Doublet Group distance statistics: 51036

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.017, 0.044, 0.071, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.044 std_dev=0.027
N1	A	0, 0.018, 0.049, 0.081, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.049 std_dev=0.031
C4	A	0, 0.021, 0.055, 0.089, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.055 std_dev=0.034
N9	A	0, 0.025, 0.063, 0.102, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.063 std_dev=0.038
O6	A	0, 0.021, 0.060, 0.099, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.060 std_dev=0.039
N3	A	0, 0.010, 0.052, 0.094, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.052 std_dev=0.042
C2	A	0, -0.004, 0.040, 0.083, 0.134 max_d=0.134 avg_d=0.040 std_dev=0.043
C1'	A	0, 0.007, 0.060, 0.113, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.060 std_dev=0.053
N7	A	0, 0.033, 0.088, 0.142, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.088 std_dev=0.054
C8	A	0, 0.039, 0.103, 0.167, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.103 std_dev=0.064
C2'	A	0, 0.020, 0.096, 0.171, 0.203 max_d=0.203 avg_d=0.096 std_dev=0.076
N2	A	0, -0.013, 0.070, 0.153, 0.250 max_d=0.250 avg_d=0.070 std_dev=0.083
O4'	A	0, 0.060, 0.175, 0.291, 0.294 max_d=0.294 avg_d=0.175 std_dev=0.115
C2'	B	0, 0.122, 0.292, 0.461, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.292 std_dev=0.170
C3'	B	0, 0.185, 0.389, 0.593, 0.604 max_d=0.604 avg_d=0.389 std_dev=0.204
C3'	A	0, 0.060, 0.265, 0.470, 0.657 max_d=0.657 avg_d=0.265 std_dev=0.205
O2'	B	0, 0.202, 0.420, 0.638, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.420 std_dev=0.218
O2'	A	0, 0.033, 0.252, 0.471, 0.586 max_d=0.586 avg_d=0.252 std_dev=0.219
C4'	A	0, 0.105, 0.328, 0.552, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.328 std_dev=0.224
O3'	B	0, 0.192, 0.426, 0.661, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.426 std_dev=0.235
N9	B	0, 0.152, 0.432, 0.713, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.432 std_dev=0.281
C1'	B	0, 0.106, 0.392, 0.677, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.392 std_dev=0.286
O5'	A	0, 0.159, 0.450, 0.741, 0.780 max_d=0.780 avg_d=0.450 std_dev=0.291
C8	B	0, 0.120, 0.413, 0.707, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.413 std_dev=0.293
C5'	A	0, 0.153, 0.448, 0.743, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.448 std_dev=0.295
C4	B	0, 0.307, 0.618, 0.928, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.618 std_dev=0.310
N7	B	0, 0.146, 0.458, 0.770, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.458 std_dev=0.312
O3'	A	0, 0.139, 0.458, 0.777, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.458 std_dev=0.319
C5	B	0, 0.291, 0.612, 0.933, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.612 std_dev=0.321
C4'	B	0, 0.128, 0.456, 0.784, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.456 std_dev=0.328
P	A	0, 0.289, 0.630, 0.971, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.630 std_dev=0.341
N3	B	0, 0.434, 0.806, 1.179, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.806 std_dev=0.373
O4'	B	0, 0.170, 0.543, 0.916, 1.246 max_d=1.246 avg_d=0.543 std_dev=0.373
