Doublet Group distance statistics: 51021

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 14, 34, 23, 13, 12, 4, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.013, 0.024, 0.034, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.024 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.014, 0.030, 0.047, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.030 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.019, 0.036, 0.054, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.036 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.027, 0.045, 0.062, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.045 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.022, 0.040, 0.057, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.040 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.024, 0.044, 0.063, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.044 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.035, 0.059, 0.082, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.059 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.042, 0.069, 0.097, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.069 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.036, 0.067, 0.099, 0.190 max_d=0.190 avg_d=0.067 std_dev=0.031
O6	A	0, 0.053, 0.088, 0.124, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.088 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.054, 0.090, 0.127, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.090 std_dev=0.037
C8	A	0, 0.071, 0.117, 0.163, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.117 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.079, 0.171, 0.263, 0.451 max_d=0.451 avg_d=0.171 std_dev=0.092
C2'	A	0, 0.175, 0.308, 0.441, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.308 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.080, 0.230, 0.381, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.230 std_dev=0.151
N3	B	0, 0.227, 0.394, 0.562, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.394 std_dev=0.168
C2	B	0, 0.200, 0.369, 0.537, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.369 std_dev=0.168
C4	B	0, 0.197, 0.372, 0.546, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.372 std_dev=0.174
C5	B	0, 0.176, 0.351, 0.526, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.351 std_dev=0.175
N1	B	0, 0.154, 0.361, 0.568, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.361 std_dev=0.207
O2'	A	0, 0.290, 0.497, 0.704, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.497 std_dev=0.207
C6	B	0, 0.160, 0.369, 0.577, 1.534 max_d=1.534 avg_d=0.369 std_dev=0.208
C3'	A	0, 0.162, 0.376, 0.591, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.376 std_dev=0.215
N2	B	0, 0.243, 0.467, 0.690, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.467 std_dev=0.224
N7	B	0, 0.224, 0.448, 0.672, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.448 std_dev=0.224
N9	B	0, 0.242, 0.470, 0.697, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.470 std_dev=0.227
C8	B	0, 0.261, 0.513, 0.765, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.513 std_dev=0.252
C2'	B	0, 0.262, 0.528, 0.794, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.528 std_dev=0.266
