Doublet Group distance statistics: 51039

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.010 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.002, 0.015, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.007, 0.023, 0.039, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.006, 0.022, 0.039, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.031 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.006, 0.029, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.023
O6	A	0, 0.005, 0.035, 0.066, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.035 std_dev=0.030
N7	A	0, 0.001, 0.032, 0.064, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.032 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.003, 0.036, 0.068, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.036 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.005, 0.043, 0.082, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.043 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.028, 0.133, 0.239, 0.259 max_d=0.259 avg_d=0.133 std_dev=0.106
C2'	A	0, 0.071, 0.254, 0.438, 0.425 max_d=0.425 avg_d=0.254 std_dev=0.183
C4'	A	0, 0.028, 0.246, 0.463, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.246 std_dev=0.218
C3'	A	0, 0.075, 0.367, 0.660, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.367 std_dev=0.292
C4	B	0, 0.124, 0.432, 0.739, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.432 std_dev=0.307
O2'	A	0, 0.109, 0.452, 0.796, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.452 std_dev=0.344
N3	B	0, 0.136, 0.499, 0.863, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.499 std_dev=0.364
C5'	A	0, 0.146, 0.512, 0.879, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.512 std_dev=0.367
N9	B	0, 0.037, 0.406, 0.775, 0.893 max_d=0.893 avg_d=0.406 std_dev=0.369
C5	B	0, 0.152, 0.546, 0.941, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.546 std_dev=0.394
C1'	B	0, 0.025, 0.453, 0.880, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.453 std_dev=0.428
C8	B	0, 0.143, 0.579, 1.014, 1.052 max_d=1.052 avg_d=0.579 std_dev=0.436
N7	B	0, 0.192, 0.655, 1.118, 0.983 max_d=0.983 avg_d=0.655 std_dev=0.463
O4'	B	0, 0.067, 0.543, 1.020, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.543 std_dev=0.477
O3'	A	0, 0.150, 0.652, 1.153, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.652 std_dev=0.501
C2	B	0, 0.092, 0.595, 1.098, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.595 std_dev=0.503
C2'	B	0, 0.104, 0.631, 1.159, 1.291 max_d=1.291 avg_d=0.631 std_dev=0.527
C6	B	0, 0.099, 0.631, 1.163, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.631 std_dev=0.532
N1	B	0, 0.050, 0.627, 1.204, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.627 std_dev=0.577
C4'	B	0, 0.215, 0.810, 1.405, 1.412 max_d=1.412 avg_d=0.810 std_dev=0.595
O2'	B	0, 0.201, 0.804, 1.408, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.804 std_dev=0.603
C3'	B	0, 0.192, 0.840, 1.488, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.840 std_dev=0.648
N2	B	0, 0.105, 0.760, 1.416, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.760 std_dev=0.656
O6	B	0, 0.097, 0.779, 1.460, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.779 std_dev=0.681
C5'	B	0, 0.287, 0.983, 1.679, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.983 std_dev=0.696
O3'	B	0, 0.267, 1.074, 1.880, 1.943 max_d=1.943 avg_d=1.074 std_dev=0.806
P	A	0, 0.288, 1.244, 2.201, 2.326 max_d=2.326 avg_d=1.244 std_dev=0.957
O5'	A	0, 0.117, 1.094, 2.071, 2.372 max_d=2.372 avg_d=1.094 std_dev=0.977
OP2	A	0, 0.358, 1.337, 2.315, 2.317 max_d=2.317 avg_d=1.337 std_dev=0.979
OP1	A	0, 0.386, 1.476, 2.566, 2.598 max_d=2.598 avg_d=1.476 std_dev=1.090
O5'	B	0, 0.401, 1.668, 2.934, 3.067 max_d=3.067 avg_d=1.668 std_dev=1.266
OP2	B	0, 0.514, 1.833, 3.151, 3.045 max_d=3.045 avg_d=1.833 std_dev=1.318
P	B	0, 0.538, 1.901, 3.263, 3.125 max_d=3.125 avg_d=1.901 std_dev=1.362
OP1	B	0, 0.772, 3.054, 5.337, 5.485 max_d=5.485 avg_d=3.054 std_dev=2.282

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.26	0.01	0.25	0.14	0.19
