Doublet Group distance statistics: 51054

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 1, 5, 3, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.014, 0.025, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.014, 0.027, 0.041, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.027 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.030 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.019, 0.035, 0.051, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.035 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.009, 0.026, 0.042, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.016, 0.035, 0.054, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.035 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.016, 0.038, 0.061, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.038 std_dev=0.022
O6	A	0, 0.027, 0.050, 0.074, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.050 std_dev=0.024
N7	A	0, 0.023, 0.050, 0.078, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.050 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.029, 0.060, 0.091, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.060 std_dev=0.031
C2'	A	0, 0.068, 0.154, 0.241, 0.343 max_d=0.343 avg_d=0.154 std_dev=0.087
O4'	A	0, 0.020, 0.115, 0.209, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.115 std_dev=0.094
O2'	A	0, 0.106, 0.211, 0.316, 0.427 max_d=0.427 avg_d=0.211 std_dev=0.105
C3'	A	0, 0.124, 0.269, 0.414, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.269 std_dev=0.145
C5	B	0, 0.183, 0.336, 0.489, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.336 std_dev=0.153
C4'	A	0, 0.067, 0.222, 0.377, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.222 std_dev=0.155
C4	B	0, 0.178, 0.373, 0.568, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.373 std_dev=0.195
N7	B	0, 0.300, 0.514, 0.729, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.514 std_dev=0.215
O5'	A	0, 0.199, 0.416, 0.634, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.416 std_dev=0.217
C6	B	0, 0.259, 0.482, 0.704, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.482 std_dev=0.222
O3'	A	0, 0.194, 0.422, 0.650, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.422 std_dev=0.228
C8	B	0, 0.357, 0.590, 0.823, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.590 std_dev=0.233
C5'	A	0, 0.089, 0.325, 0.561, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.325 std_dev=0.236
N9	B	0, 0.284, 0.532, 0.781, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.532 std_dev=0.249
N3	B	0, 0.247, 0.537, 0.827, 1.120 max_d=1.120 avg_d=0.537 std_dev=0.290
N1	B	0, 0.236, 0.560, 0.884, 1.123 max_d=1.123 avg_d=0.560 std_dev=0.324
P	A	0, 0.290, 0.615, 0.941, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.615 std_dev=0.325
N6	B	0, 0.395, 0.721, 1.047, 1.326 max_d=1.326 avg_d=0.721 std_dev=0.326
C2'	B	0, 0.323, 0.654, 0.985, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.654 std_dev=0.331
C2	B	0, 0.231, 0.566, 0.901, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.566 std_dev=0.335
OP1	A	0, 0.315, 0.664, 1.013, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.664 std_dev=0.349
O3'	B	0, 0.340, 0.731, 1.122, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.731 std_dev=0.391
C1'	B	0, 0.401, 0.793, 1.184, 1.515 max_d=1.515 avg_d=0.793 std_dev=0.391
C3'	B	0, 0.377, 0.778, 1.179, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.778 std_dev=0.401
O2'	B	0, 0.473, 0.895, 1.317, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.895 std_dev=0.422
OP2	A	0, 0.473, 0.915, 1.357, 1.543 max_d=1.543 avg_d=0.915 std_dev=0.442
O4'	B	0, 0.548, 1.091, 1.634, 2.056 max_d=2.056 avg_d=1.091 std_dev=0.543
C4'	B	0, 0.568, 1.130, 1.693, 2.017 max_d=2.017 avg_d=1.130 std_dev=0.563
O5'	B	0, 0.690, 1.303, 1.916, 2.290 max_d=2.290 avg_d=1.303 std_dev=0.613
C5'	B	0, 0.691, 1.416, 2.140, 2.745 max_d=2.745 avg_d=1.416 std_dev=0.725
P	B	0, 0.846, 1.589, 2.331, 2.692 max_d=2.692 avg_d=1.589 std_dev=0.742
OP1	B	0, 0.955, 1.724, 2.493, 2.896 max_d=2.896 avg_d=1.724 std_dev=0.769
