Doublet Group distance statistics: 51051

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 4, 4, 5, 9, 3, 2, 1, 3, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.018, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.007, 0.019, 0.032, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.019 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.020 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.005, 0.022, 0.038, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.000, 0.018, 0.037, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.027 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.002, 0.023, 0.044, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.023 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.015, 0.040, 0.065, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.040 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.009, 0.035, 0.060, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.035 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.016, 0.043, 0.071, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.043 std_dev=0.027
N2	A	0, 0.004, 0.041, 0.078, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.041 std_dev=0.037
N1	B	0, 0.199, 0.363, 0.527, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.363 std_dev=0.164
O4'	A	0, 0.009, 0.179, 0.350, 0.810 max_d=0.810 avg_d=0.179 std_dev=0.170
C2'	A	0, 0.005, 0.176, 0.347, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.176 std_dev=0.171
C6	B	0, 0.143, 0.352, 0.562, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.352 std_dev=0.209
C2	B	0, 0.176, 0.404, 0.632, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.404 std_dev=0.228
N6	B	0, 0.216, 0.461, 0.705, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.461 std_dev=0.245
C4	B	0, 0.198, 0.445, 0.693, 1.175 max_d=1.175 avg_d=0.445 std_dev=0.248
C5	B	0, 0.136, 0.389, 0.643, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.389 std_dev=0.253
N3	B	0, 0.202, 0.467, 0.733, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.467 std_dev=0.265
O2'	A	0, -0.016, 0.277, 0.570, 1.762 max_d=1.762 avg_d=0.277 std_dev=0.293
C3'	A	0, 0.016, 0.319, 0.622, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.319 std_dev=0.303
C4'	A	0, 0.029, 0.332, 0.635, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.332 std_dev=0.303
N9	B	0, 0.234, 0.559, 0.885, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.559 std_dev=0.325
N7	B	0, 0.187, 0.513, 0.839, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.513 std_dev=0.326
C8	B	0, 0.224, 0.583, 0.943, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.583 std_dev=0.359
C1'	B	0, 0.289, 0.708, 1.126, 1.656 max_d=1.656 avg_d=0.708 std_dev=0.418
O3'	A	0, -0.011, 0.437, 0.885, 2.470 max_d=2.470 avg_d=0.437 std_dev=0.448
C2'	B	0, 0.274, 0.747, 1.219, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.747 std_dev=0.473
C5'	A	0, 0.142, 0.618, 1.093, 2.260 max_d=2.260 avg_d=0.618 std_dev=0.475
O4'	B	0, 0.346, 0.882, 1.418, 2.128 max_d=2.128 avg_d=0.882 std_dev=0.536
