Doublet Group distance statistics: 51061

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.002, 0.021, 0.039, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.021 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.007, 0.034, 0.061, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.034 std_dev=0.027
C5	A	0, 0.004, 0.033, 0.061, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.033 std_dev=0.028
N2	A	0, 0.014, 0.049, 0.085, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.049 std_dev=0.036
N3	A	0, 0.007, 0.043, 0.079, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.043 std_dev=0.036
N1	A	0, 0.004, 0.042, 0.079, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.042 std_dev=0.038
O6	A	0, 0.007, 0.049, 0.092, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.049 std_dev=0.042
C4	A	0, 0.006, 0.053, 0.100, 0.147 max_d=0.147 avg_d=0.053 std_dev=0.047
N9	A	0, 0.007, 0.057, 0.106, 0.153 max_d=0.153 avg_d=0.057 std_dev=0.050
N7	A	0, 0.008, 0.065, 0.122, 0.180 max_d=0.180 avg_d=0.065 std_dev=0.057
C8	A	0, 0.011, 0.090, 0.170, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.090 std_dev=0.079
O4'	A	0, 0.044, 0.124, 0.205, 0.246 max_d=0.246 avg_d=0.124 std_dev=0.081
C2'	A	0, 0.058, 0.236, 0.415, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.236 std_dev=0.179
C3'	A	0, 0.080, 0.260, 0.441, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.260 std_dev=0.180
C4'	A	0, 0.012, 0.210, 0.409, 0.638 max_d=0.638 avg_d=0.210 std_dev=0.199
C4	B	0, 0.209, 0.497, 0.786, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.497 std_dev=0.288
N3	B	0, 0.223, 0.519, 0.816, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.519 std_dev=0.296
OP2	A	0, 0.206, 0.504, 0.801, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.504 std_dev=0.298
C2	B	0, 0.230, 0.533, 0.837, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.533 std_dev=0.303
C5	B	0, 0.218, 0.537, 0.856, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.537 std_dev=0.319
O2'	A	0, 0.074, 0.405, 0.736, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.405 std_dev=0.331
O3'	A	0, 0.092, 0.436, 0.780, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.436 std_dev=0.344
N1	B	0, 0.199, 0.568, 0.937, 0.960 max_d=0.960 avg_d=0.568 std_dev=0.369
C6	B	0, 0.198, 0.577, 0.956, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.577 std_dev=0.379
N9	B	0, 0.285, 0.675, 1.065, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.675 std_dev=0.390
C5'	A	0, 0.097, 0.516, 0.935, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.516 std_dev=0.419
N7	B	0, 0.275, 0.719, 1.163, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.719 std_dev=0.444
C2'	B	0, 0.272, 0.722, 1.173, 1.358 max_d=1.358 avg_d=0.722 std_dev=0.450
C8	B	0, 0.310, 0.771, 1.233, 1.253 max_d=1.253 avg_d=0.771 std_dev=0.461
O2'	B	0, 0.248, 0.767, 1.286, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.767 std_dev=0.519
C1'	B	0, 0.316, 0.837, 1.358, 1.445 max_d=1.445 avg_d=0.837 std_dev=0.521
