Doublet Group distance statistics: 51038

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.024 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.030 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.030 std_dev=0.021
N3	A	0, 0.009, 0.033, 0.056, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.006, 0.030, 0.054, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.030 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.009, 0.036, 0.063, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.036 std_dev=0.027
C1'	A	0, 0.007, 0.037, 0.067, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.037 std_dev=0.030
N2	A	0, 0.014, 0.063, 0.112, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.063 std_dev=0.049
C2'	A	0, 0.060, 0.207, 0.353, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.207 std_dev=0.146
O4'	A	0, 0.066, 0.229, 0.392, 0.363 max_d=0.363 avg_d=0.229 std_dev=0.163
C3'	A	0, 0.088, 0.323, 0.559, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.323 std_dev=0.235
O2'	A	0, 0.019, 0.269, 0.518, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.269 std_dev=0.250
C6	B	0, -0.007, 0.245, 0.497, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.245 std_dev=0.252
C4'	A	0, 0.107, 0.366, 0.625, 0.554 max_d=0.554 avg_d=0.366 std_dev=0.259
C5	B	0, 0.081, 0.342, 0.602, 0.631 max_d=0.631 avg_d=0.342 std_dev=0.260
O6	B	0, 0.063, 0.345, 0.628, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.345 std_dev=0.282
N7	B	0, 0.117, 0.402, 0.687, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.402 std_dev=0.285
N1	B	0, -0.010, 0.289, 0.588, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.289 std_dev=0.299
C2	B	0, 0.081, 0.413, 0.746, 0.813 max_d=0.813 avg_d=0.413 std_dev=0.332
O3'	A	0, 0.076, 0.431, 0.787, 0.871 max_d=0.871 avg_d=0.431 std_dev=0.356
N2	B	0, 0.113, 0.482, 0.851, 0.896 max_d=0.896 avg_d=0.482 std_dev=0.369
C4	B	0, 0.135, 0.521, 0.907, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.521 std_dev=0.386
N3	B	0, 0.143, 0.562, 0.981, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.562 std_dev=0.419
C8	B	0, 0.176, 0.611, 1.046, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.611 std_dev=0.435
C5'	A	0, 0.154, 0.620, 1.085, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.620 std_dev=0.466
N9	B	0, 0.188, 0.682, 1.176, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.682 std_dev=0.494
C1'	B	0, 0.236, 0.874, 1.511, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.874 std_dev=0.638
C2'	B	0, 0.212, 1.051, 1.891, 2.054 max_d=2.054 avg_d=1.051 std_dev=0.839
O4'	B	0, 0.155, 1.122, 2.089, 2.360 max_d=2.360 avg_d=1.122 std_dev=0.967
C4'	B	0, 0.368, 1.353, 2.338, 2.318 max_d=2.318 avg_d=1.353 std_dev=0.985
C3'	B	0, 0.373, 1.382, 2.391, 2.380 max_d=2.380 avg_d=1.382 std_dev=1.009
O5'	A	0, 0.365, 1.498, 2.630, 2.738 max_d=2.738 avg_d=1.498 std_dev=1.132
O2'	B	0, 0.301, 1.463, 2.625, 2.843 max_d=2.843 avg_d=1.463 std_dev=1.162
OP2	A	0, 0.426, 1.659, 2.891, 2.951 max_d=2.951 avg_d=1.659 std_dev=1.232
