Doublet Group distance statistics: 51024

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 4, 10, 10, 9, 5, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.016, 0.025, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.010, 0.019, 0.029, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.022, 0.037, 0.052, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.037 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.009, 0.025, 0.041, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.025 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.014, 0.030, 0.046, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.026, 0.043, 0.061, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.043 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.045, 0.067, 0.090, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.067 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.022, 0.045, 0.068, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.045 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.022, 0.046, 0.070, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.046 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.042, 0.071, 0.100, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.071 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.013, 0.043, 0.074, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.043 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.017, 0.059, 0.100, 0.155 max_d=0.155 avg_d=0.059 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.062, 0.207, 0.352, 0.508 max_d=0.508 avg_d=0.207 std_dev=0.145
C2'	A	0, 0.144, 0.298, 0.453, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.298 std_dev=0.155
C4	B	0, 0.269, 0.445, 0.620, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.445 std_dev=0.175
N3	B	0, 0.300, 0.477, 0.655, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.477 std_dev=0.177
C5	B	0, 0.284, 0.471, 0.658, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.471 std_dev=0.187
C2	B	0, 0.291, 0.495, 0.699, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.495 std_dev=0.204
O2'	A	0, 0.189, 0.395, 0.600, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.395 std_dev=0.205
N9	B	0, 0.248, 0.463, 0.679, 0.962 max_d=0.962 avg_d=0.463 std_dev=0.215
C4'	A	0, 0.155, 0.370, 0.586, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.370 std_dev=0.216
C3'	A	0, 0.166, 0.391, 0.617, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.391 std_dev=0.225
N7	B	0, 0.276, 0.505, 0.733, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.505 std_dev=0.229
C6	B	0, 0.290, 0.520, 0.749, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.520 std_dev=0.230
N1	B	0, 0.273, 0.506, 0.739, 1.023 max_d=1.023 avg_d=0.506 std_dev=0.233
C8	B	0, 0.250, 0.489, 0.727, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.489 std_dev=0.239
C1'	B	0, 0.276, 0.535, 0.795, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.535 std_dev=0.259
N2	B	0, 0.318, 0.581, 0.844, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.581 std_dev=0.263
O6	B	0, 0.326, 0.626, 0.926, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.626 std_dev=0.300
O3'	A	0, 0.193, 0.499, 0.805, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.499 std_dev=0.306