O5'	A	0, 0.173, 0.717, 1.261, 1.660 max_d=1.660 avg_d=0.717 std_dev=0.544
N6	B	0, 0.204, 0.778, 1.353, 1.493 max_d=1.493 avg_d=0.778 std_dev=0.574
P	A	0, 0.268, 1.137, 2.006, 2.502 max_d=2.502 avg_d=1.137 std_dev=0.869
C3'	B	0, 0.360, 1.360, 2.359, 2.525 max_d=2.525 avg_d=1.360 std_dev=1.000
O4'	B	0, 0.370, 1.484, 2.597, 2.918 max_d=2.918 avg_d=1.484 std_dev=1.114
C4'	B	0, 0.384, 1.656, 2.928, 3.263 max_d=3.263 avg_d=1.656 std_dev=1.272
O3'	B	0, 0.431, 1.915, 3.400, 3.478 max_d=3.478 avg_d=1.915 std_dev=1.485
OP1	A	0, 0.496, 2.442, 4.387, 4.760 max_d=4.760 avg_d=2.442 std_dev=1.946
O5'	B	0, 0.538, 2.598, 4.657, 4.843 max_d=4.843 avg_d=2.598 std_dev=2.060
C5'	B	0, 0.530, 2.597, 4.664, 4.980 max_d=4.980 avg_d=2.597 std_dev=2.067
OP2	B	0, 0.671, 3.374, 6.077, 5.901 max_d=5.901 avg_d=3.374 std_dev=2.703
P	B	0, 0.700, 3.478, 6.255, 6.197 max_d=6.197 avg_d=3.478 std_dev=2.778
OP1	B	0, 0.830, 4.186, 7.542, 7.435 max_d=7.435 avg_d=4.186 std_dev=3.356

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.12	0.02	0.39	0.12	0.11
C2	0.03	0.00	0.11	0.14	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.17	0.01	0.27	0.00	1.02	0.11	0.33
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.08	0.01	0.11	0.03	0.13	0.06	0.13	0.10	0.08	0.09	0.04	0.00	0.01	0.01	0.11	0.14	0.25	0.09	0.12
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.04	0.18	0.09	0.17	0.13	0.10	0.14	0.07	0.02	0.01	0.01	0.09	0.19	0.07	0.08	0.10
C4	0.01	0.00	0.08	0.11	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.12	0.01	0.27	0.01	0.96	0.10	0.31
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.08	0.08	0.07	0.05	0.04	0.09	0.05	0.02	0.04	0.00	0.02	0.10	0.15	0.27	0.02
C5	0.01	0.00	0.11	0.15	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.19	0.03	0.32	0.01	1.22	0.17	0.40
C5'	0.05	0.12	0.03	0.04	0.14	0.01	0.19	0.00	0.20	0.21	0.16	0.10	0.10	0.23	0.14	0.02	0.04	0.02	0.01	0.22	0.36	0.38	0.01
C6	0.02	0.00	0.13	0.18	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.24	0.03	0.33	0.00	1.33	0.20	0.44
C8	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.04	0.29	0.01	1.03	0.12	0.35
N1	0.03	0.00	0.13	0.17	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.23	0.02	0.31	0.00	1.21	0.17	0.39
N2	0.03	0.01	0.10	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.16	0.02	0.26	0.01	0.96	0.09	0.31
N3	0.02	0.00	0.08	0.10	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.12	0.02	0.24	0.01	0.87	0.08	0.27
N7	0.00	0.00	0.09	0.14	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.18	0.04	0.33	0.01	1.30	0.20	0.43
N9	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.05	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.23	0.01	0.79	0.07	0.25
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.08	0.02	0.10	0.02	0.13	0.03	0.14	0.13	0.09	0.07	0.04	0.00	0.04	0.05	0.08	0.14	0.10	0.19	0.08
O3'	0.02	0.17	0.01	0.01	0.12	0.04	0.19	0.04	0.24	0.10	0.23	0.16	0.12	0.18	0.07	0.04	0.00	0.03	0.09	0.27	0.20	0.11	0.09
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.03	0.00	0.03	0.04	0.14	0.22	0.03
