Doublet Group distance statistics: 51023

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 8, 15, 12, 10, 4, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.008, 0.021, 0.033, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.026 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.012, 0.032, 0.051, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.032 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.002, 0.021, 0.041, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.021 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.009, 0.029, 0.050, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.029 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.010, 0.036, 0.062, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.036 std_dev=0.026
O4'	A	0, 0.033, 0.134, 0.236, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.134 std_dev=0.101
C2'	A	0, 0.039, 0.155, 0.271, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.155 std_dev=0.116
C4'	A	0, 0.077, 0.230, 0.383, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.230 std_dev=0.153
N3	B	0, 0.220, 0.386, 0.551, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.386 std_dev=0.165
C3'	A	0, 0.127, 0.293, 0.458, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.293 std_dev=0.166
C4	B	0, 0.280, 0.446, 0.612, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.446 std_dev=0.166
O2'	A	0, 0.079, 0.254, 0.430, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.254 std_dev=0.176
C2	B	0, 0.237, 0.414, 0.592, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.414 std_dev=0.178
N1	B	0, 0.317, 0.508, 0.700, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.508 std_dev=0.191
C5	B	0, 0.411, 0.610, 0.810, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.610 std_dev=0.199
N9	B	0, 0.294, 0.499, 0.704, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.499 std_dev=0.205
C6	B	0, 0.446, 0.653, 0.861, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.653 std_dev=0.207
N2	B	0, 0.295, 0.512, 0.729, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.512 std_dev=0.217
C1'	B	0, 0.249, 0.491, 0.732, 1.322 max_d=1.322 avg_d=0.491 std_dev=0.241
C3'	B	0, 0.271, 0.519, 0.767, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.519 std_dev=0.248
C8	B	0, 0.439, 0.691, 0.942, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.691 std_dev=0.252
O6	B	0, 0.591, 0.847, 1.104, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.847 std_dev=0.257
O4'	B	0, 0.314, 0.578, 0.841, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.578 std_dev=0.263
N7	B	0, 0.513, 0.778, 1.043, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.778 std_dev=0.265
C5'	A	0, 0.126, 0.399, 0.671, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.399 std_dev=0.273
O3'	A	0, 0.179, 0.458, 0.737, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.458 std_dev=0.279
C4'	B	0, 0.303, 0.598, 0.893, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.598 std_dev=0.295
