Doublet Group distance statistics: 51027

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 3, 6, 4, 11, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.016, 0.025, 0.035, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.009, 0.019, 0.029, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.019 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.010, 0.023, 0.037, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.020, 0.034, 0.049, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.034 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.018, 0.032, 0.047, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.032 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.027, 0.045, 0.063, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.045 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.035, 0.057, 0.078, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.057 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.037, 0.059, 0.081, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.059 std_dev=0.022
N2	A	0, 0.015, 0.042, 0.069, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.042 std_dev=0.027
O4'	A	0, 0.044, 0.172, 0.301, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.172 std_dev=0.129
C2'	A	0, 0.066, 0.201, 0.336, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.201 std_dev=0.135
C4	B	0, 0.296, 0.468, 0.641, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.468 std_dev=0.173
N3	B	0, 0.247, 0.422, 0.598, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.422 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.125, 0.313, 0.500, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.313 std_dev=0.188
C5	B	0, 0.387, 0.576, 0.764, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.576 std_dev=0.188
C6	B	0, 0.442, 0.638, 0.834, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.638 std_dev=0.196
C2	B	0, 0.261, 0.462, 0.663, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.462 std_dev=0.201
N1	B	0, 0.358, 0.564, 0.769, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.564 std_dev=0.205
O2'	A	0, 0.083, 0.290, 0.498, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.290 std_dev=0.208
C3'	A	0, 0.127, 0.336, 0.545, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.336 std_dev=0.209
N9	B	0, 0.369, 0.590, 0.812, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.590 std_dev=0.222
N7	B	0, 0.491, 0.730, 0.970, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.730 std_dev=0.239
O6	B	0, 0.569, 0.822, 1.076, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.822 std_dev=0.254
C8	B	0, 0.459, 0.717, 0.974, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.717 std_dev=0.258
C1'	B	0, 0.414, 0.695, 0.977, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.695 std_dev=0.282
N2	B	0, 0.264, 0.558, 0.851, 1.357 max_d=1.357 avg_d=0.558 std_dev=0.293
O5'	A	0, 0.277, 0.571, 0.866, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.571 std_dev=0.294
C2'	B	0, 0.448, 0.764, 1.081, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.764 std_dev=0.317
