Doublet Group distance statistics: 51068

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.008, 0.028, 0.049, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.009, 0.031, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.031 std_dev=0.023
N2	A	0, 0.010, 0.035, 0.059, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.035 std_dev=0.025
C4	A	0, 0.010, 0.035, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.025
O6	A	0, 0.012, 0.040, 0.068, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.040 std_dev=0.028
N9	A	0, 0.011, 0.042, 0.074, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.042 std_dev=0.032
N7	A	0, 0.017, 0.058, 0.100, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.058 std_dev=0.041
C8	A	0, 0.019, 0.074, 0.129, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.074 std_dev=0.055
O4'	A	0, 0.022, 0.150, 0.279, 0.314 max_d=0.314 avg_d=0.150 std_dev=0.128
C2'	A	0, 0.015, 0.154, 0.293, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.154 std_dev=0.139
O2'	A	0, 0.058, 0.215, 0.372, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.215 std_dev=0.157
C3'	A	0, 0.038, 0.243, 0.449, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.243 std_dev=0.206
C4'	A	0, 0.082, 0.304, 0.526, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.304 std_dev=0.222
C5'	A	0, 0.134, 0.460, 0.785, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.460 std_dev=0.326
O5'	A	0, 0.143, 0.492, 0.840, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.492 std_dev=0.348
N3	B	0, 0.097, 0.447, 0.797, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.447 std_dev=0.350
O3'	A	0, 0.069, 0.435, 0.801, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.435 std_dev=0.366
C2	B	0, 0.135, 0.530, 0.926, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.530 std_dev=0.396
O2'	B	0, 0.140, 0.566, 0.992, 1.028 max_d=1.028 avg_d=0.566 std_dev=0.426
P	A	0, 0.172, 0.644, 1.116, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.644 std_dev=0.472
C4	B	0, 0.067, 0.576, 1.084, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.576 std_dev=0.508
N1	B	0, 0.180, 0.748, 1.315, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.748 std_dev=0.568
OP2	A	0, 0.048, 0.626, 1.203, 1.393 max_d=1.393 avg_d=0.626 std_dev=0.577
C1'	B	0, 0.038, 0.657, 1.277, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.657 std_dev=0.620
N9	B	0, 0.015, 0.637, 1.260, 1.482 max_d=1.482 avg_d=0.637 std_dev=0.623
C5	B	0, 0.103, 0.747, 1.391, 1.572 max_d=1.572 avg_d=0.747 std_dev=0.644
C2'	B	0, 0.063, 0.718, 1.374, 1.585 max_d=1.585 avg_d=0.718 std_dev=0.655
C6	B	0, 0.177, 0.852, 1.527, 1.650 max_d=1.650 avg_d=0.852 std_dev=0.675
O4'	B	0, 0.065, 0.769, 1.473, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.769 std_dev=0.704
C8	B	0, -0.012, 0.775, 1.561, 1.853 max_d=1.853 avg_d=0.775 std_dev=0.787
