Doublet Group distance statistics: 51026

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 5, 11, 4, 1, 3, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.021, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.018 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.007, 0.021, 0.034, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.008, 0.021, 0.035, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.010, 0.025, 0.040, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.013, 0.035, 0.056, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.035 std_dev=0.021
N2	A	0, 0.018, 0.039, 0.061, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.039 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.016, 0.043, 0.070, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.043 std_dev=0.027
O6	A	0, 0.008, 0.043, 0.078, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.043 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.049, 0.193, 0.337, 0.515 max_d=0.515 avg_d=0.193 std_dev=0.144
C2'	A	0, 0.061, 0.206, 0.350, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.206 std_dev=0.144
O2'	A	0, 0.098, 0.263, 0.428, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.263 std_dev=0.165
C5	B	0, 0.198, 0.386, 0.574, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.386 std_dev=0.188
C6	B	0, 0.203, 0.400, 0.596, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.400 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.230, 0.429, 0.628, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.429 std_dev=0.199
N1	B	0, 0.208, 0.432, 0.657, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.432 std_dev=0.225
C4'	A	0, 0.087, 0.328, 0.568, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.328 std_dev=0.241
C3'	A	0, 0.121, 0.364, 0.607, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.364 std_dev=0.243
N7	B	0, 0.237, 0.481, 0.725, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.481 std_dev=0.244
N9	B	0, 0.290, 0.539, 0.789, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.539 std_dev=0.249
N3	B	0, 0.229, 0.480, 0.730, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.480 std_dev=0.250
C2	B	0, 0.221, 0.472, 0.724, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.472 std_dev=0.251
O6	B	0, 0.228, 0.489, 0.749, 1.088 max_d=1.088 avg_d=0.489 std_dev=0.261
C8	B	0, 0.275, 0.549, 0.822, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.549 std_dev=0.273
N2	B	0, 0.284, 0.615, 0.947, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.615 std_dev=0.331
C2'	B	0, 0.341, 0.694, 1.048, 1.690 max_d=1.690 avg_d=0.694 std_dev=0.353
C1'	B	0, 0.336, 0.697, 1.058, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.697 std_dev=0.361
C5'	A	0, 0.142, 0.507, 0.871, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.507 std_dev=0.365
O3'	A	0, 0.177, 0.554, 0.931, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.554 std_dev=0.377
C3'	B	0, 0.298, 0.725, 1.152, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.725 std_dev=0.427
O2'	B	0, 0.442, 0.899, 1.357, 2.159 max_d=2.159 avg_d=0.899 std_dev=0.457
O4'	B	0, 0.341, 0.813, 1.284, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.813 std_dev=0.472
O5'	A	0, 0.175, 0.662, 1.148, 1.813 max_d=1.813 avg_d=0.662 std_dev=0.486
O3'	B	0, 0.269, 0.766, 1.263, 1.834 max_d=1.834 avg_d=0.766 std_dev=0.497
OP2	A	0, 0.245, 0.746, 1.247, 1.799 max_d=1.799 avg_d=0.746 std_dev=0.501
C4'	B	0, 0.361, 0.872, 1.382, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.872 std_dev=0.511
O5'	B	0, 0.455, 0.970, 1.485, 2.104 max_d=2.104 avg_d=0.970 std_dev=0.515
P	A	0, 0.175, 0.707, 1.238, 1.836 max_d=1.836 avg_d=0.707 std_dev=0.531
C5'	B	0, 0.416, 1.001, 1.585, 2.270 max_d=2.270 avg_d=1.001 std_dev=0.584
P	B	0, 0.592, 1.201, 1.811, 2.401 max_d=2.401 avg_d=1.201 std_dev=0.610
OP1	A	0, 0.224, 0.836, 1.449, 2.254 max_d=2.254 avg_d=0.836 std_dev=0.612
OP2	B	0, 0.700, 1.434, 2.168, 2.996 max_d=2.996 avg_d=1.434 std_dev=0.734
OP1	B	0, 0.703, 1.542, 2.380, 3.338 max_d=3.338 avg_d=1.542 std_dev=0.838