C5'	A	0, 0.202, 0.519, 0.836, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.519 std_dev=0.317
O3'	A	0, 0.204, 0.521, 0.838, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.521 std_dev=0.317
C3'	B	0, 0.395, 0.721, 1.047, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.721 std_dev=0.326
O3'	B	0, 0.405, 0.749, 1.094, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.749 std_dev=0.344
P	A	0, 0.314, 0.666, 1.018, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.666 std_dev=0.352
O4'	B	0, 0.455, 0.827, 1.199, 1.803 max_d=1.803 avg_d=0.827 std_dev=0.372
C4'	B	0, 0.411, 0.795, 1.179, 1.663 max_d=1.663 avg_d=0.795 std_dev=0.384
OP2	A	0, 0.332, 0.757, 1.183, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.757 std_dev=0.426
C5'	B	0, 0.530, 0.957, 1.385, 1.919 max_d=1.919 avg_d=0.957 std_dev=0.428
O2'	B	0, 0.480, 0.916, 1.352, 2.114 max_d=2.114 avg_d=0.916 std_dev=0.436
OP1	A	0, 0.354, 0.807, 1.259, 1.940 max_d=1.940 avg_d=0.807 std_dev=0.452
O5'	B	0, 0.501, 1.056, 1.611, 2.674 max_d=2.674 avg_d=1.056 std_dev=0.555
P	B	0, 0.569, 1.207, 1.845, 2.754 max_d=2.754 avg_d=1.207 std_dev=0.638
OP1	B	0, 0.564, 1.318, 2.071, 3.384 max_d=3.384 avg_d=1.318 std_dev=0.753
OP2	B	0, 0.792, 1.614, 2.437, 3.926 max_d=3.926 avg_d=1.614 std_dev=0.823

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.15	0.02	0.15	0.32	0.12
C2	0.04	0.00	0.13	0.14	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.18	0.18	0.04	0.24	0.01	0.24	0.41	0.22
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.07	0.10	0.16	0.13	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.06	0.16	0.36	0.15
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.09	0.01	0.10	0.02	0.11	0.15	0.12	0.16	0.13	0.14	0.08	0.02	0.01	0.01	0.10	0.12	0.18	0.36	0.18
C4	0.02	0.01	0.07	0.09	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.24	0.01	0.21	0.39	0.20
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.05	0.07	0.06	0.09	0.04	0.07	0.03	0.00	0.03	0.07	0.17	0.24	0.07
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.03	0.28	0.01	0.26	0.40	0.23
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.15	0.09	0.07	0.06	0.16	0.08	0.07	0.03	0.02	0.01	0.15	0.22	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.03	0.29	0.01	0.28	0.41	0.25
C8	0.02	0.02	0.07	0.15	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.18	0.04	0.28	0.02	0.21	0.37	0.20
N1	0.03	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.16	0.03	0.27	0.01	0.27	0.42	0.24
N2	0.05	0.00	0.16	0.16	0.02	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.23	0.06	0.23	0.02	0.24	0.41	0.22
N3	0.04	0.01	0.13	0.13	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.17	0.16	0.04	0.22	0.01	0.21	0.40	0.20
N7	0.02	0.01	0.05	0.14	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.18	0.04	0.30	0.02	0.26	0.39	0.24
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.22	0.02	0.18	0.36	0.17
O2'	0.01	0.18	0.00	0.02	0.09	0.07	0.07	0.07	0.10	0.04	0.15	0.22	0.17	0.03	0.03	0.00	0.06	0.06	0.09	0.09	0.18	0.35	0.16
O3'	0.02	0.18	0.03	0.01	0.10	0.03	0.13	0.03	0.15	0.18	0.16	0.23	0.16	0.18	0.08	0.06	0.00	0.03	0.25	0.16	0.26	0.43	0.29
