Doublet Group distance statistics: 51052

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 2, 2, 4, 1, 0, 2, 4, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.022, 0.031, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.031 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.013, 0.022, 0.031, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.034, 0.049, 0.064, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.049 std_dev=0.015
C5	A	0, 0.038, 0.053, 0.067, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.053 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.037, 0.052, 0.067, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.052 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.036, 0.053, 0.070, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.053 std_dev=0.017
N2	A	0, 0.040, 0.060, 0.080, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.060 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.050, 0.072, 0.094, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.072 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.037, 0.062, 0.088, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.062 std_dev=0.026
N7	A	0, 0.065, 0.093, 0.121, 0.149 max_d=0.149 avg_d=0.093 std_dev=0.028
O6	A	0, 0.076, 0.106, 0.135, 0.162 max_d=0.162 avg_d=0.106 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.077, 0.113, 0.148, 0.194 max_d=0.194 avg_d=0.113 std_dev=0.035
O4'	A	0, 0.131, 0.223, 0.314, 0.358 max_d=0.358 avg_d=0.223 std_dev=0.092
C2'	A	0, 0.167, 0.268, 0.369, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.268 std_dev=0.101
C3'	A	0, 0.264, 0.418, 0.571, 0.691 max_d=0.691 avg_d=0.418 std_dev=0.154
C4'	A	0, 0.379, 0.539, 0.698, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.539 std_dev=0.159
O2'	A	0, 0.417, 0.602, 0.786, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.602 std_dev=0.184
N9	B	0, 0.256, 0.458, 0.659, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.458 std_dev=0.201
C4	B	0, 0.273, 0.500, 0.727, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.500 std_dev=0.227
C5	B	0, 0.354, 0.583, 0.813, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.583 std_dev=0.229
C8	B	0, 0.306, 0.541, 0.776, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.541 std_dev=0.235
N7	B	0, 0.388, 0.641, 0.893, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.641 std_dev=0.252
O3'	A	0, 0.497, 0.758, 1.020, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.758 std_dev=0.261
C1'	B	0, 0.457, 0.740, 1.024, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.740 std_dev=0.283
O4'	B	0, 0.587, 0.872, 1.157, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.872 std_dev=0.285
C5'	A	0, 0.686, 1.007, 1.328, 1.795 max_d=1.795 avg_d=1.007 std_dev=0.321
N3	B	0, 0.446, 0.797, 1.148, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.797 std_dev=0.351
C6	B	0, 0.505, 0.883, 1.261, 1.398 max_d=1.398 avg_d=0.883 std_dev=0.378
C4'	B	0, 0.835, 1.295, 1.755, 1.919 max_d=1.919 avg_d=1.295 std_dev=0.460