C2	0.01	0.00	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.09	0.04	0.61	0.00	0.65	0.70	0.64
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.07	0.05	0.09	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.30	0.07	0.31	0.07	0.22
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.05	0.13	0.02	0.05	0.02	0.12	0.06	0.01	0.00	0.01	0.34	0.07	0.35	0.07	0.23
C4	0.01	0.01	0.06	0.03	0.00	0.06	0.00	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.12	0.03	0.03	0.68	0.00	0.68	0.62	0.65
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.11	0.15	0.06	0.02	0.02	0.15	0.08	0.05	0.02	0.00	0.01	0.13	0.10	0.31	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.11	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.07	0.04	0.90	0.01	0.94	0.91	0.91
C5'	0.04	0.16	0.01	0.00	0.19	0.00	0.27	0.00	0.28	0.29	0.22	0.11	0.12	0.32	0.17	0.05	0.03	0.01	0.00	0.32	0.14	0.40	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.05	0.00	0.11	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.06	0.06	0.93	0.00	1.02	1.04	0.98
C8	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.15	0.01	0.29	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.15	0.03	0.95	0.02	0.87	0.65	0.84
N1	0.01	0.00	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.06	0.05	0.78	0.00	0.86	0.91	0.83
N2	0.02	0.00	0.11	0.05	0.01	0.02	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.13	0.03	0.51	0.01	0.56	0.64	0.55
N3	0.01	0.00	0.09	0.02	0.00	0.02	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.08	0.02	0.52	0.00	0.53	0.53	0.51
N7	0.00	0.01	0.05	0.12	0.01	0.15	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	1.05	0.01	1.08	1.00	1.05
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.64	0.01	0.59	0.42	0.54
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.12	0.05	0.10	0.05	0.14	0.03	0.19	0.25	0.19	0.05	0.03	0.00	0.01	0.08	0.10	0.14	0.16	0.10	0.08
O3'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.03	0.06	0.15	0.06	0.13	0.08	0.14	0.05	0.01	0.00	0.02	0.24	0.09	0.33	0.16	0.20
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02	0.08	0.02	0.00	0.04	0.06	0.05	0.31	0.07
O5'	0.26	0.61	0.30	0.34	0.68	0.01	0.90	0.00	0.93	0.95	0.78	0.51	0.52	1.05	0.64	0.10	0.24	0.04	0.00	1.03	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.07	0.07	0.00	0.13	0.01	0.32	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.09	0.06	1.03	0.00	1.18	1.21	1.12
OP1	0.25	0.65	0.31	0.35	0.68	0.10	0.94	0.14	1.02	0.87	0.86	0.56	0.53	1.08	0.59	0.16	0.33	0.05	0.01	1.18	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.70	0.07	0.07	0.62	0.31	0.91	0.40	1.04	0.65	0.91	0.64	0.53	1.00	0.42	0.10	0.16	0.31	0.01	1.21	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.64	0.22	0.23	0.65	0.02	0.91	0.01	0.98	0.84	0.83	0.55	0.51	1.05	0.54	0.08	0.20	0.07	0.00	1.12	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.34	0.24	0.17	0.16	0.15	0.09	0.10	0.11	0.12	0.22	0.43	0.32	0.17	0.10	0.32	0.23	0.15	0.46	0.12	0.87	0.42	0.46
C2	0.28	0.15	0.34	0.47	0.21	0.43	0.25	0.51	0.15	0.34	0.12	0.21	0.16	0.34	0.28	0.26	0.53	0.32	0.97	0.15	1.98	0.37	1.14
C2'	0.20	0.36	0.26	0.18	0.17	0.17	0.08	0.07	0.12	0.10	0.25	0.48	0.33	0.15	0.09	0.37	0.26	0.16	0.49	0.13	0.81	0.50	0.48
C3'	0.25	0.37	0.33	0.23	0.18	0.23	0.01	0.10	0.05	0.11	0.23	0.50	0.37	0.16	0.11	0.50	0.34	0.21	0.53	0.08	0.64	0.58	0.47
C4	0.29	0.15	0.41	0.48	0.17	0.41	0.05	0.41	0.05	0.15	0.07	0.16	0.20	0.07	0.21	0.39	0.57	0.30	0.82	0.15	1.52	0.33	0.90
C4'	0.25	0.39	0.30	0.13	0.19	0.16	0.05	0.01	0.09	0.12	0.25	0.52	0.39	0.16	0.10	0.51	0.19	0.20	0.39	0.08	0.45	0.48	0.32
C5	0.39	0.13	0.54	0.68	0.17	0.58	0.07	0.59	0.21	0.21	0.18	0.15	0.19	0.04	0.28	0.53	0.79	0.41	0.99	0.36	1.70	0.41	1.08
C5'	0.35	0.41	0.43	0.24	0.24	0.28	0.07	0.09	0.10	0.06	0.26	0.52	0.43	0.11	0.18	0.68	0.34	0.30	0.43	0.04	0.38	0.45	0.33
C6	0.42	0.18	0.56	0.74	0.20	0.66	0.13	0.74	0.22	0.37	0.26	0.22	0.17	0.24	0.34	0.51	0.85	0.48	1.16	0.39	2.08	0.51	1.33
C8	0.33	0.14	0.54	0.58	0.10	0.45	0.14	0.35	0.21	0.08	0.07	0.20	0.22	0.26	0.14	0.62	0.75	0.31	0.71	0.35	1.03	0.47	0.67
