Doublet Group distance statistics: 51029

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 2, 1, 1, 1, 3, 0, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.021, 0.034, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.012, 0.028, 0.045, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.028 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.012, 0.029, 0.046, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.029 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.011, 0.033, 0.054, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.033 std_dev=0.021
C2	A	0, 0.006, 0.027, 0.049, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.027 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.017, 0.039, 0.061, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.039 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.027, 0.050, 0.073, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.050 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.013, 0.036, 0.059, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.036 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.010, 0.034, 0.058, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.034 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.030, 0.056, 0.083, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.056 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.013, 0.058, 0.102, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.058 std_dev=0.045
O6	A	0, 0.021, 0.069, 0.118, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.069 std_dev=0.048
C2'	A	0, 0.071, 0.154, 0.237, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.154 std_dev=0.083
O4'	A	0, 0.020, 0.142, 0.264, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.142 std_dev=0.122
O2'	A	0, 0.103, 0.229, 0.354, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.229 std_dev=0.126
C3'	A	0, 0.171, 0.334, 0.496, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.334 std_dev=0.163
C4'	A	0, 0.155, 0.342, 0.529, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.342 std_dev=0.187
O3'	A	0, 0.278, 0.538, 0.799, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.538 std_dev=0.261
C5	B	0, 0.166, 0.430, 0.694, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.430 std_dev=0.264
N7	B	0, 0.240, 0.514, 0.789, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.514 std_dev=0.275
C6	B	0, 0.121, 0.397, 0.673, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.397 std_dev=0.276
O6	B	0, 0.140, 0.433, 0.726, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.433 std_dev=0.293
N1	B	0, 0.156, 0.451, 0.745, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.451 std_dev=0.294
C5'	A	0, 0.221, 0.526, 0.832, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.526 std_dev=0.305
C4	B	0, 0.163, 0.475, 0.788, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.475 std_dev=0.313
C2	B	0, 0.194, 0.523, 0.852, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.523 std_dev=0.329
C8	B	0, 0.222, 0.566, 0.909, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.566 std_dev=0.343
N3	B	0, 0.189, 0.535, 0.880, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.535 std_dev=0.345
O5'	A	0, 0.243, 0.592, 0.941, 1.491 max_d=1.491 avg_d=0.592 std_dev=0.349
