Doublet Group distance statistics: 51028

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 3, 2, 9, 2, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.020 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.017, 0.034, 0.051, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.007, 0.027, 0.046, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.026 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.003, 0.030, 0.058, 0.145 max_d=0.145 avg_d=0.030 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.010, 0.043, 0.075, 0.125 max_d=0.125 avg_d=0.043 std_dev=0.032
O6	A	0, 0.004, 0.039, 0.074, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.039 std_dev=0.035
N9	A	0, 0.001, 0.038, 0.075, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.038 std_dev=0.037
N7	A	0, 0.016, 0.056, 0.096, 0.218 max_d=0.218 avg_d=0.056 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.009, 0.064, 0.120, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.064 std_dev=0.055
C5	B	0, 0.231, 0.402, 0.574, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.402 std_dev=0.171
N7	B	0, 0.279, 0.498, 0.716, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.498 std_dev=0.219
C6	B	0, 0.244, 0.463, 0.683, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.463 std_dev=0.219
C4	B	0, 0.219, 0.443, 0.668, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.443 std_dev=0.224
C8	B	0, 0.309, 0.564, 0.820, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.564 std_dev=0.255
N1	B	0, 0.251, 0.510, 0.769, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.510 std_dev=0.259
N9	B	0, 0.252, 0.551, 0.849, 1.263 max_d=1.263 avg_d=0.551 std_dev=0.298
O6	B	0, 0.304, 0.611, 0.918, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.611 std_dev=0.307
C2	B	0, 0.211, 0.523, 0.836, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.523 std_dev=0.312
N3	B	0, 0.181, 0.509, 0.836, 1.315 max_d=1.315 avg_d=0.509 std_dev=0.327
O4'	A	0, 0.205, 0.611, 1.016, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.611 std_dev=0.405
N2	B	0, 0.259, 0.686, 1.112, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.686 std_dev=0.427
C2'	A	0, 0.222, 0.678, 1.135, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.678 std_dev=0.457
C1'	B	0, 0.278, 0.756, 1.235, 1.997 max_d=1.997 avg_d=0.756 std_dev=0.479
C3'	A	0, 0.450, 0.986, 1.522, 2.253 max_d=2.253 avg_d=0.986 std_dev=0.536
C2'	B	0, 0.142, 0.680, 1.217, 2.133 max_d=2.133 avg_d=0.680 std_dev=0.537
O4'	B	0, 0.660, 1.234, 1.808, 2.668 max_d=2.668 avg_d=1.234 std_dev=0.574
O5'	B	0, 0.694, 1.273, 1.852, 2.622 max_d=2.622 avg_d=1.273 std_dev=0.579
C4'	A	0, 0.307, 0.904, 1.501, 2.458 max_d=2.458 avg_d=0.904 std_dev=0.597
C3'	B	0, 0.592, 1.199, 1.807, 2.852 max_d=2.852 avg_d=1.199 std_dev=0.607
O2'	B	0, 0.146, 0.819, 1.492, 2.746 max_d=2.746 avg_d=0.819 std_dev=0.673
O3'	A	0, 0.703, 1.382, 2.061, 2.651 max_d=2.651 avg_d=1.382 std_dev=0.679
C4'	B	0, 0.819, 1.536, 2.253, 3.427 max_d=3.427 avg_d=1.536 std_dev=0.717
O3'	B	0, 0.639, 1.401, 2.164, 3.594 max_d=3.594 avg_d=1.401 std_dev=0.762
O2'	A	0, 0.168, 0.964, 1.760, 3.093 max_d=3.093 avg_d=0.964 std_dev=0.796