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.06	0.04	0.04	0.02	0.06	0.03	0.00	0.18	0.04	0.19	0.26	0.12
O5'	0.15	0.24	0.07	0.10	0.24	0.03	0.28	0.01	0.29	0.28	0.27	0.23	0.22	0.30	0.22	0.09	0.25	0.18	0.00	0.31	0.03	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.16	0.04	0.31	0.00	0.32	0.41	0.27
OP1	0.15	0.24	0.16	0.18	0.21	0.17	0.26	0.22	0.28	0.21	0.27	0.24	0.21	0.26	0.18	0.18	0.26	0.19	0.03	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.41	0.36	0.36	0.39	0.24	0.40	0.13	0.41	0.37	0.42	0.41	0.40	0.39	0.36	0.35	0.43	0.26	0.02	0.41	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.22	0.15	0.18	0.20	0.07	0.23	0.02	0.25	0.20	0.24	0.22	0.20	0.24	0.17	0.16	0.29	0.12	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.29	0.30	0.19	0.21	0.21	0.21	0.24	0.27	0.21	0.30	0.35	0.25	0.20	0.23	0.50	0.18	0.25	0.42	0.30	0.44	0.68	0.40
C2	0.21	0.19	0.21	0.19	0.16	0.20	0.21	0.36	0.27	0.20	0.18	0.30	0.21	0.25	0.17	0.36	0.18	0.19	0.49	0.39	0.58	0.88	0.55
C2'	0.26	0.28	0.26	0.18	0.19	0.17	0.20	0.29	0.26	0.18	0.29	0.36	0.24	0.19	0.19	0.47	0.18	0.19	0.39	0.30	0.41	0.65	0.37
C3'	0.19	0.26	0.21	0.19	0.16	0.19	0.20	0.34	0.25	0.19	0.27	0.33	0.20	0.22	0.15	0.41	0.20	0.16	0.36	0.29	0.40	0.58	0.33
C4	0.22	0.19	0.23	0.19	0.16	0.19	0.20	0.33	0.25	0.18	0.22	0.24	0.20	0.21	0.17	0.37	0.18	0.19	0.47	0.32	0.53	0.82	0.51
C4'	0.24	0.30	0.24	0.15	0.16	0.16	0.18	0.20	0.23	0.19	0.29	0.39	0.23	0.18	0.17	0.45	0.16	0.19	0.35	0.25	0.42	0.52	0.30
C5	0.18	0.19	0.20	0.20	0.15	0.23	0.18	0.40	0.20	0.19	0.16	0.25	0.19	0.22	0.16	0.31	0.20	0.20	0.52	0.27	0.59	0.87	0.56
C5'	0.22	0.33	0.22	0.16	0.21	0.16	0.22	0.19	0.25	0.23	0.31	0.41	0.28	0.23	0.19	0.38	0.16	0.18	0.33	0.26	0.46	0.45	0.27
C6	0.17	0.23	0.19	0.21	0.15	0.25	0.18	0.44	0.18	0.22	0.17	0.33	0.21	0.26	0.17	0.28	0.20	0.22	0.55	0.27	0.66	0.94	0.62
C8	0.23	0.23	0.25	0.20	0.20	0.21	0.20	0.34	0.22	0.20	0.22	0.24	0.23	0.20	0.20	0.35	0.19	0.20	0.47	0.24	0.49	0.76	0.47
N1	0.18	0.23	0.20	0.20	0.16	0.22	0.20	0.41	0.22	0.22	0.16	0.35	0.22	0.27	0.17	0.31	0.19	0.20	0.53	0.34	0.64	0.93	0.61
N2	0.22	0.20	0.22	0.18	0.17	0.19	0.22	0.35	0.28	0.20	0.20	0.31	0.21	0.27	0.17	0.37	0.18	0.19	0.49	0.42	0.58	0.88	0.55
N3	0.23	0.19	0.23	0.19	0.16	0.19	0.21	0.32	0.28	0.18	0.23	0.26	0.20	0.23	0.17	0.40	0.18	0.19	0.47	0.38	0.52	0.82	0.50
N7	0.19	0.19	0.21	0.21	0.17	0.25	0.18	0.41	0.20	0.19	0.19	0.21	0.19	0.20	0.18	0.29	0.21	0.22	0.52	0.23	0.57	0.84	0.55
N9	0.25	0.24	0.26	0.19	0.19	0.19	0.20	0.30	0.25	0.19	0.26	0.27	0.23	0.20	0.20	0.41	0.18	0.21	0.45	0.29	0.47	0.75	0.45
O2'	0.29	0.33	0.27	0.18	0.21	0.18	0.21	0.25	0.28	0.19	0.33	0.42	0.27	0.19	0.21	0.49	0.19	0.22	0.37	0.32	0.41	0.60	0.33
O3'	0.19	0.26	0.21	0.24	0.17	0.24	0.22	0.42	0.26	0.22	0.27	0.35	0.21	0.25	0.17	0.40	0.26	0.19	0.36	0.30	0.44	0.54	0.33
O4'	0.32	0.30	0.31	0.21	0.19	0.23	0.19	0.22	0.24	0.22	0.30	0.39	0.24	0.19	0.23	0.51	0.20	0.28	0.42	0.26	0.45	0.62	0.37
O5'	0.27	0.33	0.30	0.12	0.30	0.10	0.33	0.19	0.33	0.35	0.33	0.37	0.31	0.36	0.30	0.37	0.03	0.17	0.37	0.35	0.51	0.50	0.33
O6	0.18	0.28	0.19	0.23	0.17	0.29	0.18	0.49	0.17	0.26	0.25	0.37	0.22	0.28	0.18	0.25	0.22	0.27	0.59	0.22	0.74	0.99	0.69
