Doublet Group distance statistics: 51056

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 4, 3, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C1'	A	0, 0.015, 0.032, 0.049, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.032 std_dev=0.017
C6	A	0, 0.009, 0.028, 0.047, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.028 std_dev=0.019
C5	A	0, 0.011, 0.035, 0.058, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.035 std_dev=0.023
C2	A	0, -0.005, 0.021, 0.047, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.021 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.015, 0.043, 0.070, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.043 std_dev=0.027
N1	A	0, 0.004, 0.034, 0.065, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.034 std_dev=0.030
C4	A	0, 0.009, 0.046, 0.083, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.046 std_dev=0.037
N3	A	0, 0.005, 0.042, 0.080, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.042 std_dev=0.038
O6	A	0, 0.021, 0.060, 0.100, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.060 std_dev=0.040
N7	A	0, 0.014, 0.057, 0.101, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.057 std_dev=0.043
C8	A	0, 0.016, 0.068, 0.120, 0.179 max_d=0.179 avg_d=0.068 std_dev=0.052
N2	A	0, -0.008, 0.077, 0.163, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.077 std_dev=0.086
O4'	A	0, -0.041, 0.243, 0.527, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.243 std_dev=0.284
C6	B	0, 0.604, 0.911, 1.218, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.911 std_dev=0.307
C5	B	0, 0.699, 1.013, 1.328, 1.470 max_d=1.470 avg_d=1.013 std_dev=0.315
C4	B	0, 0.662, 0.998, 1.334, 1.495 max_d=1.495 avg_d=0.998 std_dev=0.336
N6	B	0, 0.674, 1.010, 1.347, 1.445 max_d=1.445 avg_d=1.010 std_dev=0.336
C2'	A	0, -0.019, 0.317, 0.654, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.317 std_dev=0.337
N1	B	0, 0.422, 0.788, 1.154, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.788 std_dev=0.366
N3	B	0, 0.580, 0.954, 1.329, 1.480 max_d=1.480 avg_d=0.954 std_dev=0.374
N9	B	0, 0.767, 1.143, 1.518, 1.652 max_d=1.652 avg_d=1.143 std_dev=0.376
N7	B	0, 0.825, 1.203, 1.581, 1.660 max_d=1.660 avg_d=1.203 std_dev=0.378
C8	B	0, 0.839, 1.248, 1.657, 1.712 max_d=1.712 avg_d=1.248 std_dev=0.409
C2	B	0, 0.427, 0.837, 1.247, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.837 std_dev=0.410
C2'	B	0, 0.608, 1.044, 1.480, 1.828 max_d=1.828 avg_d=1.044 std_dev=0.436
O2'	B	0, 0.709, 1.148, 1.586, 1.822 max_d=1.822 avg_d=1.148 std_dev=0.439
C1'	B	0, 0.810, 1.252, 1.693, 1.794 max_d=1.794 avg_d=1.252 std_dev=0.441
C3'	A	0, -0.026, 0.456, 0.937, 1.673 max_d=1.673 avg_d=0.456 std_dev=0.482
C4'	A	0, -0.045, 0.444, 0.933, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.444 std_dev=0.489
C3'	B	0, 0.658, 1.210, 1.762, 2.033 max_d=2.033 avg_d=1.210 std_dev=0.552
O5'	A	0, 0.462, 1.018, 1.574, 2.149 max_d=2.149 avg_d=1.018 std_dev=0.556
O3'	B	0, 0.714, 1.287, 1.859, 2.155 max_d=2.155 avg_d=1.287 std_dev=0.573
O2'	A	0, -0.072, 0.519, 1.111, 2.097 max_d=2.097 avg_d=0.519 std_dev=0.592
