Doublet Group distance statistics: 51053

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 3, 1, 3, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.013, 0.023, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.023 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.014, 0.025, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.014, 0.026, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.026 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.013, 0.026, 0.038, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.010, 0.026, 0.041, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.019, 0.034, 0.050, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.016
O6	A	0, 0.018, 0.034, 0.050, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.016
N2	A	0, 0.027, 0.048, 0.069, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.048 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.014, 0.038, 0.062, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.038 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.011, 0.039, 0.067, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.039 std_dev=0.028
C2'	A	0, 0.098, 0.205, 0.313, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.205 std_dev=0.107
O4'	A	0, 0.029, 0.173, 0.317, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.173 std_dev=0.144
O2'	A	0, 0.153, 0.301, 0.449, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.301 std_dev=0.148
C3'	A	0, 0.213, 0.389, 0.564, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.389 std_dev=0.175
O5'	A	0, 0.195, 0.394, 0.593, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.394 std_dev=0.199
N3	B	0, 0.249, 0.454, 0.660, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.454 std_dev=0.206
C2	B	0, 0.241, 0.450, 0.659, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.450 std_dev=0.209
C4	B	0, 0.313, 0.527, 0.740, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.527 std_dev=0.214
N1	B	0, 0.268, 0.498, 0.727, 0.826 max_d=0.826 avg_d=0.498 std_dev=0.230
C4'	A	0, 0.090, 0.323, 0.556, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.323 std_dev=0.233
C5	B	0, 0.315, 0.574, 0.832, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.574 std_dev=0.259
C2'	B	0, 0.368, 0.627, 0.886, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.627 std_dev=0.259
C6	B	0, 0.283, 0.547, 0.811, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.547 std_dev=0.264
O3'	A	0, 0.368, 0.637, 0.905, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.637 std_dev=0.269
N9	B	0, 0.393, 0.664, 0.934, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.664 std_dev=0.271
C3'	B	0, 0.348, 0.621, 0.893, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.621 std_dev=0.272
P	A	0, 0.230, 0.526, 0.822, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.526 std_dev=0.296
C1'	B	0, 0.442, 0.740, 1.037, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.740 std_dev=0.297
OP2	A	0, 0.295, 0.604, 0.913, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.604 std_dev=0.309
O3'	B	0, 0.273, 0.620, 0.968, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.620 std_dev=0.347
N6	B	0, 0.305, 0.657, 1.010, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.657 std_dev=0.352
N7	B	0, 0.376, 0.731, 1.087, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.731 std_dev=0.356
C8	B	0, 0.414, 0.771, 1.128, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.771 std_dev=0.357
O2'	B	0, 0.447, 0.809, 1.171, 1.580 max_d=1.580 avg_d=0.809 std_dev=0.362
O4'	B	0, 0.487, 0.896, 1.305, 1.609 max_d=1.609 avg_d=0.896 std_dev=0.409
OP1	A	0, 0.285, 0.705, 1.125, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.705 std_dev=0.420
C4'	B	0, 0.434, 0.861, 1.288, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.861 std_dev=0.427
C5'	A	0, 0.059, 0.491, 0.922, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.491 std_dev=0.431
O5'	B	0, 0.554, 1.093, 1.632, 2.088 max_d=2.088 avg_d=1.093 std_dev=0.539
C5'	B	0, 0.481, 1.091, 1.700, 2.097 max_d=2.097 avg_d=1.091 std_dev=0.609
OP2	B	0, 0.563, 1.330, 2.098, 2.944 max_d=2.944 avg_d=1.330 std_dev=0.767
