Doublet Group distance statistics: 51022

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 7, 20, 21, 16, 12, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.006, 0.016, 0.025, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.011, 0.023, 0.035, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.010, 0.022, 0.035, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.023 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.006, 0.021, 0.037, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.009, 0.027, 0.046, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.027 std_dev=0.018
O6	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.032 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.013, 0.033, 0.054, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.015, 0.039, 0.063, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.039 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.068, 0.181, 0.294, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.181 std_dev=0.113
O4'	A	0, 0.051, 0.166, 0.281, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.166 std_dev=0.115
C4	B	0, 0.249, 0.382, 0.516, 0.727 max_d=0.727 avg_d=0.382 std_dev=0.134
C5	B	0, 0.234, 0.380, 0.525, 0.742 max_d=0.742 avg_d=0.380 std_dev=0.146
N1	B	0, 0.245, 0.394, 0.543, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.394 std_dev=0.149
O2'	A	0, 0.072, 0.225, 0.379, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.225 std_dev=0.153
C6	B	0, 0.232, 0.387, 0.542, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.387 std_dev=0.155
N3	B	0, 0.232, 0.398, 0.563, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.398 std_dev=0.165
C2	B	0, 0.219, 0.394, 0.569, 0.845 max_d=0.845 avg_d=0.394 std_dev=0.175
C4'	A	0, 0.130, 0.305, 0.481, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.305 std_dev=0.176
C3'	A	0, 0.152, 0.330, 0.509, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.330 std_dev=0.178
N9	B	0, 0.285, 0.465, 0.645, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.465 std_dev=0.180
O6	B	0, 0.251, 0.466, 0.681, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.466 std_dev=0.215
N7	B	0, 0.248, 0.463, 0.679, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.463 std_dev=0.216
C8	B	0, 0.279, 0.503, 0.727, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.503 std_dev=0.224
C1'	B	0, 0.328, 0.565, 0.803, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.565 std_dev=0.237
N2	B	0, 0.227, 0.479, 0.731, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.479 std_dev=0.252
C2'	B	0, 0.303, 0.562, 0.822, 1.271 max_d=1.271 avg_d=0.562 std_dev=0.260
O3'	A	0, 0.238, 0.518, 0.799, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.518 std_dev=0.280
C5'	A	0, 0.238, 0.530, 0.822, 1.693 max_d=1.693 avg_d=0.530 std_dev=0.292
O4'	B	0, 0.344, 0.637, 0.930, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.637 std_dev=0.293