O3'	B	0, 0.261, 0.557, 0.854, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.557 std_dev=0.296
O5'	A	0, 0.089, 0.396, 0.704, 2.190 max_d=2.190 avg_d=0.396 std_dev=0.307
C2'	B	0, 0.146, 0.470, 0.793, 2.184 max_d=2.184 avg_d=0.470 std_dev=0.324
C5'	B	0, 0.334, 0.708, 1.082, 1.696 max_d=1.696 avg_d=0.708 std_dev=0.374
O5'	B	0, 0.307, 0.717, 1.127, 1.821 max_d=1.821 avg_d=0.717 std_dev=0.410
OP1	A	0, 0.225, 0.673, 1.121, 2.919 max_d=2.919 avg_d=0.673 std_dev=0.448
P	A	0, 0.104, 0.555, 1.005, 3.241 max_d=3.241 avg_d=0.555 std_dev=0.450
O2'	B	0, 0.127, 0.626, 1.124, 3.818 max_d=3.818 avg_d=0.626 std_dev=0.498
P	B	0, 0.405, 0.942, 1.478, 2.271 max_d=2.271 avg_d=0.942 std_dev=0.536
OP2	A	0, 0.083, 0.650, 1.216, 4.212 max_d=4.212 avg_d=0.650 std_dev=0.567
OP1	B	0, 0.318, 1.252, 2.187, 4.843 max_d=4.843 avg_d=1.252 std_dev=0.934
OP2	B	0, 0.220, 1.161, 2.103, 4.658 max_d=4.658 avg_d=1.161 std_dev=0.942

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.02	0.10	0.11	0.08
C2	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.17	0.03	0.19	0.02	0.21	0.27	0.22
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.06	0.09	0.13	0.11	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.07	0.06	0.11	0.12	0.07
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.10	0.01	0.11	0.02	0.12	0.14	0.13	0.16	0.13	0.13	0.08	0.02	0.01	0.02	0.09	0.12	0.12	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.02	0.18	0.01	0.19	0.22	0.19
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.06	0.08	0.06	0.10	0.05	0.07	0.02	0.01	0.02	0.08	0.09	0.05	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.03	0.21	0.01	0.24	0.27	0.24
C5'	0.02	0.10	0.02	0.02	0.10	0.01	0.13	0.00	0.14	0.15	0.12	0.10	0.09	0.17	0.08	0.07	0.04	0.01	0.01	0.17	0.10	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03	0.23	0.00	0.27	0.32	0.27
C8	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.10	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.05	0.20	0.02	0.19	0.21	0.19
N1	0.03	0.01	0.09	0.13	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.03	0.22	0.02	0.25	0.31	0.25
N2	0.04	0.01	0.13	0.16	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.22	0.04	0.19	0.03	0.21	0.28	0.22
N3	0.03	0.01	0.11	0.13	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.16	0.03	0.17	0.02	0.18	0.22	0.18
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.23	0.02	0.26	0.29	0.25
N9	0.01	0.01	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.14	0.02	0.14	0.16	0.14
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.10	0.07	0.08	0.07	0.11	0.04	0.15	0.20	0.16	0.05	0.04	0.00	0.08	0.06	0.06	0.11	0.10	0.10	0.06
O3'	0.02	0.17	0.03	0.01	0.11	0.02	0.13	0.04	0.15	0.16	0.16	0.22	0.16	0.17	0.07	0.08	0.00	0.02	0.16	0.17	0.19	0.20	0.16
O4'	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.10	0.04	0.12	0.11	0.10
O5'	0.08	0.19	0.07	0.09	0.18	0.02	0.21	0.01	0.23	0.20	0.22	0.19	0.17	0.23	0.14	0.06	0.16	0.10	0.00	0.25	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.08	0.01	0.17	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.11	0.17	0.04	0.25	0.00	0.32	0.36	0.31