O4'	B	0, 0.983, 1.579, 2.176, 2.327 max_d=2.327 avg_d=1.579 std_dev=0.597
C5'	A	0, 0.107, 0.746, 1.384, 2.305 max_d=2.305 avg_d=0.746 std_dev=0.638
C4'	B	0, 0.911, 1.598, 2.284, 2.584 max_d=2.584 avg_d=1.598 std_dev=0.686
P	A	0, 0.455, 1.149, 1.843, 2.265 max_d=2.265 avg_d=1.149 std_dev=0.694
O3'	A	0, -0.070, 0.649, 1.369, 2.512 max_d=2.512 avg_d=0.649 std_dev=0.720
OP2	A	0, 0.558, 1.338, 2.118, 2.592 max_d=2.592 avg_d=1.338 std_dev=0.780
OP1	A	0, 0.450, 1.301, 2.152, 2.677 max_d=2.677 avg_d=1.301 std_dev=0.851
O5'	B	0, 0.944, 1.810, 2.676, 3.289 max_d=3.289 avg_d=1.810 std_dev=0.866
C5'	B	0, 1.201, 2.111, 3.021, 3.581 max_d=3.581 avg_d=2.111 std_dev=0.910
P	B	0, 1.439, 2.649, 3.860, 4.747 max_d=4.747 avg_d=2.649 std_dev=1.211
OP2	B	0, 1.528, 2.755, 3.982, 4.877 max_d=4.877 avg_d=2.755 std_dev=1.227
OP1	B	0, 1.539, 3.081, 4.623, 5.786 max_d=5.786 avg_d=3.081 std_dev=1.542

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.22	0.01	0.11	0.04	0.10	0.22	0.11
C2	0.04	0.00	0.22	0.18	0.03	0.05	0.01	0.10	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.21	0.12	0.18	0.02	0.19	0.39	0.24
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.12	0.02	0.07	0.13	0.12	0.12	0.17	0.27	0.21	0.08	0.03	0.01	0.03	0.02	0.34	0.11	0.38	0.50	0.37
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.19	0.01	0.26	0.03	0.27	0.26	0.23	0.16	0.15	0.30	0.18	0.02	0.01	0.03	0.14	0.31	0.21	0.21	0.16
C4	0.01	0.03	0.12	0.19	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.11	0.07	0.19	0.02	0.20	0.37	0.24
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.09	0.18	0.04	0.08	0.06	0.17	0.07	0.23	0.02	0.01	0.03	0.13	0.07	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.26	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.25	0.12	0.04	0.27	0.03	0.33	0.48	0.35
C5'	0.05	0.10	0.13	0.03	0.10	0.01	0.17	0.00	0.17	0.22	0.13	0.10	0.09	0.24	0.11	0.11	0.14	0.02	0.01	0.22	0.10	0.02	0.02
C6	0.02	0.03	0.12	0.27	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.01	0.25	0.15	0.06	0.29	0.00	0.37	0.53	0.39
C8	0.02	0.04	0.12	0.26	0.01	0.18	0.02	0.22	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.29	0.17	0.09	0.28	0.03	0.31	0.39	0.33
N1	0.03	0.01	0.17	0.23	0.03	0.04	0.01	0.13	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.17	0.15	0.09	0.24	0.01	0.29	0.48	0.32
N2	0.04	0.01	0.27	0.16	0.02	0.08	0.01	0.10	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.18	0.28	0.14	0.15	0.01	0.15	0.37	0.21
N3	0.04	0.01	0.21	0.15	0.01	0.06	0.02	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.23	0.12	0.14	0.05	0.13	0.33	0.19
N7	0.01	0.01	0.08	0.30	0.01	0.17	0.00	0.24	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.32	0.20	0.06	0.33	0.04	0.40	0.51	0.42
N9	0.01	0.04	0.03	0.18	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.16	0.06	0.02	0.16	0.03	0.16	0.30	0.20
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.15	0.23	0.25	0.11	0.25	0.29	0.17	0.18	0.11	0.32	0.16	0.00	0.07	0.16	0.22	0.30	0.27	0.48	0.27
O3'	0.22	0.21	0.03	0.01	0.11	0.02	0.12	0.14	0.15	0.17	0.15	0.28	0.23	0.20	0.06	0.07	0.00	0.13	0.16	0.19	0.23	0.23	0.20
