Doublet Group distance statistics: 51048

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 5, 13, 7, 9, 10, 5, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.008, 0.020, 0.033, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.020 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.008, 0.022, 0.035, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.022 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.023 std_dev=0.014
O6	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.032 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.017, 0.040, 0.062, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.040 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.013, 0.036, 0.060, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.036 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.005, 0.031, 0.056, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.031 std_dev=0.025
O4'	A	0, 0.047, 0.163, 0.278, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.163 std_dev=0.116
C2'	A	0, 0.052, 0.175, 0.299, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.175 std_dev=0.123
O2'	A	0, 0.069, 0.226, 0.383, 0.831 max_d=0.831 avg_d=0.226 std_dev=0.157
C4'	A	0, 0.121, 0.309, 0.496, 0.799 max_d=0.799 avg_d=0.309 std_dev=0.187
C5	B	0, 0.264, 0.454, 0.643, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.454 std_dev=0.190
C4	B	0, 0.236, 0.428, 0.620, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.428 std_dev=0.192
N3	B	0, 0.262, 0.453, 0.645, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.453 std_dev=0.192
C3'	A	0, 0.121, 0.319, 0.516, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.319 std_dev=0.197
C6	B	0, 0.284, 0.484, 0.684, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.484 std_dev=0.200
C2	B	0, 0.275, 0.478, 0.681, 0.875 max_d=0.875 avg_d=0.478 std_dev=0.203
N1	B	0, 0.277, 0.488, 0.699, 0.927 max_d=0.927 avg_d=0.488 std_dev=0.211
N7	B	0, 0.286, 0.496, 0.707, 0.919 max_d=0.919 avg_d=0.496 std_dev=0.211
N9	B	0, 0.242, 0.455, 0.667, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.455 std_dev=0.213
C8	B	0, 0.256, 0.481, 0.707, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.481 std_dev=0.226
N6	B	0, 0.330, 0.557, 0.785, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.557 std_dev=0.228
C1'	B	0, 0.299, 0.533, 0.767, 1.174 max_d=1.174 avg_d=0.533 std_dev=0.234
O3'	A	0, 0.179, 0.475, 0.770, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.475 std_dev=0.296
O4'	B	0, 0.312, 0.610, 0.908, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.610 std_dev=0.298
C2'	B	0, 0.301, 0.615, 0.929, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.615 std_dev=0.314
O2'	B	0, 0.428, 0.752, 1.075, 1.648 max_d=1.648 avg_d=0.752 std_dev=0.324
C5'	A	0, 0.226, 0.554, 0.881, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.554 std_dev=0.327
O5'	B	0, 0.421, 0.805, 1.190, 1.710 max_d=1.710 avg_d=0.805 std_dev=0.384