P	A	0, 0.567, 1.988, 3.408, 3.235 max_d=3.235 avg_d=1.988 std_dev=1.421
O3'	B	0, 0.650, 2.341, 4.032, 3.933 max_d=3.933 avg_d=2.341 std_dev=1.691
C5'	B	0, 0.730, 2.585, 4.440, 4.263 max_d=4.263 avg_d=2.585 std_dev=1.855
OP1	A	0, 0.718, 2.599, 4.479, 4.388 max_d=4.388 avg_d=2.599 std_dev=1.880
O5'	B	0, 1.009, 3.525, 6.040, 5.704 max_d=5.704 avg_d=3.525 std_dev=2.515
P	B	0, 1.389, 4.840, 8.291, 7.800 max_d=7.800 avg_d=4.840 std_dev=3.451
OP2	B	0, 1.412, 4.885, 8.358, 7.771 max_d=7.771 avg_d=4.885 std_dev=3.473
OP1	B	0, 1.754, 6.060, 10.366, 9.610 max_d=9.610 avg_d=6.060 std_dev=4.306

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.27	0.02	0.50	0.15	0.22
C2	0.04	0.00	0.12	0.25	0.01	0.13	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.27	0.03	0.83	0.00	1.57	0.38	0.88
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.09	0.14	0.12	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.34	0.04	0.50	0.04	0.31
C3'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.15	0.00	0.12	0.01	0.16	0.04	0.22	0.29	0.23	0.02	0.05	0.01	0.00	0.01	0.38	0.14	0.41	0.06	0.35
C4	0.02	0.01	0.06	0.15	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.15	0.01	0.75	0.01	1.33	0.31	0.73
C4'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.11	0.04	0.13	0.14	0.11	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.01	0.11	0.18	0.10	0.02
C5	0.01	0.00	0.03	0.12	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.12	0.01	0.85	0.01	1.59	0.41	0.87
C5'	0.03	0.24	0.02	0.01	0.19	0.00	0.20	0.00	0.24	0.09	0.26	0.25	0.21	0.16	0.11	0.03	0.05	0.01	0.01	0.24	0.31	0.16	0.01
C6	0.02	0.00	0.05	0.16	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.08	0.17	0.00	0.93	0.00	1.82	0.48	0.99
C8	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.63	0.01	1.09	0.32	0.57
N1	0.03	0.00	0.09	0.22	0.01	0.13	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.24	0.02	0.92	0.00	1.78	0.46	0.99
N2	0.05	0.00	0.14	0.29	0.01	0.14	0.00	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.12	0.33	0.04	0.82	0.01	1.56	0.38	0.89
N3	0.03	0.01	0.12	0.23	0.00	0.11	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.24	0.03	0.73	0.01	1.32	0.30	0.74
N7	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.79	0.01	1.47	0.42	0.78
N9	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.59	0.01	0.99	0.23	0.52
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.03	0.06	0.03	0.08	0.02	0.10	0.12	0.09	0.04	0.02	0.00	0.05	0.06	0.14	0.08	0.23	0.07	0.14
O3'	0.02	0.27	0.02	0.00	0.15	0.02	0.12	0.05	0.17	0.04	0.24	0.33	0.24	0.02	0.04	0.05	0.00	0.01	0.21	0.15	0.19	0.11	0.27
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.07	0.00	0.22	0.20	0.10
O5'	0.27	0.83	0.34	0.38	0.75	0.01	0.85	0.01	0.93	0.63	0.92	0.82	0.73	0.79	0.59	0.14	0.21	0.07	0.00	0.96	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.04	0.14	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.15	0.00	0.96	0.00	1.95	0.53	1.05
