Doublet Group distance statistics: 51060

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.008, 0.018, 0.027, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.018 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.009, 0.026, 0.043, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N2	A	0, 0.003, 0.025, 0.047, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.025 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.012, 0.038, 0.064, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.038 std_dev=0.026
O6	A	0, 0.009, 0.037, 0.064, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.037 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.014, 0.054, 0.095, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.054 std_dev=0.041
C8	A	0, 0.015, 0.066, 0.118, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.066 std_dev=0.051
O4'	A	0, 0.080, 0.233, 0.386, 0.458 max_d=0.458 avg_d=0.233 std_dev=0.153
C2'	A	0, 0.085, 0.274, 0.463, 0.607 max_d=0.607 avg_d=0.274 std_dev=0.189
C4'	A	0, 0.128, 0.368, 0.608, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.368 std_dev=0.240
O2'	A	0, 0.072, 0.329, 0.587, 0.790 max_d=0.790 avg_d=0.329 std_dev=0.258
C3'	A	0, 0.154, 0.423, 0.693, 0.860 max_d=0.860 avg_d=0.423 std_dev=0.269
C2	B	0, 0.226, 0.565, 0.904, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.565 std_dev=0.339
N3	B	0, 0.254, 0.610, 0.966, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.610 std_dev=0.356
O3'	A	0, 0.242, 0.628, 1.014, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.628 std_dev=0.386
C5'	A	0, 0.219, 0.626, 1.034, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.626 std_dev=0.407
C4	B	0, 0.323, 0.734, 1.144, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.734 std_dev=0.410
N1	B	0, 0.252, 0.697, 1.142, 1.209 max_d=1.209 avg_d=0.697 std_dev=0.445
O5'	A	0, 0.356, 0.819, 1.282, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.819 std_dev=0.463
C5	B	0, 0.371, 0.861, 1.351, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.861 std_dev=0.490
C6	B	0, 0.322, 0.852, 1.382, 1.456 max_d=1.456 avg_d=0.852 std_dev=0.530
N9	B	0, 0.399, 0.940, 1.481, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.940 std_dev=0.541
N7	B	0, 0.493, 1.119, 1.744, 1.727 max_d=1.727 avg_d=1.119 std_dev=0.625
C8	B	0, 0.501, 1.135, 1.768, 1.726 max_d=1.726 avg_d=1.135 std_dev=0.634
C1'	B	0, 0.428, 1.075, 1.722, 2.021 max_d=2.021 avg_d=1.075 std_dev=0.647
N6	B	0, 0.420, 1.124, 1.828, 1.874 max_d=1.874 avg_d=1.124 std_dev=0.704
C2'	B	0, 0.533, 1.348, 2.163, 2.626 max_d=2.626 avg_d=1.348 std_dev=0.815
O4'	B	0, 0.663, 1.545, 2.426, 2.377 max_d=2.377 avg_d=1.545 std_dev=0.882
O2'	B	0, 0.574, 1.462, 2.349, 2.907 max_d=2.907 avg_d=1.462 std_dev=0.888
P	A	0, 0.765, 1.738, 2.710, 2.818 max_d=2.818 avg_d=1.738 std_dev=0.973
OP2	A	0, 0.846, 1.863, 2.881, 3.150 max_d=3.150 avg_d=1.863 std_dev=1.017
C3'	B	0, 0.804, 1.869, 2.934, 3.118 max_d=3.118 avg_d=1.869 std_dev=1.065
C4'	B	0, 0.868, 2.003, 3.138, 3.128 max_d=3.128 avg_d=2.003 std_dev=1.135
OP1	A	0, 1.004, 2.250, 3.496, 3.465 max_d=3.465 avg_d=2.250 std_dev=1.246
O3'	B	0, 1.018, 2.311, 3.604, 3.733 max_d=3.733 avg_d=2.311 std_dev=1.293
C5'	B	0, 1.122, 2.570, 4.019, 3.670 max_d=3.670 avg_d=2.570 std_dev=1.449
O5'	B	0, 1.122, 2.621, 4.119, 4.195 max_d=4.195 avg_d=2.621 std_dev=1.499
OP2	B	0, 1.268, 2.947, 4.625, 4.463 max_d=4.463 avg_d=2.947 std_dev=1.679
P	B	0, 1.353, 3.164, 4.975, 4.834 max_d=4.834 avg_d=3.164 std_dev=1.811
OP1	B	0, 1.554, 3.620, 5.686, 5.647 max_d=5.647 avg_d=3.620 std_dev=2.066

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.05	0.08	0.08
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.15	0.01	0.08	0.01	0.13	0.11	0.10
