Doublet Group distance statistics: 51046

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 3, 8, 17, 12, 11, 5, 7, 4, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.016, 0.023, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.016 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.008, 0.019, 0.029, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.005, 0.018, 0.030, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N2	A	0, 0.020, 0.037, 0.054, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.037 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.013, 0.033, 0.054, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.033 std_dev=0.020
O6	A	0, 0.028, 0.050, 0.073, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.050 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.025, 0.055, 0.084, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.055 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.025, 0.059, 0.094, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.059 std_dev=0.035
C2	B	0, 0.304, 0.483, 0.662, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.483 std_dev=0.179
N3	B	0, 0.298, 0.492, 0.685, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.492 std_dev=0.193
N1	B	0, 0.319, 0.515, 0.710, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.515 std_dev=0.196
C4	B	0, 0.310, 0.532, 0.753, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.532 std_dev=0.222
C6	B	0, 0.330, 0.573, 0.816, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.573 std_dev=0.243
C5	B	0, 0.334, 0.587, 0.839, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.587 std_dev=0.253
O4'	A	0, -0.025, 0.233, 0.492, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.233 std_dev=0.258
C2'	B	0, 0.409, 0.670, 0.932, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.670 std_dev=0.261
C2'	A	0, -0.004, 0.260, 0.524, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.260 std_dev=0.264
N9	B	0, 0.335, 0.610, 0.884, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.610 std_dev=0.274
O3'	B	0, 0.537, 0.826, 1.115, 2.145 max_d=2.145 avg_d=0.826 std_dev=0.289
C3'	B	0, 0.405, 0.697, 0.990, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.697 std_dev=0.292
C1'	B	0, 0.353, 0.653, 0.952, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.653 std_dev=0.299
O2'	B	0, 0.481, 0.792, 1.104, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.792 std_dev=0.312
N6	B	0, 0.377, 0.689, 1.002, 1.901 max_d=1.901 avg_d=0.689 std_dev=0.313
N7	B	0, 0.383, 0.702, 1.020, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.702 std_dev=0.319
C8	B	0, 0.382, 0.704, 1.026, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.704 std_dev=0.322
C4'	B	0, 0.408, 0.771, 1.135, 1.972 max_d=1.972 avg_d=0.771 std_dev=0.363
O4'	B	0, 0.378, 0.752, 1.126, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.752 std_dev=0.374
OP2	A	0, 0.262, 0.648, 1.034, 2.658 max_d=2.658 avg_d=0.648 std_dev=0.386
P	A	0, 0.177, 0.565, 0.954, 2.515 max_d=2.515 avg_d=0.565 std_dev=0.388
O2'	A	0, 0.000, 0.391, 0.781, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.391 std_dev=0.390
O5'	B	0, 0.808, 1.242, 1.675, 2.296 max_d=2.296 avg_d=1.242 std_dev=0.434
C5'	B	0, 0.540, 0.994, 1.448, 2.369 max_d=2.369 avg_d=0.994 std_dev=0.454
C4'	A	0, -0.038, 0.418, 0.873, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.418 std_dev=0.456
O5'	A	0, 0.140, 0.608, 1.076, 2.194 max_d=2.194 avg_d=0.608 std_dev=0.468
OP1	A	0, 0.294, 0.764, 1.234, 3.150 max_d=3.150 avg_d=0.764 std_dev=0.470
C3'	A	0, -0.068, 0.444, 0.957, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.444 std_dev=0.512
C5'	A	0, 0.034, 0.580, 1.127, 2.253 max_d=2.253 avg_d=0.580 std_dev=0.547
P	B	0, 1.535, 2.316, 3.096, 4.310 max_d=4.310 avg_d=2.316 std_dev=0.781
O3'	A	0, -0.104, 0.730, 1.564, 3.200 max_d=3.200 avg_d=0.730 std_dev=0.834
OP1	B	0, 2.348, 3.225, 4.103, 5.323 max_d=5.323 avg_d=3.225 std_dev=0.878
OP2	B	0, 2.127, 3.061, 3.996, 5.158 max_d=5.158 avg_d=3.061 std_dev=0.935