C2	B	0, 0.532, 0.995, 1.458, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.995 std_dev=0.463
N1	B	0, 0.552, 1.042, 1.532, 1.725 max_d=1.725 avg_d=1.042 std_dev=0.490
N6	B	0, 0.647, 1.162, 1.677, 1.887 max_d=1.887 avg_d=1.162 std_dev=0.515
C2'	B	0, 0.757, 1.278, 1.798, 1.871 max_d=1.871 avg_d=1.278 std_dev=0.521
C5'	B	0, 1.227, 1.779, 2.331, 2.546 max_d=2.546 avg_d=1.779 std_dev=0.552
C3'	B	0, 0.968, 1.602, 2.236, 2.323 max_d=2.323 avg_d=1.602 std_dev=0.634
O2'	B	0, 1.021, 1.672, 2.323, 2.453 max_d=2.453 avg_d=1.672 std_dev=0.651
O5'	B	0, 1.789, 2.597, 3.405, 4.026 max_d=4.026 avg_d=2.597 std_dev=0.808
O5'	A	0, 1.700, 2.544, 3.389, 3.277 max_d=3.277 avg_d=2.544 std_dev=0.845
O3'	B	0, 1.333, 2.196, 3.059, 3.158 max_d=3.158 avg_d=2.196 std_dev=0.863
P	A	0, 2.070, 3.056, 4.043, 3.973 max_d=3.973 avg_d=3.056 std_dev=0.986
OP2	A	0, 2.493, 3.562, 4.631, 4.554 max_d=4.554 avg_d=3.562 std_dev=1.069
OP1	A	0, 2.884, 4.002, 5.121, 4.887 max_d=4.887 avg_d=4.002 std_dev=1.119
P	B	0, 2.691, 3.885, 5.080, 6.453 max_d=6.453 avg_d=3.885 std_dev=1.194
OP1	B	0, 2.039, 3.313, 4.587, 6.762 max_d=6.762 avg_d=3.313 std_dev=1.274
OP2	B	0, 3.708, 5.279, 6.850, 7.390 max_d=7.390 avg_d=5.279 std_dev=1.571

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.23	0.01	0.23	0.17	0.10
C2	0.03	0.00	0.10	0.14	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.16	0.03	0.45	0.01	0.39	0.27	0.32
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.04	0.08	0.11	0.09	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.26	0.06	0.34	0.08	0.16
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.12	0.09	0.13	0.15	0.12	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.33	0.12	0.44	0.09	0.24
C4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.48	0.01	0.40	0.24	0.33
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.09	0.08	0.08	0.07	0.06	0.09	0.04	0.06	0.01	0.00	0.01	0.10	0.20	0.30	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.61	0.01	0.50	0.38	0.46
C5'	0.03	0.13	0.02	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.19	0.16	0.17	0.12	0.11	0.19	0.11	0.07	0.04	0.01	0.01	0.22	0.27	0.40	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.09	0.01	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.02	0.62	0.00	0.52	0.43	0.50
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.62	0.02	0.47	0.28	0.43
N1	0.02	0.00	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.02	0.54	0.01	0.46	0.37	0.42
N2	0.04	0.00	0.11	0.15	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.18	0.04	0.40	0.02	0.36	0.24	0.29
N3	0.03	0.00	0.09	0.12	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.39	0.01	0.34	0.20	0.26
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.13	0.03	0.68	0.02	0.55	0.42	0.53
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.46	0.01	0.36	0.17	0.28
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.07	0.07	0.03	0.09	0.13	0.10	0.03	0.03	0.00	0.04	0.06	0.08	0.06	0.20	0.19	0.08
O3'	0.02	0.16	0.02	0.01	0.10	0.01	0.12	0.04	0.15	0.11	0.16	0.18	0.13	0.13	0.05	0.04	0.00	0.01	0.23	0.16	0.46	0.16	0.24
