Doublet Group distance statistics: 51062

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.001, 0.011, 0.021, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.002, 0.018, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.003, 0.021, 0.039, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.002, 0.021, 0.041, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N2	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.003, 0.027, 0.051, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.027 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.001, 0.025, 0.049, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.025 std_dev=0.024
O6	A	0, 0.007, 0.038, 0.069, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.038 std_dev=0.031
N7	A	0, 0.012, 0.045, 0.078, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.045 std_dev=0.033
C8	A	0, 0.007, 0.048, 0.089, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.048 std_dev=0.041
O4'	A	0, -0.031, 0.149, 0.329, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.149 std_dev=0.180
C2'	A	0, -0.003, 0.186, 0.374, 0.565 max_d=0.565 avg_d=0.186 std_dev=0.188
C4	B	0, 0.257, 0.492, 0.727, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.492 std_dev=0.235
O2'	A	0, 0.070, 0.315, 0.561, 0.718 max_d=0.718 avg_d=0.315 std_dev=0.245
C4'	A	0, 0.087, 0.360, 0.633, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.360 std_dev=0.273
C6	B	0, 0.353, 0.667, 0.980, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.667 std_dev=0.314
C3'	A	0, -0.055, 0.260, 0.575, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.260 std_dev=0.315
C2'	B	0, 0.280, 0.595, 0.910, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.595 std_dev=0.315
N1	B	0, 0.233, 0.555, 0.878, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.555 std_dev=0.322
N9	B	0, 0.332, 0.667, 1.003, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.667 std_dev=0.335
N3	B	0, 0.175, 0.510, 0.846, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.510 std_dev=0.336
O5'	A	0, 0.306, 0.657, 1.007, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.657 std_dev=0.351
C5	B	0, 0.350, 0.705, 1.060, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.705 std_dev=0.355
C1'	B	0, 0.290, 0.650, 1.010, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.650 std_dev=0.360
C2	B	0, 0.248, 0.608, 0.968, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.608 std_dev=0.360
O3'	A	0, 0.024, 0.426, 0.829, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.426 std_dev=0.403
C3'	B	0, 0.272, 0.688, 1.105, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.688 std_dev=0.417
O2'	B	0, 0.411, 0.836, 1.260, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.836 std_dev=0.424
N6	B	0, 0.479, 0.940, 1.402, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.940 std_dev=0.462
C5'	A	0, 0.254, 0.720, 1.187, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.720 std_dev=0.467
O3'	B	0, 0.315, 0.826, 1.336, 1.722 max_d=1.722 avg_d=0.826 std_dev=0.511
O4'	B	0, 0.267, 0.806, 1.345, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.806 std_dev=0.539
C4'	B	0, 0.257, 0.833, 1.409, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.833 std_dev=0.576
P	A	0, 0.158, 0.740, 1.322, 1.788 max_d=1.788 avg_d=0.740 std_dev=0.582
C8	B	0, 0.373, 0.983, 1.593, 1.629 max_d=1.629 avg_d=0.983 std_dev=0.610
N7	B	0, 0.431, 1.056, 1.680, 1.756 max_d=1.756 avg_d=1.056 std_dev=0.624
OP2	A	0, 0.232, 0.875, 1.518, 2.036 max_d=2.036 avg_d=0.875 std_dev=0.643
O5'	B	0, 0.361, 1.040, 1.718, 2.226 max_d=2.226 avg_d=1.040 std_dev=0.679
C5'	B	0, 0.262, 0.978, 1.694, 2.332 max_d=2.332 avg_d=0.978 std_dev=0.716
OP2	B	0, 0.459, 1.207, 1.955, 2.260 max_d=2.260 avg_d=1.207 std_dev=0.748
OP1	A	0, 0.124, 0.878, 1.631, 2.265 max_d=2.265 avg_d=0.878 std_dev=0.753
P	B	0, 0.356, 1.168, 1.979, 2.527 max_d=2.527 avg_d=1.168 std_dev=0.812
OP1	B	0, 0.301, 1.256, 2.210, 2.994 max_d=2.994 avg_d=1.256 std_dev=0.954

