Doublet Group distance statistics: 51032

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.009, 0.024, 0.040, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N2	A	0, 0.008, 0.024, 0.041, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.007, 0.028, 0.048, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.028 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.012, 0.036, 0.060, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.036 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.021, 0.053, 0.086, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.053 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.017, 0.053, 0.089, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.053 std_dev=0.036
N7	A	0, 0.021, 0.066, 0.112, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.066 std_dev=0.046
C8	A	0, 0.028, 0.082, 0.136, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.082 std_dev=0.054
O4'	A	0, 0.078, 0.318, 0.558, 0.699 max_d=0.699 avg_d=0.318 std_dev=0.240
C2'	A	0, 0.160, 0.478, 0.796, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.478 std_dev=0.318
C4	B	0, 0.251, 0.597, 0.943, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.597 std_dev=0.346
C1'	B	0, 0.307, 0.676, 1.045, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.676 std_dev=0.369
N9	B	0, 0.302, 0.674, 1.046, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.674 std_dev=0.372
N3	B	0, 0.195, 0.571, 0.946, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.571 std_dev=0.376
C4'	A	0, 0.153, 0.531, 0.910, 1.239 max_d=1.239 avg_d=0.531 std_dev=0.379
C2'	B	0, 0.206, 0.594, 0.983, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.594 std_dev=0.388
N1	B	0, 0.199, 0.605, 1.011, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.605 std_dev=0.406
C2	B	0, 0.165, 0.578, 0.990, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.578 std_dev=0.412
O2'	B	0, 0.215, 0.630, 1.045, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.630 std_dev=0.415
C5	B	0, 0.210, 0.633, 1.056, 1.494 max_d=1.494 avg_d=0.633 std_dev=0.423
O4'	B	0, 0.378, 0.805, 1.232, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.805 std_dev=0.427
C6	B	0, 0.195, 0.634, 1.073, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.634 std_dev=0.439
O2'	A	0, 0.264, 0.722, 1.180, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.722 std_dev=0.458
C3'	A	0, 0.258, 0.716, 1.175, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.716 std_dev=0.459
C3'	B	0, 0.296, 0.756, 1.216, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.756 std_dev=0.460
C4'	B	0, 0.328, 0.820, 1.312, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.820 std_dev=0.492
C8	B	0, 0.278, 0.770, 1.263, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.770 std_dev=0.493
N2	B	0, 0.162, 0.679, 1.196, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.679 std_dev=0.517
O3'	B	0, 0.326, 0.847, 1.367, 1.574 max_d=1.574 avg_d=0.847 std_dev=0.520
O6	B	0, 0.203, 0.729, 1.255, 1.874 max_d=1.874 avg_d=0.729 std_dev=0.526
N7	B	0, 0.221, 0.753, 1.284, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.753 std_dev=0.532