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.07	0.06	0.09	0.13	0.10	0.07	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.08	0.11	0.06	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.01	0.12	0.10	0.12	0.15	0.11	0.11	0.06	0.01	0.00	0.01	0.13	0.13	0.17	0.12	0.12
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.10	0.09	0.10
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.06	0.06	0.05	0.09	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.08	0.06	0.05	0.01
C5	0.01	0.02	0.06	0.10	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.11	0.03	0.12	0.01	0.15	0.15	0.16
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.11	0.12	0.08	0.05	0.04	0.13	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.13	0.06	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.07	0.12	0.00	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.02	0.14	0.00	0.18	0.19	0.17
C8	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.09	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.12	0.05	0.12	0.02	0.14	0.12	0.15
N1	0.02	0.01	0.09	0.12	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.15	0.02	0.12	0.00	0.16	0.16	0.14
N2	0.03	0.00	0.13	0.15	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.13	0.19	0.03	0.07	0.02	0.14	0.11	0.08
N3	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.14	0.02	0.06	0.00	0.10	0.08	0.07
N7	0.01	0.02	0.07	0.11	0.01	0.09	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.05	0.15	0.02	0.18	0.18	0.19
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.02	0.05	0.01	0.07	0.07	0.09
O2'	0.02	0.10	0.00	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.09	0.13	0.10	0.05	0.02	0.00	0.05	0.03	0.04	0.08	0.11	0.04	0.04
O3'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.09	0.01	0.11	0.02	0.14	0.12	0.15	0.19	0.14	0.13	0.05	0.05	0.00	0.01	0.18	0.17	0.27	0.20	0.20
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.00	0.12	0.03	0.11	0.14	0.13
O5'	0.05	0.08	0.06	0.13	0.07	0.01	0.12	0.01	0.14	0.12	0.12	0.07	0.06	0.15	0.05	0.04	0.18	0.12	0.00	0.16	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.17	0.03	0.16	0.00	0.21	0.23	0.21
OP1	0.05	0.13	0.11	0.17	0.10	0.06	0.15	0.06	0.18	0.14	0.16	0.14	0.10	0.18	0.07	0.11	0.27	0.11	0.02	0.21	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.11	0.06	0.12	0.09	0.05	0.15	0.07	0.19	0.12	0.16	0.11	0.08	0.18	0.07	0.04	0.20	0.14	0.02	0.23	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.10	0.05	0.12	0.10	0.01	0.16	0.02	0.17	0.15	0.14	0.08	0.07	0.19	0.09	0.04	0.20	0.13	0.01	0.21	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.41	0.16	0.32	0.12	0.25	0.08	0.33	0.12	0.26	0.30	0.34	0.12	0.26	0.09	0.14	0.37	0.15	0.36	0.47	0.38	0.37
C2	0.27	0.39	0.22	0.22	0.24	0.26	0.24	0.34	0.24	0.40	0.39	0.30	0.18	0.41	0.29	0.22	0.18	0.28	0.43	0.43	0.50	0.46
C2'	0.09	0.36	0.23	0.42	0.10	0.33	0.13	0.41	0.15	0.24	0.27	0.29	0.20	0.26	0.08	0.22	0.53	0.17	0.41	0.59	0.44	0.43
C3'	0.24	0.35	0.38	0.61	0.17	0.55	0.10	0.64	0.13	0.23	0.25	0.32	0.13	0.21	0.17	0.35	0.74	0.37	0.62	0.85	0.63	0.67
C4	0.20	0.49	0.19	0.14	0.26	0.15	0.18	0.22	0.29	0.27	0.45	0.40	0.22	0.23	0.20	0.23	0.13	0.15	0.30	0.34	0.35	0.31
C4'	0.35	0.33	0.49	0.70	0.24	0.63	0.19	0.69	0.15	0.31	0.23	0.34	0.13	0.26	0.28	0.44	0.81	0.46	0.67	0.86	0.63	0.70
C5	0.29	0.49	0.33	0.25	0.33	0.23	0.28	0.25	0.38	0.24	0.49	0.43	0.34	0.15	0.27	0.36	0.25	0.22	0.31	0.35	0.37	0.33
C5'	0.52	0.39	0.64	0.90	0.38	0.86	0.31	0.94	0.26	0.41	0.31	0.43	0.21	0.34	0.43	0.57	1.03	0.68	0.91	1.11	0.85	0.95
C6	0.35	0.45	0.39	0.36	0.32	0.34	0.28	0.37	0.39	0.34	0.47	0.39	0.39	0.24	0.32	0.40	0.36	0.31	0.42	0.43	0.44	0.42
C8	0.23	0.52	0.27	0.21	0.36	0.23	0.28	0.33	0.35	0.13	0.46	0.48	0.29	0.17	0.23	0.32	0.18	0.21	0.41	0.54	0.52	0.47
N1	0.33	0.41	0.33	0.32	0.29	0.34	0.25	0.40	0.31	0.41	0.43	0.34	0.29	0.35	0.32	0.33	0.30	0.32	0.48	0.49	0.54	0.51
N2	0.27	0.32	0.19	0.22	0.24	0.29	0.29	0.38	0.22	0.44	0.31	0.25	0.22	0.46	0.30	0.18	0.17	0.31	0.49	0.50	0.59	0.55