O4'	B	0, 0.292, 0.672, 1.053, 2.333 max_d=2.333 avg_d=0.672 std_dev=0.381
C5'	A	0, 0.290, 0.793, 1.296, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.793 std_dev=0.503
C2'	B	0, 0.127, 0.631, 1.134, 3.350 max_d=3.350 avg_d=0.631 std_dev=0.503
C4'	B	0, 0.264, 0.778, 1.292, 3.521 max_d=3.521 avg_d=0.778 std_dev=0.514
O5'	A	0, 0.212, 0.755, 1.299, 3.496 max_d=3.496 avg_d=0.755 std_dev=0.543
OP2	A	0, 0.345, 0.935, 1.525, 2.888 max_d=2.888 avg_d=0.935 std_dev=0.590
C3'	B	0, 0.128, 0.743, 1.358, 4.316 max_d=4.316 avg_d=0.743 std_dev=0.615
P	A	0, 0.106, 0.789, 1.471, 4.671 max_d=4.671 avg_d=0.789 std_dev=0.682
O2'	B	0, 0.072, 0.759, 1.446, 4.692 max_d=4.692 avg_d=0.759 std_dev=0.687
O3'	B	0, 0.190, 0.890, 1.590, 4.890 max_d=4.890 avg_d=0.890 std_dev=0.700
C5'	B	0, 0.033, 0.953, 1.872, 6.419 max_d=6.419 avg_d=0.953 std_dev=0.919
OP1	A	0, 0.049, 1.039, 2.030, 6.689 max_d=6.689 avg_d=1.039 std_dev=0.991
O5'	B	0, -0.202, 0.986, 2.175, 8.272 max_d=8.272 avg_d=0.986 std_dev=1.189
P	B	0, -0.446, 1.142, 2.730, 11.067 max_d=11.067 avg_d=1.142 std_dev=1.588
OP1	B	0, -0.382, 1.254, 2.890, 11.355 max_d=11.355 avg_d=1.254 std_dev=1.636
OP2	B	0, -0.558, 1.229, 3.016, 12.433 max_d=12.433 avg_d=1.229 std_dev=1.787

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.18	0.02	0.30	0.43	0.16
C2	0.04	0.00	0.14	0.21	0.01	0.09	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.23	0.04	0.40	0.01	0.62	0.53	0.38
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.03	0.08	0.09	0.11	0.17	0.15	0.08	0.03	0.00	0.03	0.01	0.25	0.08	0.39	0.30	0.19
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.14	0.00	0.13	0.04	0.16	0.14	0.19	0.24	0.19	0.14	0.08	0.02	0.01	0.03	0.36	0.16	0.44	0.21	0.27
C4	0.02	0.01	0.07	0.14	0.00	0.09	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02	0.40	0.01	0.53	0.52	0.35
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.09	0.00	0.13	0.01	0.13	0.14	0.11	0.09	0.08	0.16	0.08	0.07	0.02	0.00	0.03	0.16	0.29	0.36	0.11
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.13	0.00	0.33	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.13	0.03	0.49	0.01	0.65	0.59	0.44
C5'	0.06	0.23	0.03	0.04	0.24	0.01	0.33	0.00	0.35	0.33	0.30	0.20	0.18	0.38	0.21	0.07	0.06	0.02	0.01	0.40	0.25	0.43	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.13	0.01	0.35	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.17	0.03	0.51	0.01	0.73	0.62	0.49
C8	0.01	0.01	0.09	0.14	0.01	0.14	0.01	0.33	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.06	0.47	0.02	0.47	0.55	0.36
N1	0.03	0.00	0.11	0.19	0.01	0.11	0.01	0.30	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.20	0.03	0.47	0.01	0.71	0.59	0.45
N2	0.05	0.01	0.17	0.24	0.01	0.09	0.01	0.20	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.28	0.06	0.37	0.02	0.62	0.52	0.37
N3	0.04	0.01	0.15	0.19	0.00	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.21	0.04	0.35	0.02	0.53	0.50	0.32
N7	0.01	0.01	0.08	0.14	0.01	0.16	0.00	0.38	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.16	0.05	0.53	0.02	0.62	0.61	0.45
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.08	0.01	0.21	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.02	0.36	0.02	0.41	0.49	0.27
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.07	0.08	0.07	0.11	0.06	0.13	0.18	0.13	0.07	0.04	0.00	0.05	0.06	0.09	0.11	0.36	0.30	0.12