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.22	0.01	0.16	0.02	0.17	0.23	0.16
C2	0.03	0.00	0.22	0.21	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.25	0.09	0.18	0.01	0.20	0.28	0.20
C2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.12	0.02	0.08	0.14	0.12	0.09	0.18	0.25	0.21	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.30	0.10	0.36	0.40	0.33
C3'	0.02	0.21	0.01	0.00	0.21	0.01	0.26	0.02	0.28	0.25	0.25	0.20	0.18	0.29	0.17	0.02	0.01	0.02	0.07	0.31	0.18	0.15	0.10
C4	0.01	0.01	0.12	0.21	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.16	0.15	0.05	0.19	0.01	0.20	0.27	0.20
C4'	0.02	0.05	0.02	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.09	0.15	0.06	0.07	0.05	0.15	0.08	0.21	0.02	0.01	0.02	0.12	0.11	0.09	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.26	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.22	0.14	0.04	0.24	0.01	0.25	0.31	0.25
C5'	0.05	0.07	0.14	0.02	0.09	0.01	0.15	0.00	0.15	0.18	0.11	0.07	0.07	0.20	0.09	0.09	0.16	0.01	0.01	0.18	0.13	0.09	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.28	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	0.17	0.05	0.25	0.00	0.27	0.34	0.27
C8	0.01	0.01	0.09	0.25	0.01	0.15	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.22	0.15	0.07	0.24	0.02	0.23	0.27	0.23
N1	0.02	0.01	0.18	0.25	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.20	0.08	0.22	0.01	0.23	0.32	0.24
N2	0.04	0.01	0.25	0.20	0.01	0.07	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.32	0.11	0.17	0.02	0.19	0.28	0.19
N3	0.03	0.00	0.21	0.18	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.26	0.09	0.17	0.01	0.18	0.26	0.18
N7	0.01	0.01	0.05	0.29	0.01	0.15	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.25	0.19	0.05	0.27	0.02	0.28	0.33	0.28
N9	0.01	0.01	0.03	0.17	0.00	0.08	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.14	0.09	0.02	0.18	0.02	0.18	0.25	0.18
O2'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.16	0.21	0.22	0.09	0.23	0.22	0.20	0.19	0.14	0.25	0.14	0.00	0.05	0.14	0.21	0.25	0.28	0.41	0.26
O3'	0.22	0.25	0.03	0.01	0.15	0.02	0.14	0.16	0.17	0.15	0.20	0.32	0.26	0.19	0.09	0.05	0.00	0.16	0.21	0.20	0.36	0.30	0.26
O4'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.07	0.08	0.11	0.09	0.05	0.02	0.14	0.16	0.00	0.12	0.05	0.13	0.16	0.13
O5'	0.16	0.18	0.30	0.07	0.19	0.02	0.24	0.01	0.25	0.24	0.22	0.17	0.17	0.27	0.18	0.21	0.21	0.12	0.00	0.28	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.10	0.31	0.01	0.12	0.01	0.18	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.25	0.20	0.05	0.28	0.00	0.32	0.38	0.31
OP1	0.17	0.20	0.36	0.18	0.20	0.11	0.25	0.13	0.27	0.23	0.23	0.19	0.18	0.28	0.18	0.28	0.36	0.13	0.01	0.32	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.28	0.40	0.15	0.27	0.09	0.31	0.09	0.34	0.27	0.32	0.28	0.26	0.33	0.25	0.41	0.30	0.16	0.02	0.38	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.20	0.33	0.10	0.20	0.04	0.25	0.02	0.27	0.23	0.24	0.19	0.18	0.28	0.18	0.26	0.26	0.13	0.01	0.31	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.27	0.26	0.21	0.26	0.23	0.24	0.22	0.23	0.28	0.25	0.28	0.24	0.26	0.28	0.32	0.21	0.27	0.28	0.35	0.45	0.33
C2	0.23	0.22	0.21	0.21	0.23	0.21	0.25	0.24	0.25	0.27	0.23	0.22	0.30	0.28	0.24	0.26	0.21	0.23	0.36	0.44	0.58	0.45
C2'	0.24	0.28	0.22	0.23	0.22	0.22	0.22	0.25	0.23	0.27	0.26	0.25	0.25	0.26	0.24	0.27	0.27	0.23	0.32	0.43	0.50	0.38
C3'	0.19	0.27	0.17	0.13	0.23	0.13	0.27	0.15	0.29	0.27	0.28	0.23	0.33	0.29	0.22	0.23	0.12	0.16	0.25	0.36	0.50	0.33
C4	0.24	0.21	0.23	0.21	0.22	0.22	0.23	0.23	0.21	0.27	0.21	0.21	0.23	0.26	0.24	0.27	0.21	0.23	0.33	0.41	0.53	0.41
C4'	0.21	0.24	0.20	0.16	0.20	0.17	0.21	0.17	0.22	0.24	0.23	0.22	0.23	0.23	0.21	0.25	0.16	0.19	0.24	0.33	0.43	0.29
C5	0.24	0.17	0.24	0.25	0.19	0.25	0.21	0.29	0.17	0.28	0.16	0.17	0.21	0.27	0.24	0.27	0.25	0.24	0.38	0.47	0.58	0.47
C5'	0.23	0.30	0.22	0.17	0.26	0.17	0.26	0.17	0.27	0.26	0.29	0.29	0.28	0.27	0.24	0.26	0.13	0.20	0.24	0.33	0.42	0.28
C6	0.24	0.17	0.24	0.26	0.20	0.27	0.23	0.32	0.17	0.29	0.14	0.18	0.21	0.29	0.25	0.26	0.26	0.25	0.43	0.53	0.65	0.53
