Doublet Group distance statistics: 51025

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 3, 2, 11, 0, 6, 4, 2, 2, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.014, 0.021, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.014 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.015, 0.027, 0.040, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.027 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.015, 0.028, 0.042, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.028 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.021 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.019, 0.035, 0.052, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.023 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.024, 0.047, 0.071, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.047 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.011, 0.036, 0.061, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.036 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.031, 0.058, 0.086, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.058 std_dev=0.028
C8	A	0, 0.034, 0.062, 0.090, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.062 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.027, 0.180, 0.333, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.180 std_dev=0.153
C2'	A	0, 0.032, 0.198, 0.364, 0.775 max_d=0.775 avg_d=0.198 std_dev=0.166
C2'	B	0, 0.258, 0.455, 0.652, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.455 std_dev=0.197
C3'	B	0, 0.263, 0.461, 0.658, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.461 std_dev=0.197
O3'	B	0, 0.292, 0.501, 0.709, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.501 std_dev=0.208
C1'	B	0, 0.279, 0.488, 0.696, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.488 std_dev=0.209
P	A	0, 0.257, 0.468, 0.680, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.468 std_dev=0.211
N9	B	0, 0.280, 0.497, 0.713, 0.898 max_d=0.898 avg_d=0.497 std_dev=0.217
O5'	A	0, 0.179, 0.409, 0.638, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.409 std_dev=0.230
OP2	A	0, 0.267, 0.516, 0.765, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.516 std_dev=0.249
N3	B	0, 0.394, 0.660, 0.926, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.660 std_dev=0.266
C4	B	0, 0.294, 0.560, 0.827, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.560 std_dev=0.267
C4'	A	0, 0.024, 0.302, 0.580, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.302 std_dev=0.278
C8	B	0, 0.364, 0.647, 0.930, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.647 std_dev=0.283
OP1	A	0, 0.276, 0.563, 0.850, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.563 std_dev=0.287
O4'	B	0, 0.332, 0.623, 0.914, 1.533 max_d=1.533 avg_d=0.623 std_dev=0.291
O2'	B	0, 0.349, 0.642, 0.936, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.642 std_dev=0.293
C4'	B	0, 0.366, 0.665, 0.964, 1.528 max_d=1.528 avg_d=0.665 std_dev=0.299
C5'	A	0, 0.131, 0.431, 0.731, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.431 std_dev=0.300
C3'	A	0, 0.013, 0.343, 0.674, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.343 std_dev=0.330