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.09	0.02	0.09	0.17	0.07
C2	0.03	0.00	0.15	0.16	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.20	0.05	0.19	0.02	0.15	0.20	0.14
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.12	0.17	0.14	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.08	0.18	0.16	0.11
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.12	0.12	0.15	0.18	0.14	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.22	0.12	0.25	0.18	0.18
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.20	0.02	0.14	0.18	0.13
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.06	0.05	0.07	0.03	0.06	0.02	0.00	0.02	0.07	0.10	0.18	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.03	0.25	0.02	0.18	0.21	0.18
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.12	0.12	0.09	0.06	0.05	0.14	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.14	0.13	0.20	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.16	0.03	0.26	0.01	0.20	0.23	0.20
C8	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.13	0.04	0.25	0.04	0.16	0.17	0.15
N1	0.03	0.01	0.12	0.15	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.19	0.04	0.23	0.02	0.18	0.21	0.17
N2	0.04	0.01	0.17	0.18	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.24	0.06	0.18	0.03	0.15	0.20	0.14
N3	0.04	0.00	0.14	0.14	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.17	0.05	0.17	0.02	0.13	0.18	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.01	0.07	0.00	0.14	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.28	0.05	0.20	0.21	0.20
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.18	0.03	0.12	0.16	0.11
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.09	0.06	0.07	0.06	0.10	0.04	0.14	0.20	0.16	0.04	0.03	0.00	0.06	0.05	0.07	0.10	0.14	0.16	0.07
O3'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.03	0.16	0.13	0.19	0.24	0.17	0.14	0.06	0.06	0.00	0.02	0.24	0.17	0.33	0.24	0.24
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.12	0.05	0.13	0.24	0.14
O5'	0.09	0.19	0.15	0.22	0.20	0.02	0.25	0.01	0.26	0.25	0.23	0.18	0.17	0.28	0.18	0.07	0.24	0.12	0.00	0.28	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.08	0.12	0.02	0.07	0.02	0.14	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.10	0.17	0.05	0.28	0.00	0.23	0.26	0.23
OP1	0.09	0.15	0.18	0.25	0.14	0.10	0.18	0.13	0.20	0.16	0.18	0.15	0.13	0.20	0.12	0.14	0.33	0.13	0.02	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.20	0.16	0.18	0.18	0.18	0.21	0.20	0.23	0.17	0.21	0.20	0.18	0.21	0.16	0.16	0.24	0.24	0.02	0.26	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.11	0.18	0.13	0.03	0.18	0.02	0.20	0.15	0.17	0.14	0.12	0.20	0.11	0.07	0.24	0.14	0.01	0.23	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.32	0.21	0.18	0.20	0.19	0.20	0.20	0.25	0.21	0.30	0.41	0.27	0.20	0.20	0.31	0.19	0.20	0.29	0.26	0.47	0.51	0.36
C2	0.21	0.27	0.20	0.21	0.19	0.24	0.22	0.34	0.20	0.27	0.18	0.40	0.24	0.30	0.22	0.26	0.19	0.23	0.44	0.29	0.85	0.74	0.60
C2'	0.18	0.32	0.17	0.15	0.19	0.14	0.19	0.18	0.23	0.18	0.28	0.42	0.27	0.19	0.17	0.29	0.17	0.15	0.29	0.24	0.49	0.55	0.39
C3'	0.15	0.32	0.16	0.17	0.19	0.16	0.19	0.21	0.23	0.17	0.28	0.42	0.28	0.19	0.15	0.27	0.22	0.14	0.29	0.24	0.45	0.54	0.38
C4	0.18	0.23	0.18	0.21	0.13	0.22	0.16	0.31	0.15	0.23	0.19	0.32	0.18	0.23	0.18	0.24	0.19	0.20	0.40	0.21	0.72	0.66	0.53
C4'	0.18	0.37	0.17	0.12	0.23	0.13	0.21	0.13	0.25	0.18	0.32	0.47	0.33	0.19	0.17	0.28	0.16	0.15	0.23	0.25	0.35	0.44	0.28
C5	0.23	0.22	0.21	0.26	0.16	0.30	0.16	0.41	0.10	0.29	0.18	0.29	0.18	0.27	0.22	0.22	0.22	0.28	0.49	0.14	0.85	0.73	0.63
C5'	0.26	0.40	0.26	0.19	0.28	0.22	0.24	0.18	0.27	0.21	0.34	0.48	0.38	0.22	0.23	0.36	0.21	0.23	0.24	0.26	0.35	0.41	0.25
C6	0.26	0.26	0.22	0.28	0.22	0.35	0.23	0.47	0.14	0.35	0.23	0.34	0.22	0.35	0.27	0.23	0.23	0.33	0.55	0.13	0.99	0.83	0.72
C8	0.21	0.25	0.21	0.25	0.18	0.27	0.19	0.34	0.21	0.24	0.24	0.30	0.22	0.23	0.20	0.22	0.21	0.25	0.39	0.22	0.61	0.58	0.48
N1	0.25	0.30	0.21	0.25	0.23	0.30	0.25	0.42	0.20	0.33	0.24	0.40	0.25	0.35	0.26	0.25	0.21	0.29	0.51	0.23	0.96	0.81	0.69
