.18	0.23	0.10	0.19	0.31	0.27	0.22
OP2	0.12	0.06	0.16	0.14	0.12	0.10	0.13	0.13	0.15	0.08	0.12	0.08	0.29	0.19	0.18	0.09	0.18	0.26	0.24	0.19
P	0.11	0.07	0.15	0.13	0.14	0.10	0.12	0.14	0.14	0.08	0.14	0.10	0.27	0.18	0.20	0.09	0.19	0.29	0.27	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.01	0.06	0.13	0.19	0.08
C2	0.02	0.00	0.09	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.09	0.03	0.08	0.10	0.15	0.33	0.18
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.08	0.14	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.24	0.13	0.12
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.28	0.13	0.13
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.06	0.00	0.02	0.17	0.31	0.48	0.33
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.03	0.09	0.01	0.02	0.04	0.00	0.01	0.17	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.03	0.01	0.06	0.20	0.34	0.48	0.36
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.11	0.00	0.16	0.00	0.15	0.06	0.07	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.01	0.13	0.07	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.01	0.09	0.19	0.25	0.38	0.28
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.11	0.15	0.30	0.18
N3	0.01	0.01	0.08	0.04	0.01	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.02	0.15	0.08	0.03	0.06	0.13	0.22	0.42	0.25
O2	0.03	0.01	0.14	0.08	0.03	0.09	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.30	0.12	0.05	0.12	0.07	0.14	0.29	0.12
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.15	0.30	0.00	0.04	0.07	0.02	0.07	0.31	0.17	0.16
O3'	0.05	0.09	0.02	0.01	0.06	0.02	0.03	0.02	0.02	0.05	0.08	0.12	0.04	0.00	0.07	0.02	0.05	0.31	0.14	0.13
O4	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.03	0.05	0.07	0.07	0.00	0.03	0.18	0.36	0.54	0.37
O4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.06	0.12	0.02	0.02	0.03	0.00	0.07	0.09	0.19	0.08
O5'	0.06	0.10	0.06	0.05	0.17	0.01	0.20	0.01	0.19	0.11	0.13	0.07	0.07	0.05	0.18	0.07	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.13	0.15	0.24	0.28	0.31	0.17	0.34	0.13	0.25	0.15	0.22	0.14	0.31	0.31	0.36	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.33	0.13	0.13	0.48	0.11	0.48	0.07	0.38	0.30	0.42	0.29	0.17	0.14	0.54	0.19	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.18	0.12	0.13	0.33	0.03	0.36	0.01	0.28	0.18	0.25	0.12	0.16	0.13	0.37	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00