C3'	B	0, 0.405, 0.703, 1.001, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.703 std_dev=0.298
C4'	B	0, 0.492, 0.809, 1.126, 1.711 max_d=1.711 avg_d=0.809 std_dev=0.317
O2'	B	0, 0.375, 0.708, 1.041, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.708 std_dev=0.333
O3'	B	0, 0.488, 0.867, 1.246, 1.939 max_d=1.939 avg_d=0.867 std_dev=0.379
O5'	A	0, 0.199, 0.595, 0.992, 2.172 max_d=2.172 avg_d=0.595 std_dev=0.397
P	A	0, 0.368, 0.774, 1.180, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.774 std_dev=0.406
C5'	B	0, 0.812, 1.232, 1.652, 2.026 max_d=2.026 avg_d=1.232 std_dev=0.420
OP2	A	0, 0.486, 0.935, 1.383, 2.006 max_d=2.006 avg_d=0.935 std_dev=0.449
OP1	A	0, 0.371, 0.848, 1.326, 2.242 max_d=2.242 avg_d=0.848 std_dev=0.477
O5'	B	0, 0.713, 1.373, 2.033, 3.112 max_d=3.112 avg_d=1.373 std_dev=0.660
P	B	0, 0.796, 1.721, 2.645, 4.416 max_d=4.416 avg_d=1.721 std_dev=0.925
OP1	B	0, 0.998, 1.934, 2.871, 5.283 max_d=5.283 avg_d=1.934 std_dev=0.937
OP2	B	0, 1.854, 2.792, 3.731, 5.700 max_d=5.700 avg_d=2.792 std_dev=0.938

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.13	0.02	0.12	0.27	0.11
C2	0.04	0.00	0.12	0.16	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.20	0.05	0.27	0.01	0.22	0.32	0.21
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.02	0.04	0.02	0.06	0.06	0.10	0.15	0.12	0.05	0.02	0.01	0.03	0.01	0.16	0.06	0.20	0.21	0.10
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.03	0.12	0.11	0.14	0.18	0.14	0.10	0.06	0.02	0.01	0.02	0.22	0.12	0.27	0.19	0.17
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.27	0.01	0.21	0.30	0.20
C4'	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.07	0.07	0.06	0.09	0.05	0.07	0.03	0.01	0.02	0.09	0.12	0.24	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.02	0.33	0.01	0.27	0.34	0.26
C5'	0.04	0.12	0.02	0.03	0.12	0.01	0.17	0.00	0.18	0.17	0.15	0.11	0.10	0.20	0.11	0.06	0.06	0.02	0.01	0.20	0.15	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.14	0.03	0.34	0.01	0.29	0.37	0.29
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.09	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.04	0.32	0.02	0.23	0.30	0.23
N1	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.04	0.31	0.01	0.26	0.36	0.26
N2	0.05	0.01	0.15	0.18	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.24	0.06	0.25	0.02	0.21	0.32	0.20
N3	0.04	0.01	0.12	0.14	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.18	0.05	0.24	0.01	0.19	0.30	0.18
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.04	0.36	0.02	0.29	0.35	0.29
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.24	0.02	0.18	0.28	0.17
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.07	0.06	0.06	0.09	0.04	0.12	0.17	0.13	0.04	0.03	0.00	0.07	0.06	0.08	0.08	0.18	0.21	0.06
O3'	0.03	0.20	0.03	0.01	0.11	0.03	0.11	0.06	0.14	0.13	0.18	0.24	0.18	0.13	0.06	0.07	0.00	0.02	0.22	0.15	0.36	0.24	0.23
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.12	0.04	0.15	0.32	0.17