OP2	B	0, 0.611, 1.736, 2.862, 5.036 max_d=5.036 avg_d=1.736 std_dev=1.126

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.07	0.04	0.08	0.12	0.08
C2	0.03	0.00	0.13	0.15	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.13	0.19	0.03	0.14	0.01	0.17	0.26	0.18
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.02	0.09	0.04	0.12	0.14	0.12	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.09	0.11	0.10	0.06
C3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.11	0.00	0.12	0.02	0.14	0.10	0.15	0.16	0.13	0.11	0.07	0.02	0.01	0.01	0.05	0.15	0.13	0.12	0.08
C4	0.02	0.01	0.08	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.14	0.02	0.16	0.23	0.16
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.07	0.06	0.09	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.09	0.09	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.03	0.18	0.01	0.22	0.29	0.22
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.13	0.12	0.10	0.07	0.06	0.14	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.15	0.08	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.09	0.14	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.19	0.03	0.19	0.01	0.25	0.33	0.25
C8	0.02	0.02	0.04	0.10	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.11	0.05	0.17	0.02	0.17	0.22	0.17
N1	0.03	0.00	0.12	0.15	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.20	0.02	0.17	0.01	0.22	0.31	0.22
N2	0.04	0.01	0.14	0.16	0.02	0.07	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.15	0.21	0.04	0.13	0.01	0.16	0.25	0.16
N3	0.03	0.00	0.12	0.13	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.16	0.03	0.12	0.02	0.14	0.22	0.15
N7	0.02	0.02	0.04	0.11	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.14	0.05	0.20	0.02	0.23	0.29	0.23
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.02	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.07	0.01	0.12	0.03	0.12	0.18	0.13
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.07	0.06	0.05	0.06	0.08	0.03	0.11	0.15	0.12	0.02	0.02	0.00	0.06	0.05	0.05	0.08	0.15	0.10	0.07
O3'	0.02	0.19	0.02	0.01	0.13	0.02	0.15	0.02	0.19	0.11	0.20	0.21	0.16	0.14	0.07	0.06	0.00	0.02	0.08	0.20	0.20	0.22	0.14
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.01	0.05	0.02	0.00	0.08	0.04	0.07	0.13	0.09
O5'	0.07	0.14	0.05	0.05	0.14	0.02	0.18	0.01	0.19	0.17	0.17	0.13	0.12	0.20	0.12	0.05	0.08	0.08	0.00	0.22	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.01	0.09	0.15	0.02	0.09	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.08	0.20	0.04	0.22	0.00	0.29	0.36	0.28
OP1	0.08	0.17	0.11	0.13	0.16	0.09	0.22	0.08	0.25	0.17	0.22	0.16	0.14	0.23	0.12	0.15	0.20	0.07	0.02	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.26	0.10	0.12	0.23	0.04	0.29	0.02	0.33	0.22	0.31	0.25	0.22	0.29	0.18	0.10	0.22	0.13	0.02	0.36	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.18	0.06	0.08	0.16	0.02	0.22	0.02	0.25	0.17	0.22	0.16	0.15	0.23	0.13	0.07	0.14	0.09	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.26	0.18	0.16	0.11	0.17	0.18	0.25	0.20	0.24	0.22	0.21	0.27	0.26	0.15	0.28	0.15	0.16	0.47	0.42	0.70	0.50
C2	0.18	0.32	0.19	0.18	0.19	0.22	0.23	0.35	0.26	0.27	0.32	0.25	0.34	0.31	0.19	0.24	0.17	0.21	0.59	0.57	1.14	0.73
C2'	0.13	0.26	0.15	0.12	0.11	0.14	0.18	0.27	0.21	0.24	0.23	0.21	0.29	0.27	0.13	0.28	0.10	0.13	0.45	0.48	0.71	0.50
C3'	0.10	0.26	0.12	0.10	0.10	0.12	0.18	0.27	0.21	0.23	0.23	0.21	0.28	0.27	0.11	0.27	0.07	0.10	0.41	0.49	0.60	0.45
C4	0.18	0.28	0.20	0.19	0.16	0.22	0.20	0.33	0.21	0.27	0.26	0.23	0.28	0.30	0.19	0.25	0.17	0.21	0.57	0.53	1.01	0.67
C4'	0.12	0.27	0.13	0.11	0.11	0.11	0.16	0.20	0.20	0.21	0.24	0.22	0.25	0.22	0.11	0.28	0.12	0.10	0.36	0.39	0.44	0.35
C5	0.23	0.27	0.25	0.24	0.19	0.29	0.20	0.40	0.22	0.30	0.27	0.24	0.28	0.31	0.23	0.27	0.21	0.29	0.61	0.59	1.12	0.74
C5'	0.14	0.30	0.14	0.09	0.16	0.09	0.17	0.16	0.21	0.20	0.26	0.27	0.23	0.21	0.14	0.26	0.10	0.10	0.32	0.38	0.33	0.29
C6	0.25	0.29	0.25	0.26	0.21	0.32	0.22	0.44	0.25	0.32	0.31	0.24	0.33	0.32	0.24	0.26	0.23	0.32	0.65	0.66	1.26	0.82
C8	0.23	0.25	0.26	0.23	0.16	0.26	0.15	0.35	0.16	0.28	0.20	0.25	0.22	0.28	0.20	0.29	0.19	0.27	0.54	0.50	0.86	0.60