C5'	B	0, 0.492, 1.063, 1.634, 1.855 max_d=1.855 avg_d=1.063 std_dev=0.571
P	A	0, 0.514, 1.099, 1.683, 1.769 max_d=1.769 avg_d=1.099 std_dev=0.584
O5'	A	0, 0.553, 1.205, 1.858, 1.773 max_d=1.773 avg_d=1.205 std_dev=0.652
OP1	A	0, 0.520, 1.189, 1.859, 2.112 max_d=2.112 avg_d=1.189 std_dev=0.670
OP2	A	0, 0.625, 1.318, 2.010, 2.107 max_d=2.107 avg_d=1.318 std_dev=0.693
O3'	A	0, 0.378, 1.070, 1.763, 2.117 max_d=2.117 avg_d=1.070 std_dev=0.693
C5'	A	0, 0.311, 1.005, 1.699, 2.269 max_d=2.269 avg_d=1.005 std_dev=0.694
O5'	B	0, 0.617, 1.314, 2.011, 2.265 max_d=2.265 avg_d=1.314 std_dev=0.697
P	B	0, 0.751, 1.654, 2.557, 2.777 max_d=2.777 avg_d=1.654 std_dev=0.903
OP2	B	0, 0.690, 1.598, 2.505, 2.666 max_d=2.666 avg_d=1.598 std_dev=0.907
OP1	B	0, 0.839, 1.901, 2.962, 3.429 max_d=3.429 avg_d=1.901 std_dev=1.061

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.11	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.26	0.02	0.24	0.23	0.18
C2	0.03	0.00	0.13	0.17	0.01	0.05	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.24	0.04	0.42	0.01	0.32	0.20	0.26
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.06	0.04	0.10	0.07	0.17	0.14	0.08	0.03	0.01	0.03	0.01	0.26	0.06	0.31	0.15	0.18
C3'	0.02	0.17	0.01	0.00	0.12	0.01	0.15	0.02	0.16	0.18	0.15	0.21	0.16	0.18	0.09	0.01	0.01	0.01	0.31	0.18	0.38	0.16	0.23
C4	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.01	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.15	0.02	0.42	0.02	0.31	0.19	0.26
C4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.13	0.01	0.13	0.16	0.08	0.07	0.04	0.16	0.08	0.08	0.02	0.00	0.01	0.17	0.16	0.28	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.13	0.00	0.34	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.18	0.02	0.49	0.02	0.34	0.23	0.31
C5'	0.11	0.22	0.06	0.02	0.26	0.01	0.34	0.00	0.35	0.36	0.29	0.18	0.19	0.38	0.25	0.06	0.07	0.03	0.02	0.40	0.22	0.41	0.04
C6	0.02	0.01	0.04	0.16	0.01	0.13	0.01	0.35	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.20	0.03	0.51	0.01	0.36	0.25	0.33
C8	0.02	0.02	0.10	0.18	0.01	0.16	0.02	0.36	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.19	0.06	0.49	0.04	0.32	0.20	0.30
N1	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.08	0.01	0.29	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.21	0.03	0.47	0.01	0.34	0.22	0.30
N2	0.03	0.01	0.17	0.21	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.21	0.30	0.05	0.40	0.01	0.32	0.19	0.26
N3	0.03	0.01	0.14	0.16	0.00	0.04	0.01	0.19	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.16	0.21	0.05	0.38	0.02	0.30	0.19	0.24
N7	0.02	0.01	0.08	0.18	0.01	0.16	0.01	0.38	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.21	0.05	0.53	0.04	0.36	0.25	0.35
N9	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.08	0.01	0.25	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.09	0.01	0.39	0.03	0.28	0.19	0.23
O2'	0.01	0.16	0.01	0.01	0.08	0.08	0.04	0.06	0.06	0.06	0.12	0.21	0.16	0.05	0.02	0.00	0.05	0.06	0.12	0.05	0.27	0.15	0.09
O3'	0.02	0.24	0.03	0.01	0.15	0.02	0.18	0.07	0.20	0.19	0.21	0.30	0.21	0.21	0.09	0.05	0.00	0.02	0.29	0.23	0.45	0.24	0.28
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.06	0.03	0.05	0.05	0.05	0.01	0.06	0.02	0.00	0.25	0.04	0.27	0.34	0.23
