Doublet Group distance statistics: 51033

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 1, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.003, 0.015, 0.028, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.015 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.014, 0.031, 0.048, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.031 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.017, 0.038, 0.058, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.038 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.031 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.013, 0.036, 0.059, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.036 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.016, 0.039, 0.061, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.039 std_dev=0.023
O2'	A	0, 0.090, 0.234, 0.379, 0.422 max_d=0.422 avg_d=0.234 std_dev=0.144
O4'	A	0, 0.117, 0.294, 0.472, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.294 std_dev=0.178
N9	B	0, 0.245, 0.436, 0.627, 0.704 max_d=0.704 avg_d=0.436 std_dev=0.191
C2'	A	0, 0.063, 0.259, 0.456, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.259 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.221, 0.426, 0.631, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.426 std_dev=0.205
C5	B	0, 0.232, 0.477, 0.722, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.477 std_dev=0.245
C2'	B	0, 0.197, 0.443, 0.690, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.443 std_dev=0.247
N1	B	0, 0.225, 0.472, 0.719, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.472 std_dev=0.247
C8	B	0, 0.248, 0.503, 0.757, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.503 std_dev=0.255
C6	B	0, 0.260, 0.524, 0.789, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.524 std_dev=0.265
C1'	B	0, 0.229, 0.505, 0.781, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.505 std_dev=0.276
C4'	A	0, 0.237, 0.524, 0.811, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.524 std_dev=0.287
N3	B	0, 0.215, 0.505, 0.795, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.505 std_dev=0.290
C2	B	0, 0.216, 0.508, 0.800, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.508 std_dev=0.292
C3'	B	0, 0.341, 0.636, 0.931, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.636 std_dev=0.295
C3'	A	0, 0.233, 0.531, 0.828, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.531 std_dev=0.298
N7	B	0, 0.224, 0.568, 0.912, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.568 std_dev=0.344
O2'	B	0, 0.286, 0.633, 0.981, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.633 std_dev=0.348
O6	B	0, 0.304, 0.671, 1.039, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.671 std_dev=0.368
O4'	B	0, 0.266, 0.637, 1.008, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.637 std_dev=0.371
N2	B	0, 0.301, 0.674, 1.048, 1.147 max_d=1.147 avg_d=0.674 std_dev=0.374
O5'	B	0, 0.326, 0.701, 1.075, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.701 std_dev=0.375
O5'	A	0, 0.461, 0.841, 1.220, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.841 std_dev=0.379
O3'	B	0, 0.527, 0.937, 1.347, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.937 std_dev=0.410
C4'	B	0, 0.314, 0.726, 1.138, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.726 std_dev=0.412
O3'	A	0, 0.362, 0.776, 1.191, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.776 std_dev=0.415
C5'	A	0, 0.414, 0.869, 1.323, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.869 std_dev=0.454
P	A	0, 0.632, 1.112, 1.592, 1.513 max_d=1.513 avg_d=1.112 std_dev=0.480
C5'	B	0, 0.328, 0.811, 1.294, 1.749 max_d=1.749 avg_d=0.811 std_dev=0.483
OP2	A	0, 0.683, 1.220, 1.757, 1.948 max_d=1.948 avg_d=1.220 std_dev=0.537
P	B	0, 0.454, 1.099, 1.743, 1.968 max_d=1.968 avg_d=1.099 std_dev=0.644
OP1	A	0, 0.822, 1.549, 2.276, 2.424 max_d=2.424 avg_d=1.549 std_dev=0.727
OP1	B	0, 0.616, 1.408, 2.200, 3.016 max_d=3.016 avg_d=1.408 std_dev=0.792
OP2	B	0, 0.437, 1.405, 2.373, 3.067 max_d=3.067 avg_d=1.405 std_dev=0.968

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.08	0.11	0.06