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.17	0.02	0.18	0.14	0.15
C2	0.03	0.00	0.12	0.19	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.21	0.05	0.34	0.01	0.33	0.37	0.33
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.08	0.01	0.06	0.02	0.07	0.07	0.10	0.15	0.13	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.25	0.06	0.28	0.11	0.21
C3'	0.02	0.19	0.00	0.00	0.16	0.00	0.16	0.03	0.18	0.10	0.19	0.21	0.18	0.13	0.10	0.01	0.00	0.03	0.33	0.18	0.37	0.08	0.27
C4	0.02	0.00	0.08	0.16	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.16	0.03	0.34	0.01	0.33	0.34	0.33
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.12	0.07	0.04	0.04	0.12	0.07	0.07	0.03	0.00	0.02	0.11	0.10	0.23	0.01
C5	0.01	0.00	0.06	0.16	0.00	0.10	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.08	0.17	0.02	0.41	0.01	0.40	0.44	0.41
C5'	0.04	0.14	0.02	0.03	0.17	0.00	0.23	0.00	0.24	0.24	0.19	0.11	0.12	0.27	0.16	0.07	0.03	0.02	0.01	0.27	0.18	0.38	0.03
C6	0.01	0.00	0.07	0.18	0.01	0.10	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.20	0.03	0.42	0.01	0.43	0.49	0.43
C8	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.12	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.11	0.04	0.38	0.01	0.36	0.35	0.37
N1	0.02	0.00	0.10	0.19	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.22	0.04	0.39	0.01	0.39	0.45	0.39
N2	0.03	0.00	0.15	0.21	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.24	0.06	0.32	0.01	0.31	0.36	0.31
N3	0.03	0.00	0.13	0.18	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.19	0.05	0.30	0.01	0.29	0.31	0.29
N7	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.12	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.15	0.04	0.43	0.01	0.43	0.46	0.44
N9	0.00	0.01	0.03	0.10	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.10	0.01	0.31	0.01	0.29	0.27	0.28
O2'	0.03	0.11	0.00	0.01	0.07	0.07	0.08	0.07	0.11	0.04	0.12	0.12	0.09	0.07	0.03	0.00	0.02	0.09	0.03	0.11	0.08	0.13	0.02
O3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.16	0.03	0.17	0.03	0.20	0.11	0.22	0.24	0.19	0.15	0.10	0.02	0.00	0.02	0.23	0.20	0.34	0.10	0.21
O4'	0.01	0.05	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04	0.01	0.09	0.02	0.00	0.07	0.03	0.11	0.14	0.07
O5'	0.17	0.34	0.25	0.33	0.34	0.02	0.41	0.01	0.42	0.38	0.39	0.32	0.30	0.43	0.31	0.03	0.23	0.07	0.00	0.45	0.01	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.06	0.18	0.01	0.11	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.20	0.03	0.45	0.00	0.48	0.54	0.47
OP1	0.18	0.33	0.28	0.37	0.33	0.10	0.40	0.18	0.43	0.36	0.39	0.31	0.29	0.43	0.29	0.08	0.34	0.11	0.01	0.48	0.00	0.06	0.00
OP2	0.14	0.37	0.11	0.08	0.34	0.23	0.44	0.38	0.49	0.35	0.45	0.36	0.31	0.46	0.27	0.13	0.10	0.14	0.02	0.54	0.06	0.00	0.01
P	0.15	0.33	0.21	0.27	0.33	0.01	0.41	0.03	0.43	0.37	0.39	0.31	0.29	0.44	0.28	0.02	0.21	0.07	0.01	0.47	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.17	0.14	0.15	0.18	0.13	0.21	0.13	0.20	0.20	0.18	0.18	0.21	0.22	0.17	0.23	0.23	0.13	0.17	0.21	0.32	0.22
C2	0.12	0.13	0.17	0.23	0.10	0.16	0.13	0.22	0.14	0.14	0.08	0.13	0.21	0.18	0.10	0.24	0.31	0.10	0.30	0.41	0.51	0.38
C2'	0.11	0.20	0.10	0.15	0.17	0.12	0.20	0.12	0.21	0.17	0.21	0.19	0.22	0.20	0.14	0.21	0.27	0.08	0.12	0.19	0.26	0.17
C3'	0.09	0.14	0.16	0.22	0.13	0.22	0.18	0.20	0.19	0.16	0.17	0.12	0.22	0.20	0.10	0.30	0.37	0.13	0.12	0.18	0.20	0.13
C4	0.17	0.14	0.21	0.26	0.16	0.21	0.19	0.25	0.18	0.20	0.11	0.16	0.22	0.23	0.16	0.26	0.33	0.16	0.30	0.39	0.47	0.37
C4'	0.08	0.14	0.11	0.11	0.14	0.13	0.18	0.10	0.17	0.19	0.15	0.13	0.19	0.22	0.12	0.30	0.21	0.09	0.10	0.12	0.27	0.14
C5	0.24	0.19	0.27	0.33	0.22	0.30	0.26	0.35	0.23	0.28	0.16	0.21	0.26	0.30	0.24	0.27	0.38	0.23	0.41	0.50	0.57	0.48
C5'	0.22	0.17	0.27	0.23	0.17	0.30	0.21	0.22	0.20	0.22	0.17	0.19	0.23	0.26	0.16	0.52	0.36	0.24	0.13	0.13	0.30	0.15
C6	0.22	0.20	0.25	0.33	0.21	0.29	0.25	0.37	0.23	0.27	0.17	0.20	0.29	0.30	0.23	0.26	0.38	0.22	0.44	0.56	0.64	0.53