C1'	B	0, 0.288, 0.559, 0.829, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.559 std_dev=0.271
O6	B	0, 0.229, 0.502, 0.776, 1.974 max_d=1.974 avg_d=0.502 std_dev=0.273
O5'	A	0, 0.244, 0.542, 0.841, 1.779 max_d=1.779 avg_d=0.542 std_dev=0.299
C5'	A	0, 0.172, 0.496, 0.820, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.496 std_dev=0.324
O2'	B	0, 0.363, 0.700, 1.037, 2.266 max_d=2.266 avg_d=0.700 std_dev=0.337
C3'	B	0, 0.327, 0.665, 1.004, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.665 std_dev=0.339
O3'	A	0, 0.273, 0.628, 0.984, 2.875 max_d=2.875 avg_d=0.628 std_dev=0.355
O4'	B	0, 0.343, 0.700, 1.056, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.700 std_dev=0.356
O3'	B	0, 0.384, 0.790, 1.196, 2.563 max_d=2.563 avg_d=0.790 std_dev=0.406
C4'	B	0, 0.389, 0.804, 1.219, 1.765 max_d=1.765 avg_d=0.804 std_dev=0.415
P	A	0, 0.353, 0.777, 1.201, 2.977 max_d=2.977 avg_d=0.777 std_dev=0.424
OP2	A	0, 0.446, 0.891, 1.337, 3.088 max_d=3.088 avg_d=0.891 std_dev=0.446
O5'	B	0, 0.467, 0.978, 1.490, 2.940 max_d=2.940 avg_d=0.978 std_dev=0.511
C5'	B	0, 0.471, 1.014, 1.558, 2.489 max_d=2.489 avg_d=1.014 std_dev=0.544
OP1	A	0, 0.375, 0.966, 1.558, 4.656 max_d=4.656 avg_d=0.966 std_dev=0.591
P	B	0, 0.576, 1.261, 1.945, 3.145 max_d=3.145 avg_d=1.261 std_dev=0.685
OP2	B	0, 0.579, 1.377, 2.176, 4.624 max_d=4.624 avg_d=1.377 std_dev=0.798
OP1	B	0, 0.639, 1.477, 2.315, 3.848 max_d=3.848 avg_d=1.477 std_dev=0.838

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.03	0.19	0.17	0.12
C2	0.04	0.00	0.10	0.12	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.15	0.05	0.28	0.02	0.35	0.35	0.26
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.07	0.07	0.08	0.11	0.09	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.17	0.08	0.23	0.15	0.14
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.10	0.01	0.13	0.03	0.14	0.14	0.13	0.14	0.11	0.15	0.08	0.02	0.01	0.02	0.21	0.15	0.26	0.15	0.17
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.29	0.02	0.32	0.33	0.25
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.07	0.07	0.05	0.11	0.06	0.07	0.02	0.00	0.02	0.11	0.16	0.16	0.06
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.14	0.03	0.34	0.02	0.40	0.41	0.32
C5'	0.04	0.13	0.02	0.03	0.14	0.01	0.20	0.00	0.21	0.21	0.17	0.11	0.11	0.24	0.13	0.08	0.05	0.01	0.01	0.24	0.18	0.24	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.16	0.03	0.35	0.01	0.44	0.45	0.35
C8	0.02	0.02	0.07	0.14	0.01	0.11	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.15	0.04	0.33	0.03	0.33	0.34	0.29
N1	0.04	0.01	0.08	0.13	0.02	0.07	0.01	0.17	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.16	0.04	0.33	0.01	0.41	0.41	0.32
N2	0.06	0.01	0.11	0.14	0.02	0.07	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.17	0.18	0.06	0.27	0.02	0.34	0.33	0.25
N3	0.04	0.01	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.13	0.05	0.26	0.02	0.31	0.30	0.23
N7	0.02	0.02	0.07	0.15	0.01	0.11	0.00	0.24	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.37	0.03	0.41	0.44	0.35
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.26	0.03	0.27	0.27	0.21
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.08	0.07	0.06	0.08	0.09	0.04	0.12	0.17	0.13	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.08	0.09	0.21	0.11	0.09
