Doublet Group distance statistics: 51017

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.013
O6	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.007, 0.026, 0.044, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.006, 0.025, 0.043, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.025 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.008, 0.029, 0.050, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.006, 0.028, 0.050, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.028 std_dev=0.022
C2	A	0, 0.010, 0.036, 0.063, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.036 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.011, 0.039, 0.066, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.039 std_dev=0.027
C1'	A	0, 0.012, 0.041, 0.070, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.041 std_dev=0.029
N2	A	0, 0.024, 0.081, 0.138, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.081 std_dev=0.057
O4'	A	0, 0.017, 0.109, 0.202, 0.226 max_d=0.226 avg_d=0.109 std_dev=0.092
C2'	A	0, 0.016, 0.125, 0.234, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.125 std_dev=0.109
C6	B	0, 0.082, 0.349, 0.616, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.349 std_dev=0.267
C4'	A	0, 0.108, 0.375, 0.643, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.375 std_dev=0.267
N1	B	0, 0.082, 0.374, 0.665, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.374 std_dev=0.291
C2'	B	0, 0.097, 0.390, 0.684, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.390 std_dev=0.293
C5	B	0, 0.127, 0.453, 0.779, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.453 std_dev=0.326
C1'	B	0, 0.076, 0.411, 0.747, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.411 std_dev=0.335
C5'	A	0, 0.100, 0.445, 0.789, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.445 std_dev=0.345
C2	B	0, 0.144, 0.497, 0.849, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.497 std_dev=0.353
C3'	B	0, 0.093, 0.451, 0.809, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.451 std_dev=0.358
O2'	B	0, 0.133, 0.507, 0.880, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.507 std_dev=0.373
O5'	A	0, 0.152, 0.539, 0.926, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.539 std_dev=0.387
C4	B	0, 0.120, 0.519, 0.919, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.519 std_dev=0.400
N3	B	0, 0.141, 0.545, 0.948, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.545 std_dev=0.403
C4'	B	0, 0.114, 0.536, 0.958, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.536 std_dev=0.422
O4'	B	0, 0.030, 0.455, 0.881, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.455 std_dev=0.425
O2	B	0, 0.156, 0.587, 1.017, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.587 std_dev=0.431
O2'	A	0, 0.102, 0.533, 0.964, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.533 std_dev=0.431
C3'	A	0, 0.093, 0.527, 0.961, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.527 std_dev=0.434
O3'	B	0, 0.183, 0.627, 1.071, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.627 std_dev=0.444
P	A	0, 0.184, 0.666, 1.148, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.666 std_dev=0.482
OP2	A	0, 0.182, 0.665, 1.148, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.665 std_dev=0.483
O4	B	0, 0.087, 0.616, 1.145, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.616 std_dev=0.529
C5'	B	0, 0.156, 0.700, 1.244, 1.327 max_d=1.327 avg_d=0.700 std_dev=0.544
O5'	B	0, 0.224, 0.850, 1.475, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.850 std_dev=0.626
OP1	A	0, 0.195, 0.863, 1.530, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.863 std_dev=0.667
P	B	0, 0.321, 1.109, 1.897, 1.762 max_d=1.762 avg_d=1.109 std_dev=0.788
OP2	B	0, 0.282, 1.129, 1.976, 2.039 max_d=2.039 avg_d=1.129 std_dev=0.847
OP1	B	0, 0.356, 1.223, 2.090, 1.902 max_d=1.902 avg_d=1.223 std_dev=0.867