C5	B	0, 0.366, 0.705, 1.045, 1.321 max_d=1.321 avg_d=0.705 std_dev=0.339
N7	B	0, 0.420, 0.767, 1.113, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.767 std_dev=0.347
C2	B	0, 0.486, 0.838, 1.190, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.838 std_dev=0.352
O2'	A	0, -0.049, 0.311, 0.670, 1.734 max_d=1.734 avg_d=0.311 std_dev=0.359
O5'	B	0, 0.585, 0.964, 1.343, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.964 std_dev=0.379
N2	B	0, 0.607, 1.024, 1.442, 1.794 max_d=1.794 avg_d=1.024 std_dev=0.418
C5'	B	0, 0.507, 0.937, 1.367, 2.229 max_d=2.229 avg_d=0.937 std_dev=0.430
N1	B	0, 0.482, 0.915, 1.348, 1.684 max_d=1.684 avg_d=0.915 std_dev=0.433
C6	B	0, 0.433, 0.872, 1.312, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.872 std_dev=0.439
O6	B	0, 0.510, 1.045, 1.581, 1.996 max_d=1.996 avg_d=1.045 std_dev=0.536
P	B	0, 0.732, 1.294, 1.857, 2.328 max_d=2.328 avg_d=1.294 std_dev=0.563
O3'	A	0, -0.012, 0.564, 1.140, 2.720 max_d=2.720 avg_d=0.564 std_dev=0.576
OP2	B	0, 0.651, 1.346, 2.040, 2.555 max_d=2.555 avg_d=1.346 std_dev=0.695
OP1	B	0, 0.746, 1.525, 2.304, 4.657 max_d=4.657 avg_d=1.525 std_dev=0.779

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.18	0.01	0.13	0.03	0.13	0.19	0.13
C2	0.04	0.00	0.17	0.18	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.27	0.07	0.13	0.02	0.13	0.17	0.13
C2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.10	0.02	0.08	0.12	0.11	0.08	0.14	0.19	0.16	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.26	0.10	0.30	0.36	0.29
C3'	0.02	0.18	0.01	0.00	0.16	0.01	0.21	0.02	0.23	0.22	0.20	0.18	0.15	0.24	0.14	0.02	0.01	0.02	0.07	0.25	0.14	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.10	0.16	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.17	0.04	0.12	0.02	0.13	0.17	0.12
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.13	0.06	0.07	0.05	0.13	0.06	0.16	0.02	0.01	0.02	0.11	0.09	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.08	0.21	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.19	0.17	0.03	0.15	0.02	0.15	0.18	0.15
C5'	0.05	0.07	0.12	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.12	0.09	0.08	0.07	0.14	0.06	0.07	0.12	0.02	0.01	0.14	0.09	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.23	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.21	0.21	0.04	0.16	0.01	0.17	0.20	0.16
C8	0.02	0.01	0.08	0.22	0.01	0.13	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.16	0.07	0.14	0.02	0.13	0.16	0.13
N1	0.03	0.01	0.14	0.20	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.24	0.06	0.14	0.01	0.15	0.19	0.15
N2	0.05	0.01	0.19	0.18	0.02	0.07	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.33	0.09	0.13	0.02	0.13	0.17	0.12
N3	0.04	0.01	0.16	0.15	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.26	0.07	0.12	0.02	0.13	0.17	0.12
N7	0.02	0.01	0.07	0.24	0.00	0.13	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.20	0.19	0.06	0.18	0.03	0.17	0.18	0.16
N9	0.01	0.02	0.03	0.14	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.11	0.10	0.02	0.11	0.02	0.12	0.17	0.12
O2'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.14	0.16	0.19	0.07	0.21	0.17	0.19	0.17	0.13	0.20	0.11	0.00	0.06	0.12	0.21	0.23	0.25	0.41	0.26
