Doublet Group distance statistics: 51035

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.001, 0.018, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.007, 0.025, 0.044, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.025 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.006, 0.025, 0.044, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.025 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.005, 0.027, 0.049, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.027 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.004, 0.029, 0.053, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.029 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.011, 0.035, 0.060, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.035 std_dev=0.025
N2	A	0, 0.013, 0.039, 0.065, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.039 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.003, 0.033, 0.062, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.033 std_dev=0.030
C8	A	0, -0.002, 0.030, 0.061, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.030 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.036, 0.114, 0.192, 0.258 max_d=0.258 avg_d=0.114 std_dev=0.078
N9	B	0, 0.136, 0.249, 0.361, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.249 std_dev=0.112
C2'	A	0, 0.083, 0.211, 0.339, 0.428 max_d=0.428 avg_d=0.211 std_dev=0.128
C4	B	0, 0.101, 0.232, 0.363, 0.429 max_d=0.429 avg_d=0.232 std_dev=0.131
C1'	B	0, 0.167, 0.299, 0.431, 0.410 max_d=0.410 avg_d=0.299 std_dev=0.132
C4'	A	0, 0.142, 0.287, 0.432, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.287 std_dev=0.145
C2'	B	0, 0.177, 0.322, 0.467, 0.434 max_d=0.434 avg_d=0.322 std_dev=0.145
N3	B	0, 0.147, 0.304, 0.461, 0.452 max_d=0.452 avg_d=0.304 std_dev=0.157
O4'	B	0, 0.208, 0.389, 0.571, 0.518 max_d=0.518 avg_d=0.389 std_dev=0.181
O2'	B	0, 0.233, 0.420, 0.607, 0.556 max_d=0.556 avg_d=0.420 std_dev=0.187
C5	B	0, 0.202, 0.393, 0.583, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.393 std_dev=0.190
C3'	A	0, 0.114, 0.308, 0.501, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.308 std_dev=0.193
O5'	A	0, 0.234, 0.436, 0.638, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.436 std_dev=0.202
C2	B	0, 0.220, 0.424, 0.628, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.424 std_dev=0.204
C3'	B	0, 0.187, 0.403, 0.619, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.403 std_dev=0.216
O2'	A	0, 0.265, 0.486, 0.707, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.486 std_dev=0.221
C8	B	0, 0.165, 0.386, 0.608, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.386 std_dev=0.222
C4'	B	0, 0.232, 0.458, 0.683, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.458 std_dev=0.226
C5'	A	0, 0.229, 0.465, 0.701, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.465 std_dev=0.236
P	A	0, 0.303, 0.540, 0.777, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.540 std_dev=0.237
N1	B	0, 0.257, 0.499, 0.741, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.499 std_dev=0.242
OP2	A	0, 0.282, 0.528, 0.775, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.528 std_dev=0.247
C6	B	0, 0.274, 0.528, 0.782, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.528 std_dev=0.254
N2	B	0, 0.315, 0.572, 0.829, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.572 std_dev=0.257
N7	B	0, 0.216, 0.480, 0.744, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.480 std_dev=0.264
C5'	B	0, 0.281, 0.551, 0.822, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.551 std_dev=0.270
OP1	A	0, 0.339, 0.611, 0.883, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.611 std_dev=0.272
O3'	B	0, 0.314, 0.599, 0.885, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.599 std_dev=0.286
O5'	B	0, 0.310, 0.596, 0.882, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.596 std_dev=0.286
O3'	A	0, 0.246, 0.557, 0.867, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.557 std_dev=0.311
O6	B	0, 0.368, 0.725, 1.081, 1.092 max_d=1.092 avg_d=0.725 std_dev=0.357