OP1	0.10	0.21	0.11	0.12	0.19	0.09	0.24	0.10	0.27	0.19	0.25	0.21	0.18	0.26	0.14	0.10	0.19	0.12	0.02	0.32	0.00	0.02	0.01
OP2	0.11	0.27	0.12	0.12	0.22	0.05	0.27	0.04	0.32	0.21	0.31	0.28	0.22	0.29	0.16	0.10	0.20	0.11	0.02	0.36	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.22	0.07	0.09	0.19	0.03	0.24	0.02	0.27	0.19	0.25	0.22	0.18	0.25	0.14	0.06	0.16	0.10	0.01	0.31	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.23	0.23	0.21	0.19	0.18	0.21	0.19	0.22	0.23	0.22	0.31	0.20	0.24	0.20	0.24	0.19	0.20	0.37	0.24	0.42	0.56	0.38
C2	0.20	0.18	0.18	0.20	0.19	0.18	0.22	0.23	0.24	0.22	0.19	0.25	0.19	0.25	0.20	0.27	0.18	0.20	0.43	0.30	0.67	0.71	0.48
C2'	0.19	0.23	0.18	0.16	0.17	0.13	0.20	0.15	0.22	0.22	0.23	0.32	0.20	0.23	0.18	0.24	0.14	0.17	0.38	0.25	0.43	0.57	0.38
C3'	0.18	0.21	0.16	0.14	0.14	0.13	0.18	0.15	0.19	0.21	0.19	0.31	0.19	0.22	0.16	0.25	0.13	0.16	0.38	0.22	0.44	0.53	0.38
C4	0.19	0.16	0.17	0.20	0.16	0.17	0.20	0.22	0.21	0.22	0.17	0.25	0.16	0.24	0.18	0.27	0.18	0.18	0.42	0.26	0.59	0.67	0.45
C4'	0.19	0.24	0.21	0.14	0.16	0.11	0.17	0.12	0.19	0.19	0.21	0.32	0.21	0.20	0.17	0.26	0.12	0.16	0.32	0.20	0.35	0.45	0.30
C5	0.19	0.16	0.17	0.22	0.15	0.20	0.19	0.26	0.19	0.22	0.13	0.25	0.17	0.24	0.18	0.32	0.21	0.19	0.45	0.26	0.67	0.72	0.49
C5'	0.26	0.26	0.27	0.18	0.21	0.19	0.19	0.17	0.19	0.21	0.22	0.32	0.26	0.20	0.21	0.36	0.16	0.23	0.33	0.19	0.39	0.42	0.30
C6	0.20	0.19	0.18	0.23	0.17	0.22	0.20	0.29	0.20	0.23	0.15	0.26	0.19	0.25	0.19	0.33	0.22	0.20	0.47	0.27	0.76	0.77	0.53
C8	0.20	0.20	0.16	0.20	0.17	0.18	0.21	0.22	0.21	0.24	0.19	0.26	0.19	0.26	0.19	0.31	0.19	0.18	0.42	0.25	0.52	0.64	0.44
N1	0.20	0.20	0.17	0.22	0.19	0.20	0.22	0.27	0.23	0.23	0.18	0.27	0.20	0.25	0.20	0.30	0.20	0.20	0.46	0.30	0.74	0.76	0.52
N2	0.20	0.20	0.19	0.20	0.20	0.18	0.23	0.23	0.26	0.23	0.22	0.25	0.20	0.25	0.20	0.27	0.18	0.21	0.43	0.32	0.68	0.71	0.48
N3	0.19	0.17	0.18	0.19	0.17	0.17	0.21	0.21	0.23	0.21	0.19	0.24	0.17	0.24	0.19	0.26	0.17	0.19	0.41	0.28	0.59	0.67	0.45
N7	0.19	0.17	0.18	0.23	0.14	0.21	0.18	0.28	0.19	0.23	0.15	0.24	0.17	0.25	0.17	0.37	0.23	0.19	0.46	0.25	0.63	0.71	0.49
N9	0.19	0.19	0.17	0.19	0.17	0.16	0.21	0.20	0.21	0.23	0.19	0.27	0.18	0.24	0.19	0.25	0.17	0.18	0.40	0.25	0.50	0.62	0.42
O2'	0.22	0.27	0.24	0.20	0.21	0.18	0.23	0.19	0.26	0.23	0.28	0.35	0.23	0.24	0.20	0.26	0.20	0.21	0.35	0.29	0.40	0.53	0.35
O3'	0.19	0.22	0.17	0.16	0.15	0.16	0.18	0.19	0.20	0.23	0.20	0.32	0.19	0.24	0.17	0.26	0.18	0.18	0.41	0.24	0.49	0.54	0.40
O4'	0.18	0.24	0.24	0.21	0.17	0.16	0.19	0.18	0.21	0.22	0.22	0.32	0.21	0.22	0.18	0.24	0.20	0.18	0.34	0.22	0.35	0.50	0.34
O5'	0.28	0.27	0.29	0.24	0.22	0.24	0.21	0.22	0.21	0.24	0.24	0.33	0.27	0.23	0.23	0.38	0.26	0.25	0.39	0.22	0.44	0.50	0.37
O6	0.21	0.21	0.20	0.26	0.17	0.26	0.19	0.34	0.19	0.24	0.18	0.27	0.19	0.26	0.20	0.37	0.26	0.23	0.49	0.27	0.83	0.82	0.56
OP1	0.24	0.23	0.25	0.26	0.16	0.30	0.16	0.33	0.18	0.20	0.20	0.29	0.22	0.20	0.17	0.35	0.34	0.26	0.47	0.21	0.63	0.57	0.48