OP1	0.50	1.57	0.50	0.41	1.33	0.18	1.59	0.31	1.82	1.09	1.78	1.56	1.32	1.47	0.99	0.23	0.19	0.22	0.02	1.95	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.38	0.04	0.06	0.31	0.10	0.41	0.16	0.48	0.32	0.46	0.38	0.30	0.42	0.23	0.07	0.11	0.20	0.01	0.53	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.88	0.31	0.35	0.73	0.02	0.87	0.01	0.99	0.57	0.99	0.89	0.74	0.78	0.52	0.14	0.27	0.10	0.00	1.05	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.48	0.16	0.47	0.36	0.20	0.33	0.05	0.24	0.18	0.27	0.25	0.21	0.20	0.11	0.34	0.59	0.53	0.50	0.77	0.26	0.72	0.59	0.71
C2	0.39	0.28	0.38	0.19	0.28	0.28	0.16	0.38	0.05	0.22	0.13	0.31	0.34	0.13	0.30	0.55	0.31	0.42	0.77	0.13	0.86	0.56	0.77
C2'	0.50	0.09	0.48	0.38	0.24	0.33	0.09	0.21	0.08	0.26	0.09	0.08	0.27	0.12	0.35	0.66	0.60	0.53	0.73	0.18	0.68	0.49	0.65
C3'	0.31	0.14	0.23	0.38	0.14	0.05	0.09	0.13	0.16	0.15	0.18	0.16	0.16	0.07	0.20	0.34	0.67	0.32	0.42	0.22	0.31	0.36	0.34
C4	0.39	0.17	0.35	0.19	0.27	0.22	0.13	0.25	0.04	0.24	0.01	0.15	0.29	0.13	0.32	0.49	0.33	0.38	0.69	0.20	0.68	0.56	0.66
C4'	0.30	0.42	0.17	0.41	0.28	0.10	0.25	0.18	0.33	0.17	0.40	0.46	0.37	0.15	0.24	0.14	0.68	0.28	0.39	0.33	0.34	0.40	0.35
C5	0.34	0.18	0.26	0.09	0.25	0.14	0.16	0.27	0.02	0.23	0.06	0.17	0.27	0.15	0.29	0.38	0.20	0.28	0.60	0.14	0.57	0.57	0.57
C5'	0.46	0.46	0.41	0.69	0.42	0.53	0.34	0.63	0.35	0.31	0.41	0.48	0.49	0.26	0.41	0.32	0.93	0.45	0.35	0.31	0.49	0.63	0.45
C6	0.31	0.25	0.25	0.05	0.25	0.17	0.17	0.35	0.09	0.21	0.16	0.26	0.29	0.16	0.27	0.37	0.14	0.27	0.58	0.06	0.59	0.52	0.56
C8	0.35	0.08	0.24	0.15	0.21	0.06	0.09	0.14	0.09	0.26	0.10	0.08	0.19	0.13	0.30	0.33	0.29	0.25	0.62	0.20	0.57	0.68	0.60
N1	0.34	0.29	0.31	0.11	0.27	0.23	0.17	0.38	0.10	0.21	0.18	0.32	0.33	0.14	0.28	0.46	0.21	0.35	0.68	0.07	0.75	0.52	0.68
N2	0.41	0.31	0.42	0.22	0.28	0.34	0.16	0.45	0.06	0.21	0.15	0.37	0.36	0.13	0.31	0.61	0.35	0.47	0.84	0.12	1.01	0.61	0.88
N3	0.42	0.22	0.42	0.24	0.28	0.30	0.13	0.34	0.03	0.23	0.02	0.22	0.33	0.12	0.32	0.58	0.38	0.45	0.77	0.19	0.83	0.57	0.76
N7	0.31	0.11	0.21	0.06	0.22	0.07	0.13	0.25	0.01	0.24	0.00	0.09	0.21	0.15	0.28	0.30	0.18	0.20	0.56	0.14	0.53	0.67	0.55
N9	0.41	0.09	0.36	0.24	0.24	0.20	0.09	0.15	0.12	0.26	0.13	0.09	0.23	0.13	0.33	0.47	0.38	0.38	0.69	0.23	0.64	0.59	0.64
O2'	0.70	0.08	0.70	0.57	0.32	0.65	0.15	0.56	0.07	0.39	0.13	0.10	0.33	0.22	0.49	0.95	0.75	0.79	1.00	0.20	1.02	0.72	0.95
O3'	0.29	0.15	0.24	0.41	0.12	0.07	0.09	0.12	0.17	0.13	0.20	0.17	0.14	0.07	0.18	0.34	0.74	0.33	0.38	0.22	0.26	0.29	0.28
O4'	0.32	0.44	0.23	0.32	0.26	0.10	0.24	0.01	0.37	0.15	0.45	0.47	0.35	0.12	0.22	0.30	0.54	0.31	0.57	0.38	0.52	0.50	0.52
O5'	1.10	0.50	1.17	1.32	0.64	1.29	0.35	1.28	0.19	0.61	0.28	0.51	0.71	0.34	0.81	1.26	1.53	1.15	0.65	0.12	0.80	0.69	0.69
O6	0.27	0.25	0.20	0.03	0.24	0.17	0.17	0.40	0.13	0.21	0.19	0.26	0.27	0.16	0.24	0.31	0.06	0.21	0.50	0.03	0.51	0.52	0.49
OP1	1.28	0.16	1.45	1.83	0.45	1.95	0.10	2.02	0.32	0.55	0.22	0.18	0.52	0.18	0.79	1.74	2.42	1.52	1.42	0.64	1.86	1.41	1.54
OP2	1.30	0.75	1.25	1.52	0.96	1.61	0.79	1.75	0.60	1.06	0.61	0.71	0.93	0.84	1.14	1.25	1.68	1.41	1.05	0.45	1.26	1.20	1.15
P	1.47	0.60	1.55	1.89	0.86	1.95	0.56	2.00	0.29	0.95	0.34	0.56	0.88	0.61	1.13	1.65	2.27	1.66	1.35	0.06	1.58	1.33	1.41

