Doublet Group distance statistics: 51047

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 6, 14, 8, 10, 6, 9, 4, 3, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.019, 0.030, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.019 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.020 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.012, 0.024, 0.035, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.013, 0.028, 0.042, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.028 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.011, 0.028, 0.044, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.028 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.016, 0.033, 0.050, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.033 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.016, 0.036, 0.056, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.036 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.014, 0.037, 0.061, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.037 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.015, 0.044, 0.073, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.044 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.029, 0.115, 0.201, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.115 std_dev=0.086
C2'	A	0, 0.052, 0.143, 0.233, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.143 std_dev=0.090
O2'	A	0, 0.082, 0.202, 0.323, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.202 std_dev=0.120
C4'	A	0, 0.067, 0.206, 0.344, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.206 std_dev=0.139
C3'	A	0, 0.088, 0.237, 0.386, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.237 std_dev=0.149
C5	B	0, 0.246, 0.464, 0.682, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.464 std_dev=0.218
N7	B	0, 0.275, 0.494, 0.713, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.494 std_dev=0.219
C5'	A	0, 0.098, 0.320, 0.542, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.320 std_dev=0.222
C8	B	0, 0.262, 0.489, 0.715, 1.119 max_d=1.119 avg_d=0.489 std_dev=0.226
O3'	A	0, 0.156, 0.386, 0.615, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.386 std_dev=0.229
N9	B	0, 0.231, 0.462, 0.693, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.462 std_dev=0.231
C2'	B	0, 0.302, 0.535, 0.767, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.535 std_dev=0.232
N6	B	0, 0.366, 0.598, 0.830, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.598 std_dev=0.232
C4	B	0, 0.241, 0.474, 0.707, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.474 std_dev=0.233
C6	B	0, 0.285, 0.524, 0.764, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.524 std_dev=0.240
C1'	B	0, 0.265, 0.515, 0.765, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.515 std_dev=0.250
O2'	B	0, 0.337, 0.598, 0.859, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.598 std_dev=0.261
C3'	B	0, 0.291, 0.561, 0.831, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.561 std_dev=0.270
N3	B	0, 0.299, 0.578, 0.858, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.578 std_dev=0.280
O4'	B	0, 0.267, 0.566, 0.866, 1.356 max_d=1.356 avg_d=0.566 std_dev=0.299
O3'	B	0, 0.298, 0.598, 0.899, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.598 std_dev=0.301
N1	B	0, 0.286, 0.593, 0.899, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.593 std_dev=0.307
C2	B	0, 0.300, 0.624, 0.947, 1.541 max_d=1.541 avg_d=0.624 std_dev=0.323
C4'	B	0, 0.277, 0.610, 0.942, 1.625 max_d=1.625 avg_d=0.610 std_dev=0.333
O5'	A	0, 0.052, 0.403, 0.755, 2.432 max_d=2.432 avg_d=0.403 std_dev=0.351
C5'	B	0, 0.333, 0.748, 1.162, 2.029 max_d=2.029 avg_d=0.748 std_dev=0.414
OP1	A	0, 0.040, 0.581, 1.123, 4.212 max_d=4.212 avg_d=0.581 std_dev=0.541
P	A	0, -0.056, 0.488, 1.032, 4.208 max_d=4.208 avg_d=0.488 std_dev=0.544
O5'	B	0, 0.422, 1.006, 1.590, 2.854 max_d=2.854 avg_d=1.006 std_dev=0.584
