Doublet Group distance statistics: 51065

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.003, 0.016, 0.028, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.022 std_dev=0.015
C4	A	0, 0.004, 0.020, 0.035, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.002, 0.017, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.030 std_dev=0.023
O6	A	0, -0.006, 0.020, 0.046, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.020 std_dev=0.026
N2	A	0, -0.008, 0.022, 0.052, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.022 std_dev=0.030
C5	B	0, 0.016, 0.218, 0.420, 0.475 max_d=0.475 avg_d=0.218 std_dev=0.202
C6	B	0, -0.018, 0.251, 0.519, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.251 std_dev=0.268
N7	B	0, 0.018, 0.306, 0.593, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.306 std_dev=0.287
C2'	A	0, -0.073, 0.247, 0.568, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.247 std_dev=0.321
O4'	A	0, -0.069, 0.252, 0.573, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.252 std_dev=0.321
N6	B	0, -0.051, 0.320, 0.691, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.320 std_dev=0.371
C4	B	0, -0.063, 0.392, 0.847, 1.137 max_d=1.137 avg_d=0.392 std_dev=0.455
C8	B	0, -0.050, 0.446, 0.943, 1.227 max_d=1.227 avg_d=0.446 std_dev=0.496
N1	B	0, -0.086, 0.450, 0.985, 1.340 max_d=1.340 avg_d=0.450 std_dev=0.536
N9	B	0, -0.121, 0.465, 1.052, 1.446 max_d=1.446 avg_d=0.465 std_dev=0.586
C4'	A	0, -0.187, 0.409, 1.006, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.409 std_dev=0.597
C2'	B	0, -0.182, 0.451, 1.084, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.451 std_dev=0.633
C3'	A	0, -0.009, 0.631, 1.271, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.631 std_dev=0.640
C2	B	0, -0.091, 0.568, 1.227, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.568 std_dev=0.659
N3	B	0, -0.096, 0.564, 1.223, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.564 std_dev=0.659
C5'	A	0, -0.082, 0.580, 1.243, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.580 std_dev=0.662
O5'	A	0, 0.007, 0.672, 1.338, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.672 std_dev=0.666
O2'	A	0, 0.025, 0.738, 1.451, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.738 std_dev=0.713
O2'	B	0, -0.140, 0.643, 1.425, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.643 std_dev=0.783
C1'	B	0, -0.219, 0.643, 1.504, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.643 std_dev=0.862
C3'	B	0, -0.362, 0.613, 1.589, 2.301 max_d=2.301 avg_d=0.613 std_dev=0.975
P	A	0, -0.220, 0.802, 1.824, 2.519 max_d=2.519 avg_d=0.802 std_dev=1.022
O3'	B	0, -0.371, 0.696, 1.763, 2.539 max_d=2.539 avg_d=0.696 std_dev=1.067
O3'	A	0, 0.011, 1.154, 2.298, 2.478 max_d=2.478 avg_d=1.154 std_dev=1.143
OP2	A	0, -0.154, 1.008, 2.169, 2.906 max_d=2.906 avg_d=1.008 std_dev=1.162
OP1	A	0, -0.225, 0.967, 2.160, 2.966 max_d=2.966 avg_d=0.967 std_dev=1.193