O4'	0.01	0.12	0.02	0.03	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.09	0.09	0.14	0.12	0.06	0.02	0.16	0.13	0.00	0.09	0.06	0.13	0.11	0.12
O5'	0.11	0.18	0.34	0.14	0.19	0.03	0.27	0.01	0.29	0.28	0.24	0.15	0.14	0.33	0.16	0.22	0.16	0.09	0.00	0.34	0.02	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.11	0.31	0.02	0.13	0.03	0.22	0.00	0.03	0.01	0.01	0.05	0.04	0.03	0.30	0.19	0.06	0.34	0.00	0.46	0.62	0.47
OP1	0.10	0.19	0.38	0.21	0.20	0.07	0.33	0.10	0.37	0.31	0.29	0.15	0.13	0.40	0.16	0.27	0.23	0.13	0.02	0.46	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.39	0.50	0.21	0.37	0.06	0.48	0.02	0.53	0.39	0.48	0.37	0.33	0.51	0.30	0.48	0.23	0.11	0.02	0.62	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.24	0.37	0.16	0.24	0.03	0.35	0.02	0.39	0.33	0.32	0.21	0.19	0.42	0.20	0.27	0.20	0.12	0.01	0.47	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.29	0.22	0.16	0.13	0.19	0.16	0.16	0.25	0.17	0.31	0.21	0.30	0.16	0.15	0.41	0.18	0.21	0.29	0.48	0.56	0.39
C2	0.29	0.18	0.26	0.23	0.20	0.24	0.19	0.24	0.23	0.22	0.21	0.23	0.34	0.22	0.24	0.38	0.23	0.27	0.35	0.51	0.73	0.48
C2'	0.15	0.28	0.12	0.25	0.15	0.20	0.21	0.33	0.26	0.24	0.29	0.20	0.30	0.25	0.16	0.24	0.27	0.15	0.52	0.84	0.84	0.69
C3'	0.12	0.28	0.09	0.12	0.13	0.10	0.13	0.17	0.19	0.17	0.26	0.21	0.19	0.15	0.12	0.17	0.15	0.07	0.31	0.60	0.51	0.42
C4	0.26	0.22	0.26	0.24	0.13	0.22	0.12	0.23	0.22	0.16	0.25	0.20	0.30	0.14	0.18	0.38	0.25	0.22	0.35	0.53	0.69	0.47
C4'	0.13	0.42	0.11	0.11	0.24	0.08	0.24	0.13	0.32	0.18	0.40	0.34	0.32	0.19	0.16	0.14	0.12	0.09	0.27	0.46	0.43	0.34
C5	0.27	0.22	0.31	0.30	0.16	0.26	0.09	0.30	0.17	0.18	0.21	0.23	0.27	0.14	0.21	0.38	0.33	0.23	0.42	0.63	0.77	0.56
C5'	0.25	0.48	0.25	0.20	0.34	0.19	0.31	0.20	0.37	0.22	0.45	0.44	0.35	0.24	0.26	0.24	0.15	0.22	0.33	0.51	0.42	0.39
C6	0.29	0.25	0.32	0.33	0.22	0.29	0.16	0.34	0.11	0.25	0.17	0.26	0.22	0.22	0.26	0.37	0.35	0.27	0.45	0.67	0.84	0.61
C8	0.24	0.26	0.31	0.29	0.17	0.24	0.19	0.27	0.26	0.17	0.28	0.23	0.31	0.19	0.17	0.40	0.33	0.20	0.40	0.61	0.69	0.52
N1	0.30	0.22	0.29	0.28	0.23	0.26	0.20	0.29	0.18	0.26	0.14	0.26	0.30	0.25	0.26	0.37	0.29	0.27	0.41	0.60	0.81	0.55
N2	0.31	0.20	0.26	0.22	0.23	0.25	0.23	0.24	0.28	0.25	0.25	0.25	0.38	0.25	0.26	0.38	0.22	0.30	0.33	0.47	0.72	0.45
N3	0.27	0.20	0.24	0.21	0.14	0.21	0.15	0.20	0.24	0.18	0.27	0.19	0.33	0.17	0.19	0.38	0.21	0.24	0.32	0.47	0.67	0.43
N7	0.26	0.25	0.33	0.34	0.17	0.29	0.15	0.34	0.24	0.16	0.26	0.24	0.31	0.14	0.19	0.39	0.39	0.23	0.46	0.69	0.78	0.60
N9	0.25	0.26	0.26	0.21	0.13	0.20	0.15	0.20	0.24	0.16	0.28	0.21	0.30	0.15	0.16	0.40	0.24	0.20	0.33	0.52	0.63	0.45
O2'	0.21	0.29	0.18	0.14	0.13	0.14	0.25	0.22	0.33	0.25	0.33	0.22	0.44	0.31	0.14	0.46	0.15	0.17	0.46	0.81	0.88	0.67
O3'	0.11	0.43	0.09	0.11	0.22	0.11	0.21	0.16	0.31	0.17	0.42	0.33	0.31	0.17	0.13	0.14	0.16	0.08	0.29	0.53	0.45	0.37
O4'	0.16	0.41	0.17	0.16	0.21	0.18	0.25	0.16	0.35	0.19	0.42	0.30	0.37	0.21	0.14	0.33	0.22	0.15	0.23	0.36	0.41	0.28
O5'	0.17	0.30	0.18	0.07	0.18	0.06	0.17	0.09	0.22	0.21	0.28	0.26	0.21	0.18	0.16	0.22	0.02	0.11	0.25	0.50	0.38	0.34