N7	B	0, 0.057, 0.852, 1.647, 1.913 max_d=1.913 avg_d=0.852 std_dev=0.795
OP1	A	0, 0.321, 1.144, 1.967, 1.904 max_d=1.904 avg_d=1.144 std_dev=0.823
N6	B	0, 0.243, 1.100, 1.956, 2.089 max_d=2.089 avg_d=1.100 std_dev=0.856
C3'	B	0, -0.063, 0.867, 1.796, 2.156 max_d=2.156 avg_d=0.867 std_dev=0.929
C4'	B	0, -0.031, 0.922, 1.874, 2.233 max_d=2.233 avg_d=0.922 std_dev=0.952
O3'	B	0, 0.108, 1.185, 2.261, 2.604 max_d=2.604 avg_d=1.185 std_dev=1.076
C5'	B	0, -0.074, 1.180, 2.433, 2.916 max_d=2.916 avg_d=1.180 std_dev=1.254
OP1	B	0, 0.400, 1.658, 2.915, 3.044 max_d=3.044 avg_d=1.658 std_dev=1.257
O5'	B	0, -0.140, 1.539, 3.218, 3.874 max_d=3.874 avg_d=1.539 std_dev=1.679
P	B	0, 0.198, 1.988, 3.778, 4.339 max_d=4.339 avg_d=1.988 std_dev=1.790
OP2	B	0, 0.424, 2.987, 5.550, 6.258 max_d=6.258 avg_d=2.987 std_dev=2.563

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.12	0.21
C2	0.02	0.00	0.10	0.16	0.00	0.06	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.20	0.01	0.11	0.01	0.18	0.27	0.32
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.10	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.08	0.22	0.07	0.02
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.12	0.00	0.13	0.02	0.16	0.07	0.17	0.17	0.13	0.11	0.07	0.03	0.00	0.00	0.04	0.17	0.34	0.13	0.09
C4	0.01	0.00	0.06	0.12	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.14	0.00	0.10	0.01	0.21	0.27	0.33
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.07	0.08	0.07	0.05	0.08	0.04	0.02	0.03	0.00	0.02	0.10	0.07	0.03	0.06
C5	0.00	0.01	0.06	0.13	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.17	0.02	0.15	0.01	0.32	0.37	0.40
C5'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.12	0.10	0.10	0.07	0.04	0.13	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.14	0.02	0.02	0.00
C6	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.08	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.22	0.02	0.17	0.00	0.33	0.40	0.41
C8	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.03	0.14	0.01	0.34	0.33	0.40
N1	0.01	0.00	0.10	0.17	0.00	0.08	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.07	0.23	0.01	0.14	0.00	0.26	0.34	0.37
N2	0.02	0.01	0.12	0.17	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.01	0.10	0.01	0.15	0.24	0.29
N3	0.02	0.00	0.09	0.13	0.00	0.05	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.07	0.15	0.01	0.07	0.01	0.14	0.22	0.28
N7	0.01	0.01	0.03	0.11	0.00	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.03	0.17	0.01	0.40	0.43	0.45
N9	0.00	0.00	0.02	0.07	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.20	0.23	0.31
O2'	0.01	0.08	0.00	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.01	0.07	0.10	0.07	0.01	0.01	0.00	0.09	0.00	0.05	0.05	0.24	0.09	0.04
O3'	0.02	0.20	0.02	0.00	0.14	0.03	0.17	0.02	0.22	0.08	0.23	0.21	0.15	0.14	0.07	0.09	0.00	0.03	0.04	0.23	0.56	0.21	0.21
