Doublet Group distance statistics: 51014

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.022 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.003, 0.022, 0.041, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.001, 0.021, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C2	A	0, -0.003, 0.019, 0.042, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.019 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.001, 0.025, 0.049, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.025 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.020, 0.050, 0.080, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.050 std_dev=0.030
N9	A	0, 0.005, 0.038, 0.070, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.038 std_dev=0.033
N7	A	0, 0.003, 0.037, 0.072, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.037 std_dev=0.035
C8	A	0, -0.001, 0.042, 0.085, 0.135 max_d=0.135 avg_d=0.042 std_dev=0.043
N2	A	0, -0.003, 0.043, 0.089, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.043 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.101, 0.213, 0.325, 0.331 max_d=0.331 avg_d=0.213 std_dev=0.112
C2'	A	0, 0.094, 0.225, 0.356, 0.351 max_d=0.351 avg_d=0.225 std_dev=0.131
C4'	A	0, 0.211, 0.384, 0.556, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.384 std_dev=0.172
O5'	A	0, 0.238, 0.424, 0.611, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.424 std_dev=0.187
C3'	A	0, 0.226, 0.419, 0.611, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.419 std_dev=0.193
O2'	A	0, 0.176, 0.409, 0.642, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.409 std_dev=0.233
N1	B	0, 0.192, 0.433, 0.674, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.433 std_dev=0.241
C2'	B	0, 0.228, 0.504, 0.779, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.504 std_dev=0.276
C6	B	0, 0.329, 0.614, 0.899, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.614 std_dev=0.285
C5'	A	0, 0.298, 0.601, 0.904, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.601 std_dev=0.303
C1'	B	0, 0.250, 0.556, 0.863, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.556 std_dev=0.307
P	A	0, 0.293, 0.608, 0.924, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.608 std_dev=0.315
C5	B	0, 0.446, 0.763, 1.080, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.763 std_dev=0.317
O3'	A	0, 0.358, 0.695, 1.031, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.695 std_dev=0.337
C2	B	0, 0.142, 0.493, 0.843, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.493 std_dev=0.351
OP1	A	0, 0.304, 0.656, 1.007, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.656 std_dev=0.351
C4	B	0, 0.297, 0.649, 1.002, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.649 std_dev=0.353
C3'	B	0, 0.284, 0.651, 1.019, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.651 std_dev=0.367
O2'	B	0, 0.261, 0.646, 1.031, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.646 std_dev=0.385
OP2	A	0, 0.296, 0.694, 1.092, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.694 std_dev=0.398
O3'	B	0, 0.281, 0.683, 1.086, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.683 std_dev=0.402
O2	B	0, 0.378, 0.802, 1.225, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.802 std_dev=0.423
O4'	B	0, 0.315, 0.743, 1.171, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.743 std_dev=0.428
O4	B	0, 0.396, 0.845, 1.293, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.845 std_dev=0.449
N3	B	0, 0.017, 0.468, 0.919, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.468 std_dev=0.451
C4'	B	0, 0.322, 0.822, 1.323, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.822 std_dev=0.500
C5'	B	0, 0.416, 1.035, 1.654, 1.949 max_d=1.949 avg_d=1.035 std_dev=0.619
O5'	B	0, 0.282, 0.933, 1.583, 1.970 max_d=1.970 avg_d=0.933 std_dev=0.651
OP2	B	0, 0.298, 1.223, 2.148, 2.785 max_d=2.785 avg_d=1.223 std_dev=0.925