O5'	0.13	0.27	0.16	0.22	0.27	0.02	0.33	0.01	0.34	0.32	0.31	0.25	0.24	0.36	0.24	0.08	0.22	0.12	0.00	0.37	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.15	0.04	0.37	0.00	0.34	0.41	0.33
OP1	0.12	0.22	0.20	0.27	0.21	0.12	0.27	0.15	0.29	0.23	0.26	0.21	0.19	0.29	0.18	0.18	0.36	0.15	0.02	0.34	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.32	0.21	0.19	0.30	0.24	0.34	0.25	0.37	0.30	0.36	0.32	0.30	0.35	0.28	0.21	0.24	0.32	0.02	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.21	0.10	0.17	0.20	0.05	0.26	0.02	0.29	0.23	0.26	0.20	0.18	0.29	0.17	0.06	0.23	0.17	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.26	0.19	0.23	0.20	0.17	0.20	0.17	0.23	0.16	0.24	0.17	0.29	0.18	0.22	0.22	0.32	0.19	0.22	0.46	0.19	0.48	0.45	0.41
C2	0.24	0.23	0.22	0.22	0.22	0.23	0.26	0.32	0.25	0.29	0.20	0.33	0.23	0.31	0.25	0.27	0.21	0.24	0.59	0.32	0.55	0.71	0.58
C2'	0.22	0.19	0.20	0.14	0.15	0.14	0.17	0.18	0.17	0.23	0.17	0.29	0.18	0.22	0.20	0.32	0.14	0.18	0.46	0.20	0.51	0.47	0.42
C3'	0.22	0.20	0.23	0.16	0.14	0.16	0.15	0.18	0.16	0.22	0.18	0.29	0.18	0.21	0.18	0.36	0.19	0.17	0.45	0.19	0.55	0.46	0.43
C4	0.24	0.20	0.22	0.22	0.19	0.23	0.21	0.30	0.18	0.27	0.15	0.30	0.20	0.27	0.24	0.28	0.21	0.23	0.57	0.22	0.53	0.64	0.54
C4'	0.23	0.25	0.22	0.12	0.16	0.14	0.16	0.13	0.18	0.20	0.22	0.33	0.22	0.19	0.18	0.36	0.13	0.18	0.38	0.19	0.49	0.36	0.36
C5	0.25	0.21	0.24	0.26	0.19	0.27	0.21	0.37	0.15	0.30	0.16	0.30	0.19	0.30	0.25	0.27	0.25	0.26	0.64	0.19	0.60	0.75	0.62
C5'	0.31	0.33	0.33	0.20	0.27	0.23	0.24	0.18	0.26	0.25	0.30	0.39	0.33	0.24	0.26	0.48	0.20	0.26	0.37	0.26	0.51	0.36	0.36
C6	0.25	0.22	0.24	0.27	0.21	0.29	0.24	0.40	0.18	0.33	0.18	0.31	0.20	0.34	0.26	0.26	0.27	0.28	0.68	0.22	0.65	0.85	0.69
C8	0.25	0.22	0.26	0.25	0.17	0.25	0.17	0.32	0.15	0.27	0.18	0.29	0.20	0.24	0.24	0.30	0.24	0.25	0.57	0.18	0.55	0.60	0.53
N1	0.24	0.23	0.22	0.25	0.22	0.26	0.26	0.37	0.23	0.32	0.19	0.33	0.22	0.34	0.26	0.26	0.24	0.25	0.65	0.30	0.61	0.81	0.65
N2	0.25	0.24	0.21	0.22	0.23	0.22	0.27	0.31	0.28	0.29	0.22	0.33	0.24	0.32	0.25	0.28	0.20	0.24	0.58	0.36	0.54	0.71	0.57
N3	0.24	0.20	0.22	0.21	0.21	0.21	0.23	0.28	0.23	0.27	0.18	0.31	0.21	0.28	0.24	0.28	0.20	0.23	0.55	0.28	0.51	0.63	0.52
N7	0.26	0.22	0.26	0.28	0.18	0.30	0.18	0.39	0.15	0.30	0.20	0.28	0.19	0.28	0.25	0.28	0.28	0.28	0.65	0.19	0.61	0.74	0.63
N9	0.24	0.19	0.23	0.21	0.17	0.21	0.18	0.27	0.15	0.26	0.16	0.30	0.19	0.24	0.23	0.30	0.20	0.22	0.53	0.19	0.51	0.55	0.48
O2'	0.25	0.21	0.22	0.16	0.18	0.17	0.18	0.18	0.19	0.23	0.19	0.29	0.21	0.21	0.21	0.33	0.15	0.22	0.42	0.22	0.50	0.41	0.38
O3'	0.23	0.20	0.25	0.19	0.15	0.19	0.16	0.21	0.16	0.23	0.17	0.29	0.18	0.22	0.19	0.37	0.23	0.19	0.45	0.20	0.60	0.47	0.45
O4'	0.23	0.25	0.22	0.19	0.15	0.19	0.15	0.21	0.17	0.21	0.22	0.34	0.20	0.19	0.19	0.33	0.21	0.20	0.42	0.19	0.48	0.39	0.38
O5'	0.19	0.31	0.21	0.10	0.24	0.07	0.26	0.12	0.29	0.24	0.31	0.36	0.28	0.26	0.21	0.28	0.02	0.13	0.41	0.30	0.56	0.42	0.41
O6	0.26	0.22	0.25	0.30	0.21	0.33	0.24	0.46	0.16	0.35	0.21	0.30	0.19	0.36	0.27	0.26	0.30	0.31	0.73	0.19	0.72	0.95	0.77