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.03	0.19	0.17	0.27
O5'	0.03	0.11	0.04	0.04	0.10	0.02	0.15	0.01	0.17	0.14	0.14	0.10	0.07	0.17	0.08	0.05	0.04	0.02	0.00	0.20	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.17	0.01	0.10	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.23	0.03	0.20	0.00	0.40	0.46	0.45
OP1	0.07	0.18	0.22	0.34	0.21	0.07	0.32	0.02	0.33	0.34	0.26	0.15	0.14	0.40	0.20	0.24	0.56	0.19	0.02	0.40	0.00	0.02	0.01
OP2	0.12	0.27	0.07	0.13	0.27	0.03	0.37	0.02	0.40	0.33	0.34	0.24	0.22	0.43	0.23	0.09	0.21	0.17	0.01	0.46	0.02	0.00	0.01
P	0.21	0.32	0.02	0.09	0.33	0.06	0.40	0.00	0.41	0.40	0.37	0.29	0.28	0.45	0.31	0.04	0.21	0.27	0.00	0.45	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.09	0.19	0.18	0.15	0.21	0.13	0.30	0.10	0.22	0.14	0.10	0.12	0.17	0.21	0.10	0.15	0.23	0.13	0.17	0.51	0.28
C2	0.53	0.17	0.55	0.58	0.36	0.62	0.35	0.75	0.24	0.57	0.24	0.25	0.31	0.49	0.50	0.43	0.54	0.54	0.27	0.27	0.48	0.22
C2'	0.19	0.08	0.15	0.13	0.15	0.17	0.18	0.27	0.17	0.24	0.15	0.08	0.22	0.23	0.20	0.07	0.07	0.19	0.24	0.23	0.72	0.43
C3'	0.13	0.10	0.13	0.12	0.05	0.12	0.06	0.19	0.09	0.14	0.12	0.06	0.15	0.12	0.11	0.11	0.07	0.13	0.43	0.32	0.94	0.57
C4	0.40	0.17	0.41	0.41	0.24	0.43	0.18	0.52	0.22	0.36	0.28	0.18	0.32	0.24	0.36	0.33	0.40	0.39	0.02	0.21	0.56	0.31
C4'	0.18	0.18	0.20	0.19	0.13	0.19	0.08	0.22	0.07	0.12	0.14	0.17	0.07	0.08	0.15	0.20	0.12	0.19	0.43	0.30	0.79	0.47
C5	0.42	0.19	0.48	0.49	0.16	0.47	0.15	0.53	0.35	0.27	0.35	0.14	0.49	0.10	0.31	0.43	0.49	0.39	0.07	0.26	0.72	0.44
C5'	0.30	0.29	0.32	0.32	0.25	0.33	0.20	0.32	0.19	0.21	0.23	0.30	0.15	0.18	0.26	0.33	0.27	0.31	0.62	0.41	0.96	0.60
C6	0.51	0.17	0.60	0.64	0.21	0.61	0.15	0.70	0.34	0.39	0.33	0.16	0.53	0.18	0.40	0.53	0.63	0.50	0.07	0.29	0.73	0.43
C8	0.18	0.24	0.20	0.20	0.07	0.19	0.20	0.23	0.34	0.02	0.35	0.09	0.38	0.13	0.06	0.18	0.24	0.16	0.33	0.26	0.78	0.49
N1	0.55	0.16	0.61	0.65	0.31	0.67	0.24	0.79	0.24	0.54	0.27	0.22	0.41	0.39	0.49	0.50	0.63	0.56	0.25	0.29	0.59	0.31
N2	0.56	0.20	0.58	0.61	0.41	0.67	0.42	0.82	0.29	0.64	0.23	0.29	0.33	0.58	0.55	0.44	0.57	0.59	0.39	0.31	0.46	0.18
N3	0.46	0.18	0.46	0.47	0.34	0.51	0.33	0.62	0.24	0.50	0.24	0.24	0.28	0.43	0.45	0.34	0.44	0.47	0.17	0.22	0.45	0.20
N7	0.28	0.25	0.35	0.36	0.11	0.31	0.30	0.32	0.44	0.02	0.40	0.11	0.52	0.23	0.10	0.38	0.40	0.23	0.32	0.31	0.89	0.58
N9	0.27	0.16	0.26	0.26	0.14	0.27	0.08	0.35	0.19	0.20	0.26	0.11	0.25	0.11	0.22	0.19	0.26	0.26	0.14	0.19	0.59	0.35
O2'	0.20	0.08	0.16	0.14	0.19	0.19	0.23	0.29	0.22	0.28	0.15	0.12	0.27	0.28	0.23	0.08	0.07	0.22	0.15	0.18	0.56	0.32
O3'	0.12	0.12	0.12	0.11	0.05	0.11	0.08	0.17	0.09	0.15	0.10	0.09	0.17	0.15	0.10	0.11	0.11	0.13	0.46	0.34	1.01	0.61
O4'	0.16	0.15	0.15	0.13	0.11	0.15	0.09	0.21	0.10	0.13	0.16	0.11	0.10	0.10	0.14	0.13	0.06	0.16	0.28	0.21	0.57	0.33
O5'	0.33	0.31	0.35	0.34	0.28	0.35	0.24	0.35	0.24	0.25	0.27	0.32	0.21	0.22	0.29	0.35	0.28	0.34	0.74	0.50	1.18	0.74
