Doublet Group distance statistics: 51067

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.006, 0.021, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.015
C2	A	0, -0.002, 0.016, 0.033, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C5	A	0, 0.008, 0.028, 0.048, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N3	A	0, -0.002, 0.020, 0.043, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.020 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.001, 0.025, 0.048, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.025 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.008, 0.034, 0.060, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.034 std_dev=0.026
N9	A	0, 0.012, 0.041, 0.070, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.041 std_dev=0.029
O6	A	0, 0.015, 0.052, 0.089, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.052 std_dev=0.037
N2	A	0, -0.009, 0.037, 0.083, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.037 std_dev=0.046
N7	A	0, 0.010, 0.058, 0.105, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.058 std_dev=0.048
C8	A	0, 0.016, 0.070, 0.124, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.070 std_dev=0.054
C4	B	0, 0.040, 0.216, 0.392, 0.431 max_d=0.431 avg_d=0.216 std_dev=0.176
C5	B	0, 0.043, 0.242, 0.441, 0.488 max_d=0.488 avg_d=0.242 std_dev=0.199
O4'	A	0, 0.013, 0.244, 0.474, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.244 std_dev=0.231
C2'	A	0, 0.053, 0.305, 0.558, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.305 std_dev=0.253
O2'	A	0, 0.087, 0.366, 0.645, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.366 std_dev=0.279
C6	B	0, 0.118, 0.415, 0.711, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.415 std_dev=0.296
N3	B	0, 0.023, 0.361, 0.699, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.361 std_dev=0.338
N1	B	0, 0.145, 0.512, 0.879, 0.839 max_d=0.839 avg_d=0.512 std_dev=0.367
C2	B	0, 0.101, 0.470, 0.840, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.470 std_dev=0.370
N9	B	0, 0.139, 0.518, 0.896, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.518 std_dev=0.378
N7	B	0, 0.162, 0.554, 0.946, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.554 std_dev=0.392
C4'	A	0, 0.005, 0.398, 0.790, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.398 std_dev=0.392
C3'	A	0, 0.044, 0.444, 0.843, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.444 std_dev=0.399
C8	B	0, 0.185, 0.638, 1.091, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.638 std_dev=0.453
N6	B	0, 0.209, 0.713, 1.217, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.713 std_dev=0.504
C5'	A	0, 0.040, 0.626, 1.213, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.626 std_dev=0.587
C1'	B	0, 0.207, 0.836, 1.464, 1.516 max_d=1.516 avg_d=0.836 std_dev=0.628
O3'	A	0, 0.052, 0.685, 1.318, 1.527 max_d=1.527 avg_d=0.685 std_dev=0.633
O5'	A	0, -0.087, 0.548, 1.184, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.548 std_dev=0.635
P	A	0, 0.307, 1.050, 1.792, 1.617 max_d=1.617 avg_d=1.050 std_dev=0.743