OP1	0.07	0.25	0.12	0.06	0.15	0.15	0.21	0.32	0.22	0.27	0.23	0.34	0.22	0.29	0.13	0.21	0.02	0.10	0.36	0.26	0.62	0.51	0.39
OP2	0.13	0.33	0.16	0.08	0.27	0.20	0.33	0.39	0.36	0.34	0.34	0.36	0.29	0.38	0.22	0.14	0.02	0.15	0.47	0.39	0.63	0.58	0.46
P	0.08	0.22	0.14	0.03	0.15	0.10	0.20	0.23	0.21	0.26	0.21	0.29	0.19	0.28	0.14	0.18	0.01	0.04	0.34	0.25	0.54	0.46	0.33

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.23	0.02	0.44	0.42	0.25
C2	0.04	0.00	0.14	0.18	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.17	0.22	0.04	0.42	0.02	0.59	0.71	0.41
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.03	0.04	0.03	0.06	0.09	0.10	0.17	0.15	0.07	0.03	0.00	0.02	0.02	0.25	0.06	0.36	0.37	0.18
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.10	0.01	0.11	0.03	0.11	0.19	0.14	0.22	0.17	0.17	0.08	0.02	0.01	0.01	0.32	0.12	0.34	0.38	0.21
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.43	0.01	0.59	0.70	0.43
C4'	0.01	0.07	0.03	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.08	0.14	0.07	0.09	0.07	0.13	0.06	0.08	0.02	0.00	0.03	0.10	0.32	0.33	0.16
C5	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03	0.52	0.01	0.72	0.88	0.58
C5'	0.05	0.16	0.03	0.03	0.16	0.01	0.22	0.00	0.23	0.25	0.20	0.16	0.13	0.27	0.15	0.07	0.07	0.03	0.01	0.26	0.30	0.36	0.03
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.03	0.54	0.01	0.75	0.95	0.61
C8	0.01	0.02	0.09	0.19	0.01	0.14	0.01	0.25	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.21	0.05	0.51	0.02	0.71	0.79	0.55
N1	0.03	0.00	0.10	0.14	0.01	0.07	0.01	0.20	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.18	0.03	0.49	0.02	0.67	0.85	0.52
N2	0.04	0.01	0.17	0.22	0.02	0.09	0.02	0.16	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.21	0.30	0.05	0.39	0.02	0.57	0.66	0.37
N3	0.03	0.00	0.15	0.17	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.21	0.04	0.38	0.01	0.55	0.62	0.35
N7	0.01	0.02	0.07	0.17	0.01	0.13	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.20	0.05	0.57	0.02	0.81	0.96	0.67
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.02	0.40	0.02	0.55	0.62	0.38
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.09	0.08	0.07	0.07	0.10	0.06	0.14	0.21	0.16	0.05	0.03	0.00	0.04	0.07	0.08	0.10	0.45	0.32	0.25
O3'	0.02	0.22	0.02	0.01	0.11	0.02	0.12	0.07	0.14	0.21	0.18	0.30	0.21	0.20	0.08	0.04	0.00	0.02	0.30	0.15	0.47	0.36	0.25
O4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.02	0.07	0.02	0.00	0.21	0.04	0.44	0.42	0.30
O5'	0.23	0.42	0.25	0.32	0.43	0.03	0.52	0.01	0.54	0.51	0.49	0.39	0.38	0.57	0.40	0.08	0.30	0.21	0.00	0.58	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.12	0.01	0.10	0.01	0.26	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.10	0.15	0.04	0.58	0.00	0.83	1.06	0.71
OP1	0.44	0.59	0.36	0.34	0.59	0.32	0.72	0.30	0.75	0.71	0.67	0.57	0.55	0.81	0.55	0.45	0.47	0.44	0.02	0.83	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.71	0.37	0.38	0.70	0.33	0.88	0.36	0.95	0.79	0.85	0.66	0.62	0.96	0.62	0.32	0.36	0.42	0.02	1.06	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.41	0.18	0.21	0.43	0.16	0.58	0.03	0.61	0.55	0.52	0.37	0.35	0.67	0.38	0.25	0.25	0.30	0.01	0.71	0.01	0.01	0.00