Doublet Group distance statistics: 51030

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 0, 2, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.011, 0.022, 0.032, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.012, 0.025, 0.037, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.017, 0.031, 0.045, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.031 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.016, 0.032, 0.048, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.011, 0.032, 0.052, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.032 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.017, 0.039, 0.062, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.039 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.023, 0.050, 0.077, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.050 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.036, 0.065, 0.094, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.065 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.036, 0.067, 0.099, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.067 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.062, 0.134, 0.205, 0.270 max_d=0.270 avg_d=0.134 std_dev=0.072
O4'	A	0, 0.077, 0.149, 0.222, 0.238 max_d=0.238 avg_d=0.149 std_dev=0.073
C4'	A	0, 0.155, 0.250, 0.344, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.250 std_dev=0.094
C3'	A	0, 0.141, 0.244, 0.346, 0.406 max_d=0.406 avg_d=0.244 std_dev=0.103
O2'	A	0, 0.020, 0.168, 0.316, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.168 std_dev=0.148
C5'	A	0, 0.241, 0.398, 0.555, 0.602 max_d=0.602 avg_d=0.398 std_dev=0.157
O5'	A	0, 0.244, 0.406, 0.567, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.406 std_dev=0.162
O3'	A	0, 0.207, 0.380, 0.553, 0.648 max_d=0.648 avg_d=0.380 std_dev=0.173
OP2	A	0, 0.400, 0.609, 0.818, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.609 std_dev=0.209
P	A	0, 0.434, 0.705, 0.975, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.705 std_dev=0.270
N2	B	0, 0.453, 0.740, 1.027, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.740 std_dev=0.287
C2	B	0, 0.449, 0.758, 1.068, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.758 std_dev=0.310
N3	B	0, 0.398, 0.710, 1.021, 1.107 max_d=1.107 avg_d=0.710 std_dev=0.312
C2'	B	0, 0.556, 0.897, 1.237, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.897 std_dev=0.341
C4	B	0, 0.564, 0.913, 1.263, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.913 std_dev=0.349
C3'	B	0, 0.556, 0.937, 1.319, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.937 std_dev=0.381
N1	B	0, 0.587, 0.973, 1.359, 1.399 max_d=1.399 avg_d=0.973 std_dev=0.386
N9	B	0, 0.677, 1.065, 1.453, 1.450 max_d=1.450 avg_d=1.065 std_dev=0.388
O3'	B	0, 0.544, 0.938, 1.333, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.938 std_dev=0.394
C1'	B	0, 0.696, 1.094, 1.492, 1.520 max_d=1.520 avg_d=1.094 std_dev=0.398
C5	B	0, 0.693, 1.113, 1.532, 1.481 max_d=1.481 avg_d=1.113 std_dev=0.420
C6	B	0, 0.704, 1.149, 1.593, 1.606 max_d=1.606 avg_d=1.149 std_dev=0.444
OP1	A	0, 0.718, 1.166, 1.614, 1.599 max_d=1.599 avg_d=1.166 std_dev=0.448
O2'	B	0, 0.740, 1.199, 1.658, 1.578 max_d=1.578 avg_d=1.199 std_dev=0.459
C8	B	0, 0.811, 1.284, 1.756, 1.776 max_d=1.776 avg_d=1.284 std_dev=0.472
N7	B	0, 0.829, 1.325, 1.820, 1.797 max_d=1.797 avg_d=1.325 std_dev=0.495
O4'	B	0, 0.874, 1.389, 1.904, 2.060 max_d=2.060 avg_d=1.389 std_dev=0.515
C4'	B	0, 0.798, 1.329, 1.859, 2.230 max_d=2.230 avg_d=1.329 std_dev=0.531
O6	B	0, 0.843, 1.378, 1.913, 1.941 max_d=1.941 avg_d=1.378 std_dev=0.535
C5'	B	0, 0.927, 1.612, 2.297, 2.927 max_d=2.927 avg_d=1.612 std_dev=0.685
O5'	B	0, 0.778, 1.536, 2.294, 3.071 max_d=3.071 avg_d=1.536 std_dev=0.758
OP2	B	0, 1.024, 2.108, 3.193, 3.891 max_d=3.891 avg_d=2.108 std_dev=1.085
P	B	0, 0.934, 2.082, 3.230, 4.032 max_d=4.032 avg_d=2.082 std_dev=1.148
OP1	B	0, 0.669, 2.421, 4.173, 6.468 max_d=6.468 avg_d=2.421 std_dev=1.752