C8	0.27	0.21	0.28	0.25	0.21	0.25	0.23	0.25	0.22	0.29	0.21	0.20	0.24	0.27	0.26	0.31	0.25	0.26	0.32	0.40	0.50	0.39
N1	0.23	0.19	0.22	0.23	0.22	0.24	0.25	0.29	0.23	0.28	0.18	0.20	0.28	0.30	0.24	0.25	0.23	0.23	0.40	0.50	0.63	0.51
N2	0.23	0.24	0.21	0.20	0.23	0.21	0.26	0.24	0.28	0.27	0.26	0.23	0.33	0.29	0.24	0.26	0.20	0.23	0.35	0.43	0.58	0.44
N3	0.24	0.24	0.22	0.20	0.23	0.21	0.24	0.22	0.25	0.26	0.24	0.23	0.27	0.26	0.24	0.27	0.20	0.23	0.33	0.40	0.53	0.40
N7	0.26	0.18	0.28	0.28	0.18	0.28	0.20	0.31	0.19	0.29	0.19	0.17	0.23	0.27	0.25	0.29	0.28	0.26	0.39	0.47	0.57	0.47
N9	0.27	0.24	0.24	0.21	0.23	0.22	0.23	0.22	0.22	0.28	0.22	0.23	0.23	0.26	0.26	0.29	0.21	0.25	0.30	0.37	0.49	0.37
O2'	0.29	0.30	0.25	0.20	0.25	0.21	0.24	0.21	0.23	0.28	0.24	0.30	0.25	0.28	0.26	0.35	0.20	0.26	0.30	0.42	0.51	0.37
O3'	0.18	0.25	0.16	0.16	0.18	0.15	0.19	0.20	0.21	0.22	0.22	0.23	0.24	0.23	0.17	0.24	0.20	0.15	0.29	0.44	0.55	0.38
O4'	0.27	0.23	0.25	0.24	0.21	0.25	0.22	0.24	0.21	0.27	0.22	0.22	0.22	0.25	0.25	0.30	0.24	0.26	0.28	0.35	0.43	0.32
O5'	0.18	0.30	0.20	0.08	0.24	0.06	0.24	0.07	0.27	0.22	0.29	0.28	0.27	0.24	0.20	0.24	0.02	0.12	0.22	0.33	0.43	0.27
O6	0.26	0.20	0.27	0.30	0.22	0.31	0.24	0.38	0.16	0.33	0.18	0.19	0.19	0.32	0.27	0.27	0.29	0.29	0.49	0.60	0.71	0.60
OP1	0.04	0.21	0.07	0.04	0.13	0.11	0.16	0.21	0.19	0.16	0.21	0.18	0.22	0.19	0.08	0.13	0.02	0.08	0.23	0.45	0.50	0.33
OP2	0.07	0.25	0.08	0.05	0.18	0.10	0.22	0.19	0.26	0.21	0.27	0.22	0.29	0.24	0.13	0.09	0.02	0.10	0.27	0.45	0.52	0.37
P	0.05	0.21	0.08	0.02	0.14	0.05	0.17	0.12	0.19	0.16	0.21	0.18	0.22	0.19	0.10	0.12	0.01	0.03	0.20	0.36	0.44	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	0.18	0.18	0.13
C2	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.13	0.14	0.03	0.22	0.29	0.35	0.28
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.05	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.11	0.16	0.19	0.12
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.08	0.01	0.09	0.02	0.10	0.11	0.11	0.10	0.11	0.11	0.06	0.02	0.01	0.01	0.14	0.19	0.21	0.13
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.22	0.29	0.32	0.26
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.06	0.09	0.05	0.05	0.08	0.10	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.10	0.14	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.27	0.36	0.39	0.33
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.10	0.01	0.15	0.00	0.15	0.16	0.12	0.07	0.18	0.18	0.09	0.05	0.03	0.02	0.01	0.11	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.12	0.03	0.28	0.38	0.42	0.36
C8	0.02	0.01	0.05	0.11	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.12	0.04	0.26	0.34	0.33	0.29
N1	0.02	0.00	0.08	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.13	0.03	0.26	0.34	0.40	0.33
N3	0.03	0.00	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.13	0.03	0.19	0.26	0.31	0.24
N6	0.02	0.02	0.05	0.11	0.01	0.08	0.01	0.18	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.07	0.13	0.04	0.32	0.43	0.47	0.41
N7	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.13	0.04	0.29	0.39	0.41	0.35
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.20	0.26	0.27	0.22
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.04	0.11	0.12	0.07	0.03	0.02	0.00	0.05	0.05	0.06	0.12	0.19	0.08
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.12	0.12	0.13	0.13	0.13	0.13	0.06	0.05	0.00	0.02	0.15	0.26	0.30	0.17
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.19	0.16	0.12
O5'	0.11	0.22	0.11	0.14	0.22	0.02	0.27	0.01	0.28	0.26	0.26	0.19	0.32	0.29	0.20	0.06	0.15	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.18	0.29	0.16	0.19	0.29	0.10	0.36	0.11	0.38	0.34	0.34	0.26	0.43	0.39	0.26	0.12	0.26	0.19	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.18	0.35	0.19	0.21	0.32	0.14	0.39	0.15	0.42	0.33	0.40	0.31	0.47	0.41	0.27	0.19	0.30	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.28	0.12	0.13	0.26	0.04	0.33	0.02	0.36	0.29	0.33	0.24	0.41	0.35	0.22	0.08	0.17	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00