C4'	B	0, 0.306, 0.690, 1.075, 2.144 max_d=2.144 avg_d=0.690 std_dev=0.384
P	B	0, 0.557, 0.963, 1.368, 1.885 max_d=1.885 avg_d=0.963 std_dev=0.405
C3'	B	0, 0.248, 0.668, 1.088, 2.460 max_d=2.460 avg_d=0.668 std_dev=0.420
O5'	A	0, 0.258, 0.704, 1.150, 2.146 max_d=2.146 avg_d=0.704 std_dev=0.446
C5'	B	0, 0.336, 0.785, 1.233, 2.371 max_d=2.371 avg_d=0.785 std_dev=0.449
OP2	B	0, 0.616, 1.068, 1.521, 2.251 max_d=2.251 avg_d=1.068 std_dev=0.453
O3'	B	0, 0.271, 0.851, 1.431, 3.588 max_d=3.588 avg_d=0.851 std_dev=0.580
P	A	0, 0.293, 0.906, 1.519, 3.673 max_d=3.673 avg_d=0.906 std_dev=0.613
OP1	B	0, 0.485, 1.120, 1.756, 3.294 max_d=3.294 avg_d=1.120 std_dev=0.636
OP1	A	0, 0.366, 1.133, 1.900, 4.185 max_d=4.185 avg_d=1.133 std_dev=0.767
OP2	A	0, 0.224, 1.040, 1.855, 5.578 max_d=5.578 avg_d=1.040 std_dev=0.816

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.14	0.02	0.12	0.25	0.15
C2	0.04	0.00	0.11	0.16	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.19	0.05	0.25	0.01	0.23	0.39	0.26
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.03	0.07	0.07	0.09	0.14	0.11	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.17	0.07	0.19	0.19	0.12
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.11	0.01	0.12	0.02	0.14	0.12	0.15	0.18	0.14	0.13	0.07	0.03	0.01	0.02	0.22	0.15	0.26	0.18	0.17
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.12	0.03	0.27	0.01	0.24	0.40	0.28
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.09	0.11	0.08	0.08	0.06	0.11	0.06	0.06	0.03	0.01	0.03	0.11	0.12	0.23	0.06
C5	0.02	0.01	0.05	0.12	0.00	0.09	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.14	0.03	0.34	0.01	0.35	0.51	0.37
C5'	0.05	0.16	0.03	0.02	0.16	0.01	0.22	0.00	0.22	0.22	0.20	0.15	0.14	0.25	0.15	0.06	0.06	0.02	0.01	0.25	0.18	0.26	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.17	0.03	0.34	0.01	0.37	0.54	0.39
C8	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.11	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.14	0.04	0.34	0.02	0.32	0.47	0.36
N1	0.04	0.00	0.09	0.15	0.02	0.08	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.18	0.04	0.30	0.01	0.31	0.47	0.33
N2	0.05	0.01	0.14	0.18	0.01	0.08	0.01	0.15	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.15	0.23	0.06	0.22	0.02	0.20	0.36	0.23
N3	0.04	0.01	0.11	0.14	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.05	0.22	0.01	0.19	0.35	0.23
N7	0.02	0.01	0.06	0.13	0.00	0.11	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.15	0.04	0.38	0.02	0.40	0.57	0.42
N9	0.01	0.02	0.03	0.07	0.01	0.06	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.07	0.02	0.25	0.02	0.21	0.36	0.25
O2'	0.02	0.13	0.00	0.03	0.07	0.06	0.07	0.06	0.09	0.05	0.11	0.15	0.12	0.06	0.03	0.00	0.06	0.05	0.08	0.09	0.20	0.25	0.13
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.12	0.03	0.14	0.06	0.17	0.14	0.18	0.23	0.16	0.15	0.07	0.06	0.00	0.02	0.19	0.18	0.31	0.31	0.21
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.13	0.04	0.15	0.27	0.17