N1	0.36	0.19	0.46	0.63	0.21	0.57	0.21	0.67	0.11	0.41	0.22	0.27	0.16	0.36	0.33	0.38	0.70	0.42	1.12	0.13	2.18	0.49	1.32
N2	0.23	0.14	0.26	0.40	0.21	0.37	0.31	0.49	0.28	0.37	0.13	0.26	0.13	0.42	0.26	0.15	0.44	0.28	0.95	0.40	2.08	0.38	1.17
N3	0.23	0.16	0.29	0.38	0.19	0.33	0.18	0.38	0.14	0.21	0.11	0.16	0.18	0.21	0.21	0.24	0.43	0.25	0.81	0.13	1.66	0.29	0.93
N7	0.41	0.11	0.62	0.75	0.13	0.61	0.15	0.57	0.28	0.07	0.18	0.13	0.19	0.18	0.23	0.65	0.91	0.42	0.93	0.45	1.38	0.45	0.94
N9	0.26	0.20	0.40	0.40	0.14	0.32	0.04	0.26	0.07	0.04	0.06	0.25	0.25	0.14	0.14	0.44	0.50	0.24	0.65	0.18	1.12	0.39	0.66
O2'	0.19	0.43	0.19	0.11	0.22	0.13	0.17	0.06	0.22	0.12	0.34	0.57	0.38	0.17	0.13	0.29	0.16	0.15	0.44	0.22	0.81	0.43	0.44
O3'	0.26	0.41	0.32	0.21	0.19	0.23	0.03	0.12	0.08	0.11	0.26	0.56	0.39	0.16	0.12	0.51	0.31	0.23	0.54	0.08	0.62	0.62	0.49
O4'	0.21	0.40	0.26	0.07	0.18	0.10	0.06	0.06	0.09	0.17	0.25	0.53	0.40	0.20	0.08	0.43	0.11	0.14	0.33	0.09	0.56	0.47	0.28
O5'	0.03	0.25	0.03	0.01	0.16	0.02	0.18	0.05	0.24	0.07	0.27	0.27	0.20	0.12	0.08	0.07	0.02	0.02	0.42	0.25	0.44	0.44	0.41
O6	0.48	0.21	0.63	0.85	0.21	0.78	0.14	0.89	0.29	0.43	0.33	0.26	0.17	0.26	0.38	0.59	0.98	0.56	1.30	0.50	2.27	0.65	1.50
OP1	0.02	0.21	0.03	0.01	0.13	0.02	0.15	0.08	0.20	0.05	0.22	0.23	0.16	0.10	0.07	0.04	0.00	0.01	0.35	0.21	0.62	0.33	0.31
OP2	0.01	0.19	0.03	0.00	0.13	0.03	0.15	0.06	0.20	0.05	0.21	0.20	0.15	0.10	0.06	0.03	0.00	0.03	0.53	0.21	0.57	0.49	0.50
P	0.02	0.20	0.03	0.01	0.13	0.02	0.15	0.06	0.20	0.05	0.22	0.22	0.16	0.10	0.07	0.04	0.00	0.01	0.39	0.21	0.46	0.38	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.24	0.01	0.60	0.14	0.23
C2	0.03	0.00	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.13	0.03	0.38	0.00	1.26	0.22	0.45
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.08	0.10	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.21	0.06	0.40	0.19	0.22
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.10	0.03	0.11	0.11	0.08	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.25	0.10	0.24	0.21	0.22
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.09	0.01	0.42	0.00	1.21	0.22	0.47
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.02	0.05	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.16	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.51	0.00	1.48	0.30	0.59
C5'	0.03	0.08	0.01	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.09	0.09	0.09	0.08	0.07	0.09	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.09	0.21	0.22	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.13	0.01	0.50	0.00	1.57	0.33	0.60
C8	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.55	0.00	1.31	0.26	0.60
N1	0.03	0.00	0.08	0.11	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.14	0.02	0.45	0.00	1.45	0.28	0.53
N2	0.04	0.00	0.10	0.11	0.02	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.14	0.03	0.35	0.00	1.19	0.20	0.41
N3	0.03	0.01	0.08	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.35	0.00	1.10	0.19	0.39
N7	0.00	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.57	0.00	1.57	0.34	0.67
N9	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.00	0.42	0.00	1.04	0.19	0.43
O2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.05	0.04	0.01	0.05	0.07	0.05	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.10	0.04	0.18	0.11	0.11
O3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.03	0.13	0.04	0.14	0.14	0.10	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.24	0.13	0.31	0.22	0.20
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.18	0.02	0.36	0.15	0.12
O5'	0.24	0.38	0.21	0.25	0.42	0.01	0.51	0.00	0.50	0.55	0.45	0.35	0.35	0.57	0.42	0.10	0.24	0.18	0.00	0.53	0.00	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.13	0.02	0.53	0.00	1.69	0.38	0.66
OP1	0.60	1.26	0.40	0.24	1.21	0.05	1.48	0.21	1.57	1.31	1.45	1.19	1.10	1.57	1.04	0.18	0.31	0.36	0.00	1.69	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.22	0.19	0.21	0.22	0.16	0.30	0.22	0.33	0.26	0.28	0.20	0.19	0.34	0.19	0.11	0.22	0.15	0.01	0.38	0.01	0.00	0.01
P	0.23	0.45	0.22	0.22	0.47	0.02	0.59	0.01	0.60	0.60	0.53	0.41	0.39	0.67	0.43	0.11	0.20	0.12	0.00	0.66	0.00	0.01	0.00