O5'	0.26	0.42	0.26	0.31	0.42	0.01	0.49	0.02	0.51	0.49	0.47	0.40	0.38	0.53	0.39	0.12	0.29	0.25	0.00	0.54	0.01	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.18	0.02	0.17	0.02	0.40	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.05	0.23	0.04	0.54	0.00	0.39	0.29	0.36
OP1	0.24	0.32	0.31	0.38	0.31	0.16	0.34	0.22	0.36	0.32	0.34	0.32	0.30	0.36	0.28	0.27	0.45	0.27	0.01	0.39	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.20	0.15	0.16	0.19	0.28	0.23	0.41	0.25	0.20	0.22	0.19	0.19	0.25	0.19	0.15	0.24	0.34	0.03	0.29	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.26	0.18	0.23	0.26	0.03	0.31	0.04	0.33	0.30	0.30	0.26	0.24	0.35	0.23	0.09	0.28	0.23	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.30	0.32	0.30	0.25	0.26	0.26	0.15	0.28	0.15	0.16	0.18	0.37	0.38	0.13	0.25	0.34	0.23	0.26	0.41	0.23	0.51	0.55	0.48
C2	0.24	0.35	0.23	0.24	0.27	0.26	0.26	0.37	0.30	0.21	0.33	0.39	0.32	0.24	0.24	0.23	0.24	0.23	0.49	0.34	0.71	0.75	0.64
C2'	0.25	0.44	0.24	0.18	0.28	0.18	0.17	0.18	0.19	0.13	0.31	0.56	0.44	0.14	0.21	0.32	0.23	0.19	0.31	0.20	0.45	0.47	0.39
C3'	0.18	0.31	0.22	0.21	0.16	0.20	0.14	0.19	0.17	0.17	0.21	0.43	0.30	0.20	0.13	0.33	0.30	0.16	0.22	0.23	0.38	0.35	0.30
C4	0.23	0.30	0.24	0.24	0.25	0.25	0.22	0.34	0.24	0.18	0.25	0.33	0.31	0.21	0.22	0.26	0.24	0.21	0.47	0.30	0.66	0.68	0.59
C4'	0.20	0.26	0.21	0.18	0.18	0.19	0.20	0.18	0.23	0.18	0.22	0.33	0.27	0.23	0.17	0.32	0.22	0.18	0.16	0.29	0.26	0.24	0.20
C5	0.25	0.28	0.26	0.27	0.28	0.28	0.31	0.38	0.33	0.27	0.29	0.29	0.29	0.33	0.26	0.26	0.28	0.24	0.51	0.39	0.74	0.73	0.65
C5'	0.34	0.30	0.35	0.32	0.33	0.34	0.39	0.32	0.38	0.41	0.31	0.32	0.31	0.44	0.35	0.49	0.33	0.36	0.19	0.43	0.21	0.18	0.18
C6	0.27	0.32	0.26	0.28	0.31	0.31	0.36	0.43	0.39	0.32	0.34	0.32	0.30	0.38	0.29	0.25	0.29	0.27	0.54	0.46	0.80	0.80	0.70
C8	0.24	0.21	0.29	0.27	0.22	0.26	0.22	0.32	0.22	0.21	0.18	0.22	0.24	0.26	0.21	0.31	0.29	0.20	0.45	0.29	0.63	0.59	0.55
N1	0.25	0.34	0.24	0.26	0.30	0.29	0.32	0.41	0.37	0.27	0.36	0.37	0.31	0.32	0.27	0.23	0.27	0.26	0.53	0.44	0.78	0.79	0.68
N2	0.24	0.36	0.22	0.24	0.27	0.26	0.25	0.37	0.28	0.21	0.33	0.43	0.33	0.23	0.24	0.23	0.23	0.24	0.49	0.31	0.71	0.76	0.64
N3	0.23	0.34	0.23	0.23	0.25	0.24	0.20	0.33	0.22	0.17	0.28	0.39	0.33	0.18	0.22	0.24	0.23	0.21	0.46	0.27	0.65	0.70	0.59
N7	0.25	0.24	0.28	0.30	0.26	0.29	0.31	0.38	0.30	0.30	0.24	0.23	0.25	0.36	0.26	0.29	0.31	0.23	0.51	0.36	0.74	0.68	0.63
N9	0.24	0.26	0.26	0.24	0.23	0.24	0.16	0.30	0.17	0.14	0.17	0.29	0.30	0.17	0.20	0.28	0.24	0.21	0.43	0.26	0.59	0.60	0.53
O2'	0.36	0.58	0.30	0.19	0.39	0.23	0.26	0.21	0.27	0.21	0.42	0.74	0.56	0.18	0.32	0.38	0.17	0.30	0.34	0.24	0.43	0.49	0.40
O3'	0.18	0.35	0.22	0.23	0.17	0.23	0.15	0.23	0.17	0.17	0.25	0.51	0.33	0.20	0.13	0.33	0.34	0.18	0.20	0.23	0.37	0.32	0.28
O4'	0.24	0.21	0.27	0.25	0.18	0.25	0.19	0.26	0.26	0.15	0.23	0.24	0.24	0.19	0.18	0.32	0.26	0.23	0.37	0.32	0.45	0.48	0.41
O5'	0.23	0.21	0.25	0.12	0.23	0.11	0.32	0.08	0.33	0.34	0.26	0.21	0.21	0.38	0.25	0.31	0.03	0.17	0.24	0.40	0.34	0.34	0.29
O6	0.29	0.32	0.27	0.31	0.33	0.35	0.39	0.47	0.42	0.37	0.36	0.31	0.30	0.44	0.32	0.27	0.33	0.31	0.57	0.50	0.87	0.84	0.75