O6	0.52	0.18	0.66	0.72	0.15	0.67	0.19	0.75	0.39	0.30	0.35	0.13	0.60	0.14	0.35	0.59	0.72	0.50	0.04	0.35	0.88	0.55
OP1	0.28	0.28	0.15	0.15	0.25	0.21	0.21	0.17	0.22	0.21	0.25	0.29	0.20	0.19	0.25	0.13	0.25	0.30	0.38	0.06	0.81	0.33
OP2	0.21	0.15	0.15	0.12	0.14	0.15	0.12	0.15	0.15	0.13	0.16	0.15	0.16	0.10	0.16	0.15	0.09	0.21	0.58	0.23	1.18	0.58
P	0.16	0.23	0.07	0.03	0.19	0.06	0.20	0.08	0.22	0.16	0.24	0.20	0.23	0.17	0.17	0.07	0.10	0.15	0.48	0.12	0.93	0.44

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.15	0.00	0.10	0.05	0.08	0.10
C2	0.02	0.00	0.09	0.05	0.01	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.19	0.06	0.10	0.07	0.20	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.08	0.04	0.08	0.08	0.08	0.05	0.03	0.00	0.06	0.01	0.50	0.16	0.69	0.44
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.50	0.07	0.61	0.29
C4	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.16	0.04	0.07	0.02	0.15	0.07
C4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.03	0.00	0.02	0.23	0.11	0.21
C5	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.13	0.03	0.09	0.12	0.21	0.11
C5'	0.06	0.11	0.04	0.04	0.12	0.01	0.14	0.00	0.14	0.14	0.13	0.10	0.15	0.15	0.11	0.04	0.09	0.02	0.01	0.02	0.19	0.03
C6	0.01	0.00	0.08	0.03	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.15	0.04	0.11	0.11	0.22	0.07
C8	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.08	0.09	0.02	0.07	0.22	0.26	0.26
N1	0.02	0.00	0.08	0.04	0.01	0.04	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.18	0.05	0.11	0.01	0.22	0.07
N3	0.02	0.00	0.08	0.04	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.14	0.19	0.05	0.07	0.09	0.16	0.14
N6	0.01	0.01	0.08	0.03	0.01	0.04	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.17	0.14	0.03	0.11	0.18	0.26	0.14
N7	0.00	0.01	0.05	0.01	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.11	0.10	0.00	0.08	0.24	0.27	0.25
N9	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.13	0.01	0.06	0.06	0.14	0.10
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.12	0.02	0.13	0.04	0.16	0.08	0.17	0.14	0.17	0.11	0.06	0.00	0.07	0.03	0.56	0.19	0.89	0.52
O3'	0.15	0.19	0.06	0.00	0.16	0.03	0.13	0.09	0.15	0.09	0.18	0.19	0.14	0.10	0.13	0.07	0.00	0.12	0.37	0.23	0.48	0.07
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.02	0.05	0.05	0.03	0.00	0.01	0.03	0.12	0.00	0.20	0.22	0.37	0.34
O5'	0.10	0.10	0.50	0.50	0.07	0.02	0.09	0.01	0.11	0.07	0.11	0.07	0.11	0.08	0.06	0.56	0.37	0.20	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.05	0.07	0.16	0.07	0.02	0.23	0.12	0.02	0.11	0.22	0.01	0.09	0.18	0.24	0.06	0.19	0.23	0.22	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.20	0.69	0.61	0.15	0.11	0.21	0.19	0.22	0.26	0.22	0.16	0.26	0.27	0.14	0.89	0.48	0.37	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.14	0.44	0.29	0.07	0.21	0.11	0.03	0.07	0.26	0.07	0.14	0.14	0.25	0.10	0.52	0.07	0.34	0.01	0.00	0.00	0.00