Doublet Group distance statistics: 51050

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 1, 0, 2, 3, 6, 10, 5, 11, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.020, 0.031, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.020 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.011, 0.026, 0.041, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.026 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.019, 0.034, 0.050, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.034 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.011, 0.028, 0.045, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.028 std_dev=0.017
N1	A	0, 0.015, 0.033, 0.051, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.033 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.013, 0.035, 0.058, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.035 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.018, 0.041, 0.063, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.041 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.020, 0.046, 0.071, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.046 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.021, 0.057, 0.092, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.057 std_dev=0.035
N7	A	0, 0.018, 0.057, 0.095, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.057 std_dev=0.038
C8	A	0, 0.025, 0.073, 0.120, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.073 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.051, 0.121, 0.191, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.121 std_dev=0.070
C2'	A	0, 0.096, 0.185, 0.274, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.185 std_dev=0.089
C4'	A	0, 0.105, 0.212, 0.319, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.212 std_dev=0.107
C3'	A	0, 0.142, 0.271, 0.401, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.271 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.145, 0.293, 0.441, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.293 std_dev=0.148
C4	B	0, 0.289, 0.457, 0.626, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.457 std_dev=0.169
C5'	A	0, 0.183, 0.370, 0.556, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.370 std_dev=0.186
N3	B	0, 0.311, 0.514, 0.716, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.514 std_dev=0.203
N9	B	0, 0.394, 0.615, 0.837, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.615 std_dev=0.222
O3'	A	0, 0.191, 0.413, 0.635, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.413 std_dev=0.222
C2'	B	0, 0.297, 0.521, 0.745, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.521 std_dev=0.224
O3'	B	0, 0.433, 0.673, 0.913, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.673 std_dev=0.240
P	A	0, 0.255, 0.520, 0.784, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.520 std_dev=0.264
OP1	A	0, 0.275, 0.543, 0.811, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.543 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.485, 0.758, 1.031, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.758 std_dev=0.273
C2	B	0, 0.466, 0.745, 1.024, 1.266 max_d=1.266 avg_d=0.745 std_dev=0.279
O2'	B	0, 0.456, 0.742, 1.027, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.742 std_dev=0.286
C3'	B	0, 0.457, 0.751, 1.044, 1.422 max_d=1.422 avg_d=0.751 std_dev=0.293
C1'	B	0, 0.410, 0.715, 1.019, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.715 std_dev=0.305
OP2	A	0, 0.315, 0.625, 0.935, 1.418 max_d=1.418 avg_d=0.625 std_dev=0.310
O5'	A	0, 0.218, 0.530, 0.841, 1.634 max_d=1.634 avg_d=0.530 std_dev=0.311
C8	B	0, 0.659, 0.980, 1.301, 1.615 max_d=1.615 avg_d=0.980 std_dev=0.321
N1	B	0, 0.541, 0.884, 1.226, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.884 std_dev=0.343
N7	B	0, 0.729, 1.073, 1.418, 1.606 max_d=1.606 avg_d=1.073 std_dev=0.344
C6	B	0, 0.566, 0.913, 1.260, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.913 std_dev=0.347
N6	B	0, 0.820, 1.281, 1.743, 1.969 max_d=1.969 avg_d=1.281 std_dev=0.462
C4'	B	0, 0.680, 1.147, 1.614, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.147 std_dev=0.467
O5'	B	0, 0.642, 1.114, 1.586, 2.679 max_d=2.679 avg_d=1.114 std_dev=0.472
O4'	B	0, 0.679, 1.158, 1.637, 2.292 max_d=2.292 avg_d=1.158 std_dev=0.479