C8	0.31	0.20	0.33	0.36	0.28	0.34	0.28	0.36	0.21	0.31	0.15	0.25	0.20	0.31	0.30	0.33	0.40	0.29	0.37	0.42	0.47	0.41
N1	0.16	0.17	0.20	0.27	0.14	0.22	0.18	0.29	0.17	0.20	0.13	0.16	0.25	0.23	0.15	0.24	0.35	0.15	0.37	0.50	0.59	0.47
N2	0.10	0.13	0.15	0.20	0.07	0.13	0.10	0.18	0.11	0.10	0.06	0.13	0.19	0.14	0.06	0.25	0.30	0.07	0.27	0.39	0.49	0.36
N3	0.12	0.12	0.17	0.21	0.09	0.15	0.14	0.19	0.14	0.14	0.08	0.13	0.20	0.17	0.10	0.25	0.30	0.10	0.25	0.35	0.44	0.33
N7	0.32	0.21	0.33	0.40	0.30	0.38	0.32	0.43	0.25	0.36	0.17	0.26	0.24	0.37	0.32	0.32	0.43	0.32	0.46	0.54	0.59	0.53
N9	0.20	0.15	0.23	0.25	0.19	0.22	0.21	0.24	0.19	0.22	0.14	0.19	0.20	0.24	0.19	0.27	0.32	0.18	0.27	0.33	0.41	0.32
O2'	0.25	0.26	0.17	0.11	0.26	0.14	0.25	0.13	0.24	0.25	0.24	0.27	0.23	0.25	0.25	0.20	0.13	0.21	0.18	0.18	0.31	0.21
O3'	0.08	0.13	0.13	0.20	0.12	0.20	0.18	0.20	0.19	0.17	0.17	0.10	0.22	0.21	0.11	0.27	0.33	0.12	0.13	0.18	0.20	0.14
O4'	0.09	0.12	0.11	0.11	0.13	0.10	0.18	0.08	0.17	0.18	0.15	0.11	0.18	0.20	0.12	0.25	0.20	0.08	0.12	0.16	0.28	0.17
O5'	0.18	0.06	0.21	0.09	0.06	0.10	0.09	0.07	0.13	0.12	0.11	0.07	0.19	0.11	0.12	0.27	0.02	0.14	0.11	0.13	0.15	0.12
O6	0.26	0.22	0.28	0.36	0.24	0.34	0.29	0.43	0.27	0.32	0.21	0.22	0.33	0.35	0.27	0.26	0.41	0.27	0.51	0.65	0.72	0.62
OP1	0.06	0.09	0.09	0.03	0.06	0.06	0.13	0.11	0.17	0.11	0.14	0.05	0.23	0.15	0.06	0.15	0.04	0.04	0.08	0.13	0.10	0.10
OP2	0.07	0.19	0.08	0.06	0.17	0.10	0.24	0.16	0.27	0.20	0.24	0.15	0.32	0.26	0.15	0.09	0.01	0.09	0.15	0.21	0.15	0.17
P	0.05	0.12	0.08	0.01	0.08	0.02	0.14	0.07	0.18	0.12	0.17	0.07	0.23	0.16	0.07	0.13	0.00	0.01	0.08	0.12	0.10	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.06	0.11	0.06
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.15	0.03	0.15	0.18	0.28	0.18
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.09	0.08	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.08	0.12	0.07
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.12	0.08	0.13	0.09	0.14	0.09	0.05	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.10	0.07
C4	0.01	0.00	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.01	0.15	0.17	0.25	0.17
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.05	0.03	0.08	0.07	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.04	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.12	0.02	0.19	0.23	0.32	0.23
C5'	0.01	0.07	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.12	0.10	0.05	0.14	0.14	0.07	0.05	0.05	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.16	0.02	0.20	0.26	0.35	0.25
C8	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.08	0.04	0.17	0.20	0.25	0.20
N1	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.17	0.03	0.18	0.23	0.33	0.23
N3	0.02	0.00	0.08	0.09	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.12	0.03	0.13	0.14	0.24	0.15
N6	0.02	0.01	0.08	0.14	0.01	0.08	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.18	0.03	0.22	0.29	0.39	0.29
N7	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.03	0.20	0.25	0.33	0.25
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.12	0.14	0.20	0.14
O2'	0.02	0.09	0.00	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.06	0.02	0.08	0.08	0.06	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.06	0.07	0.10	0.06
O3'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.10	0.02	0.12	0.05	0.16	0.08	0.17	0.12	0.18	0.11	0.05	0.04	0.00	0.01	0.09	0.12	0.12	0.11
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.05	0.05	0.04
O5'	0.06	0.15	0.06	0.07	0.15	0.02	0.19	0.01	0.20	0.17	0.18	0.13	0.22	0.20	0.12	0.06	0.09	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.06	0.18	0.08	0.09	0.17	0.04	0.23	0.04	0.26	0.20	0.23	0.14	0.29	0.25	0.14	0.07	0.12	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00
OP2	0.11	0.28	0.12	0.10	0.25	0.04	0.32	0.01	0.35	0.25	0.33	0.24	0.39	0.33	0.20	0.10	0.12	0.05	0.01	0.05	0.00	0.00
P	0.06	0.18	0.07	0.07	0.17	0.02	0.23	0.01	0.25	0.20	0.23	0.15	0.29	0.25	0.14	0.06	0.11	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00