C3'	B	0, 0.342, 0.948, 1.555, 2.125 max_d=2.125 avg_d=0.948 std_dev=0.607
O2'	B	0, 0.330, 0.956, 1.582, 2.229 max_d=2.229 avg_d=0.956 std_dev=0.626
O5'	B	0, 0.810, 1.439, 2.069, 2.415 max_d=2.415 avg_d=1.439 std_dev=0.629
C4'	B	0, 0.418, 1.091, 1.764, 2.550 max_d=2.550 avg_d=1.091 std_dev=0.673
O5'	A	0, 0.285, 1.015, 1.745, 2.308 max_d=2.308 avg_d=1.015 std_dev=0.730
P	B	0, 0.903, 1.658, 2.413, 3.262 max_d=3.262 avg_d=1.658 std_dev=0.755
O3'	B	0, 0.371, 1.138, 1.905, 2.422 max_d=2.422 avg_d=1.138 std_dev=0.767
C5'	B	0, 0.543, 1.345, 2.147, 3.109 max_d=3.109 avg_d=1.345 std_dev=0.802
P	A	0, 0.377, 1.193, 2.009, 2.554 max_d=2.554 avg_d=1.193 std_dev=0.816
OP2	A	0, 0.425, 1.311, 2.197, 2.707 max_d=2.707 avg_d=1.311 std_dev=0.886
OP2	B	0, 0.747, 1.729, 2.710, 4.781 max_d=4.781 avg_d=1.729 std_dev=0.982
OP1	B	0, 1.091, 2.082, 3.073, 4.721 max_d=4.721 avg_d=2.082 std_dev=0.991
OP1	A	0, 0.400, 1.421, 2.441, 3.244 max_d=3.244 avg_d=1.421 std_dev=1.020

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.19	0.03	0.20	0.32	0.12
C2	0.05	0.00	0.14	0.20	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.17	0.07	0.41	0.02	0.37	0.54	0.35
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.07	0.03	0.05	0.04	0.07	0.09	0.11	0.17	0.14	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.28	0.07	0.33	0.29	0.21
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.16	0.01	0.19	0.03	0.21	0.15	0.22	0.20	0.17	0.18	0.12	0.02	0.01	0.02	0.35	0.23	0.41	0.24	0.25
C4	0.02	0.01	0.07	0.16	0.00	0.07	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.03	0.44	0.02	0.38	0.51	0.36
C4'	0.01	0.06	0.03	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.12	0.13	0.09	0.05	0.04	0.14	0.07	0.13	0.03	0.00	0.02	0.14	0.20	0.35	0.07
C5	0.02	0.01	0.05	0.19	0.01	0.11	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.15	0.02	0.56	0.02	0.51	0.64	0.49
C5'	0.04	0.16	0.04	0.03	0.18	0.01	0.26	0.00	0.27	0.26	0.22	0.13	0.13	0.30	0.16	0.10	0.07	0.02	0.01	0.32	0.25	0.44	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.21	0.01	0.12	0.01	0.27	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.16	0.18	0.03	0.57	0.01	0.55	0.70	0.53
C8	0.02	0.02	0.09	0.15	0.01	0.13	0.01	0.26	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.14	0.13	0.06	0.56	0.03	0.47	0.55	0.46
N1	0.04	0.01	0.11	0.22	0.02	0.09	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.14	0.18	0.05	0.50	0.02	0.47	0.64	0.46
N2	0.06	0.01	0.17	0.20	0.01	0.05	0.01	0.13	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.14	0.20	0.09	0.36	0.03	0.33	0.51	0.31
N3	0.05	0.01	0.14	0.17	0.01	0.04	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.15	0.07	0.36	0.01	0.32	0.47	0.29
N7	0.01	0.01	0.07	0.18	0.01	0.14	0.01	0.30	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.17	0.16	0.05	0.62	0.04	0.58	0.69	0.56
N9	0.01	0.02	0.02	0.12	0.01	0.07	0.01	0.16	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.09	0.07	0.02	0.41	0.03	0.33	0.44	0.30
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.11	0.13	0.15	0.10	0.16	0.14	0.14	0.14	0.11	0.17	0.09	0.00	0.05	0.09	0.09	0.18	0.24	0.29	0.12