O3'	0.02	0.23	0.03	0.01	0.13	0.02	0.13	0.06	0.17	0.15	0.20	0.28	0.21	0.16	0.07	0.05	0.00	0.02	0.28	0.18	0.48	0.14	0.26
O4'	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.12	0.04	0.25	0.46	0.18
O5'	0.18	0.40	0.25	0.36	0.40	0.03	0.49	0.01	0.51	0.47	0.47	0.37	0.35	0.53	0.36	0.09	0.28	0.12	0.00	0.55	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.16	0.01	0.40	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.11	0.18	0.04	0.55	0.00	0.80	0.66	0.54
OP1	0.30	0.62	0.39	0.44	0.53	0.29	0.65	0.25	0.73	0.47	0.71	0.62	0.53	0.62	0.41	0.36	0.48	0.25	0.02	0.80	0.00	0.01	0.01
OP2	0.43	0.53	0.30	0.21	0.52	0.36	0.59	0.43	0.62	0.55	0.59	0.52	0.50	0.61	0.49	0.30	0.14	0.46	0.02	0.66	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.38	0.19	0.27	0.35	0.11	0.44	0.02	0.49	0.36	0.45	0.37	0.32	0.45	0.27	0.12	0.26	0.18	0.01	0.54	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.30	0.38	0.31	0.21	0.22	0.20	0.42	0.23	0.17	0.26	0.35	0.28	0.19	0.19	0.52	0.40	0.30	0.30	0.25	0.67	0.36	0.42
C2	0.16	0.20	0.26	0.29	0.15	0.22	0.19	0.42	0.20	0.21	0.15	0.31	0.18	0.24	0.16	0.32	0.36	0.22	0.35	0.29	0.57	0.39	0.37
C2'	0.19	0.35	0.40	0.33	0.20	0.21	0.19	0.44	0.23	0.15	0.29	0.45	0.31	0.18	0.16	0.58	0.48	0.29	0.35	0.25	0.78	0.41	0.50
C3'	0.19	0.27	0.52	0.51	0.15	0.24	0.18	0.35	0.21	0.20	0.24	0.37	0.23	0.22	0.15	0.69	0.68	0.22	0.34	0.25	0.65	0.40	0.41
C4	0.15	0.20	0.31	0.34	0.12	0.20	0.15	0.36	0.17	0.17	0.17	0.29	0.17	0.20	0.13	0.36	0.41	0.21	0.32	0.24	0.48	0.40	0.31
C4'	0.21	0.26	0.55	0.49	0.18	0.18	0.20	0.26	0.22	0.20	0.23	0.32	0.24	0.22	0.18	0.73	0.62	0.21	0.28	0.24	0.59	0.37	0.36
C5	0.18	0.21	0.32	0.41	0.14	0.25	0.16	0.36	0.15	0.22	0.18	0.28	0.17	0.23	0.17	0.31	0.45	0.22	0.42	0.21	0.38	0.58	0.39
C5'	0.33	0.24	0.69	0.68	0.23	0.38	0.27	0.32	0.28	0.30	0.23	0.29	0.26	0.33	0.25	0.88	0.84	0.28	0.42	0.33	0.49	0.48	0.38
C6	0.20	0.23	0.29	0.40	0.18	0.27	0.20	0.39	0.18	0.26	0.21	0.31	0.19	0.28	0.20	0.27	0.43	0.24	0.46	0.23	0.41	0.66	0.44
C8	0.18	0.23	0.40	0.46	0.17	0.25	0.18	0.31	0.22	0.18	0.23	0.26	0.21	0.20	0.16	0.40	0.50	0.22	0.39	0.24	0.33	0.54	0.34
N1	0.19	0.23	0.27	0.34	0.18	0.24	0.21	0.40	0.20	0.25	0.19	0.33	0.20	0.28	0.19	0.27	0.39	0.23	0.40	0.28	0.47	0.53	0.38
N2	0.17	0.20	0.24	0.26	0.16	0.22	0.20	0.46	0.23	0.21	0.17	0.31	0.19	0.25	0.16	0.32	0.33	0.23	0.38	0.32	0.66	0.37	0.43
N3	0.14	0.18	0.28	0.28	0.12	0.20	0.16	0.42	0.20	0.17	0.16	0.30	0.17	0.21	0.13	0.36	0.36	0.22	0.33	0.28	0.61	0.35	0.38
N7	0.19	0.21	0.36	0.48	0.14	0.30	0.15	0.38	0.19	0.21	0.22	0.25	0.17	0.21	0.17	0.33	0.50	0.23	0.50	0.23	0.36	0.70	0.47
N9	0.16	0.24	0.36	0.37	0.16	0.19	0.17	0.33	0.21	0.16	0.22	0.29	0.21	0.18	0.14	0.43	0.43	0.22	0.28	0.24	0.46	0.37	0.29
O2'	0.30	0.43	0.37	0.25	0.29	0.35	0.24	0.62	0.28	0.21	0.35	0.55	0.40	0.20	0.26	0.60	0.36	0.44	0.53	0.27	1.06	0.63	0.77
O3'	0.19	0.30	0.52	0.49	0.16	0.24	0.18	0.39	0.21	0.20	0.26	0.42	0.25	0.22	0.15	0.72	0.69	0.25	0.37	0.25	0.78	0.46	0.51
O4'	0.18	0.25	0.47	0.39	0.18	0.16	0.19	0.31	0.21	0.17	0.23	0.29	0.23	0.19	0.16	0.61	0.48	0.24	0.25	0.23	0.58	0.36	0.35
O5'	0.41	0.28	0.81	0.86	0.29	0.48	0.33	0.41	0.36	0.35	0.31	0.30	0.30	0.37	0.32	0.94	1.00	0.25	0.62	0.42	0.47	0.62	0.51
O6	0.23	0.25	0.30	0.43	0.20	0.32	0.23	0.43	0.22	0.30	0.25	0.32	0.21	0.31	0.23	0.25	0.45	0.27	0.56	0.25	0.46	0.82	0.57