O3'	0.18	0.27	0.03	0.01	0.17	0.02	0.17	0.12	0.21	0.16	0.24	0.33	0.26	0.19	0.10	0.06	0.00	0.12	0.17	0.23	0.28	0.22	0.20
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.06	0.09	0.07	0.06	0.02	0.12	0.12	0.00	0.08	0.05	0.09	0.11	0.08
O5'	0.13	0.13	0.26	0.07	0.12	0.02	0.15	0.01	0.16	0.14	0.14	0.13	0.12	0.18	0.11	0.21	0.17	0.08	0.00	0.19	0.03	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.10	0.25	0.02	0.11	0.02	0.14	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.23	0.23	0.05	0.19	0.00	0.20	0.23	0.20
OP1	0.13	0.13	0.30	0.14	0.13	0.09	0.15	0.09	0.17	0.13	0.15	0.13	0.13	0.17	0.12	0.25	0.28	0.09	0.03	0.20	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.17	0.36	0.12	0.17	0.04	0.18	0.03	0.20	0.16	0.19	0.17	0.17	0.18	0.17	0.41	0.22	0.11	0.02	0.23	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.13	0.29	0.09	0.12	0.02	0.15	0.02	0.16	0.13	0.15	0.12	0.12	0.16	0.12	0.26	0.20	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.29	0.22	0.15	0.18	0.15	0.21	0.24	0.26	0.20	0.29	0.37	0.25	0.22	0.18	0.35	0.15	0.16	0.44	0.30	0.51	0.58	0.47
C2	0.21	0.28	0.20	0.19	0.20	0.24	0.22	0.39	0.18	0.29	0.21	0.38	0.24	0.32	0.22	0.26	0.15	0.24	0.53	0.26	0.73	0.81	0.65
C2'	0.18	0.31	0.20	0.21	0.17	0.20	0.20	0.32	0.24	0.22	0.29	0.42	0.24	0.23	0.17	0.31	0.23	0.17	0.52	0.27	0.63	0.68	0.57
C3'	0.16	0.28	0.16	0.11	0.19	0.11	0.22	0.22	0.25	0.22	0.28	0.36	0.23	0.23	0.17	0.27	0.09	0.13	0.40	0.27	0.51	0.52	0.43
C4	0.19	0.24	0.20	0.18	0.16	0.21	0.16	0.36	0.13	0.23	0.18	0.33	0.22	0.25	0.19	0.27	0.15	0.20	0.52	0.20	0.65	0.74	0.60
C4'	0.17	0.35	0.16	0.11	0.23	0.10	0.25	0.15	0.30	0.21	0.34	0.42	0.28	0.23	0.18	0.28	0.10	0.13	0.34	0.31	0.41	0.41	0.34
C5	0.21	0.27	0.21	0.21	0.18	0.27	0.16	0.43	0.16	0.26	0.24	0.32	0.24	0.25	0.21	0.24	0.17	0.26	0.55	0.18	0.72	0.79	0.66
C5'	0.20	0.38	0.19	0.13	0.27	0.12	0.27	0.14	0.31	0.23	0.35	0.44	0.33	0.25	0.22	0.25	0.10	0.16	0.31	0.31	0.40	0.32	0.31
C6	0.23	0.29	0.21	0.22	0.20	0.31	0.18	0.47	0.20	0.29	0.29	0.35	0.25	0.28	0.23	0.23	0.18	0.30	0.58	0.20	0.80	0.86	0.72
C8	0.23	0.24	0.25	0.20	0.19	0.23	0.18	0.36	0.19	0.23	0.22	0.29	0.23	0.22	0.21	0.29	0.16	0.22	0.52	0.21	0.61	0.65	0.57
N1	0.22	0.30	0.20	0.21	0.20	0.28	0.20	0.45	0.16	0.30	0.27	0.38	0.25	0.31	0.23	0.23	0.17	0.28	0.56	0.14	0.79	0.86	0.71
N2	0.21	0.28	0.19	0.19	0.21	0.23	0.26	0.38	0.24	0.30	0.22	0.40	0.25	0.35	0.23	0.26	0.14	0.24	0.53	0.34	0.74	0.82	0.65
N3	0.20	0.25	0.20	0.17	0.18	0.20	0.21	0.34	0.20	0.25	0.18	0.36	0.23	0.29	0.20	0.28	0.14	0.20	0.51	0.30	0.66	0.75	0.60
N7	0.24	0.26	0.24	0.23	0.22	0.29	0.21	0.44	0.22	0.26	0.25	0.29	0.25	0.25	0.23	0.26	0.19	0.27	0.57	0.24	0.70	0.76	0.65
N9	0.20	0.24	0.22	0.17	0.15	0.18	0.16	0.31	0.18	0.21	0.20	0.31	0.22	0.22	0.17	0.30	0.14	0.17	0.49	0.23	0.58	0.65	0.54
O2'	0.22	0.42	0.21	0.17	0.22	0.16	0.23	0.28	0.29	0.23	0.37	0.59	0.35	0.26	0.19	0.39	0.18	0.17	0.50	0.32	0.63	0.73	0.58
O3'	0.16	0.37	0.16	0.14	0.23	0.13	0.26	0.23	0.32	0.23	0.37	0.46	0.29	0.26	0.19	0.27	0.16	0.13	0.38	0.34	0.52	0.52	0.43
O4'	0.18	0.33	0.20	0.15	0.21	0.14	0.26	0.18	0.31	0.20	0.34	0.37	0.25	0.24	0.17	0.34	0.16	0.15	0.37	0.33	0.41	0.45	0.37