O5'	0.12	0.27	0.11	0.09	0.27	0.02	0.32	0.01	0.33	0.29	0.31	0.26	0.24	0.33	0.23	0.08	0.09	0.03	0.00	0.35	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.00	0.14	0.19	0.01	0.10	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.27	0.04	0.35	0.00	1.47	0.25	0.49
OP1	0.39	1.02	0.25	0.07	0.96	0.15	1.22	0.36	1.33	1.03	1.21	0.96	0.87	1.30	0.79	0.10	0.20	0.14	0.01	1.47	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.11	0.09	0.08	0.10	0.27	0.17	0.38	0.20	0.12	0.17	0.09	0.08	0.20	0.07	0.19	0.11	0.22	0.02	0.25	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.33	0.12	0.10	0.31	0.02	0.40	0.01	0.44	0.35	0.39	0.31	0.27	0.43	0.25	0.08	0.09	0.03	0.00	0.49	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.34	0.25	0.38	0.53	0.30	0.13	0.24	0.21	0.20	0.31	0.23	0.29	0.18	0.25	0.34	0.23	0.89	0.42	0.35	0.55	0.62	0.46
C2	0.13	0.23	0.47	0.58	0.14	0.17	0.18	0.23	0.17	0.20	0.12	0.21	0.32	0.26	0.13	0.34	0.84	0.21	0.43	0.59	0.71	0.53
C2'	0.46	0.29	0.30	0.53	0.32	0.13	0.21	0.19	0.18	0.31	0.23	0.36	0.18	0.20	0.38	0.15	0.97	0.53	0.35	0.62	0.69	0.49
C3'	0.45	0.25	0.28	0.65	0.30	0.20	0.23	0.33	0.19	0.35	0.22	0.30	0.19	0.26	0.38	0.17	1.15	0.38	0.50	0.85	0.82	0.65
C4	0.09	0.17	0.48	0.68	0.08	0.30	0.08	0.35	0.07	0.13	0.13	0.14	0.13	0.14	0.09	0.30	0.94	0.11	0.55	0.76	0.84	0.66
C4'	0.54	0.23	0.24	0.51	0.37	0.17	0.34	0.24	0.25	0.53	0.22	0.29	0.23	0.43	0.50	0.19	0.99	0.46	0.36	0.63	0.60	0.48
C5	0.11	0.18	0.48	0.77	0.05	0.48	0.06	0.58	0.08	0.20	0.19	0.10	0.09	0.19	0.12	0.28	0.98	0.17	0.77	1.02	1.08	0.91
C5'	0.37	0.20	0.21	0.69	0.32	0.42	0.39	0.56	0.33	0.57	0.24	0.20	0.37	0.53	0.43	0.16	1.25	0.17	0.57	0.91	0.69	0.68
C6	0.13	0.22	0.47	0.73	0.08	0.46	0.12	0.56	0.05	0.27	0.22	0.12	0.06	0.28	0.15	0.29	0.93	0.18	0.76	1.01	1.08	0.90
C8	0.11	0.17	0.48	0.87	0.12	0.59	0.15	0.72	0.20	0.12	0.21	0.12	0.22	0.13	0.10	0.26	1.10	0.23	0.87	1.14	1.13	1.00
N1	0.11	0.24	0.47	0.64	0.11	0.30	0.17	0.35	0.12	0.25	0.18	0.18	0.23	0.30	0.14	0.32	0.87	0.10	0.57	0.77	0.87	0.68
N2	0.16	0.25	0.46	0.51	0.16	0.13	0.21	0.24	0.24	0.21	0.15	0.25	0.41	0.28	0.15	0.36	0.78	0.32	0.36	0.48	0.62	0.46
N3	0.15	0.19	0.47	0.58	0.13	0.16	0.13	0.21	0.14	0.15	0.08	0.20	0.27	0.18	0.13	0.33	0.86	0.26	0.40	0.57	0.68	0.50
N7	0.17	0.17	0.48	0.88	0.07	0.66	0.09	0.83	0.19	0.18	0.23	0.08	0.24	0.12	0.14	0.26	1.06	0.34	1.00	1.29	1.31	1.16
N9	0.12	0.18	0.47	0.71	0.14	0.32	0.13	0.39	0.15	0.13	0.18	0.16	0.14	0.12	0.13	0.27	0.99	0.12	0.57	0.79	0.83	0.67
O2'	0.67	0.35	0.19	0.26	0.44	0.41	0.29	0.44	0.21	0.44	0.26	0.48	0.19	0.30	0.53	0.17	0.70	0.86	0.34	0.43	0.53	0.43
O3'	0.60	0.30	0.20	0.52	0.37	0.15	0.26	0.21	0.19	0.42	0.23	0.39	0.18	0.29	0.48	0.32	1.06	0.56	0.40	0.78	0.76	0.57
O4'	0.42	0.23	0.34	0.53	0.36	0.17	0.34	0.24	0.26	0.48	0.23	0.26	0.24	0.41	0.45	0.19	0.90	0.39	0.37	0.58	0.60	0.47
O5'	0.08	0.24	0.47	1.17	0.23	0.92	0.36	1.13	0.38	0.36	0.32	0.18	0.46	0.44	0.21	0.25	1.72	0.37	1.10	1.50	1.14	1.22
O6	0.18	0.23	0.45	0.76	0.08	0.56	0.12	0.70	0.10	0.31	0.25	0.11	0.10	0.30	0.19	0.28	0.92	0.29	0.89	1.19	1.25	1.07