O3'	0.08	0.17	0.03	0.01	0.12	0.03	0.15	0.07	0.18	0.13	0.18	0.20	0.15	0.16	0.07	0.05	0.00	0.04	0.25	0.21	0.42	0.24	0.22
O4'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.09	0.07	0.05	0.02	0.09	0.04	0.00	0.12	0.04	0.18	0.36	0.13
O5'	0.19	0.41	0.28	0.35	0.44	0.02	0.56	0.01	0.57	0.56	0.50	0.36	0.36	0.62	0.41	0.09	0.25	0.12	0.00	0.63	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.07	0.23	0.02	0.14	0.02	0.32	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.04	0.03	0.18	0.21	0.04	0.63	0.00	0.64	0.78	0.61
OP1	0.20	0.37	0.33	0.41	0.38	0.20	0.51	0.25	0.55	0.47	0.47	0.33	0.32	0.58	0.33	0.24	0.42	0.18	0.02	0.64	0.00	0.02	0.01
OP2	0.32	0.54	0.29	0.24	0.51	0.35	0.64	0.44	0.70	0.55	0.64	0.51	0.47	0.69	0.44	0.29	0.24	0.36	0.02	0.78	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.35	0.21	0.25	0.36	0.07	0.49	0.02	0.53	0.46	0.46	0.31	0.29	0.56	0.30	0.12	0.22	0.13	0.01	0.61	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.30	0.18	0.21	0.18	0.19	0.19	0.23	0.22	0.22	0.26	0.25	0.23	0.22	0.18	0.23	0.22	0.19	0.61	0.72	0.77	0.65
C2	0.20	0.17	0.20	0.26	0.18	0.23	0.21	0.29	0.20	0.26	0.16	0.17	0.26	0.27	0.21	0.20	0.28	0.21	0.70	0.79	1.05	0.77
C2'	0.19	0.31	0.19	0.23	0.18	0.21	0.18	0.25	0.21	0.22	0.27	0.26	0.23	0.21	0.17	0.25	0.26	0.19	0.65	0.82	0.82	0.71
C3'	0.23	0.29	0.26	0.25	0.18	0.25	0.17	0.28	0.19	0.22	0.25	0.26	0.22	0.22	0.18	0.36	0.32	0.23	0.67	0.89	0.80	0.73
C4	0.20	0.21	0.22	0.26	0.15	0.24	0.16	0.29	0.16	0.23	0.20	0.17	0.21	0.23	0.19	0.22	0.30	0.20	0.70	0.81	0.99	0.76
C4'	0.24	0.33	0.23	0.19	0.21	0.20	0.18	0.23	0.20	0.21	0.26	0.32	0.21	0.21	0.19	0.39	0.21	0.21	0.59	0.77	0.67	0.63
C5	0.25	0.20	0.29	0.35	0.18	0.32	0.18	0.38	0.14	0.28	0.19	0.18	0.20	0.27	0.24	0.28	0.40	0.27	0.76	0.90	1.11	0.85
C5'	0.38	0.33	0.43	0.28	0.24	0.33	0.17	0.28	0.17	0.22	0.24	0.36	0.20	0.21	0.24	0.67	0.33	0.35	0.59	0.84	0.64	0.64
C6	0.27	0.18	0.30	0.37	0.22	0.35	0.23	0.42	0.17	0.32	0.16	0.18	0.22	0.32	0.27	0.27	0.42	0.29	0.79	0.93	1.20	0.89
C8	0.26	0.27	0.33	0.34	0.18	0.31	0.15	0.33	0.21	0.22	0.25	0.25	0.25	0.21	0.21	0.35	0.40	0.26	0.73	0.88	0.98	0.79
N1	0.23	0.18	0.25	0.32	0.21	0.29	0.24	0.36	0.20	0.30	0.16	0.18	0.26	0.31	0.25	0.22	0.35	0.25	0.75	0.87	1.15	0.84
N2	0.20	0.17	0.20	0.24	0.19	0.22	0.23	0.27	0.22	0.25	0.18	0.18	0.29	0.27	0.21	0.20	0.26	0.21	0.68	0.76	1.03	0.75
N3	0.19	0.18	0.19	0.23	0.16	0.21	0.18	0.25	0.18	0.22	0.18	0.16	0.23	0.23	0.19	0.19	0.25	0.19	0.67	0.76	0.96	0.73
N7	0.30	0.22	0.36	0.41	0.20	0.38	0.15	0.43	0.17	0.28	0.22	0.22	0.23	0.24	0.26	0.35	0.47	0.32	0.79	0.95	1.12	0.88
N9	0.19	0.27	0.22	0.24	0.15	0.22	0.15	0.25	0.19	0.21	0.24	0.22	0.22	0.21	0.17	0.25	0.28	0.19	0.67	0.79	0.91	0.72
O2'	0.28	0.35	0.26	0.28	0.24	0.27	0.21	0.29	0.24	0.24	0.30	0.32	0.25	0.23	0.24	0.35	0.30	0.27	0.58	0.72	0.72	0.62
O3'	0.23	0.31	0.24	0.24	0.18	0.25	0.17	0.28	0.19	0.22	0.26	0.27	0.21	0.21	0.19	0.36	0.30	0.23	0.65	0.90	0.76	0.72
O4'	0.19	0.32	0.17	0.20	0.20	0.18	0.21	0.23	0.23	0.23	0.27	0.29	0.24	0.24	0.18	0.27	0.22	0.17	0.59	0.72	0.70	0.62