C2	0.04	0.00	0.15	0.18	0.01	0.09	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.23	0.04	0.11	0.02	0.12	0.22	0.14
C2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.08	0.01	0.04	0.02	0.07	0.05	0.11	0.17	0.15	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.07	0.17	0.11	0.08
C3'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.11	0.01	0.09	0.02	0.11	0.09	0.15	0.21	0.16	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.09	0.10	0.21	0.15	0.12
C4	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.02	0.09	0.03	0.09	0.21	0.13
C4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.06	0.11	0.08	0.06	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.05	0.15	0.05	0.03
C5	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.11	0.03	0.08	0.03	0.15	0.26	0.16
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.05	0.01	0.05	0.00	0.06	0.09	0.07	0.11	0.08	0.09	0.04	0.06	0.01	0.02	0.01	0.07	0.12	0.02	0.03
C6	0.04	0.02	0.07	0.11	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.07	0.15	0.04	0.10	0.01	0.18	0.27	0.17
C8	0.02	0.02	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.09	0.04	0.07	0.04	0.11	0.25	0.14
N1	0.03	0.01	0.11	0.15	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.20	0.04	0.10	0.02	0.15	0.25	0.16
N2	0.05	0.00	0.17	0.21	0.01	0.11	0.01	0.11	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.15	0.28	0.05	0.12	0.03	0.12	0.21	0.15
N3	0.04	0.01	0.15	0.16	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.20	0.04	0.10	0.03	0.09	0.19	0.13
N7	0.02	0.02	0.03	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.09	0.04	0.08	0.04	0.17	0.29	0.17
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.04	0.06	0.19	0.11
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.05	0.04	0.06	0.07	0.04	0.10	0.15	0.12	0.03	0.02	0.00	0.06	0.04	0.05	0.07	0.19	0.09	0.07
O3'	0.03	0.23	0.03	0.01	0.13	0.02	0.11	0.01	0.15	0.09	0.20	0.28	0.20	0.09	0.06	0.06	0.00	0.02	0.12	0.14	0.31	0.24	0.19
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.05	0.09	0.12	0.08
O5'	0.04	0.11	0.06	0.09	0.09	0.02	0.08	0.01	0.10	0.07	0.10	0.12	0.10	0.08	0.06	0.05	0.12	0.07	0.00	0.10	0.02	0.02	0.01
O6	0.05	0.02	0.07	0.10	0.03	0.05	0.03	0.07	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04	0.07	0.14	0.05	0.10	0.00	0.22	0.30	0.19
OP1	0.08	0.12	0.17	0.21	0.09	0.15	0.15	0.12	0.18	0.11	0.15	0.12	0.09	0.17	0.06	0.19	0.31	0.09	0.02	0.22	0.00	0.02	0.00
OP2	0.11	0.22	0.11	0.15	0.21	0.05	0.26	0.02	0.27	0.25	0.25	0.21	0.19	0.29	0.19	0.09	0.24	0.12	0.02	0.30	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.14	0.08	0.12	0.13	0.03	0.16	0.03	0.17	0.14	0.16	0.15	0.13	0.17	0.11	0.07	0.19	0.08	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.26	0.18	0.15	0.24	0.16	0.25	0.17	0.26	0.23	0.24	0.31	0.28	0.25	0.23	0.18	0.17	0.20	0.30	0.28	0.63	0.57	0.40
C2	0.15	0.22	0.12	0.12	0.17	0.11	0.21	0.15	0.24	0.19	0.20	0.32	0.22	0.23	0.17	0.13	0.17	0.13	0.32	0.31	0.75	0.71	0.52
C2'	0.19	0.27	0.14	0.09	0.22	0.10	0.23	0.10	0.24	0.23	0.23	0.37	0.26	0.25	0.21	0.16	0.11	0.15	0.30	0.27	0.73	0.70	0.48
C3'	0.17	0.18	0.14	0.08	0.16	0.08	0.19	0.10	0.18	0.22	0.15	0.27	0.17	0.24	0.18	0.16	0.12	0.12	0.30	0.22	0.76	0.75	0.52
C4	0.15	0.20	0.12	0.12	0.18	0.11	0.22	0.15	0.24	0.20	0.18	0.28	0.21	0.24	0.17	0.12	0.16	0.13	0.32	0.30	0.71	0.67	0.49
C4'	0.19	0.18	0.15	0.10	0.19	0.11	0.21	0.11	0.21	0.21	0.18	0.22	0.19	0.23	0.19	0.17	0.13	0.14	0.26	0.23	0.62	0.58	0.40
C5	0.12	0.19	0.08	0.08	0.16	0.07	0.22	0.13	0.25	0.20	0.17	0.26	0.18	0.25	0.16	0.10	0.15	0.10	0.32	0.32	0.71	0.71	0.51
C5'	0.20	0.14	0.19	0.11	0.18	0.12	0.21	0.13	0.20	0.23	0.16	0.15	0.15	0.24	0.21	0.22	0.13	0.15	0.29	0.22	0.62	0.60	0.42
C6	0.12	0.23	0.08	0.08	0.17	0.06	0.22	0.13	0.26	0.20	0.22	0.31	0.20	0.25	0.16	0.10	0.14	0.10	0.32	0.35	0.73	0.74	0.54
C8	0.14	0.13	0.09	0.10	0.18	0.10	0.23	0.15	0.23	0.23	0.14	0.16	0.16	0.26	0.19	0.10	0.15	0.12	0.32	0.26	0.66	0.63	0.46
N1	0.13	0.23	0.09	0.09	0.16	0.07	0.20	0.13	0.24	0.19	0.20	0.32	0.20	0.24	0.15	0.11	0.15	0.11	0.32	0.33	0.75	0.74	0.54
N2	0.16	0.23	0.13	0.13	0.18	0.12	0.21	0.15	0.23	0.19	0.21	0.33	0.23	0.23	0.17	0.14	0.18	0.14	0.32	0.31	0.77	0.72	0.52