P	B	0, 0.634, 1.099, 1.565, 1.431 max_d=1.431 avg_d=1.099 std_dev=0.465
OP1	B	0, 0.725, 1.327, 1.929, 1.876 max_d=1.876 avg_d=1.327 std_dev=0.602
OP2	B	0, 0.940, 1.642, 2.345, 2.211 max_d=2.211 avg_d=1.642 std_dev=0.703

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.05	0.08	0.06
C2	0.04	0.00	0.09	0.10	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.12	0.02	0.06	0.02	0.07	0.12	0.08
C2'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.06	0.07	0.11	0.09	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.05	0.06	0.03
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.06	0.08	0.12	0.09	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.07	0.07	0.05
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.12	0.08
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.06	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02
C5	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.08	0.13	0.09
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.15	0.10
C8	0.00	0.01	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.06	0.02	0.08	0.11	0.08
N1	0.03	0.00	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.01	0.06	0.02	0.08	0.14	0.09
N2	0.05	0.01	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.15	0.03	0.06	0.02	0.08	0.12	0.08
N3	0.04	0.00	0.09	0.09	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.11	0.03	0.05	0.01	0.07	0.11	0.08
N7	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.08	0.02	0.07	0.02	0.09	0.14	0.10
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.10	0.07
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.03	0.09	0.12	0.09	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.07	0.07	0.04	0.03
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.03	0.09	0.07	0.11	0.15	0.11	0.08	0.04	0.04	0.00	0.01	0.05	0.10	0.12	0.12	0.08
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.05	0.02	0.08	0.10	0.09
O5'	0.03	0.06	0.03	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.06	0.06	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.03	0.05	0.05	0.00	0.07	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.06	0.07	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.10	0.02	0.07	0.00	0.11	0.16	0.11
OP1	0.05	0.07	0.05	0.07	0.07	0.05	0.08	0.05	0.09	0.08	0.08	0.08	0.07	0.09	0.06	0.07	0.12	0.08	0.02	0.11	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.12	0.06	0.07	0.12	0.03	0.13	0.02	0.15	0.11	0.14	0.12	0.11	0.14	0.10	0.04	0.12	0.10	0.02	0.16	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.08	0.03	0.05	0.08	0.02	0.09	0.01	0.10	0.08	0.09	0.08	0.08	0.10	0.07	0.03	0.08	0.09	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.12	0.07	0.10	0.08	0.09	0.14	0.10	0.14	0.16	0.07	0.22	0.13	0.19	0.10	0.08	0.12	0.07	0.14	0.18	0.09	0.17	0.14
C2	0.05	0.11	0.05	0.06	0.08	0.04	0.13	0.07	0.15	0.11	0.10	0.18	0.10	0.15	0.08	0.07	0.09	0.05	0.12	0.19	0.15	0.21	0.16
C2'	0.06	0.12	0.05	0.06	0.07	0.05	0.15	0.06	0.15	0.18	0.08	0.24	0.12	0.22	0.10	0.07	0.07	0.05	0.10	0.21	0.05	0.14	0.09
C3'	0.08	0.10	0.07	0.04	0.06	0.04	0.16	0.03	0.16	0.20	0.06	0.21	0.11	0.24	0.10	0.09	0.03	0.06	0.09	0.24	0.07	0.16	0.09
C4	0.04	0.10	0.05	0.06	0.05	0.04	0.14	0.07	0.15	0.13	0.05	0.19	0.11	0.17	0.07	0.06	0.09	0.04	0.12	0.21	0.13	0.18	0.15
C4'	0.09	0.11	0.08	0.06	0.09	0.05	0.14	0.06	0.13	0.18	0.06	0.20	0.13	0.20	0.11	0.11	0.08	0.07	0.10	0.19	0.07	0.16	0.10
C5	0.06	0.10	0.07	0.07	0.05	0.06	0.12	0.09	0.16	0.11	0.06	0.17	0.12	0.17	0.06	0.07	0.08	0.06	0.13	0.25	0.17	0.20	0.17
C5'	0.13	0.12	0.13	0.06	0.09	0.07	0.13	0.04	0.12	0.18	0.06	0.19	0.14	0.20	0.12	0.17	0.04	0.10	0.09	0.17	0.09	0.18	0.10
C6	0.07	0.12	0.08	0.08	0.07	0.08	0.10	0.12	0.14	0.10	0.08	0.17	0.13	0.14	0.08	0.08	0.09	0.08	0.15	0.24	0.21	0.24	0.20
C8	0.05	0.09	0.07	0.08	0.04	0.07	0.16	0.10	0.17	0.17	0.07	0.17	0.12	0.23	0.06	0.07	0.09	0.05	0.13	0.24	0.13	0.17	0.14
N1	0.06	0.11	0.06	0.07	0.08	0.06	0.11	0.10	0.14	0.11	0.08	0.17	0.11	0.14	0.08	0.07	0.08	0.07	0.14	0.20	0.19	0.24	0.19