OP2	A	0, -0.092, 0.593, 1.277, 5.456 max_d=5.456 avg_d=0.593 std_dev=0.684
P	B	0, 0.584, 1.591, 2.598, 4.615 max_d=4.615 avg_d=1.591 std_dev=1.007
OP1	B	0, 1.449, 2.592, 3.736, 5.586 max_d=5.586 avg_d=2.592 std_dev=1.143
OP2	B	0, 0.317, 1.907, 3.497, 7.247 max_d=7.247 avg_d=1.907 std_dev=1.590

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.13	0.02	0.08	0.14	0.09
C2	0.03	0.00	0.11	0.13	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.17	0.04	0.22	0.01	0.19	0.34	0.23
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.07	0.05	0.09	0.13	0.11	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.07	0.11	0.11	0.08
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.12	0.09	0.13	0.15	0.12	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.12	0.13	0.15	0.11	0.10
C4	0.02	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.23	0.01	0.21	0.33	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.05	0.07	0.05	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.07	0.07	0.10	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.29	0.01	0.30	0.44	0.33
C5'	0.02	0.06	0.02	0.02	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.09	0.08	0.07	0.05	0.11	0.05	0.06	0.04	0.01	0.01	0.11	0.11	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.03	0.30	0.00	0.32	0.48	0.36
C8	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.04	0.29	0.02	0.29	0.38	0.32
N1	0.03	0.00	0.09	0.13	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.17	0.03	0.26	0.01	0.26	0.42	0.30
N2	0.04	0.01	0.13	0.15	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.20	0.04	0.20	0.02	0.16	0.31	0.20
N3	0.03	0.01	0.11	0.12	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.19	0.01	0.16	0.28	0.19
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.32	0.02	0.35	0.48	0.39
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.22	0.01	0.19	0.27	0.21
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.05	0.05	0.06	0.07	0.04	0.10	0.14	0.11	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.06	0.07	0.16	0.10	0.13
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.11	0.02	0.13	0.04	0.16	0.10	0.17	0.20	0.14	0.13	0.06	0.05	0.00	0.02	0.14	0.18	0.22	0.15	0.16
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.11	0.03	0.08	0.12	0.09
O5'	0.13	0.22	0.10	0.12	0.23	0.02	0.29	0.01	0.30	0.29	0.26	0.20	0.19	0.32	0.22	0.06	0.14	0.11	0.00	0.32	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.18	0.03	0.32	0.00	0.38	0.55	0.41
OP1	0.08	0.19	0.11	0.15	0.21	0.07	0.30	0.11	0.32	0.29	0.26	0.16	0.16	0.35	0.19	0.16	0.22	0.08	0.02	0.38	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.34	0.11	0.11	0.33	0.10	0.44	0.13	0.48	0.38	0.42	0.31	0.28	0.48	0.27	0.10	0.15	0.12	0.02	0.55	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.23	0.08	0.10	0.24	0.06	0.33	0.02	0.36	0.32	0.30	0.20	0.19	0.39	0.21	0.13	0.16	0.09	0.01	0.41	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.34	0.17	0.18	0.19	0.18	0.18	0.28	0.22	0.18	0.28	0.31	0.26	0.21	0.14	0.25	0.17	0.16	0.50	0.57	0.82	0.58
C2	0.21	0.43	0.20	0.20	0.25	0.23	0.21	0.36	0.29	0.20	0.42	0.35	0.29	0.21	0.20	0.24	0.18	0.22	0.62	0.73	1.34	0.85
C2'	0.15	0.37	0.17	0.15	0.18	0.15	0.18	0.27	0.24	0.17	0.32	0.32	0.28	0.20	0.13	0.27	0.14	0.14	0.48	0.65	0.81	0.58
C3'	0.16	0.31	0.19	0.14	0.15	0.14	0.16	0.26	0.21	0.19	0.27	0.27	0.26	0.22	0.13	0.30	0.15	0.13	0.43	0.68	0.67	0.52
C4	0.18	0.38	0.20	0.20	0.21	0.22	0.15	0.35	0.23	0.15	0.34	0.33	0.24	0.16	0.16	0.24	0.19	0.20	0.59	0.70	1.18	0.77
C4'	0.18	0.27	0.19	0.13	0.16	0.13	0.18	0.21	0.20	0.21	0.23	0.25	0.24	0.22	0.15	0.31	0.14	0.14	0.38	0.55	0.51	0.42
C5	0.21	0.37	0.22	0.22	0.24	0.27	0.20	0.39	0.28	0.17	0.35	0.32	0.28	0.16	0.19	0.24	0.21	0.24	0.62	0.78	1.32	0.86
C5'	0.21	0.22	0.23	0.13	0.16	0.14	0.18	0.18	0.18	0.24	0.19	0.21	0.22	0.24	0.18	0.35	0.13	0.16	0.33	0.54	0.35	0.34
C6	0.24	0.40	0.23	0.23	0.28	0.29	0.26	0.41	0.34	0.22	0.41	0.34	0.36	0.21	0.23	0.25	0.22	0.27	0.65	0.84	1.47	0.94