P	B	0, 0.037, 1.020, 2.003, 2.531 max_d=2.531 avg_d=1.020 std_dev=0.983
OP1	B	0, 0.125, 1.177, 2.229, 2.902 max_d=2.902 avg_d=1.177 std_dev=1.052

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.03	0.06	0.08	0.05
C2	0.04	0.00	0.17	0.14	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.20	0.21	0.06	0.08	0.02	0.09	0.19	0.10
C2'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.02	0.08	0.03	0.11	0.06	0.15	0.20	0.15	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.08	0.10	0.12	0.16	0.10
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.11	0.12	0.13	0.18	0.13	0.11	0.05	0.02	0.01	0.03	0.13	0.12	0.17	0.17	0.15
C4	0.02	0.01	0.10	0.08	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.04	0.07	0.02	0.07	0.16	0.08
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.10	0.05	0.07	0.05	0.09	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.08	0.06	0.04	0.04
C5	0.02	0.02	0.08	0.09	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.12	0.06	0.10	0.02	0.12	0.19	0.13
C5'	0.03	0.06	0.03	0.03	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.15	0.09	0.05	0.05	0.15	0.07	0.06	0.07	0.02	0.01	0.14	0.07	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.12	0.16	0.06	0.11	0.01	0.14	0.22	0.15
C8	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.04	0.11	0.02	0.11	0.14	0.10
N1	0.04	0.01	0.15	0.13	0.02	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.17	0.19	0.06	0.09	0.02	0.12	0.22	0.13
N2	0.05	0.01	0.20	0.18	0.02	0.07	0.02	0.05	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.25	0.27	0.05	0.08	0.04	0.08	0.20	0.09
N3	0.04	0.01	0.15	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.17	0.05	0.07	0.01	0.06	0.16	0.07
N7	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.05	0.12	0.03	0.15	0.19	0.15
N9	0.00	0.02	0.03	0.05	0.01	0.03	0.02	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.06	0.03	0.05	0.12	0.06
O2'	0.02	0.20	0.01	0.02	0.10	0.05	0.08	0.06	0.12	0.05	0.17	0.25	0.17	0.05	0.03	0.00	0.06	0.05	0.09	0.12	0.13	0.14	0.10
O3'	0.01	0.21	0.02	0.01	0.10	0.02	0.12	0.07	0.16	0.15	0.19	0.27	0.17	0.14	0.05	0.06	0.00	0.02	0.19	0.17	0.28	0.22	0.24
O4'	0.01	0.06	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.06	0.05	0.05	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.08	0.14	0.11	0.13
O5'	0.05	0.08	0.08	0.13	0.07	0.02	0.10	0.01	0.11	0.11	0.09	0.08	0.07	0.12	0.06	0.09	0.19	0.10	0.00	0.13	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.10	0.12	0.02	0.08	0.02	0.14	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.12	0.17	0.08	0.13	0.00	0.19	0.25	0.19
OP1	0.06	0.09	0.12	0.17	0.07	0.06	0.12	0.07	0.14	0.11	0.12	0.08	0.06	0.15	0.05	0.13	0.28	0.14	0.02	0.19	0.00	0.02	0.01
OP2	0.08	0.19	0.16	0.17	0.16	0.04	0.19	0.04	0.22	0.14	0.22	0.20	0.16	0.19	0.12	0.14	0.22	0.11	0.02	0.25	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.10	0.10	0.15	0.08	0.04	0.13	0.02	0.15	0.10	0.13	0.09	0.07	0.15	0.06	0.10	0.24	0.13	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.24	0.15	0.14	0.42	0.14	0.33	0.13	0.22	0.15	0.39	0.20	0.24	0.14	0.49	0.13	0.10	0.47	0.29	0.23
C2	0.13	0.11	0.13	0.08	0.39	0.09	0.41	0.16	0.24	0.07	0.11	0.34	0.23	0.05	0.55	0.09	0.25	0.33	0.37	0.31
C2'	0.10	0.22	0.12	0.10	0.40	0.10	0.31	0.10	0.19	0.12	0.37	0.19	0.22	0.10	0.50	0.10	0.12	0.55	0.37	0.30
C3'	0.13	0.16	0.16	0.13	0.26	0.14	0.18	0.13	0.09	0.04	0.25	0.22	0.24	0.15	0.33	0.12	0.17	0.68	0.50	0.41
C4	0.10	0.08	0.11	0.09	0.38	0.10	0.38	0.15	0.25	0.10	0.20	0.20	0.20	0.06	0.47	0.12	0.20	0.33	0.29	0.24
C4'	0.16	0.25	0.16	0.11	0.25	0.15	0.15	0.12	0.08	0.10	0.31	0.35	0.24	0.12	0.31	0.16	0.16	0.68	0.47	0.39
C5	0.11	0.13	0.12	0.13	0.24	0.17	0.33	0.23	0.24	0.10	0.06	0.28	0.16	0.09	0.29	0.18	0.28	0.35	0.35	0.32
C5'	0.28	0.31	0.27	0.18	0.20	0.23	0.15	0.17	0.17	0.22	0.29	0.44	0.34	0.15	0.22	0.26	0.22	0.75	0.55	0.47
C6	0.15	0.23	0.15	0.15	0.16	0.19	0.33	0.28	0.24	0.13	0.17	0.39	0.18	0.12	0.22	0.20	0.35	0.40	0.46	0.41