N2	0.05	0.10	0.04	0.06	0.08	0.03	0.13	0.06	0.15	0.12	0.13	0.15	0.09	0.15	0.08	0.07	0.09	0.05	0.12	0.18	0.15	0.21	0.16
N3	0.04	0.10	0.04	0.06	0.07	0.04	0.13	0.06	0.15	0.12	0.09	0.20	0.10	0.16	0.08	0.07	0.10	0.04	0.11	0.19	0.13	0.18	0.14
N7	0.07	0.10	0.08	0.08	0.04	0.07	0.15	0.11	0.18	0.13	0.08	0.16	0.13	0.21	0.04	0.09	0.09	0.06	0.14	0.26	0.17	0.19	0.17
N9	0.04	0.10	0.05	0.08	0.05	0.06	0.15	0.09	0.15	0.15	0.06	0.19	0.11	0.20	0.08	0.06	0.10	0.04	0.12	0.21	0.11	0.16	0.13
O2'	0.10	0.17	0.10	0.10	0.10	0.10	0.13	0.10	0.13	0.16	0.11	0.29	0.17	0.18	0.11	0.13	0.11	0.10	0.13	0.17	0.06	0.14	0.11
O3'	0.09	0.10	0.08	0.05	0.07	0.05	0.17	0.03	0.17	0.21	0.07	0.21	0.11	0.25	0.11	0.12	0.04	0.07	0.09	0.25	0.11	0.19	0.11
O4'	0.08	0.12	0.07	0.11	0.09	0.08	0.14	0.11	0.13	0.17	0.07	0.20	0.13	0.19	0.11	0.07	0.14	0.07	0.14	0.17	0.09	0.17	0.14
O5'	0.10	0.11	0.12	0.04	0.04	0.04	0.11	0.02	0.10	0.17	0.04	0.19	0.13	0.20	0.08	0.14	0.01	0.07	0.08	0.17	0.06	0.18	0.09
O6	0.09	0.13	0.10	0.10	0.09	0.11	0.08	0.15	0.13	0.11	0.11	0.17	0.13	0.13	0.09	0.09	0.10	0.11	0.19	0.25	0.25	0.28	0.24
OP1	0.04	0.11	0.06	0.02	0.04	0.04	0.10	0.08	0.10	0.15	0.08	0.17	0.11	0.17	0.04	0.10	0.01	0.03	0.09	0.16	0.11	0.23	0.12
OP2	0.05	0.16	0.06	0.04	0.10	0.06	0.13	0.10	0.14	0.17	0.13	0.20	0.16	0.20	0.08	0.06	0.01	0.05	0.13	0.18	0.06	0.25	0.14
P	0.04	0.11	0.06	0.02	0.05	0.02	0.10	0.05	0.10	0.15	0.08	0.17	0.12	0.17	0.04	0.08	0.01	0.02	0.09	0.15	0.08	0.20	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.03	0.04	0.14	0.09
C2	0.05	0.00	0.09	0.09	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.11	0.04	0.14	0.00	0.16	0.27	0.19
C2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.07	0.07	0.11	0.09	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.05	0.02
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.11	0.09	0.12	0.09	0.12	0.05	0.02	0.01	0.01	0.03	0.11	0.06	0.06	0.03
C4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.13	0.02	0.15	0.26	0.19
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06	0.07	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.05	0.03	0.00
C5	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.14	0.01	0.19	0.29	0.22
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.08	0.00	0.09	0.09	0.08	0.07	0.07	0.10	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.10	0.03	0.01	0.01
C6	0.03	0.01	0.05	0.09	0.02	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.02	0.15	0.00	0.21	0.31	0.23
C8	0.01	0.01	0.07	0.11	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.12	0.02	0.14	0.02	0.18	0.26	0.20
N1	0.06	0.00	0.07	0.09	0.03	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.07	0.10	0.04	0.15	0.01	0.19	0.30	0.22
N2	0.05	0.01	0.11	0.12	0.01	0.07	0.02	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.15	0.05	0.14	0.01	0.15	0.26	0.18
N3	0.05	0.01	0.09	0.09	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.11	0.04	0.14	0.01	0.14	0.25	0.18
N7	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.13	0.02	0.15	0.02	0.21	0.31	0.23
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.13	0.22	0.17
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.05	0.07	0.12	0.09	0.04	0.01	0.00	0.04	0.02	0.02	0.04	0.08	0.04	0.02
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.06	0.02	0.09	0.02	0.10	0.12	0.10	0.15	0.11	0.13	0.05	0.04	0.00	0.02	0.06	0.13	0.14	0.14	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.02	0.04	0.13	0.09
O5'	0.08	0.14	0.03	0.03	0.13	0.01	0.14	0.01	0.15	0.14	0.15	0.14	0.14	0.15	0.12	0.02	0.06	0.07	0.00	0.15	0.01	0.02	0.01
O6	0.03	0.00	0.06	0.11	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.13	0.02	0.15	0.00	0.23	0.32	0.24
OP1	0.04	0.16	0.04	0.06	0.15	0.05	0.19	0.03	0.21	0.18	0.19	0.15	0.14	0.21	0.13	0.08	0.14	0.04	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.27	0.05	0.06	0.26	0.03	0.29	0.01	0.31	0.26	0.30	0.26	0.25	0.31	0.22	0.04	0.14	0.13	0.02	0.32	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.19	0.02	0.03	0.19	0.00	0.22	0.01	0.23	0.20	0.22	0.18	0.18	0.23	0.17	0.02	0.10	0.09	0.01	0.24	0.01	0.00	0.00