O5'	A	0, 0.725, 1.530, 2.335, 3.561 max_d=3.561 avg_d=1.530 std_dev=0.805
C5'	B	0, 1.298, 2.145, 2.993, 3.998 max_d=3.998 avg_d=2.145 std_dev=0.848
P	B	0, 1.117, 1.970, 2.823, 3.853 max_d=3.853 avg_d=1.970 std_dev=0.853
C5'	A	0, 0.615, 1.477, 2.340, 3.720 max_d=3.720 avg_d=1.477 std_dev=0.862
P	A	0, 0.316, 1.253, 2.189, 4.111 max_d=4.111 avg_d=1.253 std_dev=0.936
OP2	A	0, 0.171, 1.131, 2.090, 4.273 max_d=4.273 avg_d=1.131 std_dev=0.960
OP2	B	0, 1.139, 2.297, 3.455, 4.550 max_d=4.550 avg_d=2.297 std_dev=1.158
OP1	B	0, 2.101, 3.335, 4.570, 5.542 max_d=5.542 avg_d=3.335 std_dev=1.234
OP1	A	0, -0.001, 1.277, 2.555, 5.178 max_d=5.178 avg_d=1.277 std_dev=1.278

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.25	0.01	0.15	0.02	0.23	0.21	0.15
C2	0.05	0.00	0.27	0.25	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.19	0.25	0.16	0.21	0.01	0.27	0.40	0.25
C2'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.14	0.02	0.08	0.17	0.12	0.16	0.21	0.34	0.27	0.11	0.03	0.00	0.03	0.03	0.36	0.09	0.48	0.52	0.43
C3'	0.02	0.25	0.01	0.00	0.26	0.01	0.33	0.02	0.34	0.33	0.31	0.24	0.21	0.37	0.23	0.02	0.01	0.03	0.07	0.38	0.30	0.26	0.18
C4	0.02	0.01	0.14	0.26	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.13	0.08	0.22	0.01	0.27	0.35	0.25
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.12	0.22	0.08	0.12	0.08	0.21	0.10	0.28	0.05	0.00	0.02	0.15	0.17	0.11	0.06
C5	0.01	0.01	0.08	0.33	0.00	0.13	0.00	0.18	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.17	0.03	0.33	0.01	0.39	0.49	0.38
C5'	0.06	0.10	0.17	0.02	0.09	0.01	0.18	0.00	0.17	0.24	0.12	0.12	0.09	0.27	0.10	0.11	0.20	0.02	0.01	0.22	0.09	0.03	0.02
C6	0.02	0.01	0.12	0.34	0.01	0.12	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.32	0.19	0.06	0.34	0.01	0.42	0.56	0.42
C8	0.02	0.02	0.16	0.33	0.01	0.22	0.01	0.24	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.36	0.23	0.12	0.33	0.02	0.36	0.36	0.33
N1	0.04	0.01	0.21	0.31	0.02	0.08	0.02	0.12	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.24	0.19	0.11	0.28	0.01	0.35	0.50	0.35
N2	0.06	0.01	0.34	0.24	0.01	0.12	0.01	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.25	0.33	0.19	0.19	0.03	0.24	0.38	0.22
N3	0.05	0.01	0.27	0.21	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.18	0.26	0.16	0.18	0.01	0.23	0.32	0.20
N7	0.01	0.01	0.11	0.37	0.01	0.21	0.00	0.27	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.41	0.27	0.08	0.40	0.02	0.46	0.52	0.45
N9	0.01	0.02	0.03	0.23	0.01	0.10	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.20	0.08	0.01	0.20	0.02	0.25	0.27	0.20
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.19	0.28	0.32	0.11	0.32	0.36	0.24	0.25	0.18	0.41	0.20	0.00	0.04	0.21	0.26	0.38	0.42	0.61	0.38
O3'	0.25	0.25	0.03	0.01	0.13	0.05	0.17	0.20	0.19	0.23	0.19	0.33	0.26	0.27	0.08	0.04	0.00	0.17	0.25	0.23	0.48	0.45	0.37
O4'	0.01	0.16	0.03	0.03	0.08	0.00	0.03	0.02	0.06	0.12	0.11	0.19	0.16	0.08	0.01	0.21	0.17	0.00	0.11	0.05	0.13	0.11	0.09
O5'	0.15	0.21	0.36	0.07	0.22	0.02	0.33	0.01	0.34	0.33	0.28	0.19	0.18	0.40	0.20	0.26	0.25	0.11	0.00	0.40	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.09	0.38	0.01	0.15	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.38	0.23	0.05	0.40	0.00	0.51	0.65	0.50