N9	B	0, 0.179, 0.543, 0.907, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.543 std_dev=0.364
C2'	B	0, 0.209, 0.583, 0.956, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.583 std_dev=0.374
N2	B	0, 0.233, 0.632, 1.032, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.632 std_dev=0.400
C3'	B	0, 0.236, 0.680, 1.125, 1.576 max_d=1.576 avg_d=0.680 std_dev=0.444
C1'	B	0, 0.171, 0.649, 1.127, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.649 std_dev=0.478
O3'	B	0, 0.278, 0.771, 1.263, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.771 std_dev=0.492
O2'	B	0, 0.267, 0.785, 1.303, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.785 std_dev=0.518
O4'	B	0, 0.144, 0.778, 1.411, 2.193 max_d=2.193 avg_d=0.778 std_dev=0.634
C4'	B	0, 0.198, 0.880, 1.561, 2.346 max_d=2.346 avg_d=0.880 std_dev=0.682
O5'	B	0, 0.354, 1.078, 1.803, 2.789 max_d=2.789 avg_d=1.078 std_dev=0.724
P	A	0, 0.115, 0.855, 1.596, 3.191 max_d=3.191 avg_d=0.855 std_dev=0.741
OP1	A	0, 0.207, 0.993, 1.778, 3.299 max_d=3.299 avg_d=0.993 std_dev=0.786
C5'	B	0, 0.229, 1.078, 1.926, 2.903 max_d=2.903 avg_d=1.078 std_dev=0.849
OP2	B	0, 0.365, 1.217, 2.069, 3.640 max_d=3.640 avg_d=1.217 std_dev=0.852
P	B	0, 0.348, 1.259, 2.170, 3.644 max_d=3.644 avg_d=1.259 std_dev=0.911
OP1	B	0, 0.372, 1.498, 2.624, 3.939 max_d=3.939 avg_d=1.498 std_dev=1.126
OP2	A	0, -0.184, 1.147, 2.478, 5.849 max_d=5.849 avg_d=1.147 std_dev=1.331

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.05	0.08	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.13	0.03	0.12	0.16	0.10
C2	0.06	0.00	0.11	0.15	0.02	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.14	0.18	0.05	0.30	0.03	0.31	0.43	0.35
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.06	0.04	0.09	0.14	0.11	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.17	0.05	0.24	0.26	0.13
C3'	0.02	0.15	0.01	0.00	0.10	0.01	0.10	0.02	0.12	0.09	0.13	0.17	0.13	0.09	0.06	0.02	0.02	0.02	0.22	0.12	0.36	0.24	0.15
C4	0.02	0.02	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.12	0.02	0.30	0.02	0.29	0.44	0.36
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.08	0.07	0.10	0.07	0.08	0.04	0.06	0.03	0.01	0.03	0.09	0.14	0.38	0.11
C5	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.12	0.04	0.39	0.02	0.41	0.72	0.52
C5'	0.03	0.10	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.13	0.11	0.11	0.11	0.09	0.13	0.06	0.07	0.04	0.02	0.02	0.16	0.23	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.07	0.15	0.04	0.41	0.01	0.47	0.80	0.57
C8	0.03	0.02	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.06	0.36	0.04	0.34	0.64	0.48
N1	0.05	0.01	0.09	0.13	0.02	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.12	0.17	0.04	0.36	0.03	0.41	0.64	0.48
N2	0.08	0.00	0.14	0.17	0.02	0.10	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.18	0.21	0.08	0.27	0.03	0.28	0.35	0.30
N3	0.06	0.01	0.11	0.13	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.12	0.15	0.05	0.25	0.02	0.24	0.31	0.27
N7	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.06	0.42	0.05	0.45	0.87	0.60
N9	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.26	0.03	0.23	0.34	0.30
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.06	0.06	0.04	0.07	0.07	0.03	0.12	0.18	0.12	0.02	0.02	0.00	0.05	0.04	0.08	0.06	0.15	0.51	0.17