OP1	0.11	0.59	0.49	1.32	0.57	1.38	0.98	1.66	1.11	0.80	0.90	0.38	1.38	1.14	0.41	0.61	2.12	0.68	1.33	1.96	1.06	1.44
OP2	0.22	0.23	0.22	0.70	0.29	0.79	0.38	1.26	0.36	0.46	0.29	0.21	0.42	0.48	0.32	0.48	1.03	0.34	1.28	1.83	1.42	1.52
P	0.26	0.16	0.52	1.42	0.13	1.39	0.35	1.69	0.41	0.32	0.30	0.12	0.56	0.48	0.08	0.37	2.05	0.80	1.54	2.01	1.42	1.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.12	0.14	0.13	0.10
C2	0.02	0.00	0.38	0.13	0.00	0.27	0.00	0.54	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.46	0.28	0.41	0.52	0.61	0.62	0.66
C2'	0.00	0.38	0.00	0.01	0.20	0.02	0.10	0.03	0.19	0.21	0.31	0.36	0.14	0.11	0.01	0.00	0.07	0.01	0.11	0.20	0.21	0.14
C3'	0.01	0.13	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.03	0.09	0.13	0.12	0.11	0.11	0.11	0.04	0.04	0.01	0.01	0.11	0.23	0.20	0.16
C4	0.01	0.00	0.20	0.06	0.00	0.14	0.00	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.21	0.13	0.22	0.33	0.35	0.37	0.37
C4'	0.00	0.27	0.02	0.00	0.14	0.00	0.08	0.01	0.12	0.18	0.21	0.26	0.09	0.12	0.04	0.08	0.03	0.00	0.02	0.09	0.04	0.01
C5	0.01	0.00	0.10	0.07	0.00	0.08	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.11	0.09	0.30	0.35	0.39	0.36
C5'	0.05	0.54	0.03	0.03	0.29	0.01	0.23	0.00	0.32	0.31	0.46	0.49	0.28	0.25	0.13	0.08	0.04	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.19	0.09	0.01	0.12	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.16	0.18	0.37	0.43	0.49	0.47
C8	0.01	0.00	0.21	0.13	0.00	0.18	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.22	0.19	0.24	0.41	0.42	0.43	0.45
N1	0.02	0.00	0.31	0.12	0.01	0.21	0.00	0.46	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.36	0.24	0.31	0.47	0.56	0.60	0.61
N3	0.02	0.01	0.36	0.11	0.00	0.26	0.00	0.49	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.43	0.25	0.41	0.47	0.52	0.52	0.56
N6	0.01	0.00	0.14	0.11	0.00	0.09	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.16	0.12	0.34	0.42	0.49	0.46
N7	0.01	0.00	0.11	0.11	0.00	0.12	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.13	0.16	0.13	0.35	0.41	0.44	0.43
N9	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.01	0.21	0.23	0.23	0.20
O2'	0.01	0.46	0.00	0.04	0.21	0.08	0.10	0.08	0.20	0.22	0.36	0.43	0.14	0.13	0.02	0.00	0.16	0.04	0.07	0.16	0.16	0.09
O3'	0.05	0.28	0.07	0.01	0.13	0.03	0.11	0.04	0.16	0.19	0.24	0.25	0.16	0.16	0.05	0.16	0.00	0.04	0.20	0.35	0.34	0.27
O4'	0.00	0.41	0.01	0.01	0.22	0.00	0.09	0.01	0.18	0.24	0.31	0.41	0.12	0.13	0.01	0.04	0.04	0.00	0.09	0.10	0.11	0.11
O5'	0.12	0.52	0.11	0.11	0.33	0.02	0.30	0.01	0.37	0.41	0.47	0.47	0.34	0.35	0.21	0.07	0.20	0.09	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.14	0.61	0.20	0.23	0.35	0.09	0.35	0.07	0.43	0.42	0.56	0.52	0.42	0.41	0.23	0.16	0.35	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.62	0.21	0.20	0.37	0.04	0.39	0.02	0.49	0.43	0.60	0.52	0.49	0.44	0.23	0.16	0.34	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.66	0.14	0.16	0.37	0.01	0.36	0.01	0.47	0.45	0.61	0.56	0.46	0.43	0.20	0.09	0.27	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00