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.10	0.03	0.14	0.31	0.08
O5'	0.23	0.45	0.26	0.33	0.48	0.01	0.61	0.01	0.62	0.62	0.54	0.40	0.39	0.68	0.46	0.08	0.23	0.10	0.00	0.67	0.02	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.06	0.12	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.16	0.03	0.67	0.00	0.58	0.53	0.57
OP1	0.23	0.39	0.34	0.44	0.40	0.20	0.50	0.27	0.52	0.47	0.46	0.36	0.34	0.55	0.36	0.20	0.46	0.14	0.02	0.58	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.27	0.08	0.09	0.24	0.30	0.38	0.40	0.43	0.28	0.37	0.24	0.20	0.42	0.17	0.19	0.16	0.31	0.01	0.53	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.32	0.16	0.24	0.33	0.03	0.46	0.02	0.50	0.43	0.42	0.29	0.26	0.53	0.28	0.08	0.24	0.08	0.01	0.57	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.30	0.17	0.16	0.13	0.16	0.12	0.28	0.14	0.20	0.23	0.27	0.18	0.23	0.11	0.30	0.14	0.14	0.76	0.71	1.36	0.94
C2	0.22	0.42	0.24	0.26	0.23	0.27	0.22	0.37	0.29	0.29	0.42	0.32	0.29	0.29	0.22	0.29	0.26	0.26	1.02	1.02	2.06	1.34
C2'	0.11	0.33	0.15	0.15	0.13	0.14	0.13	0.28	0.16	0.20	0.25	0.28	0.19	0.23	0.10	0.31	0.16	0.12	0.70	0.75	1.32	0.91
C3'	0.15	0.30	0.23	0.20	0.12	0.19	0.13	0.30	0.15	0.21	0.22	0.27	0.20	0.24	0.09	0.40	0.25	0.14	0.61	0.74	1.16	0.83
C4	0.21	0.34	0.26	0.27	0.19	0.27	0.17	0.36	0.24	0.25	0.33	0.28	0.28	0.25	0.19	0.32	0.28	0.25	0.96	0.97	1.87	1.25
C4'	0.16	0.33	0.21	0.14	0.17	0.14	0.15	0.27	0.16	0.22	0.25	0.31	0.18	0.24	0.12	0.41	0.14	0.11	0.54	0.61	0.99	0.71
C5	0.28	0.31	0.34	0.38	0.19	0.37	0.18	0.45	0.28	0.29	0.34	0.25	0.37	0.25	0.23	0.37	0.41	0.34	1.04	1.15	2.07	1.39
C5'	0.29	0.37	0.37	0.19	0.23	0.21	0.17	0.27	0.18	0.22	0.27	0.38	0.19	0.24	0.19	0.60	0.24	0.21	0.44	0.56	0.89	0.62
C6	0.30	0.34	0.35	0.40	0.22	0.40	0.21	0.50	0.33	0.33	0.39	0.26	0.43	0.28	0.26	0.36	0.43	0.37	1.10	1.25	2.27	1.50
C8	0.26	0.25	0.37	0.36	0.16	0.33	0.14	0.40	0.22	0.21	0.24	0.24	0.30	0.22	0.18	0.41	0.40	0.30	0.90	0.98	1.68	1.18
N1	0.26	0.39	0.29	0.33	0.23	0.34	0.23	0.44	0.33	0.32	0.43	0.30	0.38	0.30	0.25	0.32	0.35	0.32	1.08	1.17	2.23	1.46
N2	0.22	0.45	0.23	0.23	0.24	0.25	0.23	0.35	0.28	0.29	0.44	0.35	0.27	0.31	0.22	0.29	0.23	0.24	1.02	0.99	2.07	1.33
N3	0.20	0.39	0.22	0.22	0.21	0.23	0.19	0.33	0.24	0.25	0.37	0.31	0.23	0.27	0.19	0.29	0.22	0.22	0.96	0.92	1.88	1.23
N7	0.32	0.25	0.41	0.45	0.18	0.43	0.16	0.49	0.26	0.26	0.28	0.23	0.37	0.21	0.24	0.43	0.49	0.38	1.02	1.18	1.98	1.37
N9	0.18	0.29	0.25	0.23	0.15	0.23	0.14	0.33	0.19	0.22	0.26	0.26	0.24	0.24	0.14	0.33	0.25	0.21	0.88	0.87	1.63	1.12
O2'	0.17	0.36	0.17	0.20	0.17	0.18	0.14	0.29	0.15	0.21	0.26	0.31	0.18	0.22	0.15	0.30	0.18	0.17	0.69	0.69	1.24	0.86
O3'	0.15	0.31	0.22	0.19	0.12	0.18	0.12	0.30	0.14	0.21	0.22	0.27	0.20	0.24	0.09	0.41	0.25	0.13	0.55	0.74	1.08	0.78
O4'	0.12	0.31	0.17	0.16	0.15	0.15	0.15	0.27	0.17	0.22	0.24	0.29	0.19	0.24	0.09	0.34	0.16	0.11	0.66	0.61	1.12	0.79
O5'	0.19	0.30	0.21	0.08	0.25	0.06	0.29	0.14	0.29	0.31	0.30	0.28	0.31	0.33	0.23	0.29	0.02	0.11	0.25	0.61	0.59	0.38
O6	0.34	0.32	0.39	0.47	0.22	0.48	0.22	0.57	0.34	0.35	0.39	0.24	0.46	0.27	0.28	0.40	0.51	0.43	1.14	1.40	2.42	1.60