P	B	0, 0.615, 1.392, 2.169, 2.798 max_d=2.798 avg_d=1.392 std_dev=0.777
OP1	B	0, 0.586, 1.976, 3.365, 5.396 max_d=5.396 avg_d=1.976 std_dev=1.390

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.06	0.02	0.06	0.17	0.08
C2	0.02	0.00	0.13	0.15	0.01	0.08	0.01	0.20	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.18	0.04	0.14	0.01	0.21	0.37	0.21
C2'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.07	0.02	0.04	0.02	0.07	0.07	0.10	0.16	0.12	0.05	0.02	0.00	0.03	0.01	0.13	0.06	0.14	0.11	0.10
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.09	0.01	0.09	0.02	0.12	0.10	0.14	0.18	0.14	0.09	0.05	0.03	0.01	0.02	0.21	0.12	0.20	0.12	0.16
C4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.03	0.13	0.01	0.18	0.33	0.19
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.12	0.11	0.10	0.08	0.06	0.13	0.07	0.07	0.02	0.00	0.02	0.15	0.07	0.12	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.11	0.00	0.26	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.03	0.17	0.02	0.26	0.40	0.26
C5'	0.04	0.20	0.02	0.02	0.19	0.01	0.26	0.00	0.29	0.23	0.25	0.18	0.16	0.28	0.16	0.07	0.04	0.02	0.01	0.32	0.08	0.18	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.01	0.12	0.01	0.29	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.12	0.04	0.18	0.01	0.31	0.44	0.29
C8	0.01	0.02	0.07	0.10	0.01	0.11	0.01	0.23	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.05	0.11	0.05	0.16	0.02	0.20	0.30	0.20
N1	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.10	0.01	0.25	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.16	0.04	0.17	0.01	0.27	0.42	0.26
N2	0.04	0.01	0.16	0.18	0.02	0.08	0.02	0.18	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.18	0.22	0.05	0.14	0.02	0.19	0.37	0.20
N3	0.02	0.01	0.12	0.14	0.01	0.06	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.16	0.04	0.12	0.02	0.16	0.32	0.17
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.13	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.10	0.04	0.19	0.02	0.29	0.40	0.28
N9	0.00	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.16	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.02	0.11	0.02	0.13	0.26	0.14
O2'	0.02	0.15	0.00	0.03	0.08	0.07	0.06	0.07	0.09	0.05	0.13	0.18	0.13	0.04	0.03	0.00	0.05	0.06	0.10	0.08	0.15	0.10	0.08
O3'	0.02	0.18	0.03	0.01	0.09	0.02	0.09	0.04	0.12	0.11	0.16	0.22	0.16	0.10	0.05	0.05	0.00	0.02	0.23	0.13	0.28	0.19	0.22
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.08	0.05	0.08	0.16	0.11
O5'	0.06	0.14	0.13	0.21	0.13	0.02	0.17	0.01	0.18	0.16	0.17	0.14	0.12	0.19	0.11	0.10	0.23	0.08	0.00	0.20	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.12	0.01	0.15	0.02	0.32	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.13	0.05	0.20	0.00	0.37	0.48	0.34
OP1	0.06	0.21	0.14	0.20	0.18	0.07	0.26	0.08	0.31	0.20	0.27	0.19	0.16	0.29	0.13	0.15	0.28	0.08	0.02	0.37	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.37	0.11	0.12	0.33	0.12	0.40	0.18	0.44	0.30	0.42	0.37	0.32	0.40	0.26	0.10	0.19	0.16	0.02	0.48	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.21	0.10	0.16	0.19	0.03	0.26	0.02	0.29	0.20	0.26	0.20	0.17	0.28	0.14	0.08	0.22	0.11	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.29	0.17	0.17	0.14	0.15	0.17	0.24	0.22	0.20	0.27	0.21	0.24	0.20	0.16	0.28	0.19	0.15	0.37	0.73	0.59	0.39
C2	0.17	0.19	0.15	0.18	0.17	0.21	0.25	0.32	0.28	0.27	0.23	0.15	0.39	0.32	0.20	0.20	0.17	0.21	0.56	1.10	0.86	0.63
C2'	0.16	0.30	0.15	0.18	0.13	0.15	0.17	0.28	0.23	0.19	0.29	0.21	0.26	0.20	0.14	0.27	0.19	0.12	0.42	0.79	0.60	0.45
C3'	0.16	0.30	0.17	0.22	0.13	0.20	0.16	0.33	0.21	0.21	0.27	0.22	0.24	0.20	0.14	0.27	0.24	0.15	0.46	0.80	0.54	0.48
C4	0.18	0.25	0.17	0.17	0.15	0.19	0.19	0.30	0.21	0.23	0.24	0.18	0.25	0.25	0.18	0.23	0.16	0.19	0.51	0.97	0.77	0.56
C4'	0.17	0.31	0.16	0.16	0.16	0.14	0.17	0.22	0.21	0.20	0.28	0.24	0.23	0.19	0.15	0.28	0.18	0.13	0.35	0.67	0.44	0.36
C5	0.20	0.24	0.21	0.21	0.15	0.25	0.14	0.36	0.13	0.24	0.21	0.20	0.17	0.23	0.19	0.25	0.21	0.24	0.58	1.07	0.83	0.64
C5'	0.24	0.33	0.25	0.19	0.22	0.20	0.21	0.24	0.23	0.25	0.28	0.30	0.25	0.24	0.21	0.34	0.20	0.21	0.35	0.68	0.36	0.36
