Doublet Group distance statistics: 51049

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 2, 5, 2, 16, 6, 7, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.028, 0.036, 0.045, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.036 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.018, 0.028, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.028 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.030, 0.043, 0.055, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.043 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.049, 0.062, 0.075, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.062 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.028, 0.041, 0.055, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.041 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.036, 0.051, 0.065, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.051 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.043, 0.059, 0.076, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.059 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.041, 0.064, 0.087, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.064 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.044, 0.068, 0.091, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.068 std_dev=0.024
N2	A	0, 0.043, 0.068, 0.093, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.068 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.139, 0.174, 0.209, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.174 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.221, 0.397, 0.574, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.397 std_dev=0.177
C2'	A	0, 0.183, 0.366, 0.550, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.366 std_dev=0.184
C4	B	0, 0.491, 0.689, 0.888, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.689 std_dev=0.198
N3	B	0, 0.459, 0.672, 0.885, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.672 std_dev=0.213
C5	B	0, 0.430, 0.670, 0.909, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.670 std_dev=0.240
C2	B	0, 0.372, 0.619, 0.865, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.619 std_dev=0.247
C3'	A	0, 0.324, 0.586, 0.849, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.586 std_dev=0.262
N9	B	0, 0.596, 0.866, 1.137, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.866 std_dev=0.271
C4'	A	0, 0.220, 0.497, 0.773, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.497 std_dev=0.277
N1	B	0, 0.291, 0.600, 0.910, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.600 std_dev=0.309
O2'	A	0, 0.198, 0.508, 0.818, 2.103 max_d=2.103 avg_d=0.508 std_dev=0.310
N7	B	0, 0.521, 0.835, 1.150, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.835 std_dev=0.314
C2'	B	0, 0.604, 0.924, 1.244, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.924 std_dev=0.320
C8	B	0, 0.629, 0.950, 1.272, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.950 std_dev=0.321
C6	B	0, 0.284, 0.605, 0.927, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.605 std_dev=0.321
C1'	B	0, 0.701, 1.041, 1.381, 1.901 max_d=1.901 avg_d=1.041 std_dev=0.340