OP1	0.23	0.27	0.48	0.30	0.27	0.17	0.39	0.09	0.42	0.36	0.35	0.24	0.23	0.46	0.25	0.42	0.48	0.13	0.02	0.51	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.40	0.52	0.26	0.35	0.11	0.49	0.03	0.56	0.36	0.50	0.38	0.32	0.52	0.27	0.61	0.45	0.11	0.02	0.65	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.25	0.43	0.18	0.25	0.06	0.38	0.02	0.42	0.33	0.35	0.22	0.20	0.45	0.20	0.38	0.37	0.09	0.01	0.50	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.29	0.29	0.19	0.20	0.23	0.20	0.20	0.22	0.29	0.28	0.42	0.25	0.26	0.26	0.47	0.17	0.28	0.46	0.25	0.57	0.84	0.56
C2	0.24	0.18	0.19	0.14	0.20	0.15	0.20	0.28	0.22	0.22	0.20	0.24	0.21	0.22	0.22	0.33	0.14	0.20	0.59	0.29	0.76	0.94	0.78
C2'	0.31	0.26	0.30	0.33	0.20	0.32	0.25	0.40	0.23	0.41	0.25	0.42	0.18	0.37	0.30	0.40	0.31	0.32	0.70	0.26	0.90	1.17	0.87
C3'	0.21	0.29	0.20	0.12	0.16	0.12	0.17	0.16	0.21	0.23	0.28	0.39	0.23	0.21	0.19	0.36	0.10	0.16	0.49	0.22	0.62	0.96	0.58
C4	0.26	0.17	0.23	0.15	0.19	0.16	0.19	0.25	0.21	0.26	0.20	0.25	0.18	0.24	0.24	0.36	0.16	0.21	0.55	0.26	0.66	0.89	0.70
C4'	0.23	0.32	0.21	0.14	0.16	0.19	0.15	0.15	0.21	0.21	0.30	0.43	0.25	0.17	0.18	0.39	0.14	0.21	0.36	0.22	0.51	0.75	0.39
C5	0.24	0.15	0.24	0.22	0.17	0.20	0.18	0.34	0.17	0.24	0.15	0.22	0.17	0.24	0.22	0.33	0.27	0.19	0.61	0.24	0.75	0.97	0.80
C5'	0.22	0.40	0.21	0.12	0.24	0.16	0.20	0.14	0.26	0.19	0.36	0.48	0.35	0.16	0.19	0.34	0.13	0.18	0.33	0.25	0.52	0.70	0.34
C6	0.22	0.18	0.23	0.26	0.19	0.24	0.18	0.41	0.17	0.22	0.15	0.24	0.20	0.22	0.21	0.29	0.30	0.20	0.67	0.24	0.88	1.07	0.91
C8	0.29	0.21	0.33	0.22	0.18	0.21	0.20	0.25	0.19	0.30	0.20	0.29	0.21	0.28	0.25	0.44	0.27	0.23	0.52	0.24	0.61	0.87	0.64
N1	0.22	0.20	0.19	0.19	0.20	0.19	0.20	0.36	0.20	0.22	0.17	0.26	0.21	0.23	0.21	0.29	0.22	0.19	0.65	0.27	0.86	1.03	0.88
N2	0.25	0.20	0.19	0.13	0.20	0.15	0.21	0.27	0.23	0.22	0.21	0.25	0.22	0.22	0.22	0.34	0.12	0.21	0.59	0.32	0.78	0.94	0.79
N3	0.27	0.18	0.22	0.13	0.20	0.16	0.20	0.23	0.23	0.24	0.23	0.25	0.19	0.23	0.24	0.36	0.12	0.22	0.55	0.29	0.67	0.89	0.70
N7	0.26	0.16	0.32	0.29	0.16	0.25	0.18	0.35	0.17	0.27	0.15	0.23	0.18	0.27	0.23	0.39	0.35	0.22	0.60	0.24	0.70	0.96	0.76
N9	0.30	0.23	0.27	0.16	0.19	0.18	0.20	0.21	0.20	0.29	0.23	0.33	0.20	0.26	0.25	0.42	0.17	0.24	0.50	0.25	0.59	0.85	0.62
O2'	0.30	0.30	0.26	0.27	0.23	0.26	0.35	0.36	0.35	0.47	0.29	0.51	0.24	0.50	0.31	0.47	0.23	0.29	0.70	0.44	0.96	1.25	0.93
O3'	0.23	0.29	0.23	0.22	0.15	0.22	0.14	0.26	0.18	0.23	0.27	0.41	0.22	0.20	0.19	0.38	0.28	0.21	0.51	0.19	0.62	0.99	0.58
O4'	0.33	0.32	0.31	0.25	0.20	0.30	0.21	0.26	0.25	0.28	0.32	0.42	0.24	0.24	0.25	0.49	0.26	0.31	0.39	0.28	0.47	0.69	0.40
O5'	0.22	0.42	0.25	0.09	0.28	0.08	0.25	0.10	0.31	0.21	0.39	0.48	0.37	0.21	0.21	0.34	0.01	0.15	0.43	0.31	0.59	0.82	0.47
O6	0.22	0.21	0.26	0.33	0.20	0.32	0.19	0.50	0.16	0.23	0.19	0.26	0.21	0.23	0.22	0.29	0.39	0.23	0.74	0.22	1.00	1.18	1.03
OP1	0.08	0.34	0.12	0.04	0.18	0.10	0.20	0.19	0.26	0.20	0.32	0.41	0.28	0.22	0.11	0.18	0.03	0.07	0.27	0.29	0.80	0.76	0.38
OP2	0.12	0.36	0.15	0.08	0.25	0.17	0.31	0.32	0.36	0.31	0.39	0.41	0.29	0.33	0.20	0.15	0.02	0.13	0.46	0.40	0.86	0.96	0.61