P	B	0, 0.588, 1.204, 1.820, 3.328 max_d=3.328 avg_d=1.204 std_dev=0.616
OP1	B	0, 1.479, 2.124, 2.768, 4.154 max_d=4.154 avg_d=2.124 std_dev=0.644
C5'	B	0, 0.974, 1.647, 2.320, 3.136 max_d=3.136 avg_d=1.647 std_dev=0.673
OP2	B	0, 1.707, 2.590, 3.473, 4.792 max_d=4.792 avg_d=2.590 std_dev=0.883

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.03	0.07	0.18	0.08
C2	0.03	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.15	0.04	0.16	0.02	0.15	0.24	0.16
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.07	0.06	0.09	0.12	0.10	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.11	0.07	0.12	0.11	0.07
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.10	0.00	0.12	0.02	0.14	0.13	0.13	0.13	0.11	0.14	0.08	0.02	0.01	0.02	0.17	0.15	0.17	0.10	0.12
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.17	0.02	0.14	0.22	0.16
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.06	0.06	0.05	0.08	0.04	0.09	0.02	0.01	0.02	0.08	0.07	0.14	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.03	0.21	0.02	0.19	0.26	0.20
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.12	0.12	0.10	0.07	0.07	0.14	0.07	0.08	0.04	0.02	0.01	0.14	0.08	0.16	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.14	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.09	0.17	0.04	0.22	0.01	0.21	0.28	0.22
C8	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.21	0.03	0.17	0.22	0.18
N1	0.04	0.01	0.09	0.13	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.12	0.16	0.04	0.19	0.02	0.18	0.26	0.19
N2	0.03	0.01	0.12	0.13	0.01	0.06	0.01	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.16	0.17	0.04	0.15	0.04	0.13	0.23	0.15
N3	0.04	0.01	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.13	0.04	0.14	0.02	0.12	0.22	0.14
N7	0.01	0.02	0.06	0.14	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.03	0.24	0.04	0.21	0.26	0.22
N9	0.01	0.02	0.03	0.08	0.01	0.04	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.08	0.01	0.15	0.03	0.12	0.20	0.13
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.07	0.09	0.06	0.08	0.09	0.04	0.12	0.16	0.13	0.05	0.03	0.00	0.05	0.06	0.09	0.09	0.13	0.11	0.07
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.11	0.02	0.15	0.04	0.17	0.14	0.16	0.17	0.13	0.17	0.08	0.05	0.00	0.02	0.20	0.19	0.25	0.18	0.18
O4'	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.09	0.05	0.08	0.21	0.10
O5'	0.08	0.16	0.11	0.17	0.17	0.02	0.21	0.01	0.22	0.21	0.19	0.15	0.14	0.24	0.15	0.09	0.20	0.09	0.00	0.24	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.07	0.15	0.02	0.08	0.02	0.14	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.09	0.19	0.05	0.24	0.00	0.24	0.31	0.25
OP1	0.07	0.15	0.12	0.17	0.14	0.07	0.19	0.08	0.21	0.17	0.18	0.13	0.12	0.21	0.12	0.13	0.25	0.08	0.02	0.24	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.24	0.11	0.10	0.22	0.14	0.26	0.16	0.28	0.22	0.26	0.23	0.22	0.26	0.20	0.11	0.18	0.21	0.02	0.31	0.02	0.00	0.01
P	0.08	0.16	0.07	0.12	0.16	0.03	0.20	0.02	0.22	0.18	0.19	0.15	0.14	0.22	0.13	0.07	0.18	0.10	0.01	0.25	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.24	0.17	0.15	0.19	0.15	0.20	0.20	0.21	0.24	0.23	0.21	0.22	0.23	0.21	0.26	0.15	0.19	0.34	0.37	0.51	0.39
C2	0.18	0.15	0.16	0.22	0.20	0.22	0.27	0.36	0.28	0.28	0.20	0.15	0.35	0.32	0.22	0.19	0.20	0.21	0.49	0.59	0.75	0.62
C2'	0.21	0.25	0.17	0.14	0.18	0.13	0.19	0.20	0.21	0.24	0.23	0.21	0.23	0.23	0.20	0.28	0.14	0.17	0.36	0.40	0.58	0.43
C3'	0.22	0.22	0.20	0.18	0.17	0.16	0.19	0.23	0.19	0.27	0.20	0.19	0.21	0.26	0.21	0.29	0.18	0.18	0.36	0.39	0.56	0.41
C4	0.18	0.15	0.16	0.21	0.18	0.22	0.21	0.34	0.19	0.25	0.16	0.15	0.23	0.26	0.20	0.21	0.20	0.20	0.46	0.53	0.68	0.56
C4'	0.23	0.24	0.20	0.12	0.16	0.13	0.17	0.13	0.17	0.24	0.21	0.21	0.19	0.22	0.20	0.32	0.12	0.19	0.25	0.29	0.40	0.28
C5	0.20	0.15	0.19	0.26	0.17	0.29	0.20	0.42	0.14	0.28	0.13	0.15	0.19	0.28	0.22	0.20	0.23	0.26	0.52	0.61	0.75	0.64
C5'	0.24	0.23	0.24	0.16	0.17	0.18	0.18	0.15	0.17	0.27	0.19	0.21	0.19	0.25	0.21	0.34	0.16	0.22	0.23	0.28	0.33	0.23
C6	0.22	0.16	0.20	0.27	0.20	0.32	0.24	0.47	0.15	0.33	0.13	0.16	0.19	0.34	0.25	0.20	0.24	0.30	0.56	0.69	0.83	0.71
C8	0.19	0.17	0.18	0.24	0.15	0.25	0.18	0.35	0.17	0.26	0.16	0.16	0.21	0.26	0.20	0.22	0.23	0.21	0.44	0.49	0.61	0.51