O3'	0.03	0.18	0.03	0.02	0.12	0.03	0.12	0.04	0.15	0.10	0.17	0.21	0.15	0.12	0.07	0.05	0.00	0.03	0.17	0.16	0.40	0.40	0.12
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04	0.08	0.05	0.06	0.01	0.04	0.03	0.00	0.09	0.06	0.11	0.23	0.09
O5'	0.13	0.30	0.17	0.22	0.30	0.03	0.39	0.02	0.41	0.36	0.36	0.27	0.25	0.42	0.26	0.08	0.17	0.09	0.00	0.46	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.03	0.05	0.12	0.02	0.09	0.02	0.16	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.06	0.16	0.06	0.46	0.00	0.57	0.98	0.68
OP1	0.12	0.31	0.24	0.36	0.29	0.14	0.41	0.23	0.47	0.34	0.41	0.28	0.24	0.45	0.23	0.15	0.40	0.11	0.02	0.57	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.43	0.26	0.24	0.44	0.38	0.72	0.21	0.80	0.64	0.64	0.35	0.31	0.87	0.34	0.51	0.40	0.23	0.02	0.98	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.35	0.13	0.15	0.36	0.11	0.52	0.02	0.57	0.48	0.48	0.30	0.27	0.60	0.30	0.17	0.12	0.09	0.01	0.68	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.28	0.18	0.21	0.20	0.15	0.22	0.17	0.22	0.22	0.23	0.38	0.24	0.24	0.19	0.26	0.31	0.16	0.59	0.23	0.90	0.60	0.63
C2	0.15	0.25	0.17	0.26	0.18	0.19	0.23	0.30	0.27	0.21	0.27	0.32	0.20	0.26	0.17	0.22	0.34	0.13	0.78	0.32	1.14	0.90	0.89
C2'	0.17	0.29	0.17	0.24	0.19	0.18	0.22	0.23	0.24	0.22	0.25	0.40	0.24	0.25	0.17	0.25	0.37	0.13	0.58	0.27	0.95	0.63	0.66
C3'	0.15	0.24	0.18	0.28	0.14	0.23	0.19	0.29	0.20	0.23	0.20	0.36	0.20	0.26	0.15	0.24	0.41	0.14	0.55	0.25	0.94	0.60	0.64
C4	0.14	0.26	0.16	0.25	0.18	0.18	0.23	0.27	0.25	0.22	0.25	0.34	0.20	0.26	0.17	0.20	0.33	0.12	0.74	0.29	1.08	0.80	0.82
C4'	0.15	0.24	0.17	0.24	0.13	0.20	0.16	0.23	0.16	0.20	0.18	0.36	0.22	0.21	0.14	0.25	0.36	0.14	0.46	0.19	0.82	0.47	0.53
C5	0.14	0.24	0.16	0.29	0.17	0.25	0.23	0.35	0.26	0.23	0.25	0.30	0.19	0.28	0.17	0.15	0.35	0.17	0.79	0.31	1.13	0.87	0.89
C5'	0.15	0.24	0.17	0.26	0.12	0.26	0.13	0.29	0.13	0.19	0.16	0.34	0.23	0.20	0.12	0.24	0.39	0.18	0.42	0.17	0.78	0.40	0.49
C6	0.15	0.22	0.17	0.31	0.17	0.29	0.23	0.42	0.26	0.24	0.25	0.27	0.17	0.28	0.18	0.15	0.37	0.20	0.83	0.34	1.19	0.96	0.95
C8	0.13	0.29	0.15	0.26	0.20	0.21	0.23	0.27	0.23	0.23	0.24	0.34	0.26	0.27	0.17	0.14	0.33	0.14	0.71	0.24	1.02	0.69	0.76
N1	0.14	0.23	0.17	0.29	0.17	0.25	0.23	0.37	0.27	0.23	0.26	0.29	0.17	0.27	0.17	0.18	0.36	0.16	0.82	0.33	1.18	0.96	0.94
N2	0.17	0.26	0.17	0.25	0.19	0.18	0.23	0.29	0.27	0.21	0.27	0.33	0.21	0.25	0.18	0.24	0.34	0.14	0.78	0.32	1.15	0.91	0.89
N3	0.17	0.26	0.17	0.23	0.19	0.16	0.23	0.24	0.26	0.22	0.26	0.35	0.21	0.26	0.18	0.24	0.33	0.13	0.74	0.30	1.09	0.82	0.83
N7	0.16	0.26	0.17	0.30	0.20	0.28	0.24	0.37	0.25	0.24	0.25	0.31	0.23	0.29	0.19	0.13	0.35	0.20	0.78	0.29	1.10	0.81	0.86
N9	0.15	0.27	0.16	0.23	0.18	0.16	0.22	0.22	0.23	0.22	0.24	0.36	0.22	0.25	0.17	0.20	0.32	0.12	0.68	0.25	1.00	0.69	0.74
O2'	0.24	0.32	0.21	0.23	0.22	0.19	0.23	0.19	0.25	0.22	0.28	0.44	0.29	0.24	0.21	0.32	0.35	0.20	0.53	0.27	0.89	0.59	0.60
O3'	0.14	0.26	0.17	0.28	0.14	0.25	0.19	0.32	0.20	0.22	0.21	0.39	0.22	0.25	0.14	0.23	0.42	0.15	0.52	0.26	0.93	0.60	0.62
O4'	0.19	0.25	0.19	0.22	0.16	0.18	0.17	0.18	0.16	0.21	0.19	0.35	0.22	0.21	0.18	0.27	0.31	0.17	0.52	0.17	0.80	0.49	0.54
O5'	0.20	0.27	0.20	0.23	0.18	0.17	0.20	0.26	0.22	0.24	0.23	0.34	0.26	0.25	0.18	0.35	0.30	0.15	0.54	0.26	0.90	0.57	0.62