O5'	0.16	0.30	0.19	0.07	0.21	0.06	0.21	0.14	0.24	0.20	0.28	0.35	0.26	0.21	0.17	0.24	0.02	0.11	0.37	0.24	0.47	0.36	0.37
O6	0.25	0.31	0.22	0.25	0.22	0.35	0.22	0.53	0.27	0.31	0.33	0.35	0.26	0.28	0.25	0.22	0.21	0.35	0.60	0.30	0.86	0.91	0.78
OP1	0.07	0.27	0.11	0.03	0.14	0.07	0.15	0.15	0.19	0.16	0.24	0.35	0.23	0.17	0.08	0.16	0.03	0.04	0.32	0.20	0.53	0.29	0.35
OP2	0.09	0.21	0.09	0.07	0.16	0.17	0.22	0.30	0.23	0.24	0.22	0.24	0.17	0.27	0.15	0.08	0.02	0.12	0.46	0.26	0.62	0.38	0.47
P	0.05	0.22	0.09	0.01	0.12	0.07	0.14	0.16	0.17	0.17	0.20	0.28	0.18	0.18	0.09	0.12	0.01	0.03	0.35	0.19	0.49	0.28	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.13	0.03	0.30	0.26	0.14
C2	0.03	0.00	0.11	0.14	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.13	0.18	0.04	0.30	0.01	0.45	0.49	0.34
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.02	0.06	0.06	0.09	0.14	0.11	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.18	0.06	0.25	0.22	0.16
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.03	0.10	0.11	0.12	0.17	0.13	0.10	0.05	0.02	0.01	0.02	0.26	0.11	0.29	0.17	0.21
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.32	0.01	0.46	0.46	0.34
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.09	0.06	0.08	0.06	0.09	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.08	0.15	0.21	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.40	0.02	0.56	0.57	0.44
C5'	0.03	0.12	0.02	0.03	0.12	0.01	0.17	0.00	0.17	0.18	0.15	0.12	0.10	0.20	0.11	0.06	0.03	0.02	0.01	0.20	0.16	0.26	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.12	0.03	0.41	0.01	0.59	0.63	0.47
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.09	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.03	0.40	0.03	0.54	0.47	0.40
N1	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.15	0.03	0.36	0.01	0.53	0.57	0.42
N2	0.04	0.01	0.14	0.17	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.23	0.05	0.27	0.02	0.42	0.47	0.31
N3	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.04	0.26	0.01	0.41	0.42	0.29
N7	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.09	0.00	0.20	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.12	0.03	0.45	0.04	0.62	0.60	0.49
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.29	0.03	0.43	0.38	0.29
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.11	0.16	0.12	0.05	0.03	0.00	0.03	0.04	0.08	0.08	0.18	0.19	0.07
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.12	0.12	0.15	0.23	0.16	0.12	0.05	0.03	0.00	0.02	0.24	0.13	0.35	0.17	0.22
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.04	0.29	0.27	0.14
O5'	0.13	0.30	0.18	0.26	0.32	0.02	0.40	0.01	0.41	0.40	0.36	0.27	0.26	0.45	0.29	0.08	0.24	0.11	0.00	0.45	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.02	0.20	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.08	0.13	0.04	0.45	0.00	0.64	0.70	0.53
OP1	0.30	0.45	0.25	0.29	0.46	0.15	0.56	0.16	0.59	0.54	0.53	0.42	0.41	0.62	0.43	0.18	0.35	0.29	0.02	0.64	0.00	0.01	0.01
OP2	0.26	0.49	0.22	0.17	0.46	0.21	0.57	0.26	0.63	0.47	0.57	0.47	0.42	0.60	0.38	0.19	0.17	0.27	0.02	0.70	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.34	0.16	0.21	0.34	0.04	0.44	0.02	0.47	0.40	0.42	0.31	0.29	0.49	0.29	0.07	0.22	0.14	0.01	0.53	0.01	0.01	0.00