O4'	B	0, 0.206, 1.009, 1.812, 1.964 max_d=1.964 avg_d=1.009 std_dev=0.803
C2'	B	0, 0.411, 1.540, 2.669, 2.674 max_d=2.674 avg_d=1.540 std_dev=1.129
C4'	B	0, 0.486, 1.684, 2.881, 2.688 max_d=2.688 avg_d=1.684 std_dev=1.198
OP2	A	0, 0.494, 1.703, 2.911, 2.680 max_d=2.680 avg_d=1.703 std_dev=1.208
C3'	B	0, 0.541, 1.955, 3.368, 3.294 max_d=3.294 avg_d=1.955 std_dev=1.414
O2'	B	0, 0.500, 1.931, 3.362, 3.420 max_d=3.420 avg_d=1.931 std_dev=1.431
C5'	B	0, 0.647, 2.313, 3.979, 3.858 max_d=3.858 avg_d=2.313 std_dev=1.666
OP1	A	0, 0.427, 2.253, 4.078, 4.471 max_d=4.471 avg_d=2.253 std_dev=1.825
O3'	B	0, 0.688, 2.599, 4.509, 4.537 max_d=4.537 avg_d=2.599 std_dev=1.910
O5'	B	0, 0.918, 3.166, 5.414, 4.994 max_d=4.994 avg_d=3.166 std_dev=2.248
P	B	0, 1.126, 3.846, 6.566, 5.811 max_d=5.811 avg_d=3.846 std_dev=2.720
OP2	B	0, 1.205, 4.329, 7.454, 7.260 max_d=7.260 avg_d=4.329 std_dev=3.124
OP1	B	0, 1.383, 4.758, 8.133, 7.466 max_d=7.466 avg_d=4.758 std_dev=3.375

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.02	0.41	0.14	0.10
C2	0.04	0.00	0.27	0.31	0.00	0.12	0.01	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.40	0.02	0.16	0.00	0.60	0.41	0.17
C2'	0.00	0.27	0.00	0.01	0.14	0.01	0.09	0.02	0.14	0.07	0.21	0.32	0.26	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.04	0.12	0.32	0.13	0.10
C3'	0.02	0.31	0.01	0.00	0.18	0.00	0.13	0.01	0.18	0.06	0.26	0.37	0.28	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.05	0.15	0.33	0.12	0.12
C4	0.02	0.00	0.14	0.18	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.21	0.02	0.12	0.01	0.56	0.36	0.14
C4'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.06	0.08	0.15	0.11	0.04	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.15	0.10	0.04
C5	0.01	0.01	0.09	0.13	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.17	0.03	0.08	0.00	0.58	0.42	0.12
C5'	0.02	0.11	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.03	0.04	0.07	0.14	0.11	0.04	0.03	0.06	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.20	0.01
C6	0.02	0.00	0.14	0.18	0.01	0.04	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.25	0.04	0.09	0.00	0.59	0.47	0.12
C8	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.00	0.58	0.32	0.14
N1	0.03	0.00	0.21	0.26	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.35	0.03	0.13	0.00	0.60	0.46	0.14
N2	0.05	0.00	0.32	0.37	0.00	0.15	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.49	0.02	0.19	0.01	0.63	0.42	0.20
N3	0.04	0.00	0.26	0.28	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.34	0.02	0.16	0.01	0.57	0.36	0.17
N7	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.02	0.01	0.60	0.42	0.13
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.01	0.09	0.01	0.52	0.27	0.12
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.08	0.05	0.06	0.06	0.10	0.06	0.16	0.26	0.17	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.05	0.09	0.31	0.12	0.11
O3'	0.01	0.40	0.01	0.01	0.21	0.01	0.17	0.01	0.25	0.05	0.35	0.49	0.34	0.05	0.07	0.02	0.00	0.00	0.07	0.22	0.47	0.14	0.17