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.10	0.02	0.14	0.05	0.16	0.15	0.16	0.18	0.13	0.17	0.07	0.04	0.00	0.02	0.17	0.19	0.29	0.19	0.18
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.11	0.04	0.17	0.18	0.13
O5'	0.15	0.28	0.17	0.21	0.29	0.02	0.34	0.01	0.35	0.33	0.33	0.27	0.26	0.37	0.26	0.08	0.17	0.11	0.00	0.37	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.08	0.15	0.02	0.11	0.02	0.24	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.09	0.19	0.04	0.37	0.00	0.48	0.50	0.39
OP1	0.19	0.35	0.23	0.26	0.32	0.16	0.40	0.18	0.44	0.33	0.41	0.34	0.31	0.41	0.27	0.21	0.29	0.17	0.02	0.48	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.35	0.15	0.15	0.33	0.16	0.41	0.24	0.45	0.34	0.41	0.33	0.30	0.44	0.27	0.11	0.19	0.18	0.02	0.50	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.26	0.14	0.17	0.25	0.06	0.32	0.02	0.35	0.29	0.32	0.25	0.23	0.35	0.21	0.09	0.18	0.13	0.01	0.39	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.17	0.20	0.20	0.14	0.17	0.17	0.20	0.19	0.18	0.17	0.24	0.16	0.19	0.16	0.28	0.20	0.17	0.39	0.23	0.45	0.47	0.35
C2	0.17	0.21	0.19	0.22	0.17	0.18	0.23	0.25	0.26	0.22	0.20	0.30	0.19	0.27	0.17	0.25	0.23	0.17	0.54	0.34	0.63	0.73	0.56
C2'	0.16	0.18	0.18	0.19	0.13	0.14	0.17	0.19	0.20	0.18	0.18	0.26	0.16	0.20	0.14	0.28	0.19	0.13	0.40	0.25	0.52	0.52	0.39
C3'	0.15	0.16	0.20	0.22	0.12	0.19	0.18	0.23	0.20	0.20	0.17	0.23	0.14	0.22	0.14	0.29	0.24	0.13	0.41	0.25	0.58	0.52	0.42
C4	0.17	0.18	0.19	0.23	0.15	0.18	0.19	0.25	0.20	0.21	0.15	0.27	0.18	0.24	0.16	0.26	0.23	0.16	0.52	0.27	0.60	0.67	0.52
C4'	0.17	0.18	0.19	0.17	0.13	0.16	0.16	0.18	0.18	0.18	0.17	0.24	0.16	0.19	0.14	0.30	0.18	0.14	0.31	0.21	0.45	0.38	0.29
C5	0.18	0.20	0.20	0.27	0.16	0.23	0.18	0.31	0.17	0.23	0.15	0.28	0.19	0.25	0.18	0.26	0.28	0.19	0.59	0.23	0.69	0.77	0.61
C5'	0.23	0.23	0.27	0.23	0.20	0.24	0.23	0.23	0.23	0.24	0.22	0.26	0.22	0.26	0.21	0.39	0.27	0.22	0.33	0.26	0.49	0.37	0.32
C6	0.18	0.23	0.20	0.28	0.17	0.24	0.20	0.34	0.18	0.25	0.19	0.31	0.20	0.28	0.19	0.25	0.29	0.20	0.63	0.25	0.75	0.86	0.68
C8	0.18	0.18	0.22	0.27	0.14	0.23	0.16	0.28	0.16	0.20	0.14	0.23	0.18	0.22	0.17	0.28	0.28	0.18	0.52	0.20	0.60	0.64	0.51
N1	0.17	0.22	0.19	0.25	0.17	0.21	0.22	0.30	0.22	0.24	0.18	0.32	0.19	0.28	0.18	0.25	0.26	0.18	0.59	0.31	0.71	0.82	0.63
N2	0.17	0.21	0.19	0.21	0.18	0.17	0.24	0.24	0.28	0.23	0.22	0.30	0.19	0.27	0.18	0.26	0.22	0.17	0.53	0.37	0.61	0.73	0.54
N3	0.17	0.19	0.19	0.21	0.16	0.16	0.22	0.23	0.25	0.21	0.20	0.28	0.18	0.25	0.17	0.26	0.21	0.16	0.50	0.32	0.57	0.66	0.49
N7	0.20	0.20	0.23	0.30	0.16	0.26	0.16	0.34	0.16	0.23	0.17	0.26	0.19	0.24	0.19	0.27	0.32	0.21	0.60	0.20	0.70	0.77	0.62
N9	0.17	0.16	0.20	0.23	0.13	0.18	0.17	0.23	0.18	0.19	0.14	0.24	0.17	0.21	0.16	0.27	0.22	0.16	0.47	0.23	0.54	0.58	0.45
O2'	0.21	0.20	0.20	0.18	0.16	0.16	0.18	0.18	0.21	0.18	0.20	0.28	0.19	0.20	0.17	0.29	0.18	0.19	0.34	0.25	0.45	0.45	0.32
O3'	0.16	0.15	0.20	0.21	0.11	0.19	0.17	0.24	0.19	0.20	0.16	0.24	0.13	0.23	0.14	0.30	0.24	0.14	0.40	0.25	0.62	0.54	0.44
O4'	0.16	0.19	0.19	0.20	0.12	0.17	0.15	0.20	0.18	0.17	0.18	0.26	0.15	0.18	0.14	0.28	0.21	0.15	0.34	0.20	0.40	0.39	0.29
O5'	0.18	0.25	0.24	0.27	0.21	0.25	0.24	0.28	0.27	0.23	0.27	0.28	0.22	0.26	0.19	0.28	0.32	0.18	0.38	0.29	0.58	0.45	0.39