O4'	B	0, -0.314, 0.927, 2.167, 3.030 max_d=3.030 avg_d=0.927 std_dev=1.241
OP2	B	0, 0.077, 1.329, 2.580, 3.358 max_d=3.358 avg_d=1.329 std_dev=1.252
C4'	B	0, -0.446, 0.884, 2.215, 3.178 max_d=3.178 avg_d=0.884 std_dev=1.331
O5'	B	0, -0.353, 1.088, 2.530, 3.568 max_d=3.568 avg_d=1.088 std_dev=1.442
P	B	0, -0.309, 1.245, 2.799, 3.908 max_d=3.908 avg_d=1.245 std_dev=1.554
C5'	B	0, -0.483, 1.156, 2.796, 3.973 max_d=3.973 avg_d=1.156 std_dev=1.639
OP1	B	0, -0.527, 1.532, 3.590, 5.077 max_d=5.077 avg_d=1.532 std_dev=2.058

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.20	0.01	0.17	0.01	0.14	0.31	0.17
C2	0.03	0.00	0.15	0.11	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.30	0.17	0.07	0.01	0.07	0.19	0.04
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.02	0.04	0.18	0.07	0.08	0.13	0.17	0.14	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.44	0.07	0.45	0.62	0.47
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.17	0.01	0.27	0.02	0.26	0.33	0.20	0.06	0.07	0.35	0.19	0.01	0.00	0.02	0.08	0.31	0.13	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.08	0.17	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.18	0.12	0.07	0.08	0.00	0.12	0.30	0.15
C4'	0.01	0.10	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.01	0.08	0.24	0.02	0.17	0.11	0.22	0.08	0.28	0.01	0.01	0.02	0.12	0.05	0.02	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.27	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.29	0.13	0.02	0.17	0.01	0.24	0.39	0.27
C5'	0.07	0.12	0.18	0.02	0.05	0.01	0.14	0.00	0.11	0.30	0.03	0.20	0.13	0.28	0.10	0.09	0.18	0.01	0.02	0.17	0.07	0.05	0.04
C6	0.01	0.00	0.07	0.26	0.00	0.08	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.14	0.03	0.15	0.00	0.21	0.36	0.23
C8	0.02	0.01	0.08	0.33	0.01	0.24	0.01	0.30	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.26	0.18	0.34	0.02	0.41	0.54	0.46
N1	0.01	0.00	0.13	0.20	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.20	0.19	0.10	0.04	0.01	0.07	0.25	0.10
N2	0.04	0.00	0.17	0.06	0.01	0.17	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.41	0.23	0.14	0.00	0.17	0.14	0.12
N3	0.04	0.01	0.14	0.07	0.00	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.30	0.18	0.11	0.01	0.10	0.21	0.08
N7	0.01	0.02	0.04	0.35	0.01	0.22	0.01	0.28	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.35	0.26	0.13	0.33	0.02	0.43	0.55	0.45
N9	0.01	0.01	0.01	0.19	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.19	0.04	0.04	0.14	0.01	0.19	0.35	0.23
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.18	0.28	0.29	0.09	0.28	0.31	0.20	0.08	0.09	0.35	0.19	0.00	0.03	0.18	0.31	0.33	0.28	0.65	0.36
O3'	0.20	0.30	0.01	0.00	0.12	0.01	0.13	0.18	0.14	0.26	0.19	0.41	0.30	0.26	0.04	0.03	0.00	0.15	0.11	0.19	0.22	0.18	0.16
O4'	0.01	0.17	0.02	0.02	0.07	0.01	0.02	0.01	0.03	0.18	0.10	0.23	0.18	0.13	0.04	0.18	0.15	0.00	0.03	0.02	0.08	0.05	0.07
O5'	0.17	0.07	0.44	0.08	0.08	0.02	0.17	0.02	0.15	0.34	0.04	0.14	0.11	0.33	0.14	0.31	0.11	0.03	0.00	0.22	0.01	0.01	0.02