O3'	A	0, 0.483, 0.871, 1.258, 2.479 max_d=2.479 avg_d=0.871 std_dev=0.388
C5'	A	0, 0.500, 0.897, 1.295, 2.233 max_d=2.233 avg_d=0.897 std_dev=0.397
C3'	B	0, 0.938, 1.340, 1.743, 2.483 max_d=2.483 avg_d=1.340 std_dev=0.402
O2'	B	0, 0.613, 1.049, 1.485, 2.116 max_d=2.116 avg_d=1.049 std_dev=0.436
O3'	B	0, 1.099, 1.552, 2.005, 2.996 max_d=2.996 avg_d=1.552 std_dev=0.453
N6	B	0, 0.302, 0.762, 1.222, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.762 std_dev=0.460
O4'	B	0, 0.999, 1.467, 1.934, 2.603 max_d=2.603 avg_d=1.467 std_dev=0.467
O5'	A	0, 1.130, 1.603, 2.076, 3.022 max_d=3.022 avg_d=1.603 std_dev=0.473
OP2	A	0, 1.438, 1.958, 2.477, 3.849 max_d=3.849 avg_d=1.958 std_dev=0.519
C4'	B	0, 1.129, 1.659, 2.190, 2.954 max_d=2.954 avg_d=1.659 std_dev=0.531
P	A	0, 1.070, 1.613, 2.157, 3.626 max_d=3.626 avg_d=1.613 std_dev=0.544
C5'	B	0, 1.317, 2.044, 2.771, 4.180 max_d=4.180 avg_d=2.044 std_dev=0.727
OP1	A	0, 1.304, 2.044, 2.784, 4.915 max_d=4.915 avg_d=2.044 std_dev=0.740
OP2	B	0, 1.396, 2.420, 3.444, 6.425 max_d=6.425 avg_d=2.420 std_dev=1.024
O5'	B	0, 1.100, 2.137, 3.174, 4.544 max_d=4.544 avg_d=2.137 std_dev=1.037
P	B	0, 1.409, 2.766, 4.124, 6.115 max_d=6.115 avg_d=2.766 std_dev=1.358
OP1	B	0, 2.009, 3.970, 5.930, 8.327 max_d=8.327 avg_d=3.970 std_dev=1.960

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.11	0.03	0.14	0.14	0.10
C2	0.04	0.00	0.15	0.16	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.16	0.20	0.05	0.20	0.02	0.23	0.27	0.21
C2'	0.00	0.15	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.08	0.09	0.07	0.12	0.17	0.14	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.19	0.09	0.26	0.26	0.22
C3'	0.02	0.16	0.01	0.00	0.12	0.01	0.15	0.02	0.17	0.14	0.16	0.17	0.14	0.16	0.09	0.02	0.01	0.02	0.15	0.18	0.21	0.11	0.13
C4	0.02	0.01	0.08	0.12	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.12	0.03	0.20	0.02	0.21	0.23	0.20
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.07	0.08	0.06	0.10	0.05	0.12	0.02	0.00	0.02	0.09	0.12	0.10	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.15	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.12	0.03	0.26	0.02	0.27	0.31	0.27
C5'	0.03	0.08	0.08	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.12	0.14	0.10	0.08	0.06	0.15	0.07	0.06	0.08	0.01	0.01	0.15	0.14	0.15	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.17	0.01	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.16	0.16	0.03	0.27	0.01	0.31	0.36	0.30
C8	0.01	0.02	0.07	0.14	0.01	0.10	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.12	0.11	0.04	0.25	0.02	0.24	0.24	0.23
N1	0.04	0.01	0.12	0.16	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.17	0.18	0.04	0.24	0.01	0.27	0.33	0.26
N2	0.05	0.01	0.17	0.17	0.02	0.08	0.02	0.08	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.25	0.06	0.19	0.02	0.22	0.26	0.20
N3	0.04	0.01	0.14	0.14	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.14	0.19	0.05	0.18	0.02	0.19	0.22	0.17
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.10	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.15	0.13	0.04	0.29	0.02	0.30	0.34	0.30
N9	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.07	0.01	0.18	0.02	0.18	0.18	0.16