O5'	0.14	0.25	0.17	0.22	0.27	0.03	0.34	0.01	0.34	0.34	0.30	0.22	0.22	0.38	0.25	0.08	0.19	0.13	0.00	0.38	0.03	0.03	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.11	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.18	0.04	0.38	0.00	0.44	0.61	0.44
OP1	0.12	0.23	0.19	0.26	0.24	0.12	0.35	0.18	0.37	0.32	0.31	0.20	0.19	0.40	0.21	0.20	0.31	0.15	0.03	0.44	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.39	0.19	0.18	0.40	0.23	0.51	0.26	0.54	0.47	0.47	0.36	0.35	0.57	0.36	0.25	0.31	0.27	0.03	0.61	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.26	0.12	0.17	0.28	0.06	0.37	0.02	0.39	0.36	0.33	0.23	0.23	0.42	0.25	0.13	0.21	0.17	0.01	0.44	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.23	0.25	0.29	0.19	0.23	0.20	0.25	0.21	0.21	0.22	0.21	0.22	0.22	0.19	0.23	0.29	0.19	0.28	0.30	0.42	0.31
C2	0.15	0.17	0.21	0.29	0.16	0.20	0.20	0.25	0.23	0.19	0.21	0.16	0.29	0.22	0.16	0.20	0.28	0.15	0.33	0.38	0.47	0.39
C2'	0.18	0.23	0.25	0.29	0.17	0.23	0.19	0.26	0.21	0.19	0.22	0.20	0.23	0.20	0.17	0.25	0.30	0.17	0.29	0.35	0.43	0.32
C3'	0.22	0.21	0.30	0.34	0.16	0.30	0.16	0.32	0.17	0.19	0.18	0.20	0.20	0.18	0.18	0.32	0.38	0.22	0.32	0.40	0.44	0.34
C4	0.15	0.16	0.22	0.30	0.15	0.22	0.19	0.27	0.21	0.19	0.18	0.15	0.24	0.21	0.16	0.21	0.30	0.15	0.32	0.35	0.45	0.37
C4'	0.24	0.25	0.29	0.29	0.19	0.28	0.17	0.28	0.18	0.18	0.21	0.25	0.19	0.18	0.19	0.33	0.32	0.22	0.26	0.31	0.39	0.26
C5	0.16	0.14	0.21	0.33	0.15	0.25	0.18	0.32	0.18	0.20	0.14	0.15	0.24	0.22	0.16	0.22	0.34	0.18	0.37	0.41	0.49	0.43
C5'	0.34	0.30	0.40	0.37	0.26	0.39	0.23	0.36	0.23	0.23	0.26	0.32	0.24	0.22	0.27	0.49	0.44	0.34	0.29	0.34	0.40	0.27
C6	0.17	0.16	0.21	0.33	0.16	0.25	0.20	0.33	0.20	0.21	0.15	0.15	0.26	0.24	0.17	0.22	0.34	0.19	0.39	0.46	0.52	0.46
C8	0.18	0.16	0.23	0.34	0.15	0.27	0.17	0.32	0.17	0.20	0.14	0.17	0.20	0.22	0.17	0.26	0.35	0.19	0.35	0.36	0.45	0.38
N1	0.15	0.16	0.20	0.31	0.16	0.22	0.20	0.29	0.22	0.20	0.18	0.15	0.29	0.23	0.16	0.20	0.31	0.16	0.36	0.43	0.51	0.44
N2	0.16	0.19	0.21	0.28	0.17	0.19	0.21	0.24	0.24	0.19	0.22	0.17	0.30	0.22	0.17	0.20	0.26	0.15	0.31	0.37	0.47	0.38
N3	0.16	0.19	0.22	0.29	0.17	0.20	0.20	0.24	0.23	0.19	0.22	0.16	0.27	0.21	0.16	0.21	0.27	0.15	0.31	0.34	0.45	0.36
N7	0.18	0.15	0.23	0.36	0.15	0.29	0.17	0.36	0.16	0.21	0.13	0.16	0.21	0.22	0.18	0.26	0.37	0.21	0.39	0.42	0.49	0.44
N9	0.16	0.18	0.22	0.31	0.16	0.23	0.19	0.27	0.19	0.19	0.18	0.17	0.22	0.21	0.17	0.22	0.30	0.16	0.31	0.32	0.43	0.34
O2'	0.22	0.27	0.25	0.27	0.21	0.23	0.22	0.25	0.24	0.21	0.26	0.24	0.26	0.22	0.20	0.25	0.26	0.20	0.26	0.30	0.41	0.29
O3'	0.23	0.22	0.29	0.33	0.16	0.31	0.15	0.33	0.17	0.19	0.19	0.21	0.20	0.18	0.17	0.33	0.39	0.23	0.33	0.44	0.47	0.35
O4'	0.21	0.25	0.26	0.30	0.19	0.25	0.19	0.26	0.19	0.21	0.22	0.24	0.20	0.21	0.19	0.26	0.31	0.20	0.28	0.30	0.41	0.30
O5'	0.26	0.26	0.33	0.34	0.26	0.33	0.29	0.37	0.28	0.32	0.26	0.26	0.30	0.32	0.28	0.31	0.36	0.27	0.39	0.42	0.48	0.37