O3'	A	0, 0.086, 1.022, 1.957, 2.261 max_d=2.261 avg_d=1.022 std_dev=0.936

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.18	0.00	0.08	0.01	0.06	0.13	0.10
C2	0.03	0.00	0.07	0.15	0.01	0.04	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.34	0.17	0.03	0.19	0.00	0.21	0.26	0.20
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02	0.10	0.03	0.03	0.05	0.08	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.20	0.02	0.15	0.27	0.21
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.24	0.00	0.37	0.01	0.35	0.45	0.26	0.08	0.12	0.47	0.27	0.02	0.01	0.02	0.11	0.40	0.14	0.16	0.14
C4	0.01	0.01	0.04	0.24	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.28	0.06	0.01	0.20	0.01	0.20	0.19	0.18
C4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.10	0.00	0.19	0.00	0.17	0.28	0.10	0.04	0.02	0.28	0.14	0.26	0.02	0.00	0.02	0.20	0.05	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.37	0.00	0.19	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.31	0.23	0.02	0.33	0.01	0.34	0.35	0.32
C5'	0.01	0.13	0.10	0.01	0.17	0.00	0.28	0.00	0.29	0.33	0.22	0.08	0.09	0.37	0.16	0.14	0.14	0.02	0.01	0.34	0.05	0.01	0.00
C6	0.01	0.00	0.03	0.35	0.00	0.17	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.35	0.20	0.01	0.35	0.00	0.39	0.44	0.37
C8	0.01	0.01	0.03	0.45	0.00	0.28	0.00	0.33	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.41	0.05	0.32	0.01	0.28	0.17	0.24
N1	0.02	0.00	0.05	0.26	0.01	0.10	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.36	0.06	0.01	0.29	0.00	0.32	0.38	0.31
N2	0.04	0.00	0.08	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.34	0.30	0.05	0.16	0.01	0.17	0.24	0.17
N3	0.03	0.00	0.07	0.12	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.20	0.04	0.14	0.00	0.14	0.16	0.13
N7	0.01	0.01	0.02	0.47	0.00	0.28	0.00	0.37	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.25	0.43	0.05	0.41	0.01	0.41	0.38	0.38
N9	0.00	0.01	0.02	0.27	0.00	0.14	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.18	0.11	0.01	0.14	0.00	0.13	0.06	0.10
O2'	0.01	0.34	0.00	0.02	0.28	0.26	0.31	0.14	0.35	0.17	0.36	0.34	0.29	0.25	0.18	0.00	0.05	0.21	0.07	0.37	0.04	0.25	0.09
O3'	0.18	0.17	0.01	0.01	0.06	0.02	0.23	0.14	0.20	0.41	0.06	0.30	0.20	0.43	0.11	0.05	0.00	0.13	0.32	0.29	0.52	0.44	0.41
O4'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.05	0.04	0.05	0.01	0.21	0.13	0.00	0.11	0.02	0.10	0.16	0.14
O5'	0.08	0.19	0.20	0.11	0.20	0.02	0.33	0.01	0.35	0.32	0.29	0.16	0.14	0.41	0.14	0.07	0.32	0.11	0.00	0.41	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.02	0.40	0.01	0.20	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.37	0.29	0.02	0.41	0.00	0.47	0.54	0.45
OP1	0.06	0.21	0.15	0.14	0.20	0.05	0.34	0.05	0.39	0.28	0.32	0.17	0.14	0.41	0.13	0.04	0.52	0.10	0.00	0.47	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.26	0.27	0.16	0.19	0.02	0.35	0.01	0.44	0.17	0.38	0.24	0.16	0.38	0.06	0.25	0.44	0.16	0.01	0.54	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.20	0.21	0.14	0.18	0.01	0.32	0.00	0.37	0.24	0.31	0.17	0.13	0.38	0.10	0.09	0.41	0.14	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.18	0.03	0.09	0.15	0.06	0.10	0.07	0.07	0.09	0.19	0.25	0.10	0.14	0.16	0.01	0.12	0.26	0.31	0.22
C2	0.16	0.19	0.13	0.15	0.29	0.17	0.26	0.23	0.20	0.17	0.26	0.17	0.18	0.12	0.32	0.17	0.30	0.39	0.44	0.37
C2'	0.05	0.16	0.09	0.18	0.14	0.15	0.12	0.19	0.10	0.09	0.18	0.23	0.09	0.22	0.14	0.09	0.18	0.28	0.36	0.26
C3'	0.19	0.31	0.16	0.13	0.33	0.12	0.31	0.14	0.28	0.26	0.33	0.31	0.04	0.07	0.32	0.16	0.37	0.63	0.74	0.57
C4	0.10	0.14	0.10	0.09	0.16	0.10	0.13	0.13	0.10	0.10	0.17	0.14	0.15	0.09	0.17	0.09	0.22	0.34	0.39	0.31
C4'	0.12	0.22	0.11	0.08	0.21	0.07	0.18	0.08	0.15	0.17	0.23	0.25	0.06	0.07	0.20	0.09	0.24	0.48	0.52	0.40
C5	0.11	0.07	0.13	0.18	0.11	0.16	0.11	0.22	0.10	0.09	0.08	0.07	0.13	0.20	0.11	0.12	0.30	0.40	0.44	0.38
C5'	0.20	0.28	0.20	0.13	0.27	0.11	0.25	0.10	0.24	0.25	0.29	0.30	0.13	0.06	0.26	0.16	0.31	0.54	0.58	0.47