O2'	0.03	0.16	0.00	0.02	0.12	0.12	0.15	0.06	0.16	0.12	0.17	0.18	0.14	0.15	0.09	0.00	0.04	0.09	0.13	0.18	0.22	0.28	0.18
O3'	0.12	0.20	0.02	0.01	0.12	0.02	0.12	0.08	0.16	0.11	0.18	0.25	0.19	0.13	0.07	0.04	0.00	0.09	0.18	0.17	0.25	0.19	0.18
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.01	0.09	0.09	0.00	0.09	0.04	0.12	0.13	0.08
O5'	0.11	0.20	0.19	0.15	0.20	0.02	0.26	0.01	0.27	0.25	0.24	0.19	0.18	0.29	0.18	0.13	0.18	0.09	0.00	0.30	0.02	0.03	0.01
O6	0.03	0.02	0.09	0.18	0.02	0.09	0.02	0.15	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.18	0.17	0.04	0.30	0.00	0.36	0.42	0.34
OP1	0.14	0.23	0.26	0.21	0.21	0.12	0.27	0.14	0.31	0.24	0.27	0.22	0.19	0.30	0.18	0.22	0.25	0.12	0.02	0.36	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.27	0.26	0.11	0.23	0.10	0.31	0.15	0.36	0.24	0.33	0.26	0.22	0.34	0.18	0.28	0.19	0.13	0.03	0.42	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.21	0.22	0.13	0.20	0.03	0.27	0.02	0.30	0.23	0.26	0.20	0.17	0.30	0.16	0.18	0.18	0.08	0.01	0.34	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.25	0.18	0.19	0.17	0.13	0.18	0.21	0.20	0.21	0.23	0.22	0.23	0.21	0.18	0.30	0.13	0.16	0.61	0.98	0.82	0.62
C2	0.22	0.34	0.18	0.26	0.25	0.24	0.28	0.37	0.31	0.29	0.35	0.28	0.36	0.32	0.24	0.30	0.18	0.23	0.83	1.50	1.23	0.97
C2'	0.19	0.26	0.18	0.21	0.15	0.16	0.16	0.26	0.19	0.20	0.23	0.21	0.23	0.20	0.16	0.33	0.18	0.14	0.58	0.96	0.83	0.61
C3'	0.17	0.24	0.16	0.19	0.13	0.14	0.16	0.27	0.17	0.21	0.21	0.20	0.21	0.21	0.15	0.34	0.16	0.11	0.57	0.90	0.75	0.59
C4	0.20	0.29	0.18	0.25	0.20	0.22	0.21	0.34	0.21	0.24	0.26	0.25	0.23	0.26	0.21	0.32	0.17	0.20	0.79	1.34	1.11	0.88
C4'	0.18	0.26	0.18	0.15	0.14	0.11	0.15	0.19	0.18	0.18	0.23	0.22	0.20	0.19	0.15	0.32	0.14	0.12	0.46	0.72	0.61	0.44
C5	0.22	0.28	0.20	0.29	0.20	0.29	0.18	0.41	0.17	0.26	0.26	0.24	0.18	0.26	0.22	0.35	0.23	0.25	0.86	1.48	1.22	0.99
C5'	0.19	0.27	0.19	0.15	0.17	0.14	0.17	0.20	0.19	0.20	0.23	0.24	0.19	0.20	0.16	0.33	0.15	0.13	0.37	0.61	0.50	0.35
C6	0.24	0.30	0.21	0.31	0.23	0.32	0.23	0.46	0.23	0.30	0.30	0.26	0.23	0.30	0.25	0.35	0.25	0.29	0.91	1.64	1.35	1.09
C8	0.22	0.21	0.21	0.26	0.15	0.24	0.14	0.34	0.13	0.24	0.17	0.20	0.16	0.22	0.20	0.38	0.20	0.20	0.75	1.18	0.97	0.79
N1	0.23	0.33	0.19	0.29	0.25	0.29	0.27	0.43	0.29	0.31	0.33	0.28	0.32	0.33	0.25	0.33	0.22	0.27	0.89	1.62	1.32	1.07
N2	0.22	0.36	0.18	0.25	0.26	0.23	0.30	0.36	0.34	0.30	0.37	0.30	0.42	0.34	0.25	0.29	0.17	0.23	0.82	1.51	1.23	0.98
N3	0.21	0.33	0.17	0.24	0.23	0.21	0.25	0.32	0.28	0.26	0.32	0.27	0.33	0.28	0.22	0.30	0.16	0.20	0.78	1.36	1.12	0.88
N7	0.23	0.25	0.22	0.31	0.17	0.31	0.13	0.42	0.15	0.25	0.22	0.22	0.17	0.22	0.21	0.39	0.26	0.26	0.86	1.41	1.16	0.96
N9	0.20	0.24	0.18	0.23	0.16	0.19	0.16	0.29	0.16	0.22	0.20	0.22	0.19	0.22	0.19	0.33	0.15	0.17	0.71	1.16	0.96	0.76
O2'	0.20	0.30	0.18	0.18	0.17	0.12	0.19	0.22	0.23	0.19	0.28	0.25	0.27	0.20	0.17	0.30	0.16	0.15	0.53	0.89	0.78	0.55
O3'	0.17	0.29	0.17	0.19	0.14	0.16	0.15	0.30	0.18	0.20	0.25	0.24	0.21	0.20	0.14	0.34	0.20	0.11	0.55	0.88	0.72	0.58
O4'	0.20	0.25	0.19	0.18	0.15	0.13	0.17	0.19	0.19	0.19	0.23	0.21	0.21	0.19	0.16	0.30	0.16	0.16	0.53	0.81	0.68	0.51
O5'	0.24	0.26	0.25	0.11	0.19	0.07	0.21	0.17	0.22	0.25	0.23	0.25	0.25	0.26	0.19	0.37	0.03	0.14	0.50	0.73	0.58	0.48