P	0.08	0.32	0.12	0.02	0.19	0.07	0.21	0.16	0.27	0.20	0.31	0.38	0.26	0.22	0.12	0.17	0.01	0.04	0.35	0.29	0.68	0.78	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.07	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.16	0.02	0.40	0.27	0.15
C2	0.05	0.00	0.14	0.19	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.19	0.22	0.05	0.43	0.01	0.68	0.56	0.53
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.02	0.08	0.07	0.12	0.17	0.14	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.23	0.08	0.23	0.41	0.17
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.16	0.13	0.18	0.21	0.17	0.13	0.08	0.02	0.01	0.03	0.30	0.17	0.31	0.46	0.23
C4	0.03	0.01	0.08	0.12	0.00	0.07	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.02	0.41	0.01	0.70	0.52	0.51
C4'	0.01	0.08	0.02	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.11	0.12	0.09	0.09	0.07	0.13	0.06	0.08	0.02	0.01	0.02	0.14	0.13	0.39	0.13
C5	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.10	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.14	0.03	0.51	0.01	0.88	0.76	0.70
C5'	0.04	0.18	0.02	0.02	0.19	0.01	0.27	0.00	0.29	0.27	0.24	0.15	0.14	0.31	0.17	0.08	0.04	0.03	0.01	0.33	0.22	0.26	0.04
C6	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.11	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.18	0.03	0.55	0.01	0.93	0.85	0.77
C8	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.12	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.15	0.05	0.45	0.03	0.84	0.69	0.62
N1	0.04	0.01	0.12	0.18	0.01	0.09	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.21	0.03	0.51	0.02	0.83	0.71	0.67
N2	0.07	0.00	0.17	0.21	0.02	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.23	0.27	0.07	0.40	0.02	0.62	0.53	0.48
N3	0.05	0.00	0.14	0.17	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.18	0.19	0.05	0.36	0.01	0.60	0.45	0.42
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.13	0.00	0.31	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.15	0.05	0.53	0.04	0.97	0.90	0.78
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.08	0.02	0.34	0.02	0.63	0.41	0.41
O2'	0.02	0.19	0.00	0.02	0.10	0.08	0.08	0.08	0.12	0.04	0.17	0.23	0.18	0.05	0.04	0.00	0.04	0.06	0.10	0.11	0.15	0.57	0.21
O3'	0.03	0.22	0.03	0.01	0.13	0.02	0.14	0.04	0.18	0.15	0.21	0.27	0.19	0.15	0.08	0.04	0.00	0.02	0.25	0.20	0.45	0.63	0.24
O4'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.05	0.03	0.07	0.05	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.09	0.06	0.39	0.30	0.15
O5'	0.16	0.43	0.23	0.30	0.41	0.02	0.51	0.01	0.55	0.45	0.51	0.40	0.36	0.53	0.34	0.10	0.25	0.09	0.00	0.61	0.03	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.17	0.01	0.14	0.01	0.33	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.11	0.20	0.06	0.61	0.00	1.04	1.01	0.89
OP1	0.40	0.68	0.23	0.31	0.70	0.13	0.88	0.22	0.93	0.84	0.83	0.62	0.60	0.97	0.63	0.15	0.45	0.39	0.03	1.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.27	0.56	0.41	0.46	0.52	0.39	0.76	0.26	0.85	0.69	0.71	0.53	0.45	0.90	0.41	0.57	0.63	0.30	0.03	1.01	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.53	0.17	0.23	0.51	0.13	0.70	0.04	0.77	0.62	0.67	0.48	0.42	0.78	0.41	0.21	0.24	0.15	0.01	0.89	0.01	0.01	0.00