O5'	0.24	0.38	0.27	0.11	0.32	0.08	0.35	0.13	0.38	0.30	0.39	0.35	0.40	0.34	0.27	0.38	0.02	0.16	0.56	0.78	0.51	0.57
O6	0.31	0.19	0.34	0.44	0.24	0.41	0.26	0.50	0.18	0.37	0.18	0.20	0.22	0.36	0.31	0.31	0.49	0.35	0.84	1.01	1.29	0.96
OP1	0.06	0.26	0.12	0.03	0.16	0.12	0.19	0.22	0.24	0.16	0.27	0.22	0.27	0.20	0.09	0.21	0.03	0.08	0.44	0.82	0.38	0.48
OP2	0.14	0.40	0.19	0.06	0.32	0.16	0.36	0.33	0.42	0.28	0.43	0.34	0.44	0.35	0.23	0.20	0.02	0.12	0.81	1.24	0.69	0.87
P	0.07	0.25	0.13	0.01	0.18	0.08	0.21	0.18	0.25	0.18	0.26	0.21	0.27	0.22	0.12	0.20	0.01	0.03	0.54	0.86	0.40	0.55

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.18	0.20	0.21	0.16
C2	0.03	0.00	0.11	0.11	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.15	0.04	0.41	0.42	0.67	0.43
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.06	0.09	0.10	0.06	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.26	0.28	0.20	0.22
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.11	0.12	0.11	0.10	0.12	0.12	0.06	0.03	0.01	0.01	0.36	0.44	0.18	0.29
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.10	0.02	0.44	0.40	0.64	0.43
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.03	0.08	0.09	0.04	0.06	0.03	0.01	0.02	0.13	0.24	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.12	0.02	0.57	0.55	0.87	0.60
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.13	0.15	0.10	0.05	0.17	0.17	0.08	0.06	0.03	0.02	0.01	0.26	0.39	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.09	0.14	0.03	0.58	0.58	0.95	0.63
C8	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.04	0.13	0.04	0.59	0.53	0.75	0.57
N1	0.03	0.01	0.09	0.11	0.01	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.15	0.04	0.51	0.50	0.84	0.54
N3	0.03	0.01	0.10	0.10	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.14	0.13	0.05	0.35	0.36	0.54	0.35
N6	0.03	0.02	0.06	0.12	0.02	0.08	0.02	0.17	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.09	0.15	0.04	0.65	0.68	1.09	0.72
N7	0.01	0.02	0.05	0.12	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.14	0.03	0.66	0.64	0.97	0.70
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.41	0.35	0.52	0.38
O2'	0.02	0.15	0.00	0.03	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.04	0.13	0.14	0.09	0.04	0.03	0.00	0.06	0.05	0.07	0.16	0.12	0.08
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.10	0.03	0.12	0.03	0.14	0.13	0.15	0.13	0.15	0.14	0.06	0.06	0.00	0.02	0.30	0.48	0.22	0.26
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.10	0.20	0.15	0.11
O5'	0.18	0.41	0.26	0.36	0.44	0.02	0.57	0.01	0.58	0.59	0.51	0.35	0.65	0.66	0.41	0.07	0.30	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.42	0.28	0.44	0.40	0.13	0.55	0.26	0.58	0.53	0.50	0.36	0.68	0.64	0.35	0.16	0.48	0.20	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.67	0.20	0.18	0.64	0.24	0.87	0.39	0.95	0.75	0.84	0.54	1.09	0.97	0.52	0.12	0.22	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.43	0.22	0.29	0.43	0.05	0.60	0.02	0.63	0.57	0.54	0.35	0.72	0.70	0.38	0.08	0.26	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00