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.07	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.01	0.16	0.12	0.19
C2	0.05	0.00	0.25	0.11	0.01	0.26	0.00	0.54	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.33	0.17	0.33	0.77	0.00	0.98	0.60	0.85
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.14	0.01	0.07	0.02	0.13	0.13	0.21	0.30	0.25	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.26	0.10	0.21	0.13	0.22
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.02	0.13	0.16	0.13	0.11	0.10	0.15	0.09	0.02	0.00	0.01	0.36	0.15	0.35	0.09	0.27
C4	0.02	0.01	0.14	0.10	0.00	0.19	0.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.17	0.09	0.18	0.50	0.00	0.56	0.38	0.53
C4'	0.02	0.26	0.01	0.00	0.19	0.00	0.19	0.01	0.23	0.10	0.26	0.28	0.23	0.14	0.10	0.04	0.01	0.00	0.01	0.24	0.09	0.25	0.02
C5	0.01	0.00	0.07	0.13	0.00	0.19	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.11	0.10	0.49	0.01	0.55	0.44	0.54
C5'	0.05	0.54	0.02	0.02	0.39	0.01	0.42	0.00	0.51	0.21	0.57	0.58	0.46	0.31	0.21	0.05	0.01	0.01	0.00	0.52	0.27	0.40	0.01
C6	0.02	0.00	0.13	0.13	0.00	0.23	0.00	0.51	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.13	0.16	0.60	0.00	0.74	0.51	0.68
C8	0.01	0.01	0.13	0.16	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.10	0.19	0.15	0.41	0.01	0.42	0.50	0.47
N1	0.03	0.00	0.21	0.13	0.01	0.26	0.00	0.57	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.27	0.15	0.27	0.74	0.00	0.95	0.59	0.84
N2	0.07	0.01	0.30	0.11	0.02	0.28	0.01	0.58	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.40	0.21	0.39	0.87	0.01	1.17	0.71	0.99
N3	0.04	0.01	0.25	0.10	0.00	0.23	0.01	0.46	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.30	0.15	0.32	0.65	0.01	0.79	0.49	0.70
N7	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.14	0.00	0.31	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.17	0.07	0.40	0.01	0.44	0.52	0.48
N9	0.00	0.02	0.01	0.09	0.01	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.32	0.00	0.32	0.29	0.35
O2'	0.01	0.33	0.00	0.02	0.17	0.04	0.11	0.05	0.17	0.10	0.27	0.40	0.30	0.04	0.02	0.00	0.05	0.09	0.06	0.15	0.03	0.17	0.05
O3'	0.01	0.17	0.02	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.13	0.19	0.15	0.21	0.15	0.17	0.07	0.05	0.00	0.01	0.27	0.15	0.34	0.17	0.16
O4'	0.01	0.33	0.02	0.01	0.18	0.00	0.10	0.01	0.16	0.15	0.27	0.39	0.32	0.07	0.02	0.09	0.01	0.00	0.06	0.13	0.12	0.02	0.10
O5'	0.17	0.77	0.26	0.36	0.50	0.01	0.49	0.00	0.60	0.41	0.74	0.87	0.65	0.40	0.32	0.06	0.27	0.06	0.00	0.58	0.01	0.00	0.00
O6	0.01	0.00	0.10	0.15	0.00	0.24	0.01	0.52	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.15	0.13	0.58	0.00	0.72	0.52	0.67
OP1	0.16	0.98	0.21	0.35	0.56	0.09	0.55	0.27	0.74	0.42	0.95	1.17	0.79	0.44	0.32	0.03	0.34	0.12	0.01	0.72	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.60	0.13	0.09	0.38	0.25	0.44	0.40	0.51	0.50	0.59	0.71	0.49	0.52	0.29	0.17	0.17	0.02	0.00	0.52	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.85	0.22	0.27	0.53	0.02	0.54	0.01	0.68	0.47	0.84	0.99	0.70	0.48	0.35	0.05	0.16	0.10	0.00	0.67	0.00	0.00	0.00