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04
C2	0.03	0.00	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.06	0.03	0.12	0.01	0.13	0.22	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.07	0.07	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.08	0.08	0.05	0.03
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.07	0.09	0.05	0.04	0.03	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.04	0.09	0.10	0.07	0.05
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.05	0.02	0.12	0.02	0.12	0.18	0.13
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.03	0.02	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.08	0.03	0.17	0.02	0.19	0.24	0.20
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.13	0.13	0.10	0.05	0.05	0.15	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.16	0.06	0.02	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.09	0.03	0.18	0.01	0.22	0.28	0.23
C8	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.05	0.17	0.04	0.16	0.16	0.15
N1	0.03	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.07	0.03	0.15	0.01	0.18	0.26	0.20
N2	0.04	0.01	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.04	0.10	0.01	0.12	0.21	0.14
N3	0.03	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.10	0.05	0.03	0.10	0.01	0.10	0.17	0.11
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.09	0.00	0.15	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.05	0.20	0.03	0.22	0.24	0.22
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.10	0.03	0.10	0.12	0.09
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.05	0.06	0.05	0.09	0.02	0.11	0.14	0.10	0.03	0.02	0.00	0.05	0.04	0.03	0.10	0.11	0.05	0.04
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.09	0.10	0.07	0.07	0.05	0.11	0.05	0.05	0.00	0.02	0.09	0.12	0.16	0.14	0.11
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.06	0.04
O5'	0.04	0.12	0.02	0.04	0.12	0.01	0.17	0.01	0.18	0.17	0.15	0.10	0.10	0.20	0.10	0.03	0.09	0.03	0.00	0.21	0.03	0.02	0.01
O6	0.04	0.01	0.08	0.09	0.02	0.08	0.02	0.16	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.10	0.12	0.05	0.21	0.00	0.27	0.32	0.27
OP1	0.05	0.13	0.08	0.10	0.12	0.07	0.19	0.06	0.22	0.16	0.18	0.12	0.10	0.22	0.10	0.11	0.16	0.04	0.03	0.27	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.22	0.05	0.07	0.18	0.02	0.24	0.02	0.28	0.16	0.26	0.21	0.17	0.24	0.12	0.05	0.14	0.06	0.02	0.32	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.15	0.03	0.05	0.13	0.02	0.20	0.01	0.23	0.15	0.20	0.14	0.11	0.22	0.09	0.04	0.11	0.04	0.01	0.27	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.12	0.12	0.10	0.09	0.08	0.11	0.15	0.12	0.12	0.11	0.17	0.10	0.14	0.09	0.24	0.10	0.09	0.51	0.14	0.80	0.59	0.54
C2	0.14	0.19	0.13	0.16	0.13	0.18	0.16	0.28	0.14	0.21	0.18	0.27	0.15	0.23	0.15	0.18	0.14	0.16	0.68	0.18	1.24	0.69	0.75
C2'	0.11	0.13	0.12	0.07	0.08	0.06	0.11	0.14	0.12	0.13	0.11	0.20	0.11	0.15	0.09	0.26	0.08	0.08	0.52	0.15	0.81	0.66	0.57
C3'	0.11	0.15	0.12	0.07	0.09	0.06	0.11	0.14	0.11	0.13	0.12	0.20	0.13	0.14	0.09	0.27	0.08	0.07	0.48	0.13	0.74	0.63	0.53
C4	0.13	0.15	0.13	0.14	0.10	0.15	0.12	0.24	0.10	0.18	0.13	0.20	0.12	0.19	0.13	0.19	0.13	0.13	0.64	0.13	1.07	0.68	0.68
C4'	0.11	0.17	0.11	0.07	0.10	0.05	0.09	0.10	0.11	0.08	0.15	0.22	0.16	0.09	0.08	0.28	0.11	0.07	0.43	0.11	0.66	0.50	0.46
C5	0.16	0.17	0.17	0.20	0.13	0.21	0.15	0.30	0.16	0.22	0.19	0.21	0.14	0.21	0.17	0.19	0.20	0.18	0.70	0.19	1.16	0.72	0.74
C5'	0.12	0.17	0.12	0.05	0.11	0.05	0.09	0.09	0.10	0.11	0.13	0.22	0.16	0.11	0.10	0.28	0.10	0.07	0.40	0.09	0.62	0.45	0.43
C6	0.18	0.20	0.18	0.23	0.16	0.25	0.18	0.35	0.20	0.25	0.23	0.24	0.16	0.25	0.19	0.19	0.23	0.22	0.75	0.24	1.32	0.74	0.82
C8	0.15	0.13	0.17	0.14	0.11	0.14	0.13	0.21	0.13	0.17	0.13	0.15	0.11	0.17	0.14	0.21	0.14	0.14	0.61	0.15	0.90	0.67	0.63
N1	0.16	0.21	0.15	0.20	0.15	0.23	0.17	0.33	0.17	0.24	0.21	0.26	0.16	0.24	0.18	0.18	0.20	0.20	0.73	0.20	1.33	0.72	0.80