O6	0.30	0.29	0.35	0.39	0.25	0.35	0.19	0.42	0.12	0.29	0.24	0.28	0.13	0.26	0.28	0.37	0.41	0.29	0.52	0.78	0.93	0.69
OP1	0.06	0.24	0.10	0.03	0.11	0.08	0.10	0.17	0.16	0.12	0.22	0.20	0.18	0.11	0.06	0.17	0.03	0.05	0.31	0.53	0.33	0.36
OP2	0.09	0.26	0.09	0.06	0.15	0.11	0.16	0.21	0.21	0.17	0.26	0.22	0.24	0.16	0.10	0.10	0.03	0.11	0.38	0.63	0.43	0.46
P	0.06	0.24	0.09	0.02	0.11	0.04	0.11	0.13	0.16	0.14	0.22	0.19	0.18	0.12	0.06	0.14	0.00	0.02	0.29	0.52	0.34	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.08	0.10	0.23	0.12
C2	0.05	0.00	0.17	0.16	0.03	0.05	0.02	0.06	0.01	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.19	0.19	0.08	0.15	0.17	0.39	0.19
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.09	0.02	0.05	0.03	0.09	0.07	0.14	0.17	0.08	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.09	0.19	0.20	0.12
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.08	0.03	0.11	0.10	0.14	0.14	0.14	0.08	0.05	0.02	0.01	0.01	0.11	0.23	0.15	0.13
C4	0.02	0.03	0.09	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.08	0.10	0.03	0.16	0.18	0.36	0.20
C4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.04	0.05	0.10	0.09	0.04	0.05	0.02	0.01	0.02	0.13	0.09	0.04
C5	0.01	0.02	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.22	0.26	0.42	0.26
C5'	0.03	0.06	0.03	0.03	0.08	0.01	0.13	0.00	0.13	0.17	0.08	0.05	0.17	0.17	0.08	0.05	0.05	0.02	0.01	0.14	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.11	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.22	0.27	0.45	0.27
C8	0.02	0.04	0.07	0.10	0.01	0.10	0.02	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.05	0.11	0.06	0.23	0.26	0.37	0.26
N1	0.03	0.00	0.14	0.14	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.15	0.17	0.05	0.19	0.23	0.43	0.23
N3	0.05	0.01	0.17	0.14	0.01	0.05	0.01	0.05	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.17	0.17	0.08	0.13	0.14	0.35	0.17
N6	0.03	0.01	0.08	0.14	0.02	0.10	0.02	0.17	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.04	0.03	0.08	0.14	0.04	0.27	0.34	0.50	0.32
N7	0.01	0.03	0.04	0.08	0.02	0.09	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.04	0.09	0.04	0.25	0.31	0.45	0.31
N9	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.04	0.01	0.15	0.17	0.31	0.18
O2'	0.02	0.19	0.01	0.02	0.08	0.05	0.06	0.05	0.10	0.05	0.15	0.17	0.08	0.04	0.02	0.00	0.06	0.05	0.07	0.20	0.16	0.08
O3'	0.02	0.19	0.03	0.01	0.10	0.02	0.08	0.05	0.13	0.11	0.17	0.17	0.14	0.09	0.04	0.06	0.00	0.01	0.16	0.35	0.19	0.20
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.05	0.08	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.12	0.19	0.13
O5'	0.08	0.15	0.09	0.11	0.16	0.02	0.22	0.01	0.22	0.23	0.19	0.13	0.27	0.25	0.15	0.07	0.16	0.08	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.10	0.17	0.19	0.23	0.18	0.13	0.26	0.14	0.27	0.26	0.23	0.14	0.34	0.31	0.17	0.20	0.35	0.12	0.03	0.00	0.02	0.02
OP2	0.23	0.39	0.20	0.15	0.36	0.09	0.42	0.03	0.45	0.37	0.43	0.35	0.50	0.45	0.31	0.16	0.19	0.19	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.19	0.12	0.13	0.20	0.04	0.26	0.01	0.27	0.26	0.23	0.17	0.32	0.31	0.18	0.08	0.20	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00