N2	0.23	0.29	0.21	0.21	0.21	0.23	0.24	0.32	0.24	0.27	0.20	0.44	0.26	0.31	0.22	0.29	0.19	0.23	0.43	0.35	0.86	0.74	0.60
N3	0.19	0.23	0.19	0.20	0.15	0.20	0.18	0.28	0.19	0.22	0.17	0.36	0.20	0.24	0.18	0.27	0.19	0.19	0.39	0.27	0.73	0.66	0.52
N7	0.25	0.20	0.23	0.29	0.15	0.35	0.14	0.45	0.16	0.28	0.20	0.25	0.18	0.24	0.23	0.23	0.24	0.32	0.50	0.20	0.79	0.69	0.61
N9	0.18	0.26	0.18	0.20	0.15	0.20	0.17	0.26	0.20	0.21	0.25	0.34	0.21	0.21	0.17	0.24	0.19	0.18	0.34	0.22	0.59	0.57	0.45
O2'	0.26	0.35	0.22	0.15	0.24	0.18	0.23	0.17	0.27	0.21	0.33	0.46	0.31	0.22	0.22	0.35	0.17	0.22	0.27	0.29	0.44	0.52	0.35
O3'	0.17	0.33	0.18	0.19	0.19	0.18	0.19	0.23	0.22	0.18	0.28	0.44	0.29	0.20	0.15	0.29	0.24	0.15	0.30	0.23	0.46	0.56	0.39
O4'	0.20	0.38	0.20	0.18	0.22	0.18	0.21	0.19	0.26	0.19	0.33	0.46	0.32	0.19	0.18	0.29	0.21	0.18	0.26	0.26	0.38	0.44	0.30
O5'	0.18	0.33	0.21	0.08	0.24	0.07	0.24	0.09	0.27	0.21	0.31	0.39	0.30	0.23	0.19	0.28	0.02	0.12	0.25	0.28	0.39	0.47	0.31
O6	0.31	0.27	0.25	0.32	0.24	0.41	0.25	0.56	0.19	0.40	0.28	0.34	0.23	0.39	0.31	0.25	0.26	0.40	0.63	0.19	1.11	0.91	0.81
OP1	0.05	0.24	0.09	0.02	0.12	0.08	0.15	0.19	0.18	0.20	0.21	0.33	0.21	0.21	0.09	0.16	0.02	0.05	0.27	0.20	0.58	0.51	0.36
OP2	0.11	0.23	0.13	0.06	0.20	0.14	0.27	0.26	0.28	0.29	0.26	0.26	0.20	0.32	0.18	0.13	0.02	0.11	0.31	0.32	0.53	0.60	0.43
P	0.06	0.21	0.10	0.01	0.13	0.05	0.17	0.14	0.19	0.20	0.20	0.27	0.18	0.21	0.10	0.15	0.00	0.03	0.24	0.21	0.44	0.46	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.02	0.20	0.31	0.14
C2	0.05	0.00	0.13	0.13	0.01	0.06	0.02	0.07	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.17	0.04	0.18	0.02	0.51	0.45	0.28
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.10	0.16	0.13	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.10	0.06	0.16	0.23	0.10
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.12	0.10	0.16	0.12	0.11	0.05	0.02	0.01	0.02	0.16	0.08	0.19	0.24	0.14
C4	0.02	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.17	0.01	0.48	0.45	0.27
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.05	0.09	0.06	0.07	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.05	0.19	0.23	0.07
C5	0.02	0.02	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.21	0.01	0.64	0.55	0.36
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.11	0.00	0.11	0.12	0.09	0.08	0.06	0.14	0.07	0.06	0.04	0.01	0.01	0.14	0.22	0.23	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.11	0.03	0.23	0.01	0.70	0.59	0.39
C8	0.01	0.02	0.07	0.12	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.04	0.20	0.02	0.53	0.51	0.33
N1	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.14	0.03	0.21	0.02	0.63	0.53	0.34
N2	0.06	0.01	0.16	0.16	0.02	0.09	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.21	0.22	0.06	0.18	0.03	0.47	0.43	0.26
N3	0.05	0.01	0.13	0.12	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.15	0.15	0.04	0.16	0.01	0.42	0.40	0.24
N7	0.01	0.02	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.13	0.04	0.23	0.02	0.70	0.60	0.40
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.14	0.02	0.39	0.40	0.23
O2'	0.01	0.16	0.01	0.02	0.08	0.06	0.07	0.06	0.10	0.04	0.14	0.21	0.15	0.04	0.03	0.00	0.05	0.04	0.06	0.09	0.22	0.23	0.10
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.04	0.11	0.14	0.14	0.22	0.15	0.13	0.05	0.05	0.00	0.02	0.19	0.12	0.35	0.30	0.19
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.06	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.04	0.18	0.36	0.17
O5'	0.07	0.18	0.10	0.16	0.17	0.01	0.21	0.01	0.23	0.20	0.21	0.18	0.16	0.23	0.14	0.06	0.19	0.10	0.00	0.25	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.05	0.01	0.14	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.09	0.12	0.04	0.25	0.00	0.80	0.66	0.44
OP1	0.20	0.51	0.16	0.19	0.48	0.19	0.64	0.22	0.70	0.53	0.63	0.47	0.42	0.70	0.39	0.22	0.35	0.18	0.01	0.80	0.00	0.01	0.01
OP2	0.31	0.45	0.23	0.24	0.45	0.23	0.55	0.23	0.59	0.51	0.53	0.43	0.40	0.60	0.40	0.23	0.30	0.36	0.02	0.66	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.28	0.10	0.14	0.27	0.07	0.36	0.02	0.39	0.33	0.34	0.26	0.24	0.40	0.23	0.10	0.19	0.17	0.01	0.44	0.01	0.01	0.00