C8	0.19	0.28	0.22	0.21	0.19	0.24	0.16	0.36	0.20	0.18	0.25	0.28	0.23	0.20	0.16	0.24	0.20	0.21	0.56	0.69	1.01	0.70
N1	0.23	0.43	0.22	0.22	0.28	0.27	0.25	0.39	0.34	0.22	0.44	0.36	0.34	0.22	0.23	0.25	0.20	0.26	0.64	0.80	1.45	0.92
N2	0.21	0.43	0.20	0.20	0.25	0.23	0.23	0.35	0.29	0.21	0.42	0.35	0.30	0.23	0.21	0.25	0.18	0.22	0.62	0.71	1.35	0.85
N3	0.18	0.41	0.19	0.19	0.22	0.21	0.17	0.33	0.24	0.17	0.38	0.34	0.26	0.19	0.17	0.24	0.18	0.19	0.59	0.68	1.20	0.78
N7	0.22	0.31	0.23	0.24	0.22	0.28	0.19	0.41	0.25	0.17	0.29	0.29	0.27	0.18	0.19	0.24	0.22	0.25	0.62	0.79	1.24	0.83
N9	0.16	0.33	0.19	0.19	0.18	0.21	0.14	0.32	0.19	0.15	0.27	0.30	0.23	0.18	0.13	0.24	0.18	0.17	0.55	0.64	0.99	0.68
O2'	0.18	0.41	0.17	0.15	0.22	0.15	0.22	0.25	0.28	0.18	0.37	0.35	0.31	0.21	0.16	0.27	0.15	0.15	0.45	0.59	0.74	0.54
O3'	0.18	0.33	0.20	0.14	0.16	0.15	0.16	0.25	0.22	0.20	0.28	0.28	0.27	0.22	0.13	0.33	0.15	0.14	0.40	0.70	0.61	0.50
O4'	0.17	0.26	0.17	0.18	0.17	0.16	0.18	0.24	0.20	0.20	0.22	0.26	0.24	0.22	0.15	0.26	0.18	0.15	0.44	0.52	0.62	0.48
O5'	0.26	0.23	0.28	0.25	0.23	0.25	0.27	0.33	0.25	0.35	0.22	0.22	0.28	0.35	0.27	0.28	0.22	0.25	0.50	0.73	0.58	0.56
O6	0.26	0.39	0.25	0.25	0.30	0.32	0.30	0.44	0.38	0.25	0.42	0.34	0.41	0.25	0.26	0.25	0.24	0.31	0.66	0.91	1.58	1.00
OP1	0.29	0.18	0.29	0.40	0.20	0.45	0.24	0.55	0.20	0.37	0.17	0.18	0.24	0.34	0.28	0.26	0.45	0.38	0.63	0.90	0.72	0.69
OP2	0.15	0.24	0.10	0.27	0.20	0.35	0.29	0.56	0.27	0.39	0.24	0.21	0.33	0.40	0.23	0.16	0.21	0.29	0.61	1.05	0.77	0.76
P	0.25	0.19	0.25	0.39	0.19	0.41	0.25	0.53	0.21	0.38	0.18	0.17	0.26	0.36	0.27	0.17	0.41	0.34	0.62	0.89	0.66	0.68

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.24	0.27	0.32	0.19
C2	0.03	0.00	0.12	0.16	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.19	0.05	0.42	0.29	0.74	0.44
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.07	0.02	0.05	0.03	0.06	0.08	0.09	0.13	0.06	0.07	0.03	0.00	0.03	0.01	0.22	0.29	0.21	0.17
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.10	0.04	0.12	0.13	0.15	0.15	0.13	0.13	0.06	0.02	0.01	0.01	0.25	0.33	0.19	0.21
C4	0.02	0.01	0.07	0.10	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.03	0.44	0.27	0.74	0.45
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.09	0.07	0.06	0.09	0.09	0.05	0.06	0.03	0.00	0.02	0.24	0.22	0.09
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.12	0.03	0.52	0.35	0.98	0.59
C5'	0.03	0.13	0.03	0.04	0.11	0.01	0.15	0.00	0.16	0.15	0.15	0.10	0.18	0.17	0.09	0.06	0.07	0.02	0.01	0.11	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.53	0.38	1.04	0.62
C8	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.05	0.53	0.33	0.89	0.57
N1	0.03	0.00	0.09	0.15	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.17	0.04	0.48	0.33	0.92	0.55
N3	0.03	0.00	0.13	0.15	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.17	0.05	0.38	0.26	0.62	0.37
N6	0.02	0.01	0.06	0.13	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.16	0.03	0.56	0.45	1.19	0.71
N7	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.15	0.04	0.57	0.41	1.09	0.67
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.41	0.25	0.64	0.40
O2'	0.02	0.14	0.00	0.02	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.05	0.11	0.13	0.08	0.06	0.03	0.00	0.06	0.05	0.09	0.37	0.27	0.16
O3'	0.02	0.19	0.03	0.01	0.10	0.03	0.12	0.07	0.14	0.14	0.17	0.17	0.16	0.15	0.06	0.06	0.00	0.02	0.21	0.41	0.26	0.23
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.20	0.32	0.28	0.17
O5'	0.24	0.42	0.22	0.25	0.44	0.02	0.52	0.01	0.53	0.53	0.48	0.38	0.56	0.57	0.41	0.09	0.21	0.20	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.27	0.29	0.29	0.33	0.27	0.24	0.35	0.11	0.38	0.33	0.33	0.26	0.45	0.41	0.25	0.37	0.41	0.32	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.74	0.21	0.19	0.74	0.22	0.98	0.25	1.04	0.89	0.92	0.62	1.19	1.09	0.64	0.27	0.26	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.19	0.44	0.17	0.21	0.45	0.09	0.59	0.02	0.62	0.57	0.55	0.37	0.71	0.67	0.40	0.16	0.23	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00