OP1	0.44	0.23	0.86	1.06	0.16	0.76	0.19	0.76	0.31	0.16	0.28	0.27	0.23	0.19	0.23	0.96	1.31	0.38	0.91	0.43	0.80	0.94	0.85
OP2	0.48	0.46	0.85	1.04	0.43	0.73	0.40	0.84	0.42	0.39	0.44	0.49	0.46	0.38	0.43	0.82	1.11	0.41	1.04	0.41	0.92	1.09	0.99
P	0.51	0.22	0.94	1.12	0.26	0.77	0.17	0.76	0.17	0.29	0.18	0.26	0.29	0.20	0.35	0.99	1.31	0.42	0.92	0.22	0.72	0.91	0.82

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.18	0.02	0.17	0.32	0.19
C2	0.03	0.00	0.11	0.15	0.01	0.26	0.01	0.52	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.15	0.21	0.40	0.01	0.61	0.32	0.42
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.07	0.07	0.05	0.09	0.13	0.10	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.15	0.07	0.21	0.28	0.16
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.13	0.02	0.12	0.22	0.11	0.21	0.14	0.21	0.10	0.02	0.01	0.02	0.19	0.15	0.27	0.25	0.19
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.11	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.11	0.27	0.01	0.29	0.35	0.21
C4'	0.01	0.26	0.02	0.01	0.11	0.00	0.08	0.01	0.11	0.20	0.19	0.34	0.25	0.17	0.06	0.13	0.03	0.00	0.02	0.11	0.14	0.23	0.08
C5	0.01	0.01	0.05	0.13	0.00	0.08	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.11	0.05	0.38	0.01	0.26	0.54	0.33
C5'	0.06	0.52	0.07	0.02	0.26	0.01	0.22	0.00	0.28	0.32	0.41	0.66	0.48	0.29	0.14	0.08	0.10	0.02	0.01	0.27	0.19	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.11	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.09	0.35	0.00	0.30	0.49	0.28
C8	0.01	0.01	0.05	0.22	0.01	0.20	0.01	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.13	0.11	0.61	0.02	0.41	0.76	0.59
N1	0.03	0.01	0.09	0.11	0.01	0.19	0.01	0.41	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.13	0.16	0.33	0.01	0.47	0.31	0.29
N2	0.04	0.00	0.13	0.21	0.01	0.34	0.01	0.66	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.19	0.25	0.56	0.02	0.84	0.48	0.64
N3	0.03	0.01	0.10	0.14	0.00	0.25	0.01	0.48	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.14	0.21	0.35	0.01	0.54	0.31	0.36
N7	0.01	0.01	0.05	0.21	0.01	0.17	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.07	0.59	0.02	0.40	0.81	0.59
N9	0.01	0.01	0.03	0.10	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.33	0.01	0.21	0.45	0.29
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.10	0.13	0.12	0.08	0.13	0.15	0.14	0.20	0.15	0.15	0.08	0.00	0.05	0.09	0.09	0.15	0.19	0.25	0.12
O3'	0.11	0.15	0.03	0.01	0.09	0.03	0.11	0.10	0.13	0.13	0.13	0.19	0.14	0.15	0.06	0.05	0.00	0.07	0.21	0.15	0.36	0.27	0.23
O4'	0.01	0.21	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.02	0.09	0.11	0.16	0.25	0.21	0.07	0.01	0.09	0.07	0.00	0.18	0.07	0.18	0.33	0.21
O5'	0.18	0.40	0.15	0.19	0.27	0.02	0.38	0.01	0.35	0.61	0.33	0.56	0.35	0.59	0.33	0.09	0.21	0.18	0.00	0.41	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.11	0.01	0.27	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.15	0.15	0.07	0.41	0.00	0.30	0.61	0.37
OP1	0.17	0.61	0.21	0.27	0.29	0.14	0.26	0.19	0.30	0.41	0.47	0.84	0.54	0.40	0.21	0.19	0.36	0.18	0.02	0.30	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.32	0.28	0.25	0.35	0.23	0.54	0.21	0.49	0.76	0.31	0.48	0.31	0.81	0.45	0.25	0.27	0.33	0.02	0.61	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.42	0.16	0.19	0.21	0.08	0.33	0.02	0.28	0.59	0.29	0.64	0.36	0.59	0.29	0.12	0.23	0.21	0.01	0.37	0.01	0.01	0.00