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.10	0.04	0.38	0.07	0.09
O5'	0.07	0.16	0.04	0.05	0.12	0.02	0.08	0.01	0.09	0.02	0.13	0.19	0.16	0.02	0.09	0.05	0.07	0.10	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01
O6	0.02	0.00	0.12	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.22	0.04	0.06	0.00	0.58	0.50	0.11
OP1	0.41	0.60	0.32	0.33	0.56	0.15	0.58	0.06	0.59	0.58	0.60	0.63	0.57	0.60	0.52	0.31	0.47	0.38	0.01	0.58	0.00	0.00	0.01
OP2	0.14	0.41	0.13	0.12	0.36	0.10	0.42	0.20	0.47	0.32	0.46	0.42	0.36	0.42	0.27	0.12	0.14	0.07	0.01	0.50	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.17	0.10	0.12	0.14	0.04	0.12	0.01	0.12	0.14	0.14	0.20	0.17	0.13	0.12	0.11	0.17	0.09	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.39	0.08	0.44	0.63	0.13	0.33	0.05	0.31	0.08	0.20	0.14	0.08	0.11	0.11	0.25	0.39	0.82	0.41	0.34	0.38	0.64	0.29
C2	0.24	0.16	0.08	0.24	0.15	0.03	0.09	0.05	0.03	0.18	0.11	0.18	0.13	0.15	0.19	0.13	0.34	0.24	0.52	0.11	1.25	0.47
C2'	0.34	0.15	0.48	0.79	0.21	0.38	0.16	0.43	0.15	0.20	0.14	0.22	0.15	0.16	0.25	0.37	1.06	0.36	0.51	0.48	0.82	0.45
C3'	0.20	0.04	0.62	1.07	0.06	0.63	0.04	0.79	0.06	0.10	0.07	0.04	0.08	0.06	0.12	0.39	1.39	0.23	0.91	0.90	1.15	0.88
C4	0.28	0.05	0.12	0.37	0.13	0.11	0.05	0.18	0.07	0.18	0.11	0.09	0.12	0.10	0.21	0.22	0.46	0.20	0.61	0.35	1.20	0.57
C4'	0.26	0.25	0.78	1.13	0.18	0.69	0.17	0.80	0.19	0.19	0.24	0.21	0.19	0.16	0.20	0.55	1.43	0.30	0.83	0.82	0.94	0.79
C5	0.21	0.08	0.07	0.32	0.06	0.19	0.00	0.37	0.11	0.14	0.14	0.02	0.15	0.06	0.16	0.30	0.36	0.03	0.99	0.83	1.63	1.00
C5'	0.39	0.37	0.88	1.39	0.34	1.01	0.30	1.20	0.30	0.32	0.34	0.37	0.27	0.29	0.35	0.57	1.74	0.53	1.23	1.31	1.28	1.23
C6	0.19	0.09	0.16	0.27	0.06	0.20	0.01	0.36	0.12	0.17	0.15	0.05	0.18	0.09	0.15	0.30	0.30	0.09	1.07	0.90	1.85	1.10
C8	0.22	0.15	0.10	0.56	0.02	0.32	0.04	0.53	0.12	0.14	0.17	0.08	0.13	0.07	0.13	0.38	0.60	0.05	1.00	0.95	1.40	1.00
N1	0.20	0.14	0.08	0.23	0.11	0.10	0.06	0.20	0.07	0.18	0.15	0.12	0.14	0.15	0.16	0.19	0.29	0.10	0.81	0.50	1.60	0.80
N2	0.24	0.20	0.12	0.22	0.15	0.09	0.10	0.11	0.03	0.17	0.11	0.21	0.16	0.16	0.17	0.12	0.33	0.30	0.41	0.23	1.15	0.37
N3	0.30	0.10	0.17	0.32	0.18	0.11	0.10	0.04	0.05	0.18	0.07	0.19	0.14	0.13	0.23	0.19	0.44	0.32	0.37	0.06	1.02	0.31
N7	0.18	0.13	0.12	0.42	0.04	0.35	0.06	0.60	0.14	0.09	0.16	0.09	0.16	0.04	0.10	0.43	0.41	0.16	1.26	1.23	1.80	1.30
N9	0.32	0.10	0.24	0.52	0.09	0.22	0.02	0.29	0.09	0.18	0.14	0.04	0.12	0.09	0.21	0.29	0.63	0.23	0.60	0.43	1.04	0.56
O2'	0.44	0.18	0.53	0.73	0.25	0.42	0.19	0.38	0.18	0.24	0.17	0.27	0.20	0.19	0.31	0.49	1.02	0.55	0.32	0.63	0.41	0.31
O3'	0.21	0.05	0.68	1.14	0.07	0.70	0.07	0.87	0.10	0.09	0.10	0.07	0.14	0.07	0.12	0.46	1.53	0.26	0.93	0.96	1.13	0.90
O4'	0.26	0.33	0.66	0.86	0.18	0.47	0.19	0.50	0.26	0.17	0.33	0.24	0.26	0.15	0.17	0.49	1.04	0.28	0.54	0.52	0.69	0.50
O5'	0.34	0.28	0.71	1.41	0.28	1.10	0.25	1.40	0.23	0.30	0.25	0.29	0.20	0.26	0.31	0.30	1.72	0.63	1.58	1.75	1.66	1.61
O6	0.19	0.10	0.28	0.31	0.04	0.31	0.03	0.50	0.15	0.17	0.16	0.02	0.22	0.07	0.14	0.41	0.34	0.21	1.32	1.27	2.19	1.41