C6	B	0, 0.427, 0.814, 1.200, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.814 std_dev=0.387
OP2	A	0, 0.425, 0.829, 1.233, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.829 std_dev=0.404
O6	B	0, 0.440, 0.851, 1.262, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.851 std_dev=0.411
C2	B	0, 0.544, 1.006, 1.468, 1.326 max_d=1.326 avg_d=1.006 std_dev=0.462
N1	B	0, 0.546, 1.010, 1.474, 1.378 max_d=1.378 avg_d=1.010 std_dev=0.464
C5'	B	0, 0.221, 0.709, 1.197, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.709 std_dev=0.488
OP1	A	0, 0.447, 0.935, 1.424, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.935 std_dev=0.488
N2	B	0, 0.657, 1.231, 1.805, 1.681 max_d=1.681 avg_d=1.231 std_dev=0.574
O5'	B	0, 0.708, 2.196, 3.685, 3.695 max_d=3.695 avg_d=2.196 std_dev=1.489
OP1	B	0, 1.082, 3.000, 4.918, 5.062 max_d=5.062 avg_d=3.000 std_dev=1.918
P	B	0, 1.058, 3.252, 5.445, 5.406 max_d=5.406 avg_d=3.252 std_dev=2.193
OP2	B	0, 1.454, 4.348, 7.241, 6.925 max_d=6.925 avg_d=4.348 std_dev=2.893

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.09	0.00	0.02	0.04	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.07	0.11	0.09	0.01	0.01	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.05	0.11	0.08
C2	0.09	0.00	0.09	0.13	0.01	0.11	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.11	0.21	0.09	0.10	0.00	0.11	0.17	0.12
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.02	0.04	0.06	0.13	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.03	0.08	0.14	0.11
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.03	0.05	0.09	0.18	0.13	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.07	0.09	0.06
C4	0.04	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.08	0.01	0.08	0.14	0.09
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.07	0.15	0.10	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.04	0.03
C5	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.03	0.12	0.01	0.12	0.15	0.11
C5'	0.02	0.07	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.11	0.07	0.11	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.09	0.04	0.01	0.01
C6	0.04	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.12	0.04	0.13	0.00	0.14	0.18	0.13
C8	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.10	0.04	0.04	0.12	0.02	0.10	0.09	0.07
N1	0.07	0.00	0.06	0.09	0.02	0.07	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.17	0.07	0.11	0.00	0.12	0.18	0.12
N2	0.11	0.00	0.13	0.18	0.02	0.15	0.00	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.15	0.26	0.11	0.12	0.02	0.12	0.18	0.14
N3	0.09	0.00	0.10	0.13	0.01	0.10	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.19	0.08	0.10	0.00	0.10	0.16	0.12
N7	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.05	0.04	0.15	0.02	0.14	0.14	0.12
N9	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.07	0.02	0.07	0.12	0.08
O2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.04	0.08	0.10	0.08	0.15	0.11	0.11	0.04	0.00	0.03	0.01	0.11	0.11	0.11	0.20	0.14
O3'	0.06	0.21	0.01	0.01	0.11	0.02	0.09	0.01	0.12	0.04	0.17	0.26	0.19	0.05	0.06	0.03	0.00	0.04	0.06	0.11	0.07	0.09	0.05