O6	0.20	0.24	0.22	0.30	0.18	0.28	0.20	0.38	0.18	0.27	0.22	0.32	0.20	0.29	0.21	0.26	0.32	0.24	0.68	0.22	0.82	0.94	0.75
OP1	0.12	0.21	0.19	0.36	0.13	0.39	0.20	0.44	0.24	0.17	0.24	0.25	0.16	0.22	0.10	0.16	0.52	0.24	0.40	0.29	0.67	0.43	0.44
OP2	0.19	0.31	0.19	0.32	0.29	0.37	0.34	0.46	0.37	0.32	0.35	0.31	0.28	0.37	0.25	0.15	0.37	0.29	0.55	0.40	0.81	0.66	0.63
P	0.19	0.21	0.24	0.40	0.18	0.41	0.21	0.45	0.23	0.23	0.22	0.23	0.19	0.24	0.18	0.15	0.50	0.29	0.46	0.26	0.68	0.47	0.48

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.17	0.02	0.18	0.26	0.17
C2	0.05	0.00	0.14	0.15	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.17	0.07	0.35	0.02	0.33	0.45	0.31
C2'	0.00	0.14	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.06	0.08	0.07	0.12	0.16	0.13	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.22	0.08	0.25	0.22	0.17
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.11	0.01	0.14	0.03	0.15	0.14	0.15	0.16	0.13	0.15	0.09	0.02	0.01	0.02	0.25	0.16	0.33	0.18	0.18
C4	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.04	0.36	0.01	0.33	0.43	0.31
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.11	0.06	0.08	0.06	0.11	0.05	0.09	0.02	0.00	0.02	0.10	0.16	0.23	0.11
C5	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.13	0.03	0.46	0.01	0.44	0.57	0.43
C5'	0.04	0.12	0.06	0.03	0.12	0.01	0.18	0.00	0.18	0.19	0.15	0.11	0.10	0.22	0.11	0.06	0.07	0.02	0.01	0.22	0.21	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.15	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.04	0.48	0.01	0.49	0.63	0.47
C8	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.09	0.14	0.06	0.45	0.03	0.40	0.48	0.39
N1	0.04	0.01	0.12	0.15	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.14	0.16	0.05	0.42	0.02	0.42	0.56	0.40
N2	0.06	0.01	0.16	0.16	0.01	0.08	0.02	0.11	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.21	0.08	0.31	0.03	0.30	0.42	0.28
N3	0.05	0.01	0.13	0.13	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.15	0.07	0.30	0.02	0.28	0.38	0.26
N7	0.02	0.02	0.05	0.15	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.16	0.05	0.51	0.03	0.50	0.62	0.49
N9	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.02	0.33	0.02	0.28	0.35	0.26
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.09	0.09	0.09	0.06	0.11	0.09	0.14	0.20	0.15	0.09	0.05	0.00	0.05	0.07	0.11	0.11	0.23	0.24	0.19
O3'	0.07	0.17	0.02	0.01	0.10	0.02	0.13	0.07	0.15	0.14	0.16	0.21	0.15	0.16	0.07	0.05	0.00	0.06	0.23	0.17	0.44	0.23	0.24
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.08	0.07	0.05	0.02	0.07	0.06	0.00	0.12	0.05	0.19	0.32	0.22
O5'	0.17	0.35	0.22	0.25	0.36	0.02	0.46	0.01	0.48	0.45	0.42	0.31	0.30	0.51	0.33	0.11	0.23	0.12	0.00	0.52	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.16	0.01	0.10	0.01	0.22	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.11	0.17	0.05	0.52	0.00	0.57	0.72	0.54
OP1	0.18	0.33	0.25	0.33	0.33	0.16	0.44	0.21	0.49	0.40	0.42	0.30	0.28	0.50	0.28	0.23	0.44	0.19	0.02	0.57	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.45	0.22	0.18	0.43	0.23	0.57	0.27	0.63	0.48	0.56	0.42	0.38	0.62	0.35	0.24	0.23	0.32	0.02	0.72	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.31	0.17	0.18	0.31	0.11	0.43	0.02	0.47	0.39	0.40	0.28	0.26	0.49	0.26	0.19	0.24	0.22	0.01	0.54	0.01	0.01	0.00