OP1	1.05	0.80	1.13	1.84	0.85	1.83	0.75	2.25	0.70	0.81	0.72	0.88	0.63	0.73	0.91	0.96	2.30	1.39	2.34	2.76	2.34	2.44
OP2	0.63	0.36	0.67	1.67	0.51	1.68	0.54	2.27	0.47	0.69	0.37	0.42	0.50	0.65	0.61	0.07	1.83	1.19	2.70	3.18	2.79	2.83
P	0.73	0.53	0.87	1.78	0.57	1.68	0.50	2.10	0.45	0.57	0.47	0.58	0.39	0.50	0.63	0.39	2.17	1.18	2.30	2.63	2.29	2.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.17	0.12	0.33	0.10
C2	0.03	0.00	0.40	0.21	0.00	0.18	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.43	0.34	0.37	0.39	1.03	0.42	0.59
C2'	0.00	0.40	0.00	0.00	0.20	0.00	0.07	0.02	0.16	0.23	0.30	0.40	0.10	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.27	0.26	0.29	0.20
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.08	0.00	0.03	0.01	0.05	0.23	0.15	0.21	0.04	0.17	0.06	0.02	0.01	0.01	0.34	0.48	0.17	0.25
C4	0.02	0.00	0.20	0.08	0.00	0.11	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.13	0.20	0.28	0.49	0.58	0.28
C4'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.14	0.05	0.17	0.16	0.14	0.07	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01	0.13	0.13	0.01
C5	0.01	0.00	0.07	0.03	0.00	0.11	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.10	0.42	0.37	0.89	0.37
C5'	0.04	0.40	0.02	0.01	0.26	0.00	0.25	0.00	0.32	0.10	0.39	0.34	0.31	0.15	0.13	0.02	0.03	0.02	0.00	0.32	0.32	0.01
C6	0.02	0.00	0.16	0.05	0.01	0.14	0.00	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.19	0.11	0.18	0.39	0.59	0.85	0.41
C8	0.01	0.00	0.23	0.23	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.25	0.20	0.70	0.48	1.13	0.65
N1	0.02	0.00	0.30	0.15	0.01	0.17	0.00	0.39	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.33	0.25	0.30	0.36	0.90	0.60	0.51
N3	0.03	0.00	0.40	0.21	0.00	0.16	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.42	0.31	0.36	0.34	0.87	0.34	0.49
N6	0.01	0.00	0.10	0.04	0.01	0.14	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.07	0.13	0.46	0.51	1.04	0.46
N7	0.00	0.00	0.13	0.17	0.00	0.07	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.19	0.09	0.66	0.40	1.23	0.62
N9	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.01	0.36	0.19	0.66	0.27
O2'	0.01	0.43	0.00	0.02	0.20	0.02	0.09	0.02	0.19	0.17	0.33	0.42	0.13	0.09	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.12	0.08	0.05
O3'	0.01	0.34	0.01	0.01	0.13	0.01	0.04	0.03	0.11	0.25	0.25	0.31	0.07	0.19	0.05	0.03	0.00	0.00	0.21	0.56	0.15	0.18
O4'	0.00	0.37	0.00	0.01	0.20	0.00	0.10	0.02	0.18	0.20	0.30	0.36	0.13	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.19	0.14	0.05
O5'	0.17	0.39	0.27	0.34	0.28	0.01	0.42	0.00	0.39	0.70	0.36	0.34	0.46	0.66	0.36	0.06	0.21	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	1.03	0.26	0.48	0.49	0.13	0.37	0.32	0.59	0.48	0.90	0.87	0.51	0.40	0.19	0.12	0.56	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.33	0.42	0.29	0.17	0.58	0.13	0.89	0.32	0.85	1.13	0.60	0.34	1.04	1.23	0.66	0.08	0.15	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.59	0.20	0.25	0.28	0.01	0.37	0.01	0.41	0.65	0.51	0.49	0.46	0.62	0.27	0.05	0.18	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00