O6	0.01	0.01	0.07	0.31	0.00	0.12	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.33	0.19	0.02	0.22	0.00	0.30	0.44	0.31
OP1	0.14	0.07	0.45	0.13	0.12	0.05	0.24	0.07	0.21	0.41	0.07	0.17	0.10	0.43	0.19	0.28	0.22	0.08	0.01	0.30	0.00	0.03	0.01
OP2	0.31	0.19	0.62	0.11	0.30	0.02	0.39	0.05	0.36	0.54	0.25	0.14	0.21	0.55	0.35	0.65	0.18	0.05	0.01	0.44	0.03	0.00	0.01
P	0.17	0.04	0.47	0.07	0.15	0.04	0.27	0.04	0.23	0.46	0.10	0.12	0.08	0.45	0.23	0.36	0.16	0.07	0.02	0.31	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.57	0.09	0.12	0.20	0.08	0.08	0.12	0.23	0.29	0.46	0.47	0.15	0.20	0.08	0.24	0.17	0.08	0.09	0.15	0.02	0.07
C2	0.44	0.31	0.27	0.15	0.16	0.30	0.05	0.26	0.21	0.35	0.38	0.15	0.27	0.20	0.34	0.38	0.11	0.42	0.23	0.22	0.29	0.22
C2'	0.06	0.60	0.08	0.28	0.22	0.24	0.09	0.34	0.25	0.29	0.49	0.49	0.15	0.21	0.05	0.10	0.32	0.12	0.35	0.34	0.30	0.33
C3'	0.11	0.52	0.07	0.04	0.15	0.03	0.12	0.09	0.20	0.41	0.41	0.42	0.17	0.35	0.14	0.14	0.08	0.05	0.09	0.24	0.17	0.12
C4	0.18	0.46	0.09	0.07	0.11	0.03	0.04	0.05	0.21	0.30	0.41	0.34	0.16	0.21	0.13	0.20	0.12	0.11	0.05	0.12	0.11	0.04
C4'	0.09	0.54	0.07	0.06	0.19	0.05	0.07	0.10	0.20	0.30	0.43	0.46	0.10	0.21	0.07	0.13	0.12	0.03	0.10	0.23	0.13	0.11
C5	0.03	0.34	0.08	0.21	0.12	0.15	0.06	0.20	0.15	0.22	0.29	0.26	0.08	0.19	0.04	0.10	0.25	0.06	0.19	0.24	0.16	0.16
C5'	0.19	0.50	0.20	0.12	0.24	0.15	0.12	0.16	0.21	0.24	0.39	0.45	0.11	0.17	0.13	0.25	0.09	0.15	0.13	0.24	0.07	0.12
C6	0.13	0.15	0.05	0.12	0.02	0.05	0.06	0.10	0.09	0.20	0.16	0.07	0.09	0.17	0.12	0.12	0.18	0.06	0.11	0.18	0.23	0.11
C8	0.20	0.48	0.28	0.45	0.27	0.42	0.11	0.48	0.18	0.17	0.36	0.46	0.05	0.17	0.14	0.22	0.49	0.32	0.44	0.45	0.24	0.37
N1	0.32	0.15	0.17	0.06	0.15	0.18	0.06	0.15	0.13	0.27	0.23	0.12	0.22	0.16	0.27	0.26	0.07	0.29	0.14	0.16	0.28	0.15
N2	0.57	0.26	0.36	0.27	0.25	0.46	0.09	0.43	0.22	0.38	0.38	0.22	0.33	0.19	0.43	0.49	0.22	0.59	0.37	0.35	0.39	0.35
N3	0.40	0.46	0.25	0.13	0.09	0.25	0.04	0.20	0.23	0.38	0.45	0.25	0.23	0.22	0.30	0.38	0.09	0.36	0.18	0.17	0.24	0.18
N7	0.20	0.38	0.26	0.44	0.24	0.41	0.11	0.48	0.13	0.15	0.27	0.37	0.03	0.18	0.16	0.19	0.46	0.33	0.46	0.47	0.28	0.40
N9	0.05	0.53	0.09	0.20	0.21	0.15	0.08	0.19	0.22	0.27	0.43	0.45	0.12	0.19	0.03	0.16	0.24	0.06	0.17	0.21	0.05	0.13
O2'	0.11	0.64	0.09	0.18	0.23	0.11	0.19	0.25	0.34	0.27	0.55	0.51	0.32	0.25	0.02	0.39	0.19	0.04	0.35	0.37	0.45	0.39
O3'	0.09	0.70	0.07	0.05	0.24	0.04	0.09	0.10	0.28	0.35	0.57	0.57	0.16	0.26	0.06	0.13	0.13	0.03	0.15	0.36	0.25	0.21
O4'	0.11	0.53	0.07	0.10	0.18	0.10	0.08	0.11	0.21	0.30	0.42	0.44	0.14	0.21	0.08	0.20	0.19	0.09	0.11	0.21	0.15	0.12
O5'	0.12	0.32	0.15	0.02	0.08	0.01	0.03	0.09	0.08	0.30	0.24	0.27	0.07	0.23	0.09	0.22	0.03	0.05	0.12	0.28	0.12	0.15
O6	0.05	0.01	0.07	0.20	0.05	0.14	0.10	0.20	0.07	0.11	0.01	0.02	0.09	0.14	0.06	0.06	0.25	0.07	0.21	0.27	0.31	0.20
OP1	0.05	0.27	0.06	0.06	0.12	0.13	0.05	0.24	0.11	0.11	0.21	0.25	0.08	0.08	0.03	0.13	0.04	0.10	0.26	0.38	0.21	0.26