N2	0.14	0.21	0.12	0.15	0.14	0.17	0.17	0.27	0.17	0.21	0.19	0.29	0.16	0.24	0.15	0.19	0.13	0.16	0.68	0.21	1.27	0.69	0.75
N3	0.12	0.17	0.12	0.12	0.11	0.13	0.15	0.23	0.13	0.18	0.14	0.24	0.14	0.20	0.13	0.20	0.11	0.13	0.63	0.17	1.11	0.67	0.68
N7	0.18	0.16	0.19	0.22	0.15	0.22	0.17	0.29	0.18	0.23	0.18	0.17	0.14	0.22	0.18	0.21	0.22	0.20	0.69	0.21	1.05	0.73	0.72
N9	0.11	0.10	0.13	0.10	0.07	0.10	0.10	0.18	0.09	0.15	0.08	0.16	0.08	0.16	0.11	0.21	0.09	0.10	0.58	0.12	0.91	0.65	0.61
O2'	0.10	0.18	0.09	0.09	0.11	0.07	0.13	0.14	0.16	0.11	0.17	0.25	0.15	0.14	0.09	0.23	0.11	0.07	0.47	0.19	0.76	0.60	0.52
O3'	0.11	0.15	0.11	0.09	0.09	0.07	0.10	0.16	0.10	0.12	0.11	0.22	0.14	0.14	0.09	0.28	0.11	0.07	0.45	0.13	0.71	0.63	0.51
O4'	0.11	0.16	0.12	0.11	0.10	0.09	0.11	0.13	0.12	0.08	0.14	0.19	0.14	0.10	0.09	0.26	0.13	0.09	0.44	0.13	0.67	0.50	0.46
O5'	0.15	0.14	0.18	0.05	0.13	0.04	0.14	0.10	0.13	0.17	0.12	0.17	0.14	0.17	0.14	0.26	0.02	0.09	0.45	0.13	0.68	0.51	0.48
O6	0.21	0.22	0.20	0.27	0.19	0.30	0.21	0.40	0.24	0.28	0.25	0.25	0.18	0.27	0.22	0.20	0.28	0.27	0.78	0.30	1.42	0.76	0.87
OP1	0.09	0.15	0.13	0.01	0.09	0.03	0.11	0.14	0.10	0.15	0.11	0.20	0.14	0.16	0.08	0.22	0.02	0.03	0.41	0.13	0.78	0.52	0.50
OP2	0.11	0.15	0.09	0.09	0.16	0.17	0.22	0.29	0.22	0.25	0.18	0.15	0.13	0.28	0.16	0.11	0.02	0.17	0.61	0.26	0.93	0.79	0.71
P	0.05	0.11	0.10	0.02	0.08	0.05	0.12	0.15	0.12	0.16	0.10	0.14	0.09	0.18	0.08	0.17	0.00	0.03	0.45	0.14	0.73	0.53	0.51

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.20	0.01	0.32	0.11	0.19
C2	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.13	0.02	0.44	0.01	0.80	0.45	0.47
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.06	0.07	0.12	0.11	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.05	0.34	0.18	0.23
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.07	0.11	0.08	0.13	0.11	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.33	0.07	0.41	0.21	0.30
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.47	0.01	0.77	0.41	0.46
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.04	0.05	0.05	0.09	0.04	0.07	0.01	0.00	0.01	0.07	0.14	0.18	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.58	0.01	1.00	0.55	0.60
C5'	0.02	0.09	0.02	0.02	0.10	0.00	0.14	0.00	0.14	0.15	0.12	0.07	0.08	0.17	0.09	0.07	0.04	0.01	0.01	0.16	0.22	0.33	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.02	0.61	0.00	1.09	0.62	0.65
C8	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.12	0.04	0.58	0.01	0.87	0.43	0.55
N1	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.02	0.54	0.01	0.98	0.56	0.58
N2	0.03	0.01	0.12	0.13	0.02	0.05	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.17	0.17	0.04	0.40	0.01	0.74	0.43	0.43
N3	0.03	0.01	0.11	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.13	0.12	0.02	0.39	0.01	0.68	0.36	0.40
N7	0.01	0.02	0.05	0.10	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.12	0.04	0.64	0.01	1.08	0.59	0.66
N9	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.43	0.01	0.64	0.31	0.40
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.07	0.07	0.06	0.07	0.09	0.04	0.12	0.17	0.13	0.04	0.02	0.00	0.03	0.05	0.07	0.09	0.18	0.06	0.07
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.07	0.01	0.07	0.04	0.08	0.12	0.10	0.17	0.12	0.12	0.05	0.03	0.00	0.01	0.29	0.09	0.47	0.26	0.30
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.02	0.05	0.01	0.00	0.13	0.03	0.17	0.19	0.14
O5'	0.20	0.44	0.24	0.33	0.47	0.01	0.58	0.01	0.61	0.58	0.54	0.40	0.39	0.64	0.43	0.07	0.29	0.13	0.00	0.66	0.02	0.03	0.01
O6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.66	0.00	1.22	0.70	0.73
OP1	0.32	0.80	0.34	0.41	0.77	0.14	1.00	0.22	1.09	0.87	0.98	0.74	0.68	1.08	0.64	0.18	0.47	0.17	0.02	1.22	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.45	0.18	0.21	0.41	0.18	0.55	0.33	0.62	0.43	0.56	0.43	0.36	0.59	0.31	0.06	0.26	0.19	0.03	0.70	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.47	0.23	0.30	0.46	0.02	0.60	0.02	0.65	0.55	0.58	0.43	0.40	0.66	0.40	0.07	0.30	0.14	0.01	0.73	0.00	0.01	0.00