OP1	0.09	0.24	0.14	0.02	0.16	0.08	0.18	0.19	0.20	0.20	0.23	0.21	0.20	0.22	0.12	0.20	0.02	0.03	0.27	0.60	0.59	0.31
OP2	0.14	0.25	0.15	0.10	0.21	0.19	0.25	0.32	0.26	0.26	0.25	0.23	0.28	0.29	0.19	0.14	0.02	0.16	0.36	0.91	0.74	0.55
P	0.06	0.18	0.11	0.01	0.12	0.07	0.16	0.17	0.16	0.20	0.17	0.16	0.18	0.21	0.11	0.15	0.01	0.03	0.18	0.60	0.44	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.37	0.26	0.54	0.33
C2	0.04	0.00	0.11	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.11	0.06	0.62	0.28	1.14	0.68
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.07	0.08	0.11	0.04	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.21	0.30	0.33	0.19
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.08	0.02	0.07	0.14	0.06	0.07	0.09	0.13	0.06	0.02	0.01	0.02	0.15	0.30	0.27	0.16
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.10	0.05	0.03	0.66	0.29	1.17	0.72
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.06	0.11	0.03	0.04	0.10	0.11	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.32	0.14	0.11
C5	0.01	0.01	0.03	0.08	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.81	0.48	1.54	0.95
C5'	0.03	0.08	0.02	0.02	0.11	0.01	0.17	0.00	0.17	0.20	0.12	0.06	0.23	0.22	0.11	0.04	0.04	0.01	0.01	0.12	0.17	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.11	0.07	0.04	0.82	0.51	1.62	0.99
C8	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.11	0.01	0.20	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.15	0.05	0.84	0.50	1.46	0.94
N1	0.04	0.00	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.16	0.08	0.04	0.73	0.39	1.42	0.85
N3	0.04	0.01	0.11	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.10	0.06	0.55	0.25	0.97	0.57
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.10	0.02	0.23	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.10	0.10	0.06	0.91	0.68	1.85	1.14
N7	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.11	0.01	0.22	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.05	0.15	0.04	0.91	0.64	1.74	1.10
N9	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.64	0.26	1.05	0.66
O2'	0.01	0.19	0.01	0.02	0.10	0.04	0.08	0.04	0.11	0.04	0.16	0.17	0.10	0.05	0.03	0.00	0.04	0.05	0.07	0.53	0.23	0.21
O3'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.05	0.02	0.08	0.04	0.07	0.15	0.08	0.10	0.10	0.15	0.06	0.04	0.00	0.02	0.22	0.46	0.36	0.24
O4'	0.00	0.06	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.06	0.06	0.04	0.01	0.05	0.02	0.00	0.32	0.31	0.41	0.27
O5'	0.37	0.62	0.21	0.15	0.66	0.02	0.81	0.01	0.82	0.84	0.73	0.55	0.91	0.91	0.64	0.07	0.22	0.32	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.26	0.28	0.30	0.30	0.29	0.32	0.48	0.12	0.51	0.50	0.39	0.25	0.68	0.64	0.26	0.53	0.46	0.31	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.54	1.14	0.33	0.27	1.17	0.14	1.54	0.17	1.62	1.46	1.42	0.97	1.85	1.74	1.05	0.23	0.36	0.41	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.33	0.68	0.19	0.16	0.72	0.11	0.95	0.01	0.99	0.94	0.85	0.57	1.14	1.10	0.66	0.21	0.24	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00