OP2	0.10	0.31	0.03	0.08	0.18	0.16	0.11	0.25	0.16	0.07	0.25	0.29	0.12	0.06	0.10	0.05	0.02	0.16	0.30	0.43	0.19	0.28
P	0.03	0.27	0.06	0.04	0.11	0.09	0.05	0.17	0.11	0.15	0.21	0.25	0.08	0.11	0.01	0.12	0.01	0.06	0.19	0.29	0.12	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.07	0.06	0.19	0.06
C2	0.03	0.00	0.27	0.13	0.03	0.11	0.02	0.28	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.33	0.21	0.21	0.34	0.45	0.56	0.46
C2'	0.01	0.27	0.00	0.01	0.13	0.01	0.06	0.02	0.11	0.14	0.21	0.26	0.07	0.08	0.03	0.00	0.01	0.02	0.08	0.05	0.18	0.08
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.05	0.09	0.10	0.13	0.07	0.07	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.10	0.04
C4	0.01	0.03	0.13	0.06	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.16	0.10	0.12	0.26	0.28	0.44	0.31
C4'	0.02	0.11	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.07	0.11	0.09	0.12	0.05	0.03	0.03	0.05	0.01	0.02	0.06	0.05	0.01
C5	0.01	0.02	0.06	0.04	0.00	0.07	0.00	0.17	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.05	0.05	0.26	0.29	0.51	0.32
C5'	0.03	0.28	0.02	0.01	0.17	0.01	0.17	0.00	0.23	0.12	0.27	0.24	0.24	0.10	0.07	0.03	0.09	0.01	0.01	0.08	0.02	0.03
C6	0.01	0.00	0.11	0.05	0.01	0.09	0.01	0.23	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.09	0.11	0.32	0.40	0.60	0.42
C8	0.01	0.02	0.14	0.09	0.00	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.10	0.14	0.11	0.07	0.32	0.11
N1	0.03	0.00	0.21	0.10	0.02	0.11	0.02	0.27	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.26	0.17	0.17	0.35	0.47	0.61	0.48
N3	0.02	0.01	0.26	0.13	0.01	0.09	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.32	0.20	0.21	0.30	0.37	0.47	0.38
N6	0.02	0.01	0.07	0.07	0.02	0.12	0.03	0.24	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.06	0.03	0.10	0.08	0.09	0.34	0.44	0.66	0.45
N7	0.01	0.03	0.08	0.07	0.00	0.05	0.01	0.10	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.07	0.08	0.17	0.14	0.44	0.18
N9	0.01	0.03	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.15	0.10	0.31	0.14
O2'	0.03	0.33	0.00	0.02	0.16	0.03	0.09	0.03	0.15	0.10	0.26	0.32	0.10	0.04	0.03	0.00	0.04	0.02	0.03	0.03	0.13	0.02
O3'	0.04	0.21	0.01	0.02	0.10	0.05	0.05	0.09	0.09	0.10	0.17	0.20	0.08	0.07	0.03	0.04	0.00	0.04	0.07	0.06	0.07	0.04
O4'	0.02	0.21	0.02	0.02	0.12	0.01	0.05	0.01	0.11	0.14	0.17	0.21	0.09	0.08	0.00	0.02	0.04	0.00	0.06	0.14	0.10	0.06
O5'	0.07	0.34	0.08	0.03	0.26	0.02	0.26	0.01	0.32	0.11	0.35	0.30	0.34	0.17	0.15	0.03	0.07	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.06	0.45	0.05	0.04	0.28	0.06	0.29	0.08	0.40	0.07	0.47	0.37	0.44	0.14	0.10	0.03	0.06	0.14	0.02	0.00	0.03	0.00
OP2	0.19	0.56	0.18	0.10	0.44	0.05	0.51	0.02	0.60	0.32	0.61	0.47	0.66	0.44	0.31	0.13	0.07	0.10	0.02	0.03	0.00	0.00
P	0.06	0.46	0.08	0.04	0.31	0.01	0.32	0.03	0.42	0.11	0.48	0.38	0.45	0.18	0.14	0.02	0.04	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00