Doublet Group distance statistics: 51057

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 1, 2, 0, 2, 3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.024, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.010, 0.024, 0.039, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.024 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.011, 0.026, 0.042, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.026 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.013, 0.029, 0.045, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.029 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.007, 0.024, 0.040, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.024 std_dev=0.017
O6	A	0, 0.014, 0.031, 0.048, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.031 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.010, 0.028, 0.046, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.028 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.022 std_dev=0.020
N2	A	0, 0.009, 0.049, 0.090, 0.154 max_d=0.154 avg_d=0.049 std_dev=0.040
C2'	A	0, 0.131, 0.230, 0.329, 0.405 max_d=0.405 avg_d=0.230 std_dev=0.099
O4'	A	0, 0.084, 0.193, 0.302, 0.497 max_d=0.497 avg_d=0.193 std_dev=0.109
O2'	A	0, 0.187, 0.330, 0.474, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.330 std_dev=0.144
C4'	A	0, 0.132, 0.277, 0.421, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.277 std_dev=0.144
C3'	A	0, 0.155, 0.315, 0.475, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.315 std_dev=0.160
O3'	A	0, 0.224, 0.456, 0.687, 0.978 max_d=0.978 avg_d=0.456 std_dev=0.232
C5'	A	0, 0.345, 0.597, 0.848, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.597 std_dev=0.252
C8	B	0, 0.317, 0.571, 0.826, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.571 std_dev=0.255
N9	B	0, 0.343, 0.608, 0.874, 0.981 max_d=0.981 avg_d=0.608 std_dev=0.266
N7	B	0, 0.331, 0.602, 0.872, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.602 std_dev=0.270
C5	B	0, 0.371, 0.649, 0.927, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.649 std_dev=0.278
C4	B	0, 0.360, 0.652, 0.944, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.652 std_dev=0.292
C1'	B	0, 0.405, 0.698, 0.991, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.698 std_dev=0.293
C6	B	0, 0.427, 0.744, 1.061, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.744 std_dev=0.317
N6	B	0, 0.497, 0.814, 1.131, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.814 std_dev=0.317
O5'	A	0, 0.459, 0.781, 1.103, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.781 std_dev=0.322
N3	B	0, 0.396, 0.741, 1.086, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.741 std_dev=0.345
C2'	B	0, 0.709, 1.055, 1.401, 1.473 max_d=1.473 avg_d=1.055 std_dev=0.346
N1	B	0, 0.428, 0.806, 1.185, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.806 std_dev=0.379
C2	B	0, 0.421, 0.805, 1.188, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.805 std_dev=0.384
P	A	0, 0.695, 1.200, 1.705, 1.949 max_d=1.949 avg_d=1.200 std_dev=0.505
O2'	B	0, 1.144, 1.678, 2.212, 2.167 max_d=2.167 avg_d=1.678 std_dev=0.534
O4'	B	0, 0.984, 1.573, 2.162, 2.791 max_d=2.791 avg_d=1.573 std_dev=0.589
OP1	A	0, 1.498, 2.140, 2.782, 2.754 max_d=2.754 avg_d=2.140 std_dev=0.642
C3'	B	0, 1.349, 2.040, 2.731, 3.139 max_d=3.139 avg_d=2.040 std_dev=0.691
OP2	A	0, 1.701, 2.392, 3.084, 3.002 max_d=3.002 avg_d=2.392 std_dev=0.691
C4'	B	0, 1.453, 2.226, 2.998, 3.654 max_d=3.654 avg_d=2.226 std_dev=0.772
OP2	B	0, 1.395, 2.318, 3.241, 3.409 max_d=3.409 avg_d=2.318 std_dev=0.923
O3'	B	0, 2.238, 3.163, 4.087, 4.273 max_d=4.273 avg_d=3.163 std_dev=0.924
O5'	B	0, 1.074, 2.009, 2.943, 3.794 max_d=3.794 avg_d=2.009 std_dev=0.934
C5'	B	0, 1.749, 2.711, 3.673, 4.549 max_d=4.549 avg_d=2.711 std_dev=0.962
P	B	0, 1.227, 2.208, 3.188, 3.660 max_d=3.660 avg_d=2.208 std_dev=0.980
OP1	B	0, 2.058, 3.351, 4.643, 5.299 max_d=5.299 avg_d=3.351 std_dev=1.293