N3	0.21	0.42	0.14	0.15	0.21	0.17	0.21	0.25	0.22	0.36	0.40	0.32	0.16	0.37	0.23	0.16	0.13	0.20	0.34	0.35	0.39	0.36
N7	0.30	0.52	0.37	0.26	0.39	0.22	0.34	0.26	0.41	0.16	0.49	0.48	0.37	0.19	0.29	0.42	0.27	0.24	0.34	0.45	0.49	0.42
N9	0.12	0.50	0.14	0.18	0.25	0.16	0.16	0.26	0.26	0.19	0.42	0.43	0.19	0.18	0.11	0.19	0.19	0.11	0.33	0.43	0.38	0.35
O2'	0.16	0.30	0.28	0.42	0.14	0.32	0.22	0.36	0.23	0.30	0.25	0.24	0.31	0.33	0.17	0.28	0.55	0.18	0.36	0.53	0.37	0.36
O3'	0.27	0.29	0.44	0.68	0.13	0.62	0.09	0.71	0.12	0.23	0.21	0.27	0.19	0.21	0.17	0.44	0.87	0.40	0.68	0.96	0.68	0.73
O4'	0.24	0.41	0.35	0.52	0.24	0.45	0.21	0.51	0.21	0.31	0.30	0.38	0.19	0.29	0.23	0.26	0.54	0.33	0.52	0.63	0.50	0.53
O5'	0.60	0.50	0.65	0.95	0.48	0.94	0.40	1.06	0.36	0.48	0.42	0.54	0.29	0.40	0.52	0.54	1.04	0.78	1.05	1.23	1.00	1.09
O6	0.39	0.45	0.47	0.46	0.35	0.42	0.32	0.45	0.41	0.35	0.47	0.39	0.44	0.25	0.35	0.48	0.49	0.36	0.48	0.50	0.48	0.48
OP1	0.91	0.55	0.91	1.31	0.64	1.45	0.52	1.63	0.43	0.69	0.45	0.65	0.34	0.55	0.75	0.87	1.56	1.21	1.53	1.82	1.39	1.60
OP2	0.74	0.55	0.62	1.03	0.61	1.21	0.57	1.48	0.51	0.69	0.51	0.60	0.46	0.60	0.69	0.46	1.02	1.05	1.49	1.77	1.45	1.61
P	0.85	0.58	0.81	1.23	0.65	1.32	0.58	1.49	0.50	0.70	0.51	0.65	0.44	0.60	0.74	0.67	1.38	1.13	1.45	1.65	1.33	1.50

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.09	0.12	0.09	0.10
C2	0.02	0.00	0.20	0.18	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.24	0.09	0.16	0.17	0.18	0.19
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.09	0.16	0.20	0.08	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.18	0.07	0.03
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.10	0.01	0.07	0.02	0.10	0.09	0.15	0.17	0.09	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.22	0.10	0.10
C4	0.01	0.01	0.11	0.10	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.11	0.05	0.17	0.17	0.15	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.12	0.06	0.03
C5	0.00	0.01	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.08	0.02	0.21	0.19	0.18	0.21
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.06	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.07	0.05	0.10	0.09	0.05	0.04	0.04	0.01	0.01	0.14	0.03	0.02
C6	0.01	0.00	0.10	0.10	0.01	0.03	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.04	0.22	0.20	0.20	0.22
C8	0.01	0.02	0.09	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.06	0.21	0.17	0.13	0.17
N1	0.01	0.01	0.16	0.15	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.20	0.07	0.19	0.19	0.20	0.22
N3	0.02	0.00	0.20	0.17	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.21	0.08	0.15	0.15	0.15	0.17
N6	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.24	0.22	0.23	0.24
N7	0.01	0.02	0.05	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.23	0.19	0.18	0.20
N9	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.16	0.15	0.12	0.14
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.08	0.04	0.05	0.04	0.08	0.06	0.13	0.16	0.07	0.04	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.15	0.07	0.03
O3'	0.02	0.24	0.02	0.01	0.11	0.02	0.08	0.04	0.13	0.10	0.20	0.21	0.11	0.06	0.03	0.03	0.00	0.02	0.13	0.33	0.17	0.19
O4'	0.01	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.08	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.09	0.15	0.14	0.14
O5'	0.09	0.16	0.03	0.06	0.17	0.01	0.21	0.01	0.22	0.21	0.19	0.15	0.24	0.23	0.16	0.02	0.13	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.12	0.17	0.18	0.22	0.17	0.12	0.19	0.14	0.20	0.17	0.19	0.15	0.22	0.19	0.15	0.15	0.33	0.15	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.18	0.07	0.10	0.15	0.06	0.18	0.03	0.20	0.13	0.20	0.15	0.23	0.18	0.12	0.07	0.17	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.19	0.03	0.10	0.17	0.03	0.21	0.02	0.22	0.17	0.22	0.17	0.24	0.20	0.14	0.03	0.19	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00