N3	0.17	0.23	0.14	0.14	0.19	0.13	0.22	0.16	0.24	0.20	0.20	0.32	0.23	0.24	0.18	0.14	0.17	0.15	0.32	0.30	0.73	0.68	0.49
N7	0.12	0.15	0.08	0.07	0.16	0.06	0.24	0.13	0.24	0.22	0.15	0.20	0.16	0.27	0.16	0.11	0.14	0.09	0.32	0.29	0.68	0.69	0.50
N9	0.18	0.20	0.14	0.13	0.21	0.13	0.23	0.16	0.24	0.22	0.19	0.24	0.22	0.25	0.20	0.14	0.17	0.15	0.32	0.27	0.67	0.62	0.45
O2'	0.24	0.35	0.18	0.13	0.27	0.15	0.27	0.14	0.30	0.24	0.31	0.45	0.34	0.26	0.24	0.21	0.15	0.21	0.27	0.32	0.66	0.62	0.41
O3'	0.18	0.19	0.16	0.12	0.15	0.12	0.19	0.14	0.18	0.24	0.15	0.30	0.18	0.25	0.18	0.19	0.14	0.14	0.33	0.22	0.81	0.82	0.57
O4'	0.21	0.20	0.18	0.16	0.22	0.16	0.23	0.17	0.24	0.22	0.21	0.21	0.22	0.24	0.22	0.17	0.19	0.19	0.28	0.26	0.56	0.50	0.35
O5'	0.20	0.09	0.21	0.10	0.15	0.08	0.18	0.07	0.16	0.24	0.11	0.12	0.10	0.23	0.20	0.24	0.02	0.14	0.30	0.19	0.72	0.68	0.50
O6	0.15	0.27	0.10	0.08	0.20	0.08	0.25	0.13	0.30	0.22	0.28	0.32	0.23	0.28	0.18	0.11	0.14	0.13	0.32	0.41	0.71	0.76	0.56
OP1	0.04	0.09	0.10	0.03	0.07	0.09	0.10	0.24	0.11	0.09	0.10	0.13	0.07	0.11	0.05	0.20	0.02	0.05	0.40	0.14	0.72	0.59	0.50
OP2	0.17	0.33	0.13	0.13	0.27	0.15	0.25	0.22	0.27	0.18	0.31	0.36	0.32	0.21	0.21	0.10	0.03	0.18	0.45	0.26	0.88	0.76	0.63
P	0.04	0.15	0.07	0.02	0.08	0.05	0.09	0.14	0.11	0.09	0.13	0.20	0.13	0.10	0.05	0.13	0.01	0.04	0.35	0.12	0.73	0.63	0.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.09	0.14	0.07
C2	0.04	0.00	0.11	0.13	0.02	0.07	0.02	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.11	0.17	0.03	0.15	0.01	0.30	0.32	0.19
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.07	0.07	0.15	0.12	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.04	0.29	0.28	0.14
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.05	0.08	0.09	0.17	0.13	0.06	0.02	0.02	0.01	0.01	0.18	0.04	0.37	0.37	0.24
C4	0.02	0.02	0.05	0.06	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.14	0.01	0.24	0.27	0.17
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.06	0.04	0.09	0.06	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.10	0.15	0.02
C5	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.00	0.10	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.02	0.17	0.01	0.29	0.33	0.23
C5'	0.03	0.07	0.02	0.03	0.07	0.01	0.10	0.00	0.10	0.13	0.09	0.08	0.06	0.14	0.07	0.05	0.05	0.02	0.01	0.12	0.09	0.13	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.02	0.18	0.01	0.33	0.37	0.25
C8	0.01	0.03	0.07	0.08	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.05	0.08	0.02	0.17	0.01	0.21	0.26	0.20
N1	0.03	0.00	0.07	0.09	0.02	0.04	0.02	0.09	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.08	0.12	0.03	0.17	0.01	0.33	0.36	0.23
N2	0.05	0.00	0.15	0.17	0.02	0.09	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.15	0.23	0.04	0.14	0.02	0.31	0.31	0.18
N3	0.04	0.01	0.12	0.13	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.16	0.03	0.13	0.01	0.25	0.27	0.15
N7	0.01	0.03	0.06	0.06	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.07	0.02	0.19	0.02	0.28	0.33	0.25
N9	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.13	0.01	0.17	0.22	0.13
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.05	0.08	0.15	0.10	0.05	0.02	0.00	0.03	0.05	0.07	0.06	0.23	0.23	0.07
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.08	0.02	0.05	0.05	0.07	0.08	0.12	0.23	0.16	0.07	0.03	0.03	0.00	0.01	0.22	0.07	0.51	0.48	0.34
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.11	0.02	0.09	0.14	0.15
O5'	0.07	0.15	0.11	0.18	0.14	0.02	0.17	0.01	0.18	0.17	0.17	0.14	0.13	0.19	0.13	0.07	0.22	0.11	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.07	0.02	0.20	0.00	0.37	0.40	0.29
OP1	0.09	0.30	0.29	0.37	0.24	0.10	0.29	0.09	0.33	0.21	0.33	0.31	0.25	0.28	0.17	0.23	0.51	0.09	0.01	0.37	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.32	0.28	0.37	0.27	0.15	0.33	0.13	0.37	0.26	0.36	0.31	0.27	0.33	0.22	0.23	0.48	0.14	0.01	0.40	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.19	0.14	0.24	0.17	0.02	0.23	0.02	0.25	0.20	0.23	0.18	0.15	0.25	0.13	0.07	0.34	0.15	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00