N1	0.20	0.15	0.18	0.25	0.21	0.28	0.27	0.42	0.24	0.32	0.13	0.15	0.31	0.35	0.24	0.19	0.22	0.26	0.54	0.66	0.81	0.69
N2	0.18	0.16	0.15	0.21	0.21	0.21	0.29	0.34	0.32	0.29	0.24	0.16	0.41	0.34	0.22	0.19	0.19	0.20	0.49	0.59	0.75	0.62
N3	0.18	0.16	0.15	0.19	0.19	0.19	0.24	0.31	0.26	0.25	0.21	0.16	0.30	0.28	0.20	0.21	0.18	0.19	0.45	0.52	0.69	0.56
N7	0.21	0.17	0.21	0.28	0.16	0.32	0.17	0.44	0.16	0.27	0.17	0.16	0.22	0.26	0.22	0.21	0.25	0.28	0.52	0.60	0.72	0.62
N9	0.19	0.18	0.16	0.19	0.17	0.19	0.19	0.28	0.18	0.24	0.17	0.16	0.20	0.24	0.20	0.22	0.19	0.18	0.41	0.46	0.60	0.48
O2'	0.26	0.31	0.20	0.15	0.22	0.16	0.22	0.18	0.26	0.24	0.31	0.26	0.28	0.24	0.23	0.32	0.15	0.22	0.32	0.35	0.53	0.38
O3'	0.22	0.23	0.21	0.19	0.16	0.17	0.19	0.24	0.19	0.28	0.21	0.20	0.22	0.27	0.21	0.32	0.20	0.18	0.37	0.40	0.58	0.42
O4'	0.24	0.24	0.18	0.14	0.18	0.14	0.19	0.16	0.19	0.25	0.22	0.21	0.20	0.22	0.21	0.28	0.14	0.20	0.28	0.31	0.41	0.30
O5'	0.17	0.22	0.20	0.06	0.15	0.06	0.18	0.11	0.19	0.25	0.21	0.20	0.21	0.24	0.17	0.29	0.02	0.10	0.25	0.32	0.38	0.27
O6	0.26	0.18	0.23	0.30	0.21	0.38	0.24	0.53	0.14	0.37	0.18	0.17	0.16	0.37	0.28	0.22	0.27	0.36	0.61	0.77	0.89	0.78
OP1	0.04	0.18	0.08	0.02	0.09	0.08	0.15	0.19	0.16	0.22	0.16	0.16	0.21	0.24	0.09	0.11	0.02	0.05	0.23	0.34	0.32	0.24
OP2	0.11	0.24	0.15	0.07	0.20	0.15	0.26	0.28	0.28	0.28	0.26	0.21	0.33	0.32	0.17	0.15	0.02	0.13	0.33	0.43	0.40	0.35
P	0.06	0.18	0.10	0.02	0.11	0.07	0.16	0.16	0.17	0.23	0.17	0.16	0.21	0.24	0.11	0.13	0.01	0.03	0.23	0.32	0.32	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.24	0.25	0.16	0.21
C2	0.03	0.00	0.15	0.13	0.01	0.05	0.01	0.18	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.18	0.05	0.39	0.41	0.49	0.43
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.09	0.12	0.15	0.08	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.17	0.23	0.15	0.15
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.06	0.01	0.08	0.02	0.07	0.17	0.09	0.13	0.09	0.15	0.06	0.02	0.01	0.02	0.16	0.26	0.16	0.15
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.05	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.07	0.02	0.40	0.41	0.44	0.42
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.08	0.14	0.06	0.05	0.10	0.13	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.15	0.17	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.09	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.09	0.08	0.03	0.48	0.52	0.57	0.54
C5'	0.07	0.18	0.03	0.02	0.20	0.01	0.26	0.00	0.27	0.29	0.23	0.15	0.30	0.32	0.19	0.06	0.06	0.02	0.01	0.25	0.26	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.07	0.01	0.08	0.01	0.27	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.09	0.03	0.48	0.55	0.63	0.57
C8	0.01	0.02	0.09	0.17	0.01	0.14	0.01	0.29	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.18	0.04	0.49	0.51	0.46	0.50
N1	0.03	0.00	0.12	0.09	0.01	0.06	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.13	0.04	0.44	0.49	0.59	0.51
N3	0.03	0.00	0.15	0.13	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.19	0.17	0.05	0.35	0.36	0.41	0.37
N6	0.03	0.01	0.08	0.09	0.02	0.10	0.02	0.30	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.11	0.12	0.04	0.52	0.63	0.71	0.63
N7	0.02	0.02	0.07	0.15	0.01	0.13	0.00	0.32	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.17	0.04	0.53	0.59	0.61	0.59
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.07	0.01	0.19	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.38	0.38	0.34	0.37
O2'	0.02	0.20	0.01	0.02	0.11	0.06	0.09	0.06	0.12	0.05	0.17	0.19	0.11	0.05	0.03	0.00	0.04	0.07	0.05	0.16	0.11	0.09
O3'	0.02	0.18	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.06	0.09	0.18	0.13	0.17	0.12	0.17	0.06	0.04	0.00	0.02	0.18	0.29	0.26	0.19
O4'	0.00	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.07	0.02	0.00	0.22	0.25	0.17	0.20
O5'	0.24	0.39	0.17	0.16	0.40	0.02	0.48	0.01	0.48	0.49	0.44	0.35	0.52	0.53	0.38	0.05	0.18	0.22	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.25	0.41	0.23	0.26	0.41	0.15	0.52	0.25	0.55	0.51	0.49	0.36	0.63	0.59	0.38	0.16	0.29	0.25	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.49	0.15	0.16	0.44	0.17	0.57	0.26	0.63	0.46	0.59	0.41	0.71	0.61	0.34	0.11	0.26	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.43	0.15	0.15	0.42	0.05	0.54	0.02	0.57	0.50	0.51	0.37	0.63	0.59	0.37	0.09	0.19	0.20	0.00	0.01	0.01	0.00