C6	0.15	0.10	0.16	0.23	0.15	0.23	0.19	0.32	0.17	0.13	0.08	0.10	0.15	0.25	0.14	0.17	0.38	0.44	0.49	0.44
C8	0.01	0.08	0.05	0.06	0.13	0.04	0.11	0.05	0.08	0.05	0.11	0.10	0.09	0.12	0.15	0.01	0.17	0.32	0.36	0.28
N1	0.17	0.16	0.15	0.21	0.26	0.22	0.26	0.31	0.22	0.18	0.20	0.14	0.17	0.20	0.28	0.20	0.37	0.43	0.48	0.43
N2	0.18	0.22	0.13	0.14	0.34	0.17	0.30	0.24	0.23	0.19	0.30	0.18	0.20	0.11	0.40	0.19	0.31	0.39	0.44	0.38
N3	0.13	0.19	0.10	0.09	0.24	0.11	0.20	0.15	0.15	0.14	0.24	0.18	0.18	0.08	0.26	0.13	0.23	0.34	0.40	0.32
N7	0.05	0.04	0.12	0.18	0.13	0.14	0.10	0.18	0.05	0.02	0.09	0.02	0.12	0.25	0.16	0.06	0.26	0.39	0.43	0.36
N9	0.04	0.13	0.05	0.02	0.13	0.03	0.09	0.03	0.06	0.07	0.15	0.17	0.12	0.05	0.14	0.03	0.15	0.30	0.35	0.26
O2'	0.09	0.14	0.06	0.07	0.21	0.03	0.21	0.10	0.14	0.09	0.16	0.24	0.14	0.05	0.26	0.05	0.18	0.31	0.34	0.26
O3'	0.14	0.21	0.15	0.22	0.24	0.19	0.27	0.26	0.25	0.20	0.23	0.23	0.07	0.24	0.23	0.16	0.52	0.91	0.95	0.78
O4'	0.06	0.18	0.08	0.13	0.16	0.10	0.12	0.11	0.10	0.12	0.19	0.24	0.09	0.18	0.16	0.06	0.13	0.26	0.29	0.20
O5'	0.13	0.24	0.12	0.06	0.25	0.05	0.23	0.05	0.21	0.21	0.25	0.24	0.08	0.00	0.24	0.09	0.29	0.52	0.62	0.48
O6	0.14	0.09	0.17	0.28	0.07	0.27	0.17	0.38	0.17	0.12	0.06	0.12	0.14	0.32	0.06	0.19	0.44	0.48	0.53	0.50
OP1	0.03	0.14	0.05	0.01	0.19	0.06	0.18	0.08	0.15	0.12	0.17	0.13	0.05	0.01	0.20	0.03	0.24	0.60	0.67	0.51
OP2	0.06	0.19	0.04	0.02	0.25	0.03	0.24	0.07	0.20	0.17	0.23	0.17	0.03	0.02	0.26	0.04	0.34	0.54	0.75	0.58
P	0.05	0.16	0.05	0.02	0.20	0.01	0.20	0.04	0.17	0.14	0.19	0.14	0.04	0.00	0.21	0.01	0.28	0.55	0.64	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.05	0.10	0.06
C2	0.02	0.00	0.02	0.07	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.07	0.08	0.08	0.05
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.00	0.07	0.22	0.13	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.11	0.08	0.09	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.14	0.28	0.24	0.21
C4	0.03	0.01	0.04	0.11	0.00	0.11	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.00	0.06	0.14	0.10	0.15	0.11
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.12	0.01	0.11	0.07	0.08	0.03	0.04	0.01	0.11	0.00	0.02	0.13	0.03	0.03
C5	0.03	0.00	0.05	0.12	0.01	0.12	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.14	0.01	0.06	0.14	0.11	0.21	0.12
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.18	0.01	0.19	0.00	0.16	0.11	0.14	0.07	0.04	0.02	0.19	0.01	0.00	0.06	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.11	0.00	0.11	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.12	0.01	0.05	0.11	0.09	0.18	0.09
N1	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.04	0.06	0.07	0.11	0.05
N3	0.02	0.00	0.02	0.09	0.00	0.08	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.09	0.01	0.05	0.10	0.08	0.10	0.07
O2	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.00	0.04	0.04	0.02	0.04	0.06	0.10	0.05	0.04
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.03	0.04	0.00	0.03	0.03	0.05	0.09	0.30	0.16	0.15
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.12	0.01	0.14	0.02	0.12	0.08	0.09	0.04	0.03	0.00	0.12	0.01	0.23	0.50	0.45	0.39
O4	0.03	0.01	0.04	0.11	0.00	0.11	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.12	0.00	0.07	0.15	0.12	0.18	0.13
O4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.01	0.07	0.00	0.12	0.06	0.21	0.16
O5'	0.03	0.07	0.07	0.14	0.14	0.02	0.14	0.00	0.11	0.06	0.10	0.06	0.09	0.23	0.15	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.08	0.22	0.28	0.10	0.13	0.11	0.06	0.09	0.07	0.08	0.10	0.30	0.50	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.08	0.13	0.24	0.15	0.03	0.21	0.01	0.18	0.11	0.10	0.05	0.16	0.45	0.18	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.05	0.11	0.21	0.11	0.03	0.12	0.01	0.09	0.05	0.07	0.04	0.15	0.39	0.13	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00