OP2	0.43	0.30	0.44	0.50	0.32	0.53	0.32	0.57	0.30	0.41	0.29	0.32	0.32	0.38	0.37	0.55	0.53	0.47	0.71	0.31	0.74	0.73	0.69
P	0.32	0.24	0.34	0.37	0.21	0.39	0.19	0.38	0.19	0.25	0.20	0.28	0.25	0.23	0.24	0.43	0.46	0.34	0.50	0.21	0.55	0.52	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.09	0.01	0.16	0.02	0.27	0.44	0.23
C2	0.03	0.00	0.15	0.17	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.17	0.05	0.26	0.02	0.54	0.56	0.31
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.08	0.06	0.09	0.11	0.18	0.15	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.23	0.05	0.28	0.42	0.26
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.12	0.01	0.13	0.02	0.15	0.13	0.16	0.20	0.16	0.14	0.09	0.02	0.01	0.01	0.25	0.15	0.26	0.31	0.21
C4	0.02	0.01	0.07	0.12	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.28	0.01	0.52	0.57	0.33
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.10	0.08	0.08	0.07	0.11	0.06	0.11	0.02	0.00	0.01	0.10	0.15	0.28	0.08
C5	0.02	0.01	0.04	0.13	0.01	0.09	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.10	0.03	0.36	0.01	0.67	0.68	0.41
C5'	0.05	0.13	0.08	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.18	0.16	0.12	0.11	0.21	0.12	0.05	0.07	0.02	0.01	0.22	0.22	0.26	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.13	0.12	0.04	0.37	0.01	0.72	0.71	0.43
C8	0.01	0.01	0.09	0.13	0.01	0.10	0.01	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.13	0.05	0.38	0.03	0.59	0.64	0.40
N1	0.03	0.01	0.11	0.16	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.14	0.04	0.32	0.01	0.65	0.65	0.38
N2	0.04	0.01	0.18	0.20	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.22	0.06	0.23	0.03	0.50	0.53	0.29
N3	0.03	0.01	0.15	0.16	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.15	0.04	0.22	0.02	0.46	0.52	0.28
N7	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.14	0.13	0.04	0.41	0.03	0.73	0.74	0.46
N9	0.01	0.02	0.02	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.02	0.27	0.02	0.45	0.53	0.31
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.09	0.11	0.12	0.05	0.13	0.12	0.13	0.18	0.13	0.14	0.07	0.00	0.05	0.08	0.13	0.14	0.26	0.42	0.21
O3'	0.09	0.17	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.07	0.12	0.13	0.14	0.22	0.15	0.13	0.05	0.05	0.00	0.07	0.27	0.13	0.39	0.35	0.25
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.04	0.02	0.08	0.07	0.00	0.15	0.05	0.24	0.46	0.26
O5'	0.16	0.26	0.23	0.25	0.28	0.01	0.36	0.01	0.37	0.38	0.32	0.23	0.22	0.41	0.27	0.13	0.27	0.15	0.00	0.40	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.05	0.15	0.01	0.10	0.01	0.22	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.14	0.13	0.05	0.40	0.00	0.80	0.79	0.47
OP1	0.27	0.54	0.28	0.26	0.52	0.15	0.67	0.22	0.72	0.59	0.65	0.50	0.46	0.73	0.45	0.26	0.39	0.24	0.02	0.80	0.00	0.02	0.01
OP2	0.44	0.56	0.42	0.31	0.57	0.28	0.68	0.26	0.71	0.64	0.65	0.53	0.52	0.74	0.53	0.42	0.35	0.46	0.02	0.79	0.02	0.00	0.01
P	0.23	0.31	0.26	0.21	0.33	0.08	0.41	0.02	0.43	0.40	0.38	0.29	0.28	0.46	0.31	0.21	0.25	0.26	0.01	0.47	0.01	0.01	0.00