O6	0.26	0.29	0.23	0.33	0.23	0.37	0.22	0.51	0.23	0.32	0.31	0.25	0.25	0.30	0.26	0.37	0.29	0.33	0.95	1.76	1.44	1.18
OP1	0.14	0.22	0.15	0.03	0.11	0.09	0.16	0.25	0.18	0.20	0.19	0.20	0.22	0.22	0.10	0.26	0.02	0.09	0.27	0.69	0.40	0.30
OP2	0.17	0.24	0.20	0.10	0.19	0.21	0.26	0.40	0.28	0.29	0.26	0.21	0.34	0.33	0.17	0.40	0.03	0.19	0.48	0.88	0.62	0.57
P	0.14	0.20	0.14	0.03	0.11	0.08	0.17	0.23	0.19	0.21	0.19	0.18	0.23	0.23	0.10	0.27	0.01	0.07	0.37	0.69	0.44	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.11	0.01	0.22	0.39	0.41	0.20
C2	0.03	0.00	0.19	0.20	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.13	0.19	0.08	0.50	0.91	0.75	0.50
C2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.10	0.02	0.06	0.07	0.09	0.10	0.15	0.19	0.08	0.07	0.02	0.01	0.03	0.01	0.28	0.43	0.38	0.24
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.14	0.01	0.16	0.02	0.18	0.16	0.19	0.19	0.18	0.17	0.10	0.02	0.01	0.02	0.34	0.47	0.30	0.26
C4	0.02	0.01	0.10	0.14	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.04	0.50	0.84	0.72	0.49
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.12	0.07	0.08	0.09	0.12	0.06	0.12	0.02	0.00	0.02	0.35	0.34	0.16
C5	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.11	0.03	0.62	1.08	0.94	0.67
C5'	0.04	0.12	0.07	0.02	0.11	0.01	0.16	0.00	0.16	0.19	0.14	0.10	0.19	0.20	0.10	0.07	0.09	0.02	0.01	0.37	0.38	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.18	0.01	0.08	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.13	0.04	0.64	1.18	1.01	0.72
C8	0.01	0.02	0.10	0.16	0.01	0.12	0.01	0.19	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.15	0.15	0.05	0.58	0.90	0.83	0.60
N1	0.03	0.01	0.15	0.19	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.15	0.06	0.59	1.09	0.91	0.63
N3	0.03	0.01	0.19	0.19	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.17	0.08	0.43	0.76	0.63	0.40
N6	0.02	0.02	0.08	0.18	0.01	0.09	0.01	0.19	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.13	0.14	0.04	0.71	1.34	1.16	0.83
N7	0.01	0.02	0.07	0.17	0.01	0.12	0.00	0.20	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.15	0.16	0.04	0.66	1.15	1.03	0.75
N9	0.01	0.02	0.02	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.44	0.68	0.62	0.41
O2'	0.03	0.13	0.01	0.02	0.08	0.12	0.11	0.07	0.11	0.15	0.11	0.13	0.13	0.15	0.08	0.00	0.08	0.09	0.11	0.43	0.40	0.25
O3'	0.11	0.19	0.03	0.01	0.09	0.02	0.11	0.09	0.13	0.15	0.15	0.17	0.14	0.16	0.06	0.08	0.00	0.07	0.28	0.57	0.31	0.27
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.06	0.08	0.04	0.04	0.01	0.09	0.07	0.00	0.19	0.31	0.46	0.24
O5'	0.22	0.50	0.28	0.34	0.50	0.02	0.62	0.01	0.64	0.58	0.59	0.43	0.71	0.66	0.44	0.11	0.28	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.39	0.91	0.43	0.47	0.84	0.35	1.08	0.37	1.18	0.90	1.09	0.76	1.34	1.15	0.68	0.43	0.57	0.31	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.41	0.75	0.38	0.30	0.72	0.34	0.94	0.38	1.01	0.83	0.91	0.63	1.16	1.03	0.62	0.40	0.31	0.46	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.50	0.24	0.26	0.49	0.16	0.67	0.02	0.72	0.60	0.63	0.40	0.83	0.75	0.41	0.25	0.27	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00