N1	0.21	0.31	0.21	0.22	0.20	0.28	0.23	0.40	0.26	0.30	0.33	0.24	0.34	0.32	0.22	0.24	0.20	0.27	0.63	0.63	1.24	0.80
N2	0.17	0.34	0.18	0.17	0.19	0.20	0.23	0.34	0.26	0.27	0.33	0.26	0.36	0.31	0.19	0.23	0.15	0.19	0.59	0.56	1.15	0.73
N3	0.17	0.30	0.18	0.16	0.17	0.19	0.21	0.31	0.24	0.26	0.28	0.24	0.33	0.30	0.18	0.25	0.15	0.18	0.56	0.52	1.02	0.67
N7	0.28	0.25	0.29	0.28	0.20	0.33	0.17	0.43	0.19	0.31	0.23	0.25	0.25	0.29	0.25	0.30	0.24	0.34	0.61	0.59	1.06	0.72
N9	0.17	0.26	0.20	0.17	0.13	0.20	0.18	0.30	0.18	0.26	0.21	0.22	0.25	0.28	0.17	0.26	0.15	0.19	0.52	0.47	0.85	0.58
O2'	0.17	0.27	0.17	0.13	0.14	0.14	0.20	0.24	0.23	0.23	0.25	0.22	0.31	0.27	0.15	0.31	0.12	0.14	0.43	0.44	0.64	0.46
O3'	0.11	0.25	0.13	0.10	0.09	0.11	0.17	0.26	0.20	0.23	0.22	0.20	0.28	0.27	0.11	0.30	0.08	0.09	0.41	0.51	0.58	0.45
O4'	0.15	0.28	0.17	0.17	0.10	0.16	0.16	0.23	0.20	0.22	0.24	0.21	0.24	0.23	0.13	0.29	0.18	0.14	0.42	0.37	0.54	0.41
O5'	0.16	0.29	0.19	0.08	0.20	0.08	0.21	0.18	0.23	0.25	0.26	0.28	0.25	0.26	0.18	0.24	0.01	0.11	0.37	0.43	0.40	0.34
O6	0.29	0.29	0.28	0.31	0.22	0.38	0.22	0.50	0.27	0.34	0.32	0.24	0.35	0.31	0.27	0.28	0.28	0.38	0.68	0.73	1.36	0.89
OP1	0.09	0.25	0.13	0.03	0.13	0.06	0.16	0.16	0.19	0.22	0.22	0.23	0.23	0.24	0.11	0.20	0.02	0.04	0.28	0.45	0.33	0.26
OP2	0.09	0.25	0.09	0.07	0.19	0.17	0.26	0.30	0.29	0.29	0.28	0.21	0.35	0.34	0.16	0.09	0.02	0.15	0.36	0.61	0.42	0.39
P	0.05	0.22	0.10	0.02	0.12	0.07	0.17	0.17	0.19	0.23	0.20	0.20	0.23	0.24	0.10	0.14	0.01	0.04	0.29	0.44	0.27	0.26

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.24	0.20	0.27	0.20
C2	0.04	0.00	0.13	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.17	0.04	0.44	0.29	0.66	0.45
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.08	0.10	0.14	0.07	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.23	0.23	0.15	0.18
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.09	0.02	0.10	0.16	0.11	0.13	0.12	0.15	0.06	0.02	0.01	0.02	0.28	0.28	0.15	0.22
C4	0.02	0.01	0.07	0.07	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.08	0.02	0.46	0.28	0.66	0.45
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.11	0.06	0.06	0.08	0.11	0.04	0.06	0.02	0.00	0.01	0.17	0.21	0.06
C5	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.10	0.03	0.55	0.36	0.88	0.58
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.16	0.10	0.06	0.15	0.17	0.08	0.06	0.04	0.01	0.01	0.14	0.28	0.01
C6	0.02	0.01	0.07	0.10	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.12	0.03	0.56	0.39	0.94	0.61
C8	0.02	0.01	0.08	0.16	0.01	0.11	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.18	0.05	0.56	0.33	0.81	0.55
N1	0.03	0.00	0.10	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.14	0.03	0.51	0.35	0.83	0.55
N3	0.04	0.01	0.14	0.13	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.16	0.04	0.40	0.25	0.54	0.39
N6	0.03	0.01	0.07	0.12	0.02	0.08	0.02	0.15	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.09	0.15	0.04	0.60	0.45	1.08	0.69
N7	0.02	0.01	0.07	0.15	0.01	0.11	0.00	0.17	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.17	0.05	0.60	0.41	1.00	0.65
N9	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.02	0.43	0.25	0.57	0.40
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.06	0.13	0.16	0.09	0.04	0.02	0.00	0.05	0.05	0.11	0.26	0.21	0.15
O3'	0.02	0.17	0.02	0.01	0.08	0.02	0.10	0.04	0.12	0.18	0.14	0.16	0.15	0.17	0.06	0.05	0.00	0.02	0.26	0.32	0.25	0.23
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.05	0.02	0.00	0.20	0.25	0.29	0.19
O5'	0.24	0.44	0.23	0.28	0.46	0.01	0.55	0.01	0.56	0.56	0.51	0.40	0.60	0.60	0.43	0.11	0.26	0.20	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.20	0.29	0.23	0.28	0.28	0.17	0.36	0.14	0.39	0.33	0.35	0.25	0.45	0.41	0.25	0.26	0.32	0.25	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.66	0.15	0.15	0.66	0.21	0.88	0.28	0.94	0.81	0.83	0.54	1.08	1.00	0.57	0.21	0.25	0.29	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.45	0.18	0.22	0.45	0.06	0.58	0.01	0.61	0.55	0.55	0.39	0.69	0.65	0.40	0.15	0.23	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00