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.06	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.08	0.10	0.06
C2	0.04	0.00	0.11	0.12	0.02	0.06	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.12	0.16	0.05	0.08	0.01	0.12	0.22	0.13
C2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.01	0.07	0.06	0.09	0.13	0.10	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.08	0.11	0.06
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.02	0.08	0.10	0.10	0.14	0.11	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.09	0.08	0.11	0.10	0.08
C4	0.02	0.02	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.08	0.02	0.11	0.20	0.12
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.05	0.08	0.06	0.06	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.05	0.02
C5	0.01	0.02	0.05	0.07	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.11	0.01	0.17	0.25	0.16
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.13	0.08	0.08	0.06	0.13	0.07	0.07	0.04	0.01	0.01	0.13	0.12	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.02	0.12	0.01	0.19	0.27	0.18
C8	0.01	0.02	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.13	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.13	0.02	0.15	0.20	0.13
N1	0.03	0.01	0.09	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.14	0.03	0.10	0.01	0.15	0.25	0.16
N2	0.06	0.01	0.13	0.14	0.03	0.08	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.14	0.20	0.07	0.08	0.02	0.11	0.21	0.12
N3	0.04	0.01	0.10	0.11	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.10	0.14	0.05	0.07	0.01	0.10	0.19	0.11
N7	0.01	0.02	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.03	0.14	0.02	0.19	0.25	0.17
N9	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.02	0.10	0.16	0.09
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.06	0.06	0.07	0.08	0.03	0.11	0.14	0.10	0.04	0.02	0.00	0.04	0.04	0.03	0.08	0.11	0.07	0.04
O3'	0.01	0.16	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.04	0.11	0.11	0.14	0.20	0.14	0.11	0.04	0.04	0.00	0.02	0.13	0.11	0.19	0.15	0.13
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.07	0.05	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.11	0.03	0.15	0.11	0.11
O5'	0.05	0.08	0.05	0.09	0.08	0.01	0.11	0.01	0.12	0.13	0.10	0.08	0.07	0.14	0.08	0.03	0.13	0.11	0.00	0.14	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.07	0.08	0.02	0.05	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.08	0.11	0.03	0.14	0.00	0.22	0.30	0.21
OP1	0.08	0.12	0.08	0.11	0.11	0.09	0.17	0.12	0.19	0.15	0.15	0.11	0.10	0.19	0.10	0.11	0.19	0.15	0.01	0.22	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.22	0.11	0.10	0.20	0.05	0.25	0.06	0.27	0.20	0.25	0.21	0.19	0.25	0.16	0.07	0.15	0.11	0.02	0.30	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.06	0.08	0.12	0.02	0.16	0.02	0.18	0.13	0.16	0.12	0.11	0.17	0.09	0.04	0.13	0.11	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.29	0.17	0.16	0.22	0.15	0.24	0.16	0.29	0.19	0.30	0.25	0.31	0.22	0.19	0.16	0.17	0.17	0.37	0.37	0.44	0.39
C2	0.15	0.15	0.14	0.17	0.14	0.14	0.14	0.17	0.17	0.15	0.16	0.17	0.23	0.15	0.15	0.13	0.18	0.15	0.43	0.47	0.57	0.49
C2'	0.15	0.27	0.13	0.13	0.18	0.12	0.20	0.14	0.26	0.16	0.27	0.23	0.29	0.19	0.15	0.14	0.14	0.12	0.36	0.37	0.44	0.37
C3'	0.11	0.24	0.12	0.13	0.16	0.12	0.20	0.15	0.25	0.16	0.25	0.19	0.29	0.20	0.13	0.12	0.16	0.09	0.33	0.37	0.39	0.34
C4	0.15	0.15	0.15	0.17	0.13	0.15	0.15	0.17	0.20	0.14	0.19	0.15	0.26	0.15	0.14	0.14	0.18	0.14	0.43	0.45	0.54	0.47
C4'	0.14	0.25	0.14	0.12	0.18	0.12	0.21	0.13	0.25	0.17	0.26	0.21	0.28	0.20	0.15	0.15	0.14	0.12	0.27	0.30	0.31	0.27
C5	0.21	0.14	0.20	0.22	0.17	0.20	0.12	0.22	0.12	0.16	0.08	0.21	0.21	0.14	0.19	0.19	0.21	0.20	0.47	0.50	0.58	0.52
C5'	0.18	0.22	0.18	0.16	0.18	0.17	0.21	0.17	0.23	0.20	0.23	0.20	0.26	0.22	0.18	0.20	0.18	0.17	0.22	0.28	0.23	0.21
C6	0.24	0.24	0.22	0.23	0.23	0.22	0.17	0.24	0.12	0.21	0.14	0.27	0.15	0.17	0.23	0.20	0.22	0.23	0.50	0.55	0.63	0.56
C8	0.20	0.16	0.20	0.21	0.15	0.20	0.17	0.20	0.21	0.16	0.18	0.18	0.27	0.17	0.17	0.20	0.20	0.19	0.45	0.45	0.52	0.47