C6	0.21	0.21	0.21	0.24	0.15	0.28	0.16	0.39	0.13	0.26	0.21	0.17	0.18	0.26	0.20	0.23	0.24	0.26	0.64	1.20	0.91	0.72
C8	0.23	0.27	0.26	0.20	0.16	0.23	0.11	0.32	0.13	0.22	0.21	0.25	0.15	0.19	0.19	0.31	0.19	0.22	0.49	0.85	0.66	0.50
N1	0.19	0.19	0.18	0.21	0.16	0.25	0.21	0.36	0.19	0.28	0.19	0.15	0.28	0.30	0.20	0.20	0.20	0.24	0.61	1.19	0.91	0.70
N2	0.18	0.18	0.14	0.17	0.19	0.20	0.28	0.31	0.32	0.29	0.24	0.15	0.45	0.34	0.21	0.19	0.16	0.21	0.55	1.12	0.88	0.64
N3	0.17	0.23	0.15	0.16	0.17	0.18	0.25	0.29	0.29	0.25	0.27	0.16	0.36	0.29	0.19	0.21	0.15	0.18	0.50	0.99	0.79	0.56
N7	0.24	0.26	0.27	0.25	0.17	0.28	0.12	0.38	0.14	0.23	0.22	0.24	0.16	0.20	0.20	0.30	0.24	0.26	0.58	1.00	0.77	0.61
N9	0.19	0.28	0.19	0.17	0.14	0.18	0.15	0.28	0.18	0.21	0.24	0.22	0.21	0.20	0.16	0.27	0.16	0.17	0.45	0.84	0.67	0.47
O2'	0.19	0.30	0.16	0.17	0.16	0.13	0.19	0.23	0.24	0.19	0.30	0.22	0.28	0.20	0.16	0.29	0.19	0.14	0.38	0.75	0.57	0.41
O3'	0.17	0.30	0.18	0.23	0.13	0.21	0.16	0.34	0.21	0.21	0.28	0.22	0.25	0.20	0.15	0.28	0.25	0.16	0.47	0.82	0.54	0.50
O4'	0.16	0.31	0.16	0.20	0.15	0.16	0.17	0.23	0.22	0.19	0.28	0.24	0.23	0.19	0.14	0.27	0.22	0.13	0.32	0.63	0.49	0.33
O5'	0.21	0.28	0.25	0.06	0.19	0.04	0.20	0.19	0.21	0.28	0.24	0.24	0.21	0.26	0.21	0.35	0.02	0.10	0.37	0.74	0.42	0.40
O6	0.23	0.22	0.24	0.28	0.16	0.32	0.14	0.44	0.16	0.26	0.23	0.18	0.19	0.24	0.21	0.25	0.29	0.30	0.69	1.30	0.96	0.79
OP1	0.05	0.25	0.11	0.02	0.12	0.12	0.15	0.25	0.17	0.21	0.21	0.21	0.20	0.21	0.10	0.15	0.02	0.07	0.19	0.79	0.42	0.32
OP2	0.11	0.32	0.15	0.06	0.22	0.22	0.27	0.42	0.30	0.27	0.32	0.27	0.33	0.30	0.18	0.16	0.03	0.16	0.36	0.87	0.48	0.45
P	0.07	0.25	0.13	0.02	0.14	0.11	0.16	0.25	0.18	0.23	0.22	0.22	0.20	0.23	0.12	0.17	0.01	0.05	0.28	0.76	0.37	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.14	0.35	0.36	0.14
C2	0.03	0.00	0.16	0.22	0.01	0.11	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.26	0.03	0.33	0.79	0.58	0.36
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.02	0.08	0.08	0.12	0.17	0.06	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.22	0.42	0.27	0.19
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.03	0.12	0.15	0.18	0.21	0.10	0.13	0.06	0.02	0.01	0.01	0.29	0.49	0.22	0.25
C4	0.02	0.01	0.09	0.11	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.02	0.34	0.73	0.57	0.33
C4'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.07	0.10	0.09	0.10	0.07	0.09	0.04	0.05	0.03	0.00	0.02	0.22	0.28	0.05
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.02	0.43	0.90	0.69	0.42
C5'	0.02	0.16	0.02	0.03	0.12	0.01	0.14	0.00	0.15	0.17	0.16	0.14	0.17	0.17	0.09	0.05	0.06	0.02	0.01	0.30	0.37	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.44	0.97	0.73	0.45
C8	0.01	0.01	0.08	0.15	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.17	0.04	0.44	0.76	0.65	0.38
N1	0.02	0.00	0.12	0.18	0.01	0.09	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.02	0.40	0.91	0.67	0.42
N3	0.03	0.00	0.17	0.21	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.24	0.03	0.29	0.68	0.52	0.30
N6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.03	0.49	1.06	0.80	0.50
N7	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.15	0.03	0.49	0.94	0.76	0.46
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.31	0.60	0.51	0.28
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.08	0.05	0.06	0.05	0.09	0.05	0.12	0.14	0.08	0.04	0.02	0.00	0.03	0.04	0.10	0.34	0.22	0.12
O3'	0.02	0.26	0.02	0.01	0.12	0.03	0.10	0.06	0.13	0.17	0.21	0.24	0.13	0.15	0.06	0.03	0.00	0.03	0.25	0.64	0.25	0.29
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.04	0.03	0.00	0.08	0.19	0.37	0.13
O5'	0.14	0.33	0.22	0.29	0.34	0.02	0.43	0.01	0.44	0.44	0.40	0.29	0.49	0.49	0.31	0.10	0.25	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.35	0.79	0.42	0.49	0.73	0.22	0.90	0.30	0.97	0.76	0.91	0.68	1.06	0.94	0.60	0.34	0.64	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.36	0.58	0.27	0.22	0.57	0.28	0.69	0.37	0.73	0.65	0.67	0.52	0.80	0.76	0.51	0.22	0.25	0.37	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.36	0.19	0.25	0.33	0.05	0.42	0.02	0.45	0.38	0.42	0.30	0.50	0.46	0.28	0.12	0.29	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00