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.07	0.11	0.08	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.04	0.06	0.12	0.10
O5'	0.05	0.10	0.09	0.06	0.08	0.02	0.12	0.01	0.13	0.12	0.11	0.12	0.10	0.15	0.07	0.11	0.06	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00
O6	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.11	0.11	0.04	0.15	0.00	0.17	0.20	0.15
OP1	0.05	0.11	0.08	0.07	0.08	0.03	0.12	0.04	0.14	0.10	0.12	0.12	0.10	0.14	0.07	0.11	0.07	0.06	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.17	0.14	0.09	0.14	0.04	0.15	0.01	0.18	0.09	0.18	0.18	0.16	0.14	0.12	0.20	0.09	0.12	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.11	0.06	0.09	0.03	0.11	0.01	0.13	0.07	0.12	0.14	0.12	0.12	0.08	0.14	0.05	0.10	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.20	0.10	0.13	0.14	0.10	0.17	0.19	0.20	0.17	0.21	0.23	0.16	0.18	0.14	0.25	0.13	0.10	0.71	0.21	0.43	1.20	0.72
C2	0.11	0.25	0.12	0.12	0.13	0.10	0.13	0.14	0.16	0.16	0.22	0.31	0.20	0.18	0.11	0.16	0.15	0.10	0.71	0.19	0.61	1.45	0.91
C2'	0.14	0.20	0.13	0.16	0.15	0.14	0.17	0.25	0.19	0.18	0.21	0.24	0.17	0.18	0.15	0.26	0.14	0.13	0.80	0.20	0.54	1.29	0.81
C3'	0.16	0.23	0.14	0.10	0.16	0.08	0.18	0.15	0.21	0.18	0.23	0.27	0.18	0.18	0.15	0.29	0.09	0.12	0.57	0.22	0.25	0.92	0.49
C4	0.11	0.23	0.10	0.11	0.15	0.10	0.15	0.19	0.18	0.14	0.22	0.26	0.20	0.16	0.11	0.18	0.11	0.09	0.85	0.19	0.69	1.53	1.00
C4'	0.18	0.21	0.14	0.09	0.16	0.08	0.18	0.09	0.20	0.19	0.22	0.25	0.18	0.19	0.17	0.30	0.09	0.14	0.40	0.21	0.13	0.66	0.27
C5	0.11	0.25	0.12	0.08	0.17	0.09	0.16	0.19	0.21	0.12	0.25	0.28	0.22	0.13	0.11	0.19	0.08	0.09	0.96	0.21	0.89	1.76	1.21
C5'	0.18	0.17	0.17	0.08	0.15	0.08	0.16	0.06	0.16	0.20	0.17	0.19	0.14	0.19	0.17	0.29	0.05	0.14	0.33	0.17	0.22	0.47	0.17
C6	0.10	0.27	0.12	0.08	0.16	0.08	0.13	0.15	0.22	0.10	0.27	0.30	0.22	0.09	0.09	0.17	0.09	0.08	0.92	0.22	0.93	1.81	1.24
C8	0.13	0.22	0.14	0.10	0.18	0.13	0.18	0.26	0.20	0.16	0.22	0.23	0.20	0.18	0.14	0.23	0.06	0.12	1.01	0.21	0.86	1.65	1.16
N1	0.09	0.26	0.11	0.09	0.12	0.08	0.08	0.13	0.15	0.13	0.25	0.31	0.20	0.14	0.08	0.16	0.11	0.08	0.79	0.16	0.77	1.63	1.08
N2	0.13	0.24	0.14	0.14	0.14	0.12	0.17	0.13	0.19	0.18	0.21	0.33	0.19	0.21	0.14	0.18	0.17	0.13	0.61	0.24	0.51	1.32	0.80
N3	0.12	0.24	0.11	0.14	0.15	0.11	0.16	0.17	0.18	0.16	0.21	0.28	0.21	0.18	0.13	0.17	0.16	0.11	0.73	0.19	0.56	1.39	0.86
N7	0.15	0.24	0.16	0.11	0.20	0.13	0.20	0.25	0.23	0.15	0.25	0.26	0.22	0.17	0.15	0.22	0.09	0.14	1.08	0.23	1.03	1.87	1.34
N9	0.10	0.20	0.09	0.11	0.15	0.11	0.16	0.22	0.18	0.15	0.20	0.23	0.18	0.16	0.12	0.21	0.11	0.09	0.86	0.19	0.65	1.45	0.95
O2'	0.14	0.21	0.12	0.18	0.15	0.17	0.18	0.30	0.21	0.19	0.22	0.24	0.16	0.20	0.15	0.26	0.16	0.13	0.89	0.22	0.69	1.49	0.96
O3'	0.16	0.29	0.12	0.11	0.19	0.08	0.22	0.13	0.27	0.18	0.30	0.34	0.22	0.20	0.16	0.27	0.09	0.12	0.53	0.28	0.19	0.90	0.43
O4'	0.17	0.20	0.12	0.12	0.16	0.10	0.19	0.14	0.20	0.20	0.21	0.22	0.17	0.20	0.17	0.27	0.14	0.13	0.51	0.21	0.15	0.84	0.43
O5'	0.15	0.13	0.18	0.04	0.10	0.03	0.13	0.10	0.13	0.18	0.13	0.16	0.11	0.16	0.13	0.27	0.02	0.08	0.52	0.14	0.23	0.73	0.43
O6	0.12	0.28	0.14	0.10	0.18	0.09	0.17	0.15	0.26	0.11	0.30	0.30	0.23	0.09	0.12	0.17	0.11	0.11	0.96	0.28	1.07	1.97	1.38