OP1	0.11	0.17	0.16	0.03	0.12	0.08	0.18	0.21	0.22	0.18	0.19	0.19	0.14	0.21	0.11	0.28	0.02	0.06	0.08	0.27	0.18	0.16	0.12
OP2	0.16	0.20	0.11	0.12	0.20	0.18	0.21	0.28	0.20	0.26	0.18	0.24	0.21	0.27	0.21	0.09	0.02	0.21	0.19	0.23	0.35	0.26	0.24
P	0.05	0.09	0.10	0.01	0.06	0.05	0.14	0.14	0.16	0.18	0.11	0.13	0.08	0.21	0.08	0.17	0.01	0.03	0.11	0.22	0.24	0.19	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.03	0.05	0.14	0.07
C2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.02	0.03	0.02	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.09	0.11	0.04	0.19	0.01	0.23	0.39	0.24
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.06	0.02	0.07	0.08	0.06	0.11	0.09	0.08	0.03	0.00	0.02	0.01	0.11	0.09	0.13	0.18	0.12
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.11	0.07	0.12	0.08	0.10	0.04	0.02	0.00	0.02	0.13	0.10	0.17	0.17	0.15
C4	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.18	0.01	0.21	0.35	0.22
C4'	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.05	0.03	0.08	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.06	0.06	0.04	0.02
C5	0.01	0.02	0.06	0.06	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.23	0.01	0.30	0.44	0.31
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.09	0.01	0.15	0.00	0.15	0.16	0.12	0.06	0.06	0.18	0.09	0.07	0.05	0.02	0.01	0.16	0.10	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.11	0.03	0.24	0.00	0.34	0.49	0.34
C8	0.02	0.02	0.08	0.11	0.00	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.05	0.19	0.02	0.23	0.32	0.25
N1	0.02	0.00	0.06	0.07	0.02	0.04	0.02	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.08	0.10	0.04	0.23	0.01	0.31	0.46	0.30
N2	0.04	0.01	0.11	0.12	0.03	0.05	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.13	0.16	0.04	0.17	0.01	0.21	0.38	0.21
N3	0.02	0.01	0.09	0.08	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.03	0.16	0.01	0.18	0.33	0.19
N7	0.02	0.02	0.08	0.10	0.01	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.13	0.05	0.24	0.02	0.32	0.44	0.33
N9	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.14	0.02	0.16	0.27	0.17
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.04	0.06	0.06	0.07	0.08	0.06	0.08	0.13	0.09	0.07	0.02	0.00	0.02	0.03	0.05	0.10	0.11	0.10	0.06
O3'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.06	0.02	0.09	0.05	0.11	0.12	0.10	0.16	0.11	0.13	0.05	0.02	0.00	0.01	0.15	0.14	0.24	0.18	0.19
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.04	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.09	0.04	0.12	0.07	0.10
O5'	0.07	0.19	0.11	0.13	0.18	0.01	0.23	0.01	0.24	0.19	0.23	0.17	0.16	0.24	0.14	0.05	0.15	0.09	0.00	0.25	0.01	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.09	0.10	0.01	0.06	0.01	0.16	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.10	0.14	0.04	0.25	0.00	0.39	0.53	0.38
OP1	0.05	0.23	0.13	0.17	0.21	0.06	0.30	0.10	0.34	0.23	0.31	0.21	0.18	0.32	0.16	0.11	0.24	0.12	0.01	0.39	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.39	0.18	0.17	0.35	0.04	0.44	0.02	0.49	0.32	0.46	0.38	0.33	0.44	0.27	0.10	0.18	0.07	0.02	0.53	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.24	0.12	0.15	0.22	0.02	0.31	0.02	0.34	0.25	0.30	0.21	0.19	0.33	0.17	0.06	0.19	0.10	0.01	0.38	0.01	0.01	0.00