O6	0.19	0.18	0.22	0.35	0.18	0.29	0.21	0.38	0.20	0.24	0.17	0.17	0.26	0.26	0.20	0.23	0.36	0.22	0.43	0.52	0.57	0.51
OP1	0.17	0.17	0.24	0.35	0.19	0.43	0.26	0.57	0.25	0.32	0.20	0.15	0.30	0.34	0.22	0.17	0.42	0.30	0.50	0.63	0.64	0.51
OP2	0.46	0.43	0.45	0.65	0.50	0.71	0.57	0.85	0.54	0.64	0.48	0.42	0.59	0.65	0.53	0.19	0.65	0.61	0.82	0.85	0.87	0.82
P	0.31	0.26	0.35	0.50	0.31	0.54	0.36	0.63	0.34	0.43	0.29	0.26	0.37	0.43	0.35	0.19	0.57	0.43	0.57	0.61	0.63	0.55

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.13	0.16	0.25	0.15
C2	0.03	0.00	0.14	0.16	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.12	0.16	0.05	0.25	0.29	0.32	0.27
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.06	0.07	0.08	0.11	0.14	0.07	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.20	0.26	0.30	0.21
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.13	0.01	0.15	0.03	0.16	0.14	0.17	0.15	0.18	0.16	0.09	0.02	0.01	0.01	0.19	0.26	0.28	0.16
C4	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.09	0.03	0.25	0.28	0.30	0.25
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.10	0.06	0.05	0.09	0.10	0.05	0.11	0.03	0.01	0.02	0.12	0.25	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.12	0.03	0.31	0.36	0.34	0.31
C5'	0.04	0.09	0.06	0.03	0.10	0.01	0.14	0.00	0.15	0.16	0.12	0.08	0.17	0.18	0.09	0.06	0.09	0.02	0.01	0.13	0.28	0.02
C6	0.02	0.02	0.07	0.16	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.04	0.32	0.38	0.36	0.34
C8	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.11	0.13	0.04	0.30	0.32	0.29	0.27
N1	0.03	0.01	0.11	0.17	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.05	0.29	0.35	0.35	0.31
N3	0.03	0.00	0.14	0.15	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.05	0.22	0.25	0.30	0.23
N6	0.02	0.02	0.07	0.18	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.12	0.16	0.04	0.35	0.44	0.39	0.38
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.12	0.15	0.04	0.33	0.39	0.35	0.33
N9	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.02	0.22	0.24	0.27	0.21
O2'	0.02	0.12	0.01	0.02	0.08	0.11	0.10	0.06	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.12	0.07	0.00	0.05	0.07	0.11	0.22	0.33	0.16
O3'	0.09	0.16	0.02	0.01	0.09	0.03	0.12	0.09	0.14	0.13	0.15	0.15	0.16	0.15	0.06	0.05	0.00	0.07	0.18	0.35	0.38	0.20
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.05	0.04	0.04	0.02	0.07	0.07	0.00	0.11	0.14	0.27	0.15
O5'	0.13	0.25	0.20	0.19	0.25	0.02	0.31	0.01	0.32	0.30	0.29	0.22	0.35	0.33	0.22	0.11	0.18	0.11	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.16	0.29	0.26	0.26	0.28	0.12	0.36	0.13	0.38	0.32	0.35	0.25	0.44	0.39	0.24	0.22	0.35	0.14	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.25	0.32	0.30	0.28	0.30	0.25	0.34	0.28	0.36	0.29	0.35	0.30	0.39	0.35	0.27	0.33	0.38	0.27	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.15	0.27	0.21	0.16	0.25	0.05	0.31	0.02	0.34	0.27	0.31	0.23	0.38	0.33	0.21	0.16	0.20	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00