O6	0.19	0.22	0.20	0.36	0.19	0.37	0.24	0.51	0.25	0.27	0.24	0.26	0.18	0.30	0.21	0.15	0.41	0.28	0.86	0.33	1.21	1.02	1.00
OP1	0.28	0.26	0.25	0.12	0.16	0.05	0.16	0.25	0.18	0.20	0.18	0.35	0.28	0.24	0.15	0.58	0.29	0.16	0.47	0.24	0.94	0.64	0.66
OP2	0.36	0.36	0.31	0.78	0.51	0.73	0.70	1.05	0.67	0.82	0.50	0.32	0.32	0.88	0.57	0.17	0.77	0.57	1.36	0.77	1.78	1.58	1.57
P	0.16	0.27	0.17	0.52	0.28	0.44	0.39	0.64	0.39	0.43	0.32	0.29	0.24	0.48	0.28	0.24	0.62	0.30	0.83	0.45	1.19	0.94	0.97

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.22	0.02	0.33	0.11	0.16
C2	0.03	0.00	0.16	0.20	0.01	0.08	0.02	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.25	0.05	0.49	0.02	0.67	0.43	0.48
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.01	0.05	0.02	0.07	0.09	0.11	0.19	0.16	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.26	0.07	0.44	0.10	0.23
C3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.12	0.01	0.10	0.01	0.13	0.13	0.17	0.23	0.18	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.34	0.13	0.51	0.11	0.29
C4	0.01	0.01	0.08	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.03	0.51	0.01	0.62	0.36	0.46
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.07	0.08	0.08	0.07	0.08	0.04	0.06	0.03	0.00	0.02	0.09	0.19	0.26	0.05
C5	0.01	0.02	0.05	0.10	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.03	0.63	0.01	0.74	0.51	0.60
C5'	0.03	0.13	0.02	0.01	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.11	0.15	0.12	0.11	0.14	0.08	0.06	0.03	0.02	0.02	0.18	0.21	0.39	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.17	0.04	0.66	0.01	0.80	0.60	0.65
C8	0.01	0.02	0.09	0.13	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.05	0.61	0.02	0.61	0.35	0.51
N1	0.02	0.01	0.11	0.17	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.11	0.22	0.04	0.59	0.02	0.76	0.55	0.59
N2	0.04	0.01	0.19	0.23	0.02	0.08	0.02	0.12	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.18	0.31	0.06	0.45	0.03	0.66	0.42	0.44
N3	0.03	0.00	0.16	0.18	0.01	0.07	0.01	0.11	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.22	0.05	0.43	0.02	0.59	0.33	0.40
N7	0.01	0.02	0.07	0.11	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.05	0.69	0.02	0.74	0.53	0.64
N9	0.00	0.02	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.46	0.02	0.52	0.23	0.37
O2'	0.02	0.14	0.01	0.02	0.07	0.06	0.05	0.06	0.08	0.06	0.11	0.18	0.13	0.06	0.02	0.00	0.04	0.06	0.09	0.08	0.29	0.13	0.11
O3'	0.02	0.25	0.02	0.01	0.13	0.03	0.13	0.03	0.17	0.15	0.22	0.31	0.22	0.15	0.06	0.04	0.00	0.02	0.27	0.17	0.52	0.17	0.29
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.12	0.04	0.18	0.27	0.10
O5'	0.22	0.49	0.26	0.34	0.51	0.02	0.63	0.02	0.66	0.61	0.59	0.45	0.43	0.69	0.46	0.09	0.27	0.12	0.00	0.70	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.07	0.13	0.01	0.09	0.01	0.18	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.08	0.17	0.04	0.70	0.00	0.86	0.68	0.72
OP1	0.33	0.67	0.44	0.51	0.62	0.19	0.74	0.21	0.80	0.61	0.76	0.66	0.59	0.74	0.52	0.29	0.52	0.18	0.01	0.86	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.43	0.10	0.11	0.36	0.26	0.51	0.39	0.60	0.35	0.55	0.42	0.33	0.53	0.23	0.13	0.17	0.27	0.02	0.68	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.48	0.23	0.29	0.46	0.05	0.60	0.02	0.65	0.51	0.59	0.44	0.40	0.64	0.37	0.11	0.29	0.10	0.01	0.72	0.01	0.01	0.00