OP1	0.05	0.23	0.10	0.03	0.13	0.09	0.17	0.21	0.20	0.19	0.22	0.30	0.19	0.21	0.09	0.17	0.02	0.06	0.38	0.23	0.69	0.54	0.50
OP2	0.13	0.31	0.16	0.08	0.25	0.14	0.29	0.28	0.32	0.26	0.32	0.33	0.27	0.30	0.20	0.17	0.03	0.13	0.50	0.34	0.70	0.59	0.56
P	0.06	0.22	0.11	0.02	0.14	0.07	0.17	0.17	0.20	0.18	0.22	0.27	0.18	0.20	0.10	0.16	0.01	0.04	0.38	0.23	0.60	0.44	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.25	0.02	0.20	0.36	0.21
C2	0.04	0.00	0.13	0.16	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.19	0.04	0.45	0.01	0.36	0.52	0.41
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.10	0.15	0.12	0.06	0.03	0.01	0.03	0.01	0.24	0.07	0.28	0.23	0.17
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.03	0.12	0.13	0.14	0.19	0.14	0.13	0.07	0.02	0.01	0.02	0.30	0.13	0.38	0.19	0.24
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.02	0.48	0.01	0.38	0.52	0.42
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.07	0.08	0.06	0.12	0.06	0.06	0.03	0.01	0.02	0.11	0.15	0.34	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03	0.60	0.01	0.50	0.67	0.56
C5'	0.04	0.13	0.02	0.03	0.14	0.01	0.20	0.00	0.21	0.22	0.17	0.12	0.11	0.24	0.13	0.06	0.05	0.02	0.01	0.24	0.23	0.35	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.03	0.61	0.01	0.53	0.73	0.59
C8	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.11	0.01	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.15	0.04	0.61	0.03	0.49	0.60	0.54
N1	0.03	0.01	0.10	0.14	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.03	0.54	0.01	0.46	0.64	0.51
N2	0.04	0.01	0.15	0.19	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.19	0.24	0.05	0.40	0.02	0.32	0.48	0.36
N3	0.03	0.01	0.12	0.14	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.17	0.04	0.40	0.01	0.31	0.45	0.34
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.67	0.03	0.57	0.74	0.64
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.46	0.02	0.35	0.46	0.38
O2'	0.02	0.15	0.01	0.02	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.05	0.13	0.19	0.14	0.05	0.03	0.00	0.06	0.06	0.10	0.09	0.23	0.31	0.15
O3'	0.02	0.19	0.03	0.01	0.11	0.03	0.12	0.05	0.14	0.15	0.17	0.24	0.17	0.15	0.07	0.06	0.00	0.02	0.29	0.16	0.47	0.30	0.31
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.05	0.04	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.21	0.04	0.20	0.45	0.24
O5'	0.25	0.45	0.24	0.30	0.48	0.02	0.60	0.01	0.61	0.61	0.54	0.40	0.40	0.67	0.46	0.10	0.29	0.21	0.00	0.67	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.11	0.01	0.24	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.16	0.04	0.67	0.00	0.60	0.83	0.68
OP1	0.20	0.36	0.28	0.38	0.38	0.15	0.50	0.23	0.53	0.49	0.46	0.32	0.31	0.57	0.35	0.23	0.47	0.20	0.02	0.60	0.00	0.01	0.01
OP2	0.36	0.52	0.23	0.19	0.52	0.34	0.67	0.35	0.73	0.60	0.64	0.48	0.45	0.74	0.46	0.31	0.30	0.45	0.02	0.83	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.41	0.17	0.24	0.42	0.08	0.56	0.02	0.59	0.54	0.51	0.36	0.34	0.64	0.38	0.15	0.31	0.24	0.01	0.68	0.01	0.01	0.00