C8	0.10	0.13	0.07	0.14	0.27	0.16	0.29	0.20	0.23	0.14	0.20	0.12	0.11	0.07	0.29	0.19	0.19	0.37	0.28	0.23
N1	0.14	0.20	0.14	0.12	0.27	0.14	0.38	0.23	0.24	0.11	0.10	0.41	0.21	0.09	0.40	0.14	0.31	0.38	0.45	0.39
N2	0.14	0.11	0.13	0.07	0.41	0.07	0.42	0.14	0.24	0.05	0.13	0.35	0.26	0.04	0.61	0.07	0.25	0.33	0.39	0.32
N3	0.13	0.07	0.13	0.08	0.44	0.08	0.40	0.12	0.24	0.08	0.23	0.23	0.25	0.06	0.58	0.09	0.19	0.32	0.30	0.24
N7	0.13	0.10	0.12	0.17	0.18	0.22	0.26	0.27	0.22	0.12	0.08	0.18	0.13	0.13	0.20	0.24	0.29	0.35	0.33	0.30
N9	0.11	0.17	0.11	0.12	0.38	0.12	0.34	0.14	0.25	0.15	0.30	0.11	0.18	0.08	0.43	0.14	0.15	0.38	0.27	0.21
O2'	0.14	0.27	0.16	0.13	0.47	0.15	0.34	0.12	0.21	0.14	0.44	0.25	0.27	0.15	0.59	0.14	0.12	0.59	0.37	0.31
O3'	0.17	0.17	0.20	0.18	0.25	0.21	0.17	0.19	0.09	0.06	0.26	0.25	0.28	0.23	0.34	0.18	0.22	0.82	0.60	0.52
O4'	0.12	0.25	0.15	0.17	0.30	0.16	0.20	0.15	0.13	0.10	0.34	0.33	0.22	0.20	0.35	0.13	0.13	0.58	0.37	0.31
O5'	0.10	0.22	0.11	0.05	0.15	0.05	0.15	0.06	0.13	0.11	0.21	0.33	0.13	0.02	0.16	0.07	0.09	0.67	0.51	0.40
O6	0.19	0.31	0.19	0.20	0.12	0.26	0.27	0.35	0.24	0.20	0.32	0.44	0.20	0.18	0.11	0.26	0.41	0.48	0.55	0.49
OP1	0.05	0.16	0.06	0.02	0.12	0.02	0.21	0.05	0.20	0.09	0.13	0.31	0.10	0.02	0.13	0.02	0.13	0.86	0.66	0.54
OP2	0.05	0.11	0.05	0.04	0.24	0.07	0.33	0.12	0.29	0.15	0.14	0.16	0.04	0.01	0.26	0.07	0.13	0.76	0.71	0.55
P	0.04	0.13	0.05	0.01	0.13	0.02	0.22	0.06	0.20	0.09	0.11	0.25	0.06	0.00	0.14	0.02	0.11	0.76	0.60	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01	0.11	0.17	0.11	0.10
C2	0.04	0.00	0.11	0.07	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.11	0.01	0.04	0.24	0.28	0.29	0.24
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.03	0.08	0.04	0.10	0.19	0.00	0.02	0.06	0.02	0.12	0.38	0.21	0.17
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.08	0.01	0.15	0.03	0.16	0.07	0.05	0.16	0.02	0.01	0.08	0.01	0.10	0.44	0.27	0.24
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.10	0.01	0.25	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.00	0.04	0.34	0.38	0.41	0.36
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.14	0.07	0.05	0.10	0.04	0.01	0.10	0.00	0.04	0.20	0.03	0.03
C5	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.14	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.04	0.37	0.38	0.39	0.35
C5'	0.05	0.14	0.03	0.03	0.25	0.01	0.29	0.00	0.26	0.16	0.18	0.10	0.04	0.03	0.26	0.02	0.01	0.09	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.02	0.14	0.01	0.26	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.17	0.02	0.04	0.34	0.32	0.28	0.28
N1	0.02	0.01	0.04	0.07	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.03	0.24	0.26	0.24	0.21
N3	0.03	0.00	0.10	0.05	0.00	0.05	0.01	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.08	0.01	0.04	0.28	0.33	0.36	0.30
O2	0.07	0.00	0.19	0.16	0.01	0.10	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.24	0.22	0.02	0.07	0.20	0.25	0.26	0.21
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.08	0.04	0.06	0.04	0.06	0.04	0.14	0.24	0.00	0.04	0.09	0.07	0.10	0.40	0.20	0.16
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.09	0.01	0.17	0.03	0.17	0.06	0.08	0.22	0.04	0.00	0.09	0.01	0.11	0.62	0.41	0.35
O4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.10	0.01	0.26	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.09	0.00	0.05	0.36	0.41	0.46	0.39
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.07	0.07	0.01	0.05	0.00	0.05	0.03	0.19	0.18
O5'	0.11	0.24	0.12	0.10	0.34	0.04	0.37	0.01	0.34	0.24	0.28	0.20	0.10	0.11	0.36	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.17	0.28	0.38	0.44	0.38	0.20	0.38	0.09	0.32	0.26	0.33	0.25	0.40	0.62	0.41	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.29	0.21	0.27	0.41	0.03	0.39	0.02	0.28	0.24	0.36	0.26	0.20	0.41	0.46	0.19	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.17	0.24	0.36	0.03	0.35	0.01	0.28	0.21	0.30	0.21	0.16	0.35	0.39	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00