N1	0.20	0.20	0.18	0.20	0.19	0.19	0.15	0.21	0.14	0.18	0.14	0.22	0.18	0.16	0.20	0.16	0.20	0.19	0.47	0.52	0.61	0.53
N2	0.14	0.16	0.13	0.15	0.14	0.12	0.15	0.16	0.18	0.15	0.18	0.16	0.24	0.16	0.15	0.12	0.17	0.14	0.42	0.47	0.57	0.48
N3	0.14	0.17	0.13	0.15	0.14	0.13	0.16	0.15	0.21	0.14	0.21	0.15	0.27	0.16	0.14	0.12	0.17	0.13	0.41	0.44	0.53	0.46
N7	0.24	0.14	0.23	0.24	0.19	0.23	0.12	0.24	0.13	0.18	0.09	0.22	0.22	0.15	0.22	0.22	0.22	0.23	0.49	0.51	0.58	0.53
N9	0.15	0.21	0.15	0.17	0.16	0.15	0.20	0.17	0.25	0.16	0.25	0.18	0.29	0.19	0.15	0.14	0.18	0.15	0.41	0.41	0.50	0.44
O2'	0.21	0.32	0.18	0.14	0.23	0.16	0.23	0.15	0.28	0.18	0.31	0.28	0.30	0.20	0.20	0.21	0.14	0.18	0.33	0.33	0.40	0.34
O3'	0.12	0.24	0.13	0.14	0.16	0.14	0.20	0.18	0.24	0.17	0.25	0.20	0.29	0.21	0.13	0.15	0.17	0.11	0.31	0.37	0.38	0.33
O4'	0.18	0.28	0.17	0.17	0.22	0.16	0.25	0.17	0.29	0.21	0.30	0.24	0.31	0.24	0.19	0.15	0.18	0.16	0.34	0.34	0.40	0.35
O5'	0.18	0.22	0.20	0.17	0.21	0.16	0.24	0.17	0.26	0.24	0.24	0.20	0.29	0.26	0.20	0.18	0.20	0.15	0.35	0.40	0.34	0.33
O6	0.29	0.33	0.26	0.27	0.31	0.27	0.26	0.29	0.22	0.27	0.27	0.34	0.14	0.24	0.30	0.24	0.25	0.29	0.54	0.60	0.67	0.60
OP1	0.09	0.18	0.11	0.05	0.14	0.11	0.18	0.21	0.20	0.18	0.19	0.16	0.24	0.21	0.12	0.19	0.16	0.07	0.32	0.26	0.23	0.21
OP2	0.16	0.24	0.14	0.24	0.21	0.26	0.25	0.32	0.27	0.23	0.26	0.21	0.31	0.27	0.18	0.06	0.27	0.22	0.52	0.55	0.39	0.47
P	0.08	0.15	0.11	0.20	0.11	0.21	0.15	0.24	0.18	0.16	0.16	0.13	0.21	0.18	0.09	0.09	0.28	0.14	0.36	0.39	0.26	0.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.14	0.15	0.25	0.17
C2	0.04	0.00	0.11	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.13	0.05	0.28	0.30	0.43	0.32
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.08	0.06	0.10	0.11	0.09	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.18	0.23	0.23	0.19
C3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.08	0.01	0.10	0.02	0.11	0.13	0.11	0.10	0.13	0.13	0.06	0.03	0.01	0.01	0.22	0.29	0.17	0.20
C4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.07	0.03	0.29	0.30	0.40	0.31
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.10	0.05	0.05	0.08	0.10	0.04	0.07	0.03	0.00	0.02	0.15	0.17	0.05
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.10	0.02	0.36	0.39	0.48	0.39
C5'	0.02	0.07	0.03	0.02	0.08	0.01	0.13	0.00	0.13	0.16	0.10	0.06	0.17	0.18	0.08	0.06	0.05	0.01	0.01	0.18	0.22	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.11	0.02	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.11	0.11	0.03	0.37	0.42	0.51	0.42
C8	0.02	0.02	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.07	0.13	0.04	0.36	0.35	0.40	0.36
N1	0.04	0.01	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.12	0.04	0.33	0.37	0.48	0.38
N3	0.04	0.00	0.11	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.13	0.12	0.05	0.24	0.25	0.38	0.28
N6	0.03	0.01	0.09	0.13	0.02	0.08	0.02	0.17	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.11	0.14	0.04	0.40	0.48	0.56	0.47
N7	0.01	0.01	0.06	0.13	0.01	0.10	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.14	0.04	0.40	0.43	0.50	0.43
N9	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.26	0.26	0.34	0.28
O2'	0.01	0.14	0.00	0.03	0.08	0.07	0.08	0.06	0.11	0.07	0.13	0.13	0.11	0.07	0.04	0.00	0.06	0.05	0.07	0.17	0.20	0.11
O3'	0.04	0.13	0.03	0.01	0.07	0.03	0.10	0.05	0.11	0.13	0.12	0.12	0.14	0.14	0.05	0.06	0.00	0.04	0.20	0.33	0.18	0.18
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.05	0.04	0.00	0.10	0.11	0.24	0.15
O5'	0.14	0.28	0.18	0.22	0.29	0.02	0.36	0.01	0.37	0.36	0.33	0.24	0.40	0.40	0.26	0.07	0.20	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.15	0.30	0.23	0.29	0.30	0.15	0.39	0.18	0.42	0.35	0.37	0.25	0.48	0.43	0.26	0.17	0.33	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.25	0.43	0.23	0.17	0.40	0.17	0.48	0.22	0.51	0.40	0.48	0.38	0.56	0.50	0.34	0.20	0.18	0.24	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.32	0.19	0.20	0.31	0.05	0.39	0.01	0.42	0.36	0.38	0.28	0.47	0.43	0.28	0.11	0.18	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00