OP1	0.02	0.10	0.07	0.02	0.04	0.09	0.06	0.17	0.08	0.10	0.09	0.13	0.08	0.10	0.03	0.11	0.00	0.05	0.40	0.09	0.12	0.35	0.22
OP2	0.05	0.13	0.10	0.05	0.10	0.15	0.12	0.28	0.13	0.13	0.14	0.15	0.11	0.14	0.08	0.11	0.02	0.11	0.84	0.14	0.71	1.04	0.86
P	0.04	0.10	0.09	0.01	0.05	0.07	0.07	0.16	0.08	0.11	0.10	0.14	0.08	0.11	0.05	0.13	0.00	0.03	0.53	0.09	0.23	0.60	0.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.19	0.02	0.08	0.40	0.16
C2	0.02	0.00	0.12	0.10	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.08	0.23	0.02	0.12	0.72	0.34
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.09	0.15	0.12	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.27	0.06	0.14	0.43	0.16
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.07	0.06	0.09	0.12	0.09	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.33	0.07	0.12	0.38	0.20
C4	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.04	0.38	0.02	0.26	0.86	0.51
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.04	0.08	0.02	0.05	0.03	0.08	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.05	0.28	0.04	0.11
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.01	0.57	0.01	0.55	1.22	0.82
C5'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.04	0.00	0.10	0.00	0.09	0.15	0.05	0.05	0.03	0.15	0.06	0.04	0.03	0.02	0.01	0.12	0.07	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.54	0.01	0.57	1.26	0.82
C8	0.01	0.00	0.08	0.06	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.08	0.74	0.02	0.65	1.28	0.95
N1	0.02	0.01	0.09	0.09	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.10	0.05	0.38	0.02	0.35	1.00	0.58
N2	0.03	0.00	0.15	0.12	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.15	0.10	0.12	0.03	0.06	0.55	0.17
N3	0.02	0.00	0.12	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.11	0.08	0.19	0.02	0.05	0.60	0.25
N7	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.08	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.76	0.02	0.79	1.50	1.09
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.01	0.43	0.01	0.27	0.83	0.53
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.04	0.06	0.04	0.08	0.07	0.10	0.15	0.11	0.07	0.03	0.00	0.02	0.04	0.10	0.08	0.40	0.16	0.12
O3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.02	0.05	0.03	0.07	0.07	0.10	0.15	0.11	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.24	0.07	0.29	0.22	0.10
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.05	0.10	0.08	0.06	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.02	0.16	0.14	0.06
O5'	0.19	0.23	0.27	0.33	0.38	0.01	0.57	0.01	0.54	0.74	0.38	0.12	0.19	0.76	0.43	0.10	0.24	0.05	0.00	0.63	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.02	0.06	0.07	0.02	0.05	0.01	0.12	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.08	0.07	0.02	0.63	0.00	0.74	1.47	1.00
OP1	0.08	0.12	0.14	0.12	0.26	0.28	0.55	0.07	0.57	0.65	0.35	0.06	0.05	0.79	0.27	0.40	0.29	0.16	0.02	0.74	0.00	0.00	0.00
OP2	0.40	0.72	0.43	0.38	0.86	0.04	1.22	0.10	1.26	1.28	1.00	0.55	0.60	1.50	0.83	0.16	0.22	0.14	0.02	1.47	0.00	0.00	0.01
P	0.16	0.34	0.16	0.20	0.51	0.11	0.82	0.01	0.82	0.95	0.58	0.17	0.25	1.09	0.53	0.12	0.10	0.06	0.00	1.00	0.00	0.01	0.00